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RIG-I、MDA-5からIRF-3に至るシグナル伝達の構造生物学

研究課題

研究課題/領域番号 19041003
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関北海道大学

研究代表者

稲垣 冬彦  北海道大学, 大学院・薬学研究院, 教授 (70011757)

研究分担者 高橋 清大  北海道大学, 大学院・薬学研究院, 博士研究員 (90399965)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
7,500千円 (直接経費: 7,500千円)
2008年度: 3,800千円 (直接経費: 3,800千円)
2007年度: 3,700千円 (直接経費: 3,700千円)
キーワードウイルス感染 / RIG-1 / MDA-5 / LGP2 / RNA結合ループ / dsRNA / 5'ppp-ssRNA / 二重連鎖DNA
研究概要

RIG-I like receptor(RIG-I, MDA5, LGP2)は細胞内に侵入したウィルス由来の二重鎖RNA(dsRNA)や5'ppp-ssRNAを認識し、IFN産生を促す細胞質内レセプターである。それぞれ異なるタイプのウィルスを認識することが知られている。我々は、これらのタンパク質に比較的保存されたC末端ドメイン(CTD)を見出し、このドメインの構造をNMR法により決定した。ついで、dsRNA, 5'ppp-ssRNAを適定し、化学シフト変化より、RNA結合部位を同定するとともに、RNA認識の分子機構の解明を行った。
RIG-I, MDA5, LGP2のCTDドメインはともによく似た立体構造を取っていた。分子中央部には塩基性の表面が存在し、良く保存された塩基性残基が存在していた。RIG-I, LGP2では、溝の一方の壁を形成するRNA結合ループが立ち上がり、比較的深い溝が形成されるのに対し、MDA5ではRNA結合ループはフラットな形状をとり浅い溝が認められるにすぎない。dsRNA, 5'ppp-ssRNAとRIG-I, MDA5, LGP2の結合をSPRにより測定したところ、RIG-I, LGP2はともに強くRNAを結合するのに対し、MDA5はほとんど結合しなかった。RNA結合ループがRNA結合に重要な役割を果たしていることがわかる。実際、RIG-I, LGP2に保存されたRNA結合ループ上のPheに変異を加えると、RNAの結合は認められなかった。今回の結果より、RLRによるウィルスの識別がCTDにより行われていることが明らかとなった。

報告書

(2件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (15件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (8件)

  • [雑誌論文] Atg systems from the protein structural point of view2009

    • 著者名/発表者名
      Node N
    • 雑誌名

      Chemical Reviews (in printing)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis of target reeognition by Atg8/LC3 during selective autophagy2008

    • 著者名/発表者名
      Noda N
    • 雑誌名

      Genes Cell 13

      ページ: 1211-1218

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Solution structure of the Grb2 SH2 domain complexed with a high-affinity inhibitor2008

    • 著者名/発表者名
      Ogura K
    • 雑誌名

      J. Biomol NMR 42

      ページ: 197-207

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The NMR structure of the NIPP1 FHA domain2008

    • 著者名/発表者名
      Kumeta H
    • 雑誌名

      J. Biomol., NMR 40

      ページ: 219-224

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nonself RNA-Sensing Mechanism of RIG-I Helicase and Activation of Antiviral Immune Responses2008

    • 著者名/発表者名
      Takahasi K
    • 雑誌名

      Mol. Cell 29

      ページ: 428-440

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] p40^<phox>の結晶構造と活性酸素発生の制御機構2008

    • 著者名/発表者名
      本坊和也
    • 雑誌名

      生化学 80(Invited)

      ページ: 743-747

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] 細胞内シグナル伝達2008

    • 著者名/発表者名
      稲垣冬彦
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 53(Invited)

      ページ: 600-603

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Nonself RNA-Sensing Mechanism of RIG-I Helicase and Activation of Antiviral Immune Responses2008

    • 著者名/発表者名
      Takahasi K
    • 雑誌名

      Mol. Cell. 29

      ページ: 428-440

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 構造が解き明かすアダプター蛋白質Crkの癌化機構2008

    • 著者名/発表者名
      小橋川敬博
    • 雑誌名

      蛋白質核酸酵素 53

      ページ: 148-156

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] An efficient method for protein phosphorylation using the artificially introduced of cognate-binding modules into kinases and substrates.2007

    • 著者名/発表者名
      Kobashigawa Y
    • 雑誌名

      J Biotechnol. 131

      ページ: 458-465

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK.2007

    • 著者名/発表者名
      Kobashigawa Y
    • 雑誌名

      Nat. Struct. Mol. Biol. 14

      ページ: 503-510

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 構造が解き明かすアダプターCRKのシグナル伝達2007

    • 著者名/発表者名
      小橋川敬博
    • 雑誌名

      実験医学 25

      ページ: 2887-2890

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] 極性発現に必要なPB1ドメイン間の相互作用2007

    • 著者名/発表者名
      稲垣冬彦
    • 雑誌名

      生体の科学 58

      ページ: 402-403

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] Grb2 SH2の構造を基盤とした抗ガン剤の設計2007

    • 著者名/発表者名
      稲垣冬彦
    • 雑誌名

      医薬ジャーナル 43

      ページ: 5-10

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [雑誌論文] オートファジーの構造生物学2007

    • 著者名/発表者名
      鈴木展生
    • 雑誌名

      生物物理 47

      ページ: 107-111

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] NMR構造生物学の新展開2008

    • 著者名/発表者名
      稲垣冬彦
    • 学会等名
      平成20年度日本分光学会NMR分光部会シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学薬学部講堂
    • 年月日
      2008-09-01
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 常磁性ランタニドプローブ法のタンパク質構造解析への応用2008

    • 著者名/発表者名
      稲垣冬彦
    • 学会等名
      BMB2008
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Solution structure of RIG-like receptor C-terminal domains2008

    • 著者名/発表者名
      Fuyuhiko Inagaki
    • 学会等名
      回日本免疫学会総会・学術集会・国際シンポジウム
    • 発表場所
      国立京都国際会館
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structural Biology of Autophagy. International Conference On Structural Genomics Organization2008

    • 著者名/発表者名
      Fuyuhiko Inagaki
    • 学会等名
      International Conference On Structural Genomics Organization
    • 発表場所
      University of Oxford
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for the transforming activity of human-cancer related signaling adaptor protein CRK2008

    • 著者名/発表者名
      Fuyuhiko Inagaki
    • 学会等名
      International Conference Magnetic in Biological Systems
    • 発表場所
      San Diego
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] RIG-I C末端側ドメインの機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      高橋清大
    • 学会等名
      科学研究費補助金「特定領域研究」感染現象のマトリックス第4回全体班会議
    • 発表場所
      東京学術総合センター
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 構造が解き明かすアダプタータンパク質CRKの癌化機構2007

    • 著者名/発表者名
      小橋川敬博
    • 学会等名
      BMB 2007
    • 発表場所
      横浜 パシフィコ横浜ヨコハマグランドインターコンチネンタルホテル
    • 年月日
      2007-12-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Structural basis for the transforming activity of human cancer-related signaling adaptor protein CRK2007

    • 著者名/発表者名
      稲垣冬彦
    • 学会等名
      よこはまNMR構造生物学研究会「International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR」
    • 発表場所
      横浜 理化学研究所横浜研究所交流ホール
    • 年月日
      2007-10-22
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2018-03-28  

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