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低分子マイクロアレイを用いた蛋白質機能モジュレーターの探索と創成

研究課題

研究課題/領域番号 19021005
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 理工系
研究機関東北大学

研究代表者

叶 直樹  東北大学, 大学院・薬学研究科, 准教授 (40317293)

研究分担者 清水 史郎  独立行政法人理化学研究所, 長田抗生物質研究室, 専任研究員 (30312268)
近藤 恭光  独立行政法人理化学研究所, 長田抗生物質研究室, 先任研究員 (80333342)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
4,600千円 (直接経費: 4,600千円)
2008年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
2007年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワード低分子マイクロアレイ / 低分子アフィニティービーズ / リガンドスクリーニング / 蛋白質機能モジュレーター
研究概要

微生物化学研究会(微化研)との共同研究として、微化研が所有する約2,000種の小分子を固定化した小分子アレイ(微化研ライブラリーアレイ)を作成した。微化研の小分子ライブラリーには、50種類以上のブレオマイシン(BLM)類縁体が含まれていることを利用して、放線菌Streptoalloteichus hindustanus由来のBLM結合蛋白質であるShBleとBLMとの構造-結合活性相関を微化研ライブラリーアレイを用いて解析した。モデル動物を用いた実験から、ShBleはBLMが抗がん剤として投与された時の副作用である肺線維症を軽減する作用を持つことが明らかにされているため、ShBleとBLM類との相互作用を十分理解することは低毒性かつ薬効の高い新たなBLM類縁体の創成に役立つと考えられた。微化研ライブラリーアレイとShBle-RFPを用いた結合実験の結果、ShBleとBLMとの結合にはBLM構造中のビスチアゾール部分が必須であるが、グルオースとマンノースからなる2糖部分は必須ではないこと、また、BLM中のピリミジルプロピオンアミドのアミド部分や、ビスチアゾールから伸びた長鎖ポリアミン部分がShBleとの結合を補強していることも強く示唆された。これらの結果はITC(等温滴定カロリメトリー)を用いた熱力学的パラメータ測定や、共同研究で得られた共結晶構造からも支持された。特にこれらの構造の重要性を定量的に論じることは単独の結晶構造やNMR解析からでは難しいため、改めて小分子アレイプラットフォームを起点とした構造-結合活性相間の有用性を示す結果が得られた。

報告書

(2件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (7件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Structure-affinity relationship study of bleomycins and Shble protein by use of a chemical array2009

    • 著者名/発表者名
      Isao Miyazaki
    • 雑誌名

      ChemBioChem 10

      ページ: 845-852

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The identification of an osteoclastogenesis inhibitor through the inhibi-tion of glyoxalase I2008

    • 著者名/発表者名
      Makoto Kawatani
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Scineces of the United States of America 105

      ページ: 11691-11696

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Total Synthesis of Methyl Sarcophytoate2007

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Ichige
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society 129

      ページ: 9862-9863

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of an Enantiomeric DNA Oligomer and Its T-Hg(II)-T Base-Pair Formation2007

    • 著者名/発表者名
      Kaichiro Haruta
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symposium Series

      ページ: 187-188

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 生理活性物質の固相単体への官能基非選択的導入法は化学遺伝学研究のパラダイムシフトとなり得るか?2008

    • 著者名/発表者名
      叶 直樹
    • 学会等名
      日本薬学会第128年会一般シンポジウム
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2008-03-28
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] SPRイメージング法を用いたp38 MAP kinaseとp62の結合部位の同定2008

    • 著者名/発表者名
      齊藤 安貴子
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス(愛知県名古屋市)
    • 年月日
      2008-03-27
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 生理活性物質の固相単体への官能基非選択的導入法は化学遺伝学研究のパラダイムシフトとなり得るか?2008

    • 著者名/発表者名
      叶 直樹
    • 学会等名
      第4回理研ケミカルバイオロジーシンポジウム
    • 発表場所
      熱海金城館(静岡県熱海市)
    • 年月日
      2008-02-07
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] The identification of a novel inhibitor of osteoclastogenesis that acts via inhibition of glyoxalase I2007

    • 著者名/発表者名
      川谷 誠
    • 学会等名
      AACR-NCI-EORTC International Conference on Molecular Targets and Cancer Therapeutics
    • 発表場所
      Moscone Convention Center West, San Francisco, CA
    • 年月日
      2007-10-22
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Development of A Photo-Cross-Linked Natural Product Microarray Platform for Screening Lysate of Human Cells2007

    • 著者名/発表者名
      宮崎 功
    • 学会等名
      The 2nd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • 発表場所
      早稲田大学早稲田キャンパス(東京都新宿区)
    • 年月日
      2007-09-06
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質-低分子間相互作用検出法の開発2007

    • 著者名/発表者名
      叶 直樹
    • 学会等名
      日本薬学会東北支部学術講演会
    • 発表場所
      東北薬科大学(宮城県仙台市)
    • 年月日
      2007-05-19
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 低分子リガンドの網羅的スクリーニングを目指したSPRイメージングの高感度化2007

    • 著者名/発表者名
      高山 浩
    • 学会等名
      第2回ケミカルバイオロジー研究会年会
    • 発表場所
      京都大学時計台記念(京都府京都市)
    • 年月日
      2007-05-10
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] マイクロアレイ・バイオチップの最新技術2007

    • 著者名/発表者名
      清水史郎
    • 総ページ数
      305
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] 分子間相互作用解析ハンドブック(光親和型低分子マイクロアレイを用いた低分子-蛋白質相互作用の検出)2007

    • 著者名/発表者名
      齊藤安貴子
    • 総ページ数
      287
    • 出版者
      (株)羊土社
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2018-03-28  

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