発現多様性を産み出すゲノム動態を介したHIV-1発現制御機構の解析

• 研究課題/領域番号: 19041020
• 研究種目: 特定領域研究
• 配分区分: 補助金
• 審査区分: 生物系
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 水谷 壮利 東京大学, 医科学研究所, 助教 (00376617)
• 研究分担者: 伊庭 英夫 東京大学, 医科学研究所, 教授 (60111449)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 8,100千円 (直接経費: 8,100千円); 2008年度: 4,100千円 (直接経費: 4,100千円); 2007年度: 4,000千円 (直接経費: 4,000千円)
• キーワード: HIV-1 / レトロウイルス / SWI / SNF複合体 / SNF

研究概要

これまでの我々の研究の結果、レトロウイルスの発現維持に重要な機能を果たすことが考えられるクロマチン構造変換因子、Brm型SWI/SNF複合体はTat非依存的なHIV-1の発現維持能にも必須であることを明らかにした。またBrmを始めとするSWI/SNF複合体構成因子はHIV-1が活発に増殖する場である末梢血由来の活性化T細胞では一過的に発現上昇がみられ、一方、潜伏感染化するとされる静止期T細胞においてはその発現量が非常に抑えられていることから、これらの発現量の違いは宿主内におけるHIV-1の発現挙動に密接に関与していることが示唆された。またBrm欠失細胞株で見られるTat非依存的なHIV-1プロモーターの発現抑制は転写が開始しているにもかかわらず, 転写伸長が効率よく進んでいないことをRT-PCRにより明らかにした。さらにRNase Protection assayの結果からほぼ60nt近傍において、その転写が停止していること明らかにした。一方、BrmはSWI/SNF複合体としてLTRに動員されることをクロマチン免疫沈降法により示し、それに伴い転写開始点直下に形成されるヌクレオソーム-1の破壊がおこり転写伸長が回復することを観察している。以上の結果からBrm型SWI/SNFはその性状からHIV-1の転写伸長時におけるヌクレオソーム-1のクロマチン構造変換を介してHIV-1の転写に寄与していることが示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Cdx2 and the Brm-type SWI/SNF complex cooperatively regurate villin expression in gastrointestinal cells (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamamichi N, Inada K, Furukawa C, Sakurai K, Tando T, Ishizaka A, Haraguchi T, Mizutani T, Fujishiro M, Shimomura. R, Oka M, Ichinose M, Tsutsumi Y, Omata M, Iba H.
  • 雑誌名: Experimental cell Reseach (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] miR-21 Gene Expression Triggered by AP-1 Is Sustained through a Double-Negative Feedback Mechanism. (2008)
  • 著者名/発表者名: Fujita S, Ito T, Mizutani T, Minoguchi S, Yamamichi N, Sakurai K, Iba H.
  • 雑誌名: J Mol Biol. (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Class-specific regulation of pro-inflammatory genes by MYD88 pathways and Ikappa Bzeta. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kayama H, Ramirez-Carrozzi VR, Yamamoto M, Mizutani T, Kuwata H, Iba H, Matsumoto M, Honda K, Smale ST, Takeda K.
  • 雑誌名: J Biol Chem. (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Brm transactivates the telomerase reverse transcriptase (TERT) gene and modulates the splicing patterns of its transcripts inconcert with p54(nrb). (2008)
  • 著者名/発表者名: Ito T, Watanabe H, Yamamichi N, Kondo S, Tando T, Haraguchi T, Mizutani T, Sakurai K, Fujita S, Izumi T, Isobe T, Iba H.
  • 雑誌名: Biochem J. 411(1) ページ: 201-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Frequent loss of Brm expression in gastric cancer correlates with histologic features and differentiation state. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamamichi N, Inada K, Ichinose M, Yamamichi-Nishina M, Mizutani T, Watanabe H, Shiogama K, Fujishiro M, Okazaki T, Yahagi N, Haraguchi T, Fujita S, Tsutsumi Y, Omata M, Iba H.
  • 雑誌名: Cancer. Res. 67(22) ページ: 10727-35
  • 査読あり
• [雑誌論文] SiRNAs do not induce RNA-dependent transcriptional silencing of retrovirus in human cells. (2007)
  • 著者名/発表者名: Haraguchi T, Mizutani T, Yamamichi N, Ito T, Minoguchi S, Iba H.
  • 雑誌名: FEBS Lett. 581(25) ページ: 4949-54
  • 査読あり
• [学会発表] Brm, a catalytic subunit of SVI/SNF complex is required for Tat-independent stable expression of HIV-1 (2008)
  • 著者名/発表者名: 水谷壮利、石坂彩、山道信毅、伊庭英夫
  • 学会等名: The 8^<th> Awaiishima International Forum on Infection and Immunity
  • 発表場所: 兵庫県淡路島夢舞台国際会議場
• [学会発表] HIV-1のTat非依存的な発現を維持するSWI/SNF複合体の作用点の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 石坂彩、水谷壮利、山道信毅、原口健、富沢麻利子、岩本愛吉、伊庭英夫
  • 学会等名: 第56回日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 岡山コンベンションセンター
• [学会発表] Brm, a catalytic subunit of SWI/SNF complex is required for Tat-independent stable expression of HIV-1 (2007)
  • 著者名/発表者名: 水谷 壮利、石坂 彩、山道信毅、伊庭英夫
  • 学会等名: The 7th Awajishima International Forum on Infection and Immunity
  • 発表場所: 兵庫県 淡路島夢舞台国際会議場
• [学会発表] HIV-1のTat非依存的な発現におけるSWI/SNF複合体の機能解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 水谷 壮利、石坂 彩、山道信毅、伊庭英夫
  • 学会等名: 第55回 日本ウイルス学会学術集会
  • 発表場所: 札幌コンベンションセンター