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バイオナノマシンによる分子通信を介した自己組織的な形態形成

研究課題

研究課題/領域番号 18KK0314
研究種目

国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(A))

配分区分基金
研究分野 情報ネットワーク
研究機関大阪公立大学 (2022-2023)
大阪市立大学 (2021)
大阪大学 (2018-2020)

研究代表者

中野 賢  大阪公立大学, 大学院情報学研究科, 教授 (70571173)

研究期間 (年度) 2019 – 2024
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
14,430千円 (直接経費: 11,100千円、間接経費: 3,330千円)
キーワード分子通信 / 形態形成 / バイオナノマシン
研究開始時の研究の概要

分子通信とは、細胞間通信に着想を得たバイオナノマシンのための通信方式である。本研究では、バイオナノマシンの集団が分子通信を介して相互作用する結果、ある種の幾何学構造を形成することを考える。形態形成における分子通信の役割を理解すること、および、形態形成におけるバイオナノマシン間の分子通信を制御することによって、形成される幾何学構造を制御することを目指す。本研究により得られる知見は、生物発生過程の理解や再生医療の発展に寄与すると考えられる。

研究実績の概要

分子通信とは、細胞間通信に着想を得たバイオナノマシンのための通信方式である。本研究では、バイオナノマシンの集団が分子通信を介して相互作用する結果、ある種の幾何学構造を形成することを考える。形態形成における分子通信の役割を理解すること、および、形態形成におけるバイオナノマシン間の分子通信を制御することによって、形成される幾何学構造を制御することを目指す。本研究により得られる知見は、生物発生過程の理解や再生医療の発展に寄与すると考えられる。

これまでに本研究では、バイオナノマシン集団の振る舞いを理解し、制御することを目標として、バイオナノマシン間の相互作用、バイオナノマシンと基質間の相互作用、基質の動体を表現するモデルを構築した。また、このモデルの評価や改良を行うための実験系を構築し、実験データを取得した。さらに、実験で取得したデータの分析、分析結果に基づくモデルの改良、コンピュータシミュレーションによる再現・予測実験を行った。

2023年度には、バイオナノマシン間の場を介した相互作用について調査した。実験では、蛍光ビーズを埋め込んだマトリゲル上にHeLa細胞を播種し、時間経過に伴うイメージング実験を行い、細胞周囲のビーズの動きを分析した。その結果、蛍光ビーズが細胞から100マイクロメートル程度の距離にあるとき、蛍光ビーズの運動と細胞の動きとの間に高い相関が見られた。これらの知見から、細胞がこの距離範囲内で機械的な信号を伝達し、相互作用している可能性があることがわかった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

2020年度より新型コロナウィルス感染症拡大の影響を受けて、研究計画および渡航計画を大幅に変更する必要が生じ、研究の進捗は遅れていた。しかし、2021年度には、渡航先で予定していた実験を国内研究機関で行う方法を検討し、一部の実験を国内で実施することができた。2023年度には、共同研究者が所属する研究機関を訪問し、共同研究を進めることができた。また、共同研究の成果の一部を国際会議で発表することができた。

今後の研究の推進方策

最終年度となる2024年度には、共同研究者が所属する研究機関を再訪し、当該共同研究を遂行できる見込みである。これまでの研究成果をとりまとめ国際ジャーナルに論文を投稿することを目指す。

報告書

(5件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2023 2022

すべて 学会発表 (6件) (うち国際学会 2件、 招待講演 3件)

  • [学会発表] 2点相関関数を用いたがん細胞の空間構造解析2023

    • 著者名/発表者名
      土屋友佳、中野賢、William C. Tang
    • 学会等名
      BioMedical Forum 2024
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Modelling and Computer Simulation of Large-scale Network Formation of Cancer Cells2023

    • 著者名/発表者名
      T. Nakano and W. C. Tang
    • 学会等名
      2023 IEEE 5th Eurasia Conference on IoT, Communication and Engineering (IEEE ECICE 2023)
    • 関連する報告書
      2023 実施状況報告書
  • [学会発表] Two Point Correlation Analysis of Cancer Cell Structure Formation2023

    • 著者名/発表者名
      T. Tsuchiya, T. Nakano and W. Tang
    • 学会等名
      2022 Joint 12th International Conference on Soft Computing and Intelligent Systems and 23rd International Symposium on Advanced Intelligent Systems (SCIS&ISIS 2022),
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会
  • [学会発表] Collective Migration and Large-scale Structure Formation of Cancer Cells2022

    • 著者名/発表者名
      T. Nakano
    • 学会等名
      Workshop on Molecular, Biological, and Multi-Scale Communications (WMBMC)
    • 関連する報告書
      2022 実施状況報告書
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] がん細胞集団が作る大規模ネットワーク構造の分析2022

    • 著者名/発表者名
      中野 賢
    • 学会等名
      Biomedical Forum 2022
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演
  • [学会発表] 生体内分子通信ネットワークの理解と医療応用2022

    • 著者名/発表者名
      中野 賢
    • 学会等名
      日本化学会第102春季年会
    • 関連する報告書
      2021 実施状況報告書
    • 招待講演

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公開日: 2019-02-06   更新日: 2024-12-25  

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