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食品成分に制御されるセンサータンパクの構造アンサンブル

研究課題

研究課題/領域番号 18K19161
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分38:農芸化学およびその関連分野
研究機関東北大学

研究代表者

黒河 博文  東北大学, 多元物質科学研究所, 講師 (80359546)

研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
2020年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2019年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
2018年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円)
キーワードタンパク質 / 結晶構造 / X線結晶構造解析 / センサー / 酸化ストレス / 分子センサー
研究成果の概要

本研究は従来の鍵と鍵穴モデルでは説明できない「アンサンブル構造」による分子認識の解明を目指すものである.当初、酸化ストレスセンサーと有機化合物との複合体形成による準安定状態のトラップを試みたが,これとは別のモデル系として,cis型プレニル転移酵素が有用であることがわかり,そのX線結晶構造を明らかとした。X線回折実験に適したサイズのストレスセンサー結晶を得ることが困難であったため,微結晶でも解析が可能なクライオ電顕を用いた微結晶電子線回折法に着目し,まず低分子試料の分子置換法による構造解析を行った.年度末に所属部局にクライオ電顕が導入されたため,今後の解析を行うための基礎を確立した.

研究成果の学術的意義や社会的意義

cis型プレニル転移酵素の結晶解析から低分子の結合によるタンパク質のダイナミックな構造変化を高分解能で明らかとした.このような成功例がある一方,柔軟なセンサータンパク質はX線解析が可能なサイズの大きな結晶を得ることが困難である.微結晶でも解析が可能なクライオ電子顕微鏡を用いた解析が必須と判断し,関連する共同研究を実施した.本研究はセンサータンパク質の分子認識を解明する上で鍵となる微小結晶解析に向けた基礎を築いたといえる.

報告書

(5件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2022 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Crystal structure of Thermobifida fusca cis-prenyltransferase reveals the dynamic nature of its RXG motif-mediated inter-subunit interactions critical for its catalytic activity2020

    • 著者名/発表者名
      Kurokawa Hirofumi、Ambo Takanori、Takahashi Seiji、Koyama Tanetoshi
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      巻: 532 号: 3 ページ: 459-465

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2020.08.062

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Ph-BTBTT-Cn系有機半導体の分子構造異性による結晶構造の転換2022

    • 著者名/発表者名
      東野 寿樹, 井上 悟, 荒井 俊人, 松井弘之, 都築誠二, 高場圭章, 眞木 さおり, 黒河 博文, 米倉 功治, 長谷川 達生
    • 学会等名
      応用物理学会春季学術講演会
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] cis型プレニル基転移酵素の構造ダイナミクス2019

    • 著者名/発表者名
      黒河博文
    • 学会等名
      第29回イソプレノイド研究会例会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 結晶構造解析によるcis型プレニル基転移酵素のダイナミクスと活性制御2018

    • 著者名/発表者名
      黒河博文、安保貴永、古山種俊
    • 学会等名
      第28回イソプレノイド研究会例会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書

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公開日: 2018-07-25   更新日: 2023-01-30  

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