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新規シャペロンDmp1/2の構造解析を基盤としたプロテアソームの分子集合機構

研究課題

研究課題/領域番号 19044018
研究種目

特定領域研究

配分区分補助金
審査区分 生物系
研究機関名古屋市立大学 (2008)
名古屋大学 (2007)

研究代表者

水島 恒裕  名古屋市立大学, 大学院・薬学研究科, 准教授 (90362269)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
7,400千円 (直接経費: 7,400千円)
2008年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
2007年度: 3,800千円 (直接経費: 3,800千円)
キーワードプロテアソーム / シャペロン / Dmp1-Dmp2複合体 / 蛋白質分解 / αリング
研究概要

プロテアソームは約100個のサブユニットが分子集合することにより形成された巨大な蛋白質分解酵素複合体であり、各サブユニットが厳密に配置することで非常に高度な機能を獲得し、生体内の様々な調節を行っている。新規シャペロンDmp1-Dmp2複合体は酵母20Sプロテアソームの分子集合においてαリング形成の足場としての役割が推定されている。これまでにDmp1-Dmp2複合体およびDmp1-Dmp2-α5サブユニット複合体の立体構造を決定したことから、立体構造情報をもとにαリングの形成に関与する機構を種々の複合体形成中問状態を作製しin vitroで解析を行った。Dmp1-Dmp2複合体を含む20Sプロテアソームの中間体モデルはDmp1-Dmp2-α5サブユニット、20Sプロテアソームの結晶構造から構築した。その結果、Dmp1-Dmp2はβサブユニットの結合サイトからα5と結合しており、中間体モデルの解析からα5と同時にα4、α6サブユニットとも相互作用することが示された。さらに、Dmp1-Dmp2が結合したαリングにβサブユニットが結合した時、β4、β5、β6サブユニットの結合時にDmp1-Dmp2との間に立体障害が生じることが明らかとなった。これまでにプロテアソームの中間体の解析よりαリングにはβ2、β3、β4の順に結合することが報告されていることから、Dmp1-Dmp2はβ4の結合により解離していると考えられる。また、Dmp1-Dmp2を含めたα4、α5、α6サブユニットの複合体形成機構の解析を行うことにより、Dmp1-Dmp2の存在がαサブユニットの特異的な複合体形成に関与している可能性が示された。

報告書

(2件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 5件) 学会発表 (6件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Structural basis for sorting mechanism of p62 in selective autophagy2008

    • 著者名/発表者名
      Ichimura Y, Kumanomidou T, Sou Y, Mizushima, T, Ezaki, J, Ueno T, Kominami E, Yamane T, Tanaka K, Komatsu M
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem 283

      ページ: 22847-22857

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 出芽酵母20Sプロテアソーム形成に関わるシャペロン複合体Dmp1/Dmp2の立体構造解析2008

    • 著者名/発表者名
      八代田英樹、水島恒裕
    • 雑誌名

      細胞工学 27

      ページ: 474-475

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of a chaperone complex that contributes to the assembly of yeast 20S proteasomes2008

    • 著者名/発表者名
      Yashiroda H, Mizushima T, Okamoto K, Kameyama T, Hayashi H, Kishimoto T, Niwa S, Kasahara M, Kurimoto E, Sakata E, Takagi K, Suzuki A, Hirano Y, Murata S, Kato K, Yamane T, Tanaka K
    • 雑誌名

      Nat Struct Mol Biol. 15

      ページ: 228-236

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structures and physiological roles of 13 integral lipids of bovine heart cytochrome c oxidase.2007

    • 著者名/発表者名
      Shinzawa-Itoh K, Aoyama H, Muramoto K, Terada H, Kurauchi T, Tadehara Y, Yamasaki A, Sugimura T, Kurono S, Tsujimoto K, Mizushima T, Yamashita E, Tsukihara T, Yoshikawa S
    • 雑誌名

      EMBO Journal 26

      ページ: 17131-1725

    • NAID

      120000861649

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the selection of glycosylated substrates by SCF^<Fbs1>ubiquitin ligase.2007

    • 著者名/発表者名
      Mizushima T, Yoshida Y, Kumanomidou T, Hasegawa Y, Suzuki A, Yamane T, Tanaka K
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A. 104

      ページ: 5777-5781

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of Ufcl, the Ufml-conjugating enzyme2007

    • 著者名/発表者名
      Mizushima T, Tatsumi K, Ozakai Y, Kawakami T, Suzuki A, Ogasahara K, Komatsu M, Kominami E, Tanaka K, Yamane T
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun 362

      ページ: 1079-1084

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 鎖認識ユビキチンリガーゼFbsファミリーの構造と反応機構2009

    • 著者名/発表者名
      水島恒裕
    • 学会等名
      第4回プロテオミクス・構造生物学講演会
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2009-01-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] STRUCTURE BASIS FOR RECOGNITION OF GLYCOSYLAT ED SUBSTRATES BY SCFFbs1 UBIQUITIN LIGASE2008

    • 著者名/発表者名
      T. Mizushima, Y. Yoshida, T. Kumanomidou, Y. Yamaguchi, T. Yamane, K. Tanaka, K. Kato
    • 学会等名
      ZOMES V
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 年月日
      2008-11-13
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] X-ray Structure of the Skp1-Fbs1 glycoprotein complex2008

    • 著者名/発表者名
      T. Mizushima, Y. Yoshida, T. Kumanomidou, Y. Hasegawa, A. Suzuki, T. Yamane, K. Tanaka
    • 学会等名
      FEBS Congress & IUBMB Conference
    • 発表場所
      Athens, Greece
    • 年月日
      2008-06-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] プロテアソームシャペロンDmp1-Dmp2複合体による20Sプロテアソーム分子集合機構2008

    • 著者名/発表者名
      水島恒裕、八代田英樹、田中啓二
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-06-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] SCF^<Fbs1>ユビキチンリガーゼによる糖蛋白の選択的認識機構2007

    • 著者名/発表者名
      水島恒裕、吉田雪子、熊埜御堂太-、田中啓二、山根隆
    • 学会等名
      日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2007-05-26
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] X-ray Structure of the Skp1-Fbs1 glycoprotein complex2007

    • 著者名/発表者名
      Tsunehiro Mizushima, Yukiko Yoshida, Taichi Kumanomidou, Yuko Hasegawa, Atsuo Suzuki, Takashi Yamane, Keiji Tanaka
    • 学会等名
      ASCA2007
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] 実験医学増刊号 タンパク質の分解機構 (SCF^<Fbs1>の構造と機能 分担執筆)2008

    • 著者名/発表者名
      水島恒裕、吉田雪子
    • 出版者
      羊土社
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2018-03-28  

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