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秋において植物が温度ノイズの中から冬を感知するメカニズム

研究課題

研究課題/領域番号 18K19319
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分44:細胞レベルから個体レベルの生物学およびその関連分野
研究機関岩手大学

研究代表者

河村 幸男  岩手大学, 農学部, 准教授 (10400186)

研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2022-03-31
研究課題ステータス 完了 (2021年度)
配分額 *注記
6,240千円 (直接経費: 4,800千円、間接経費: 1,440千円)
2019年度: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円)
2018年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワード低温馴化 / 植物 / 冬季感知 / 温度ノイズ / 季節情報 / 機械学習 / 重回帰分析
研究成果の概要

植物の低温馴化の分子メカニズムに関する研究は、単純な人工環境で行われてきたため、依然、野外での季節感知メカニズムは全くの未知であり、推測の域を出ていない。本課題では、まず、野外での凍結耐性の変遷と気象データを合わせ、機械学習による解析を行ったところ、野外の馴化では植物は日長では無く温度変化を鋭敏に読んでいる可能性が示唆された。また、それぞれの温度域で特徴的な馴化制御がある可能性がRNA-seq解析から明らかとなった。一方で、秋から冬にかけての平均的な気温変化を再現した人工気象器を用いた実験により、フィトクロムを介した日長による馴化制御は12月以降の真冬のみに生じている可能性が示唆された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

本研究では、野外データと気象データを組み合わせ、また、機械学習も導入することにより、植物は温度に対し鋭敏に対応し、温度域により低温馴化制御のメカニズムが異なることが明らかに出来た。野外実験では気象データを含む膨大なデータが生じるが、機械学習を用いることにより生理学的データと結びつけられ、生理変化をもたらす野外環境の因子を特定できる可能性を示せたことは、本研究の大きな成果であった。また、これまで日長や光質の季節変化も植物の冬季感知に用いられている可能性が指摘されていたが、野外実験や野外を再現した人工気象器を用いた実験により、これらの可能性が低いことが示せたことも学術的な意義が高いと考える。

報告書

(5件)
  • 2021 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (8件)

すべて 2021 2020 2019 2018

すべて 雑誌論文 (3件) (うち国際共著 1件、 査読あり 3件) 学会発表 (5件)

  • [雑誌論文] Season specificity in the cold‐induced calcium signal and the volatile chemicals in the atmosphere2019

    • 著者名/発表者名
      Hiraki Hayato、Watanabe Manabu、Uemura Matsuo、Kawamura Yukio
    • 雑誌名

      Physiologia Plantarum

      巻: 168 号: 4 ページ: 803-818

    • DOI

      10.1111/ppl.13019

    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of Temperature Fluctuating Cyclic Cold Acclimation on Freezing Tolerance in Three Arabidopsis Accessions2019

    • 著者名/発表者名
      HIRAKI, H., TANINO, K., WATANABE, E., MANO, S., UEMURA, M., and KAWAMURA, Y.
    • 雑誌名

      低温生物工学会誌

      巻: 65 号: 1 ページ: 17-22

    • DOI

      10.20585/cryobolcryotechnol.65.1_17

    • NAID

      130007700253

    • ISSN
      1340-7902, 2424-1555
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 査読あり / 国際共著
  • [雑誌論文] Calcium Signaling-Linked CBF/DREB1 Gene Expression was Induced Depending on the Temperature Fluctuation in the Field: Views from the Natural Condition of Cold Acclimation2018

    • 著者名/発表者名
      Hiraki Hayato、Uemura Matsuo、Kawamura Yukio
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 60 号: 2 ページ: 303-317

    • DOI

      10.1093/pcp/pcy210

    • 関連する報告書
      2018 実施状況報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 野外でのシロイヌナズナの凍結耐性の季節的変遷と機械学習によるその予測2021

    • 著者名/発表者名
      河村幸男、上村松生
    • 学会等名
      日本植物学会第85回大会(東京(オンライン大会))
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] フィトクロムを介した日長および温度による低温誘導性遺伝子の発現制御とその解析2021

    • 著者名/発表者名
      笠松勇登、上村松生、河村幸男
    • 学会等名
      東北植物学会第11回大会(福島)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 光を介した低温馴化プロセスにおけるクリプトクロムの役割2021

    • 著者名/発表者名
      下平基、高橋亜未、上村松生、河村幸男
    • 学会等名
      東北植物学会第11回大会(福島)
    • 関連する報告書
      2021 実績報告書
  • [学会発表] 植物の冬の感知と秋から冬にかけての気温と日長の特徴的な変化2020

    • 著者名/発表者名
      河村幸男、上村松生
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] Plant winter sensing and characteristic changes in air temperature and day length from autumn to winter2020

    • 著者名/発表者名
      河村 幸男, 上村 松生
    • 学会等名
      第61回日本植物生理学会年会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書

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公開日: 2018-07-25   更新日: 2023-01-30  

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