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マイクロバイオームに基づく森林環境の評価手法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 18K19870
研究種目

挑戦的研究(萌芽)

配分区分基金
審査区分 中区分64:環境保全対策およびその関連分野
研究機関東京大学

研究代表者

山田 利博  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (30332571)

研究分担者 平尾 聡秀  東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 講師 (90598210)
研究期間 (年度) 2018-06-29 – 2023-03-31
研究課題ステータス 完了 (2022年度)
配分額 *注記
5,980千円 (直接経費: 4,600千円、間接経費: 1,380千円)
2019年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
2018年度: 2,990千円 (直接経費: 2,300千円、間接経費: 690千円)
キーワード樹木 / 健全性 / 森林環境 / ナノポアシーケンサー / マイクロバイオーム
研究成果の概要

マイクロバイオーム分析に基づく森林環境の評価手法については、心材腐朽病害木のマイクロバイオームを特徴づけるバイオマーカーが得られ、さらに共起ネットワーク解析により腐朽病害木周辺土壌において健全木周辺土壌とは異なる群集構造を示すことが明らかになり、土壌中の腐朽菌の共出現の程度が環境の健全性の指標になり得ることが示された。
また、リアルタイムシーケンスを用いた樹木病害の現地診断手法を検討し制限要因を抽出した結果、実用化には対象サンプルに応じて条件分岐したプロトコルの作成が必要になることが示された。

研究成果の学術的意義や社会的意義

マイクロバイオーム分析に基づいて森林の樹木腐朽被害を評価することが可能であり、リアルタイムシーケンス解析を用いることで迅速な評価を行うことができることが示された。このことは、樹木腐朽のように外部表徴から判別できない環境変化に対しても、リアルタイムなマイクロバイオーム分析が環境評価の実用的なアプローチになり得ることを示唆している。
こうした手法で樹病や森林撹乱と関連する微生物叢の特徴を解明することで、樹木保護の実務を進展させ、マイクロバイオームに基づいた全く新しい環境評価手法の開発に資するだけでなく、基礎科学として、環境微生物学への有意なフィードバックが期待できる。

報告書

(6件)
  • 2022 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 2018 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 1件、 オープンアクセス 1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 1件)

  • [雑誌論文] Detection and Quantification of Serpula himantioides in the Wood of Chamaecyparis pisifera Butt Rot Trees by Real-Time PCR2022

    • 著者名/発表者名
      Haraguchi Ryusei、Hirao Toshihide、Yamada Toshihiro
    • 雑誌名

      Forests

      巻: 13 号: 9 ページ: 1429-1429

    • DOI

      10.3390/f13091429

    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] 街路樹の機器診断の精度を高めるための課題2020

    • 著者名/発表者名
      山田利博
    • 雑誌名

      TREE DOCTOR

      巻: 27 ページ: 8-16

    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] クマ剥ぎによるヒノキ被害部の主要腐朽菌と拮抗菌の選別2023

    • 著者名/発表者名
      戴 健平・原口竜成・平尾聡秀・山田利博
    • 学会等名
      日本森林学会大会
    • 関連する報告書
      2022 実績報告書
  • [学会発表] サワラ人工林における腐朽病害木と健全木の環境マイクロバイオームの違い2021

    • 著者名/発表者名
      平尾聡秀・原口竜成・山田利博
    • 学会等名
      第132回日本森林学会大会
    • 関連する報告書
      2020 実施状況報告書
  • [学会発表] 森林マイクロバイオームによる樹木腐朽病害の検出可能性の検討2020

    • 著者名/発表者名
      山田利博・原口竜成・平尾聡秀
    • 学会等名
      日本森林学会大会
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
  • [学会発表] Rapid characterization of wood-decaying fungal communities using the nanopore sequencing system2019

    • 著者名/発表者名
      Yamada T, Haraguchi R & Hirao T
    • 学会等名
      Asian Mycological Congress 2019
    • 関連する報告書
      2019 実施状況報告書
    • 国際学会

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公開日: 2018-07-25   更新日: 2024-01-30  

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