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陸域環境の窒素固定を担う微生物基盤の刷新

研究課題

研究課題/領域番号 18K19165
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分38:農芸化学およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

妹尾 啓史  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (40206652)

研究分担者 伊藤 英臣  国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員 (70748425)
研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2021-03-31
研究課題ステータス 完了 (2020年度)
配分額 *注記
6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円)
2019年度: 3,770千円 (直接経費: 2,900千円、間接経費: 870千円)
2018年度: 2,470千円 (直接経費: 1,900千円、間接経費: 570千円)
キーワード窒素固定微生物 / 鉄還元細菌 / 陸域土壌 / Anaeromyxobacter / Geobacter / 生物的窒素固定 / 鉄還元菌 / 窒素固定活性 / 土壌圏 / 窒素固定 / 水田土壌 / 土壌 / 微生物 / 陸域生態系
研究成果の概要

世界(農耕地、底泥、森林、砂漠、極地土壌)および日本(水田、畑、森林、底泥)の土壌メタゲノム解析の結果、多くの地点でGeobacterとAnaeromyxobacterの窒素固定遺伝子が検出され、鉄還元細菌による窒素固定が陸域環境において普遍的である可能性が示された。
土壌からGeobacterならびにAnaeromyxobacterを多数分離し、窒素固定活性を確認した。主に水田から分離したGeobacterの解析から、新属GeomonasおよびOryzomonasを提唱した。
様々な陸域環境土壌において嫌気的条件下で鉄還元細菌による窒素固定が起こることが示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

窒素固定は大気中の窒素ガスを生物が利用できる形態の窒素に変換して土壌に供給する、自然生態系を支える重要な反応である。19世紀末に窒素固定が発見されて以降、「土壌の窒素固定は植物共生細菌や光合成細菌が担う」というのが一般常識として定着していた。本研究により、窒素固定できる鉄還元細菌が地球規模で普遍的に分布していること、そして従来の窒素固定微生物よりも存在量が多い傾向も見出された。このことは窒素固定に関する定説を刷新して自然生態系の支持基盤の本質に迫るものであり、その波及効果は土壌学分野に留まることなく、微生物学、地球科学、生態学まで広く自然科学分野全般に及ぶ。

報告書

(4件)
  • 2020 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (33件)

すべて 2021 2020 2019 2018 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 6件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (25件) (うち国際学会 10件、 招待講演 9件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Geomonas silvestris sp. nov., Geomonas paludis sp. nov. and Geomonas limicola sp. nov., isolated from terrestrial environments, and emended description of the genus Geomonas2021

    • 著者名/発表者名
      Itoh Hideomi、Xu Zhenxing、Masuda Yoko、Ushijima Natsumi、Hayakawa Chie、Shiratori Yutaka、Senoo Keishi
    • 雑誌名

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology

      巻: 71 号: 1

    • DOI

      10.1099/ijsem.0.004607

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 理想の農業を追求する—サステイナブルで革新的な食糧生産を支える基礎研究と現場技術—2020

    • 著者名/発表者名
      妹尾啓史・増田曜子・伊藤英臣・野田口理孝・田畑 亮・岡安浩次・ 澤井 優・鈴木孝征・黒谷賢一・藤 雅子・Yuniar Devi Utami・清水幸子・ 西條雄介・大森良弘・藤原 徹・白鳥 豊・太田沙由理
    • 雑誌名

      日本土壌肥料学雑誌

      巻: 91 号: 2 ページ: 94-98

    • DOI

      10.20710/dojo.91.2_94

    • NAID

      130007831579

    • ISSN
      0029-0610, 2424-0583
    • 年月日
      2020-04-05
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [雑誌論文] DiazotrophicAnaeromyxobacterIsolates from Soils2020

    • 著者名/発表者名
      Masuda Yoko、Yamanaka Haruka、Xu Zhen-Xing、Shiratori Yutaka、Aono Toshihiro、Amachi Seigo、Senoo Keishi、Itoh Hideomi
    • 雑誌名

      Applied and Environmental Microbiology

      巻: 86 号: 16

    • DOI

      10.1128/aem.00956-20

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Description of Three Novel Members in the Family Geobacteraceae, Oryzomonas japonicum gen. nov., sp. nov., Oryzomonas sagensis sp. nov., and Oryzomonas ruber sp. nov.2020

    • 著者名/発表者名
      Xu Zhenxing、Masuda Yoko、Hayakawa Chie、Ushijima Natsumi、Kawano Keisuke、Shiratori Yutaka、Senoo Keishi、Itoh Hideomi
    • 雑誌名

      Microorganisms

      巻: 8 号: 5 ページ: 634-634

    • DOI

      10.3390/microorganisms8050634

    • 関連する報告書
      2020 実績報告書 2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と応用 オミクス解析から低窒素農業へ2020

