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膜タンパク質会合過程の高速AFMイメージング

研究課題

研究課題/領域番号 19042009
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関金沢大学

研究代表者

内橋 貴之  金沢大学, 数物科学系, 准教授 (30326300)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
2008年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
2007年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
キーワード生物物理 / AFM / 蛋白質
研究概要

1. バクテリオロドプシン(bR)の構造変化の観察 : 光吸収サイクルが野性型bRよりも遅いD96N変異体を試料として、緑色レーザー光照射時の光吸収に伴う構造変化の観察を行った。細胞質側では光照射に同期してAFMで観察されるモノマーの輝点が約0.7nm変化することがわかった。光励起された分子の寿命を解析した結果、AFMで観察された構造変化は、基底状態からN中間体への遷移時に発生すると考えられている、EFループの移動であることが分かった。一方、このような構造変化は細胞外側では観察されなかった。また、EFループの移動により隣り合ったbRトライマー内のモノマー同士が相互作用した結果、励起分子の寿命が変化することが分かり、従来から分光法により議論されてきた光吸収サイクルの協同性が構造変化に起因することを明らかにした。
2. ロドプシンの会合状態の観察 : 高速AFMでロドプシンの高分解能な動態変化過程や生理過程を捉えるため、AFM観察に適したロドプシン試料の調整としてウシロドプシンの抽出及び天然脂質膜へ再構成を行った。その結果、再構成時の脂質割合や界面活性剤の割合などの条件を変える事で2次元結晶の結晶化度が変化する事が分かった。また、天然の円盤膜中に存在するロドプシンでも、4℃で長時間インキュベーションを行うと2次元結晶化し、ダイマー構造をとることが確認できた。
3. ATPaseの回転観察の試み : リジン基で修飾したF1モーターを用いることで、アミノシランおよびグルタルアルデヒド処理したマイカに比較的容易に固定できることが分かった。F1のYサブユニットに標識としてストレプトアビジンを固定し、ATP加水分解による回転運動を観察することができた。しかしながら、AFM観察によりYサブユニットが容易に引き抜かれてしまうことも判明し、再現性よく回転観察を行うところまでは達しなかった。

報告書

(2件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] High-speed atomic force microscopy for nano-visualization of dynamic biomolecular processes2008

    • 著者名/発表者名
      T. Ando, T. Uchihashi, and, T. Fukuma
    • 雑誌名

      Progress in Surface Science 83

      ページ: 337-437

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Anisotropic diffusion of point defects in two-dimensional crystal of streptavidin observed by hieh-sneed atomic force microscopy2008

    • 著者名/発表者名
      D. Yamamoto, T. Uchihashi, N. Kodera, and, T. Ando
    • 雑誌名

      Nanotechnology 19

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Visualization of intrinsically disordered regions of proteins by high-speed atomic force microscopy2008

    • 著者名/発表者名
      A. Miyagi, Y Tsunaka, T. Uchihashi, K. Mayanagi, S. Hirose, K. Morikawa, and, T. Ando
    • 雑誌名

      Chem Phys Chem 9

      ページ: 1859-1866

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High resonance frequency force microscope scanner using inertia balance support2008

    • 著者名/発表者名
      T. Fukuma, Y. Okazaki, N. Kodera, T. Uchihahsi, and, T. A
    • 雑誌名

      Applied Physics Letters 92

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-speed AFM and nano-visualization of biomolecular processes2008

    • 著者名/発表者名
      T. Ando, T. Uchihashi, N. Kodera, D Yamamoto, M. Taniguch, A. Miyagi, and H. Yamashita
    • 雑誌名

      Pflugers Archiv European. Jourbnal of Physiology 456

      ページ: 211-225

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Tip-sample distance control using photothermal actuation of a small cantilever for high-speed atomic force microscopy2007

    • 著者名/発表者名
      H. Yamashita, T. Uchihashi, N. Kodera, A. Miyagi, D. Yamamoto, and T. Ando
    • 雑誌名

      Review of Scientific Instruments 78

      ページ: 83702-83702

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] High-speed Atomic Force Microscopy for Observing Dynamic Biomolecular Processes2007

    • 著者名/発表者名
      T. Ando, T. Uchihashi, N. Kodera, D Yamamoto, M. Taniguch, A. Miyagi, and H. Yamashita
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Recognition 20

      ページ: 448-458

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Direct observation of single protein dynamics with high-speed AFM2009

    • 著者名/発表者名
      T. Uchihashi
    • 学会等名
      6^<th> Asian Biophysics Association Symposium, 27th Hong Kong Society of Neurosciences Annual Meeting
    • 発表場所
      Hong Kong
    • 年月日
      2009-01-13
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] High-speed AFM for Visualizing Biomolecular Processes2008

    • 著者名/発表者名
      T. Uchihashi
    • 学会等名
      39^<th> NIPS International Symposium &, 7^<th> OIB Symposium : Frontier of Biological Imaging
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2008-06-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] High-Speed AFM for Visualizing Biomolecular Processes : nanoelectronics and mo lecular biology2008

    • 著者名/発表者名
      T. Uchihashi
    • 学会等名
      International Conference : From Solid State To BioPhysics IV
    • 発表場所
      Dubrovnik, Croatia
    • 年月日
      2008-06-11
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Protein Dynamics Captured by High-speed AFM2007

    • 著者名/発表者名
      T. Uchihashi and T. Ando
    • 学会等名
      Handai Nanoscience and Nanotechnology International Symposium
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2007-09-28
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] "Single Molecule Dynamics in Life Science", T. Yanagida & Yoshiharu Ishii (Eds.)2008

    • 著者名/発表者名
      T. Ando, T. Uchihashi, N. Kodera, D. Yamamoto, M. Taniguchi, A. Miyagi, H. Yamashita
    • 総ページ数
      19
    • 出版者
      Wiley-VCH
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2018-03-28  

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