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アジア・アフリカの都市下水の全ゲノム解析による多剤耐性大腸菌プロファイリング

研究課題

研究課題/領域番号 18K18881
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分22:土木工学およびその関連分野
研究機関京都大学

研究代表者

原田 英典  京都大学, アジア・アフリカ地域研究研究科, 准教授 (40512835)

研究分担者 五味 良太  京都大学, 工学研究科, 助教 (30794284)
松田 知成  京都大学, 工学研究科, 准教授 (50273488)
松村 康史  京都大学, 医学研究科, 准教授 (80726828)
山本 正樹  京都大学, 医学研究科, 講師 (90726837)
研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2019年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2018年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード多剤耐性大腸菌 / 都市下水 / アジア・アフリカ / 全ゲノム解析
研究成果の概要

途上国由来の多剤(薬剤)耐性菌の広がりが世界的に懸念されている。本研究では,ウガンダにおける調査から,リスクの高いクローンの存在実態や薬剤耐性大腸菌の伝播実態を明らかにし,下水(またはし尿)サーベイランスと全ゲノム解析の組み合わせは,都市レベルでの薬剤耐性大腸菌の保有・排出状況を監視するための強力なツールとなりうることを示した。タイにおける調査から,下水処理場を経ても多量の薬剤耐性大腸菌が環境中に放出されており,人口密度と相関して薬剤耐性大腸菌の濃度が増加していることがわかった。これらより,薬剤耐性大腸菌の環境への排出実態と,その伝播の一旦を明らかにすることができた。

研究成果の学術的意義や社会的意義

途上国由来の薬剤耐性菌の広がりが世界的に懸念されている。本研究では東南アジアではタイのバンコク,アフリカではウガンダのカンパラを対象に,都市レベルでの薬剤耐性大腸菌の広がりを下水調査により明らかにした。タイでは使用する抗菌薬に応じた耐性大腸菌がもっとも多くみられるとともに,人口密度に応じてその濃度も高まることがわかった。ウガンダでは,薬剤耐性大腸菌の全ゲノム解析から,世界的な高リスククローンが検出されたとともに,その耐性を決定する多様な因子が確認された。また,下水調査と全ゲノム解析の組み合わせが都市レベルの薬剤耐性の広がりを把握する有効なツールとなることを示した。

報告書

(6件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 国際共同研究 (10件) 雑誌論文 (7件) (うち国際共著 5件、 査読あり 6件、 オープンアクセス 4件) 学会発表 (9件) (うち国際学会 5件、 招待講演 1件) 図書 (4件)

  • [国際共同研究] マケレレ大学(ウガンダ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] マヒドン大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [国際共同研究] マヒドン大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [国際共同研究] マケレレ大学(ウガンダ)

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [国際共同研究] マヒドン大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] マケレレ大学(ウガンダ)

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [国際共同研究] マケレレ大学(ウガンダ)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [国際共同研究] マヒドン大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [国際共同研究] マケレレ大学(ウガンダ)

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [国際共同研究] マヒドン大学(タイ)

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [雑誌論文] Human source identification by using a human<b>-</b>associated <i>Escherichia coli</i> genetic marker in the Mae Klong River, Thailand2022

    • 著者名/発表者名
      Nopprapun Pimchanok、Boontanon Suwanna Kitpati、Piyaviriyakul Pitchaya、Sweattatut Rawiwan、Fujii Shigeo、Harada Hidenori
    • 雑誌名

      Journal of Water and Health

      巻: - 号: 5 ページ: 794-802

    • DOI

      10.2166/wh.2022.296

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書 2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Antimicrobial Resistant Escherichia coli Distribution along the Lower Part of the Chao Phraya River, Thailand2022

    • 著者名/発表者名
      Sweattatut Rawiwan、Boontanon Suwanna Kitpati、Piyaviriyakul Pitchaya、Harada Hidenori、Fujii Shigeo
    • 雑誌名

      IOP Conference Series: Earth and Environmental Science

      巻: 973 号: 1 ページ: 012005-012005

    • DOI

      10.1088/1755-1315/973/1/012005

    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Social Allocation of the Health Risks in Sanitation2022

    • 著者名/発表者名
      Harada Hidenori
    • 雑誌名

      The Sanitation Triangle: Socio-Culture, Health and Materials

      巻: - ページ: 129-149

    • DOI

      10.1007/978-981-16-7711-3_8

    • ISBN
      9789811677106, 9789811677113
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Evaluation of a human-associated genetic marker for Escherichia coli (H8) for fecal source tracking in Thailand2020

    • 著者名/発表者名
      Nopprapun Pimchanok、Boontanon Suwanna Kitpati、Harada Hidenori、Surinkul Nawatch、Fujii Shigeo
    • 雑誌名

      Water Science and Technology

      巻: 82 号: 12 ページ: 2929-2936

    • DOI

      10.2166/wst.2020.525

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著
  • [雑誌論文] Human-associated Escherichia coli Marker: Important Indicator to Evaluate River W2020

    • 著者名/発表者名
      Pimchanok Nopprapun, Suwanna Kitpati Boontanon, Shigeo Fujii, Hidenori Harada
    • 雑誌名

