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ハイギョの染色体情報を用いた脊椎動物のゲノム・染色体進化過程の検証

研究課題

研究課題/領域番号 18KK0422
研究種目

国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(A))

配分区分基金
研究分野 進化生物学
研究機関東京大学 (2020-2023)
国立研究開発法人理化学研究所 (2018-2019)

研究代表者

宇野 好宣  東京大学, 大学院総合文化研究科, 助教 (60609717)

研究期間 (年度) 2019 – 2024
研究課題ステータス 交付 (2023年度)
配分額 *注記
15,600千円 (直接経費: 12,000千円、間接経費: 3,600千円)
キーワード脊椎動物 / オーストラリアハイギョ / 染色体 / ゲノム進化 / 核型進化 / マイクロ染色体 / FISH
研究開始時の研究の概要

「なぜ一部の脊椎動物種は、非常に微小な染色体であるマイクロ染色体を多数保持しているのか?」本研究ではこの疑問に答えるため、ハイギョ亜綱とシーラカンス亜綱の動物種で多数のマイクロ染色体をもち、かつ生体サンプルが確保可能である唯一の動物種である、オーストラリア固有種のオーストラリアハイギョにおけるゲノム・染色体解析を行う。得られた染色体解析結果を他の脊椎動物種のゲノム情報と比較することで、四肢動物における祖先核型の再検討を行い、「いつマイクロ染色体が脊椎動物の進化過程で獲得されたのか?」を中心とした、脊椎動物ゲノム進化の一端を解き明かすことが本研究の目的である。

研究実績の概要

「なぜ一部の脊椎動物種は、非常に微小な染色体であるマイクロ染色体を多数保持しているのか?」本研究ではこの疑問に答えるため、系統学的に魚類と両生類の間に位置するハイギョ亜綱の動物種で多数のマイクロ染色体をもち、かつ生体サンプルが確保可能である唯一の動物種である、オーストラリア固有種のオーストラリアハイギョにおけるゲノム・染色体解析を行う。当初の予定では、2020年夏から共同研究者であるTariq Ezaz博士(University of Canberra、キャンベラ、オーストラリア)の研究室にて、オーストラリアハイギョから培養細胞を樹立し、得られた細胞から染色体解析を行うことで、他の脊椎動物種との比較染色体ゲノム解析を行う予定であった。現在Ezaz博士オンラインにて打ち合わせやディスカッションを通じ、オーストラリア現地での一連の実験における綿密なプランを構築するだけでなく、実験終了後すぐに研究結果を学術論文として発表するために執筆活動を行っている。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

3: やや遅れている

理由

オンラインでの打ち合わせならびに研究論文の執筆活動をしつつ、渡航準備をすすめている

今後の研究の推進方策

オーストラリアハイギョのサンプリングを行い、実験と解析を現地にて行う。また本研究費申請後に別の研究者よりこの生物種の全ゲノム解読が報告された。そこで今後は本研究を効率よく進めることができるように、公開されているこの全ゲノム情報を用いて、バイオインフォマティクス解析手法による予備解析を行いつつ、準備をすすめていく。

報告書

(5件)
  • 2023 実施状況報告書
  • 2022 実施状況報告書
  • 2021 実施状況報告書
  • 2020 実施状況報告書
  • 2019 実施状況報告書

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公開日: 2019-02-06   更新日: 2024-12-25  

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