| 研究課題/領域番号 |
19200022
|
|---|
| 研究種目 |
基盤研究(A)
|
| 配分区分 | 補助金 |
|---|
| 応募区分 | 一般 |
|---|
| 研究分野 |
生体生命情報学
|
|---|
| 研究機関 | 京都大学 |
|---|
研究代表者 |
阿久津 達也 京都大学, 化学研究所, 教授 (90261859)
|
|---|
| 研究分担者 |
川端 猛夫 京都大学, 化学研究所, 教授 (50214680)
林田 守広 京都大学, 化学研究所, 助教 (40402929)
永持 仁 京都大学, 情報学研究科, 教授 (70202231)
|
|---|
| 研究期間 (年度) |
2007 – 2009
|
| 研究課題ステータス |
完了 (2009年度)
|
| 配分額 *注記 |
34,710千円 (直接経費: 26,700千円、間接経費: 8,010千円)
2009年度: 12,090千円 (直接経費: 9,300千円、間接経費: 2,790千円)
2008年度: 13,000千円 (直接経費: 10,000千円、間接経費: 3,000千円)
2007年度: 9,620千円 (直接経費: 7,400千円、間接経費: 2,220千円)
|
|---|
| キーワード | カーネル法 / グラフアルゴリズム / 特徴ベクトル / サポートベクターマシン / 列挙アルゴリズム / 動的計画法 / ケモインフォマティクス / グラフ理論 / RNA二次構造 / タンパク質立体構造 / 化学構造 / 立体異性体 / 木構造 / 外平面的グラフ / 構造活性相関 / 光学異性体 / 外平面グラフ |
|---|
| 研究概要 |
本研究ではグラフ理論と機械学習手法の一つであるカーネル法を組み合わせることにより新規化学構造を設計するための方法について研究を行い、ラベルつきパスの頻度からなる特徴ベクトルから木状化合物を列挙するアルゴリズムおよびそれを実装したWebサーバー、木状および外平面グラフ構造を持つ化学構造の立体異性体列挙アルゴリズム、立体異性体を区別可能な化学構造に対するカーネル関数の開発などの成果を得た。
|
