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微小管ダイナミックス制御の構造的基礎

研究課題

研究課題/領域番号 19037017
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関奈良先端科学技術大学院大学

研究代表者

箱嶋 敏雄  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 教授 (00164773)

研究分担者 平野 良憲  奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助教 (50452529)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
2008年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2007年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
キーワードCLIP-170 / チューブリン / EB1 / APC / CLASP
研究概要

本年度は, CLASPのEB1やチューブリンや微小管結合ドメインの試料調製を進めるとともに相互作用を解析した. 先ず, in vivoの機能解析が進んでいるCLASP2γを用いて, EB1との結合に関与するドメインの種々の発現コンストラクトを作成して, 大腸菌をホストとした高効率の調製系を確立した. 発現タンパク質のGSTタグを利用して, 簡便なpull-downアッセイでEB1と結合する領域を同定した. 更に, この最小の結合領域を用いて, EB1-CLASP2γ複合体を結晶化ロボット(既設のHYDRA-II)を用いて結晶化スクリーニングした. その結果, 複合体結晶を得られたので, セレノメチオニン誘導試料結晶も調製して, SPring-8での放射光実験によりx線強度データを収集した. MAD法とMRを組み合わせて位相決定して, 複合体構造を精密化した. その結果, EB1のα-らせんの束が形成する疎水性ポケットにCLASP2γのIPモチーフが結合していることが明らかとなった.さらに, IPモチーフの周辺の相互作用に重要な残基も同定した. 今後, 得られた構造に基づいた点変異実験を組み合わせた機能解析により, 特異性に重要な残基を決定するとともに, チューブリンや微小管、他の+TIPとCLASPとの間の相互作用の関係, 正または負に干渉する, あるいは全く干渉しない, を解析して機能との関係を考察した後に, 論文としてまとめる.

報告書

(2件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (32件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (17件) (うち査読あり 11件) 学会発表 (15件)

  • [雑誌論文] ジベレリン受容体の構造と機能の解明 : 植物ホルモンー識別と標的タンパク質認識の機構2009

    • 著者名/発表者名
      箱鳴敏雄
    • 雑誌名

      細胞工学 28

      ページ: 162-163

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] 構造解析に基づくRhoキナーゼ阻害剤の開発2009

    • 著者名/発表者名
      合田圭吾
    • 雑誌名

      実験医学2009年3月増刊号「分子標的薬開発への挑戦」 27

      ページ: 172-178

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] A molecular mechanism of P-loop pliability of Rho-kinase investigated bymolecular dynamic simulation2008

    • 著者名/発表者名
      Gohda, K.
    • 雑誌名

      J. Comput. Aided Mol. Des 22

      ページ: 789-797

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of the cytoplasmic tail of adhesion molecule CD43 and itsbinding to ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Takai, Y.
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 381

      ページ: 634-644

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for CD44 recognition by ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Mori, T.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 283

      ページ: 29602-29612

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the radixin FERM domain bound to thecytoplasmic tail of membrane-type 1 matrix metalloproteinase (MT1-MMP)2008

    • 著者名/発表者名
      Terawaki, S.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F 64

      ページ: 911-913

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Gibberellin-induced DELLA recognition by the gibberellin receptor GID12008

    • 著者名/発表者名
      Murase, K.
    • 雑誌名

      Nature 456

      ページ: 459-464

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the membrane-targeting domain ofRac-specific guanine nucleotide exchange factors Tiaml and 22008

    • 著者名/発表者名
      Terawaki, S.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F 64

      ページ: 1039-1042

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the catalytic domain of human flap endonuclease-1 FEN1 in complex with a nicked DNA product: Use of a DPCS kit for efficient protein-DNA complex crystallization.2008

    • 著者名/発表者名
      Sakurai, S.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F 64

      ページ: 39-43

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 血管収縮阻害剤:Rhoキナーゼの構造と機能2008

    • 著者名/発表者名
      合田 圭吾
    • 雑誌名

      医薬ジャーナル 44

      ページ: 5-10

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] 微小管ダイナミクスを制御する蛋白質の構造研究2008

    • 著者名/発表者名
      前崎 綾子
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 53

      ページ: 139-147

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis for type II membrane protein binding by ERM proteins revealed by the radixin-neutral endopeptidase 24.11 (NEP) complex.2007

