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膜貫通型プロテアーゼの細胞骨格への連結の構造的基礎

研究課題

研究課題/領域番号 19036014
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

箱嶋 敏雄  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 教授 (00164773)

研究分担者 平野 良憲  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助教 (50452529)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
6,100千円 (直接経費: 6,100千円)
2008年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2007年度: 3,100千円 (直接経費: 3,100千円)
キーワードNEP / ERM / 膜タンパク質 / アダプタータンパク質 / シグナル伝達
研究概要

精製した組み替え型radixinのFERMドメイン(残基1-310)と一回膜貫通型I型膜タンパク質プロテアーゼMT1-MMP(membrane-typel 1 matrix metalloproteinase)の細胞質テールの合成ペプチド(20残基)との複合体を, 結晶化ロボット(HYDRA-II)を用いることで, 結晶化に成功した(a=b=122.7, c=128.3Å, P6_122、非対称単位に1複合体).SPring-8での放射光実験により, 2.4ÅのX線強度データを収集した. その後, 通常のMR法により位相決定して, 最終的にR_<work>=0.252/R_<free>=0.292までCNSとREFMACを用いて構造の精密化を行った.
得られたFERM-MT1-MMP複合体結晶中では, ペプチドの両親媒性領域は、FERMドメインのサブドメインAのβ2A-鎖と反平行β-β相互作用をしており, 疎水性残基がサブドメインAのくぼみにはまり込んでいた. この相互作用は, サブドメインCに結合する従来のICAM-2やCD44などの膜タンパク質と全く異なるものであった. この新事実は, ERMタンパク質が, FERMドメインを介して, MT1-MMPに結合するとともに, その基質である接着分子CD44とも結合できることを示唆している.
上記の研究結果を踏まえ, 現在, 論文を作成中であり, 学術雑誌に投稿予定である.

報告書

(2件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (17件) (うち査読あり 11件) 学会発表 (11件)

  • [雑誌論文] ジベレリン受容体の構造と機能の解明 : 植物ホルモン識別と標的タンパク質認識の機構2009

    • 著者名/発表者名
      箱嶋敏雄
    • 雑誌名

      細胞工学 28

      ページ: 162-163

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] 構造解析に基づくRhoキナーゼ阻害剤の開発2009

    • 著者名/発表者名
      合田圭吾
    • 雑誌名

      実験医学2009年3月増刊号「分子標的薬開発への挑戦」 27

      ページ: 172-178

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] A molecular mechanism of P-loop pliability of Rho-kinase investigated by molecular dynamic simulation2008

    • 著者名/発表者名
      Gohda, K.
    • 雑誌名

      J. Comput. Aided Mol. Des. 22

      ページ: 789-797

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of the cytoplasmic tail of adhesion molecule CD43 and its binding to ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Takai, Y.
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 381

      ページ: 634-644

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for CD44 recognition by ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Mori, T
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 283

      ページ: 29602-29612

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the radixin FERM domain bound to the cytoplasmic tail of membrane-type 1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP)2008

    • 著者名/発表者名
      Terawaki, S
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F 64

      ページ: 911-913

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gibberellin-induced DELLA recognition by the gibberellin receptot GID12008

    • 著者名/発表者名
      Murase, K.
    • 雑誌名

      Nature 456

      ページ: 459-464

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the membrane-targeting domain ofRac-specific guanine nucleotide exchange factors Tiaml and 22008

    • 著者名/発表者名
      Terawaki, S.
    • 雑誌名

      Acta. Crystallogr. F 64

      ページ: 1039-1042

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the catalytic domain of human flap endonuclease-1 FEN1 in complex with a nicked DNA product: Use of a DPCS kit for efficient protein-DNA complex crvstallization2008

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, S.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F 64