      Thai Environmental Engineering Journal

      巻: 34(2) ページ: 35-43

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Fecal contamination and the proportion of human-associated E.coli along Nhue river, Viet Nam2018

    • 著者名/発表者名
      Mai Tanaka, Hidenori Harada, Shigeo Fujii, Min Li Chua, Nguyen Duy, Hung, Nguyen Pham Hong Lien, Nghiem Trung Dung, Ryota Gomi
    • 雑誌名

      Vietnam Journal of Science and Technology,

      巻: 56(2C) ページ: 23-29

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Source identification of Escherichia coli by using a Human-associated genetic marker: A case study in Nhue River, Vietnam2018

    • 著者名/発表者名
      M. Tanaka, H. Harada, S. Fujii, M. Chua, H. Nguyen, L. Nguyen, D. Nghiem, R. Gomi
    • 雑誌名

      Proceedings of the 27th Joint KAIST-KU-NTU-NUS Symposium on Environmental Engineering

      巻: 27 ページ: 118-124

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際共著
  • [学会発表] アフリカと水・衛生の価値2023

    • 著者名/発表者名
      原田英典
    • 学会等名
      京大アジア・アフリカ塾2023京大アジア・アフリカ塾2023「産官学の立場から見たアフリカの現状と未来」第4回「公衆衛生・ヘルスケア」
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Antimicrobial Resistant Escherichia coli Distribution along the Lower Part of the Chao Phraya River, Thailand2021

    • 著者名/発表者名
      Rawiwan Sweattatut, Suwanna Kitpati Boontanon, Pitchaya Piyaviriyakul, Hidenori Hidenori and Shigeo Fujii
    • 学会等名
      6th International Conference on Environmental Engineering and Sustainable Development 2021 (CEESD2021), Sanya, China
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Occurrence of antimicrobial-resistant Escherichia coli in wastewater treatment plants and a fecal sludge treatment plant2020

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Harada, Suwanna Kitpati Boontanon, Wutyi Naing, Shigeo Fujii
    • 学会等名
      Kyoto University International ONLINE Symposium 2020 on Education and Research in Global Environmental Studies in Asia
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Water, Sanitation and Hygiene for Development in Asia and Africa2019

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Harada
    • 学会等名
      Seminar on Environmental Engineering between GSGES/ENFIT lab and Environmental Engineering Program, MOST, Taiwan
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] アジア・アフリカの現場から見たSDGs - SDG6(水・衛生)を例に -2019

    • 著者名/発表者名
      原田英典
    • 学会等名
      EICA未来プロジェクト「若手技術者・研究者交流セミナー」第三回セミナー
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] アジア・アフリカの衛生改善とサニテーションの価値2019

    • 著者名/発表者名
      原田英典
    • 学会等名
      京大テックフォーラム「社会課題から読み解く「水・衛生問題」 ~SDGs・防災・減災へのアプローチ~」
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Cross-country performance of a human associated E. coli source tracking marker, H8, in Asia and Africa2019

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Harada, Chua Min Li, Mai Tanaka, Nguyen Pham Hong Lien, Allan J Komakech, Nazmul Ahsan, Meki Chirwa, Imasiku Nyambe, Ryota Gomi, Shigeo Fujii
    • 学会等名
      20th Symposium on Health-Related Water Microbiology
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Fecal exposure assessment through various transmission pathways2019

    • 著者名/発表者名
      Hidenori Harada, Min Li Chua, Shigeo Fujii, Imasiku Nyambe, Meki Chirwa
    • 学会等名
      8th Zambia Water Forum and Exhibition
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Proportions of human-associated Escherichia coli isolates along a heavily contaminated river in Vietnam2018

    • 著者名/発表者名
      Harada, H., Tanaka, M., Fujii, S., Chua, M.L., Nguyen, D.H., Nguyen, P.H.L., Nghiem T.D., Gomi, R.
    • 学会等名
      Water Microbiology 2018
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [図書] 指標としての大腸菌の意味とその定量方法,コラム②,『サニテーションと健康』(原田 英典,山内 太郎(編著)),講座サニテーション学 第4巻2023

    • 著者名/発表者名
      五味良太
    • 総ページ数
      4
    • 出版者
      北海道大学出版会
    • ISBN
      9784832929548
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] サニテーションと健康2023

    • 著者名/発表者名
      原田 英典、山内 太郎
    • 総ページ数
      230
    • 出版者
      北海道大学出版会
    • ISBN
      9784832929548
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [図書] The Sanitation Triangle: Socio-Culture, Health and Materials2022

    • 著者名/発表者名
      Taro Yamauchi, Seiji Nakao, Hidenori Harada
    • 総ページ数
      264
    • 出版者
      Springer Nature Singapore
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
  • [図書] 第5章 安全な水とトイレを世界中に(知る・わかる・伝えるSDGs I 貧困・食料・健康・ジェンダー・水と衛生,編著:阿部治, 野田 恵)2019

    • 著者名/発表者名
      原田英典
    • 総ページ数
      172
    • 出版者
      学文社
    • ISBN
      9784762029233
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2018-07-25   更新日: 2024-01-30  

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