    • 著者名/発表者名
      Terawaki, S.
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 282

      ページ: 19854-19862

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the CLIP-170 CAP-Gly domain grasping the C-terminal acidic tail of α-tubulin.2007

    • 著者名/発表者名
      Mishima, M.
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104

      ページ: 10346-10351

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallographic characterization of the radixinFERM domain bound to the cytoplasmic tail of adhesion molecule CD44.2007

    • 著者名/発表者名
      Mori, T.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr. F 63

      ページ: 844-847

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of SixA, a histidine protein phosphatase of the ArcB HPt domain in E. coli.2007

    • 著者名/発表者名
      Hakoshima, T.
    • 雑誌名

      Methods in Enzymology 422

      ページ: 288-304

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] Structural basis of PSGL-1 binding to ERM proteins.2007

    • 著者名/発表者名
      Takai, Y
    • 雑誌名

      Genes to Cells 12

      ページ: 1329-1338

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] P-loop pliability of Rho-kinase for inhibitor binding.2007

    • 著者名/発表者名
      Gohda, K.
    • 雑誌名

      P-loop pliability of Rho-kinase for inhibitor binding. in Drug Design Research Perspectives, Nova Science Publishers, Inc.

      ページ: 39-56

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 植物核内受容体の作用機構2009

    • 著者名/発表者名
      村瀬浩司
    • 学会等名
      日本農芸化学会2009年度大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ジベレリンとその受容体、およびDELLAタンパク質複合体の結晶構造2009

    • 著者名/発表者名
      村瀬浩司
    • 学会等名
      第50回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2009-03-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ヒトPCNA変異体を用いるFEN1活性制御機構の解析2008

    • 著者名/発表者名
      右田裕二
    • 学会等名
      BMB2008(31回日本分子生物学会年会・81回日本生化学会大会合同大会)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ジベレリン受容体GID1による植物ホルモンおよびDELLAタンパク質認識の構造的基礎2008

    • 著者名/発表者名
      平野良憲
    • 学会等名
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] RacGEF Tiam1/2の新規なタンパク質標的認識ドメインの構造2008

    • 著者名/発表者名
      箱嶋敏雄
    • 学会等名
      BB2008(第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会)シンポジウム「シグナル伝達タンパク質の分子認識研究の新展開」
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] EB1の構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      金場哲平
    • 学会等名
      2008生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-12-04
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 微小管制御因子EB1の構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      金場哲平
    • 学会等名
      第47回NMR討論会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2008-11-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for the recognition of a-tubulin by the plus end tracking protein CLIP-1702008

    • 著者名/発表者名
      Masaki Mishima
    • 学会等名
      2^<nd> International Symposium on Bio-nanosystems
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-11-01
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for CD44 recognition by ERM proteins2008

    • 著者名/発表者名
      Tomoyuki Mori
    • 学会等名
      The XXI Congress and Assembly of the InternationalUnion of Crystallography (IUCr2008)
    • 発表場所
      大阪
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] CLIP-170による微小管認識の構造的基礎2007

    • 著者名/発表者名
      箱嶋 敏雄
    • 学会等名
      BMB2007(第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会)ワークショップ「細胞極性を決定・制御・活用するタンパク質の機能構造研究」
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-13
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] CLIP-170による微小管認識機構2007

    • 著者名/発表者名
      三島 正規
    • 学会等名
      BMB2007(第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] NMRによるRho-kinaseのsplit PHドメインの構造解析2007

    • 著者名/発表者名
      佐藤 明子
    • 学会等名
      BMB2007(第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Structural study of CLIP-170 in complex with the C-terminal tail of α-tubulin2007

    • 著者名/発表者名
      三島 正規
    • 学会等名
      第46回NMR討論会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2007-09-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Rho-kinaseのsplit PHドメインの構造解析2007

    • 著者名/発表者名
      佐藤 明子
    • 学会等名
      第46回NMR討論会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2007-09-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 溶液NMRを用いた出芽酵母Irelp RNaseドメインの解析2007

    • 著者名/発表者名
      河原 郁美
    • 学会等名
      第46回NMR討論会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2007-09-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2018-03-28  

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