    • 著者名/発表者名
      増田曜子・ 伊藤英臣・白鳥豊・妹尾啓史
    • 雑誌名

      化学と生物

      巻: 58(3) ページ: 143-150

    • NAID

      130007993004

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Geomonas oryzae gen. nov., sp. nov., Geomonas edaphica sp. nov., Geomonas ferrireducens sp. nov., Geomonas terrae sp. nov., four ferric-reducing bacteria isolated from paddy soil, and reclassification of three species of the genus Geobacter as members of the genus Geomonas gen. nov.2019

    • 著者名/発表者名
      Zhenxing Xu, Yoko Masuda, Hideomi Itoh, Natsumi Ushijima, Yutaka Shiratori, Keishi Senoo
    • 雑誌名

      Frontiers in Microbiology

      巻: 10 ページ: 2201-2201

    • DOI

      10.3389/fmicb.2019.02201

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 日本農芸化学会との合同企画シンポジウム「植物・微生物機能の解析・制御と食糧・バイオマス生産への応用展開」2019

    • 著者名/発表者名
      浅見忠男・安藤康雄・森川正章・Jog Rahul・三輪京子・池田成志・松井章浩・佐古香織・上田実・Khurram Bashir・砂押裕司・Sultana Rasheed・田中真帆・石田順子・金鍾明・Huong Mai Nguyen・吉田稔・土生芳樹・関原明・野尻秀昭・妹尾啓史
    • 雑誌名

      日本土壌肥料学雑誌

      巻: 90(1) ページ: 82-87

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 増田曜子、石田敬典、山中遥加、Zhenxing Xu、伊藤英臣、白鳥豊、大峡広智、妹尾啓史2020

    • 著者名/発表者名
      水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見・検証と鉄・稲わら添加による増強
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2020年度岡山大会
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] 増田曜子、石田敬典、伊藤英臣、早川智恵、白鳥豊、妹尾啓史2020

    • 著者名/発表者名
      水田土壌の鉄還元菌窒素固定の増強-稲わらと鉄添加の効果
    • 学会等名
      日本土壌微生物学会2020年度大会(大阪)
    • 関連する報告書
      2020 実績報告書
  • [学会発表] Nitrogen fixation by iron reducing bacteria - previously overlooked diazotrophs essential for sustainable soil-plant ecosystems2019

    • 著者名/発表者名
      Yoko Masuda, Haruka Yamanaka, Hideomi Itoh, Zhenxing Xu, Yutaka Shiratori, Seigo Amachi, Toshihiro Aono, Keishi Senoo
    • 学会等名
      11th Asian Symposium of Microbial Ecology
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Nitrogen fixation of iron reducing bacteria in paddy soils - previously overlooked diazotroph essential for sustainable soil nitrogen fertility -2019

    • 著者名/発表者名
      Yoko Masuda, Haruka Yamanaka, Hideomi Itoh, Zhenxing Xu, Yutaka Shiratori, Seigo Amachi, Toshihiro Aono, Keishi Senoo
    • 学会等名
      5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis & Nitrogen Fixation Program
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Boosting nitrogen fixation of iron-reducing bacteria in paddy soil by Fe(iii) and rice straw application2019

    • 著者名/発表者名
      Takanori Ishida, Yoko Masuda, Yutaka Shiratori, Hideomi Itoh, Keishi Senoo
    • 学会等名
      5th Asian Conference on Plant-Microbe Symbiosis & Nitrogen Fixation Program
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Nitrogen fixation of iron reducing bacteria in rice paddy soils - potent agents for sustainable crop production with low nitrogen input2019

    • 著者名/発表者名
      Y. Masuda, H. Yamanaka, H. Itoh, Y. Shiratori, S. Amachi, T. Aono, K. Senoo
    • 学会等名
      15th symposium on Bacterial Genetics and Ecology
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Nitrogen fixation of iron reducing bacteria in rice paddy soils - discovery, verification and application to low-nitrogen agriculture -2019

    • 著者名/発表者名
      Keishi Senoo
    • 学会等名
      Seminar at National Engineering Research Center for Biotechnology and School of Biotechnology and Pharmaceutical Engineering, Nanjing Tech University
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] Soil microbial ecology for sustainable agriculture2019

    • 著者名/発表者名
      Keishi Senoo
    • 学会等名
      Seminar at Nanjing University of Information Science and Technology
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と応用-マイクロバイオーム解析から低窒素農業へ-2019

    • 著者名/発表者名
      増田曜子・伊藤英臣・白鳥豊・妹尾啓史
    • 学会等名
      日本土壌微生物学会 2019 年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と低窒素農業への応用の試み -オミクス解析からサステイナブル農業へ-2019