      ページ: 39-43

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 血管収縮阻害剤:Rhoキナーゼの構造と機能2008

    • 著者名/発表者名
      合田 圭吾
    • 雑誌名

      医薬ジャーナル 44

      ページ: 5-10

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] 微小管ダイナミクスを制御する蛋白質の構造研究2008

    • 著者名/発表者名
      前崎 綾子
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 53

      ページ: 139-147

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for type II membrane protein binding by ERM proteins revealed by the radixin-neutral endopeptidase 24.11 (NEP) complex2007

    • 著者名/発表者名
      Terawaki, S
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 282

      ページ: 19854-19862

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the CLIP-170 CAP-Gly domain grasping the C-terminal acidic tail of α-tubulin.2007

    • 著者名/発表者名
      Mishima, M.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104

      ページ: 10346-10351

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the radixinFERM domain bound to the cytoplasmic tail of adhesion molecule CD44.2007

    • 著者名/発表者名
      Mori, T.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F 63

      ページ: 844-847

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of SixA, a histidine protein phosphatase of the ArcB HPt domain in E. coli.2007

    • 著者名/発表者名
      Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      Methods in Enzymology 422

      ページ: 288-304

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis of PSGL-1 binding to ERM proteins.2007

    • 著者名/発表者名
      Takai, Y
    • 雑誌名

      Genes to Cells 12

      ページ: 1329-1338

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] P-loop pliability of Rho-kinase for inhibitor binding.2007

    • 著者名/発表者名
      Gohda, K.
    • 雑誌名

      P-loop pliability of Rho-kinase for inhibitor binding. in Drug Design Research Perspectives, Nova Science Publishers, Inc.

      ページ: 39-56

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 植物核内受容体の作用機構2009

    • 著者名/発表者名
      村瀬浩司
    • 学会等名
      日本農芸化学会2009年度大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ジベレリンとその受容体、およびDELLAタンパク質複合体の結晶構造2009

    • 著者名/発表者名
      村瀬浩司
    • 学会等名
      第50回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2009-03-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structure of a novel membrane-targeting domain found in Rac GEF Tiam1/22009

    • 著者名/発表者名
      Toshio Hakoshima
    • 学会等名
      International Symposium on Molecular Soft Interactions in Biological Systems
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2009-01-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ジベレリン受容体GID1による植物ホルモソおよびDELLAタンパク質認識の構造的基礎2008

    • 著者名/発表者名
      平野良憲
    • 学会等名
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] RacGEF Tiam1/2の新規なタンパク質標的認識ドメインの構造2008

    • 著者名/発表者名
      箱嶋敏雄
    • 学会等名
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)シンポジウム「シグナル伝達タンパク質の分子認識研究の新展開」
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 酵母Irelpによって部位特異的な切断を受けるRNAのNMR構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      河原郁美
    • 学会等名
      第47回NMR討論会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2008-11-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Rho-キナーゼの構造と活性制御:非典型AGCキナーゼとしての特徴2008

    • 著者名/発表者名
      箱嶋 敏雄
    • 学会等名
      第283回CBI研究講演会「キナーゼの構造多様性と阻害剤の開発」
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-02-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for neutral endopeptidas 24.11 recognition by ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Toshio Hakoshima
    • 学会等名
      特定領域研究「膜インタフェイス」国際シンポジウムin福岡
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-01-25
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for CD44 recognition by ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Tomoyuld Mori
    • 学会等名
      The XXI Congress and Assembly of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ERMタンパク質によるペプチド認識:特異性と複数結合部位の干渉性2007

    • 著者名/発表者名
      箱嶋 敏雄
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回(2007年度)年会シンポジウム「タンパク質リガンド相互作用」
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Crystallographic characterization of the radixin FERM domain bound to cytoplasmic tail of adhesion molecule CD442007

    • 著者名/発表者名
      Tomoyuki Mori
    • 学会等名
      The 8th Conference of the Asian Crystallographic Association (AsCA '07)
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan R.O.C.
    • 年月日
      2007-11-06
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2018-03-28  

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