    • 著者名/発表者名
      妹尾啓史・増田曜子・伊藤英臣・白鳥豊
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2019年度大会シンポジウム 理想の農業を追求する-サステイナブルで革新的な食糧生産を支える基礎研究と現場技術
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 水田土壌における鉄還元菌窒素固定:鉄添加による窒素固定活性の増強2019

    • 著者名/発表者名
      高野諒・石田敬典・増田曜子・伊藤英臣・白鳥豊・妹尾啓史
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 水田土壌を集積培地として用いた鉄還元細菌の単離2019

    • 著者名/発表者名
      河野圭丞・Zhenxing Xu・増田曜子・白鳥豊・妹尾啓史・伊藤英臣
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] 水田土壌における鉄還元菌窒素固定の発見と検証2019

    • 著者名/発表者名
      増田曜子・Zhenxing Xu・山中遥加・伊藤英臣・白鳥豊・妹尾啓史
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第33回大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Isolation and characterization of Geomonas species, a novel genus involved in reductive nitrogen transformation in paddy soils2019

    • 著者名/発表者名
      Zhenxing Xu, Yoko Masuda, Hideomi Itoh, Keishi Senoo
    • 学会等名
      日本微生物生態学会第33回大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Identification and isolation of active N2O reducers in rice paddy soil, and application to N2O mitigation2018

    • 著者名/発表者名
      Keishi Senoo
    • 学会等名
      China-Japan Symposium on Rhizosphere Cross-talk (NFSC-JST Cooperative Research Projects)
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Microbial Drivers of Nitrogen Transformation in Rice Paddy Soil: Identification, Isolation and Application to N2O Mitigation2018

    • 著者名/発表者名
      Keishi Senoo
    • 学会等名
      Seminar at Nanjing University of Information Science and Technology
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Microbial Drivers of Nitrogen Transformation in Rice Paddy Soil: Identification, Isolation and Application to N2O Mitigation2018

    • 著者名/発表者名
      Keishi Senoo
    • 学会等名
      Seminar at Nanjing Agricultural University
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Microbial Ecology of Nitrogen Dynamics in Agricultural Soils: Key Drivers of Reductive Nitrogen Transformation in Paddy Field and N2O Generation in Upland Field2018

    • 著者名/発表者名
      Keishi SENOO
    • 学会等名
      2018 International Symposium and Annual Meeting of the KSABC
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Nitrogen fixing activity of iron reducing bacteria in paddy soils: potent agents for low nitrogen rice production in East Asia2018

    • 著者名/発表者名
      Yoko Masuda, Hideomi Itoh, Yutaka Shiratori, Keishi Senoo
    • 学会等名
      NARO-MARCO International Symposium on Nitrogen Cycling and Its Environmental Impacts in East Asia
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 農耕地土壌の窒素循環微生物の群集構造と機能、環境保全型農業への応用2018

    • 著者名/発表者名
      妹尾啓史
    • 学会等名
      (一財)バイオインダストリー協会 植物バイオ研究会 第16回会合「植物バイオの先端技術(1)セミナー」
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 陸域土壌における鉄還元菌窒素固定遺伝子の分布-水田だけではない!?鉄還元菌による窒素固定-2018

    • 著者名/発表者名
      増田曜子、伊藤英臣、白鳥豊、天知誠吾、妹尾啓史
    • 学会等名
      日本微生物生態学会、10th Asian Symposium on Microbial Ecology
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] 鉄還元細菌の窒素固定能の検証2018

    • 著者名/発表者名
      山中遥加、増田曜子、伊藤英臣、青野俊裕、天知誠吾、白鳥豊、妹尾啓史
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2018年度神奈川大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 還元的な陸域環境下における鉄還元細菌の窒素固定活性の検証2018

    • 著者名/発表者名
      松島賢吾、藤村玲子、増田曜子、山中遥加、伊藤英臣、白鳥豊、青野俊裕、大塚重人、妹尾啓史
    • 学会等名
      日本土壌肥料学会2018年度神奈川大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] 水田土壌の優占種、鉄還元細菌の新機能 ~窒素肥沃度を支えるキープレーヤー~2018

    • 著者名/発表者名
      増田曜子、伊藤英臣、白鳥豊、妹尾啓史
    • 学会等名
      第11回北陸バイオシンポジウム
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [学会発表] Isolation and characterization of Geobacter species, potential drivers of reductive nitrogen transformation in paddy soils2018

    • 著者名/発表者名
      Zhenxing Xu, Yoko Masuda, Hideomi Itoh, Keishi Senoo
    • 学会等名
      日本農芸化学会2019年度大会
    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
  • [備考] Yayoi Highlight 「鉄で土を肥やす! 低窒素農業」

    • URL

      https://www.a.u-tokyo.ac.jp/pr-yayoi/70yh.pdf

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

URL: 

公開日: 2018-07-25   更新日: 2022-01-27  

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