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機能未知なるカオナシ遺伝子の正体解明を目指す戦略的ゲノム研究

研究課題

研究課題/領域番号 19201038
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 基礎ゲノム科学
研究機関慶應義塾大学

研究代表者

清水 信義  慶應義塾大学, 医学部, 名誉教授 (50162706)

研究分担者 浅川 修一  慶應義塾大学, 医学部, 講師 (30231872)
清水 厚志  慶應義塾大学, 医学部, 助教 (30327655)
佐々木 貴史  慶應義塾大学, 医学部, 助教 (70306843)
研究協力者 楊 浩  慶應義塾大学, 医学部, 助教 (10464992)
塩浜 愛子  慶應義塾大学, 医学部, 助教 (40383731)
小島 サビヌ和子  慶應義塾大学, 医学部, 研究員 (10445439)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
49,400千円 (直接経費: 38,000千円、間接経費: 11,400千円)
2008年度: 20,540千円 (直接経費: 15,800千円、間接経費: 4,740千円)
2007年度: 28,860千円 (直接経費: 22,200千円、間接経費: 6,660千円)
キーワードメダカ / ノックダウン / モルフォリノ / カオナシ / ドメイン / モチーフ / モルフォリノアンチセンス / ノックダウン解析 / 比較ゲノム解析
研究概要

カオナシ遺伝子を統合的に解析するために、慶應ヒト遺伝子データベースを構築し、メダカカオナシ遺伝子のノックダウン解析結果や初期胚における発現パターンによる検索を可能とした。さらにヒトカオナシ遺伝子を培養細胞で強制発現させた細胞内局在解析や、高効率なメダカ発現コンストラクトの開発を行った。タンパク質コード遺伝子のみならず小分子カオナシRNAを対象としてシーケンシングと解析を行った。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて 2010 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 13件) 学会発表 (6件) 図書 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Retinoic Acid Signaling Positively Regulates Liver Specification by Inducing wnt2bb Gene Expression in Medaka2010

    • 著者名/発表者名
      Negishi, T., Nagai, Y., Asaoka, Y., Namae, M., Mitani, H., Sasaki, T., Shimizu, N., Terai, S., Sakaida, I., Kondoh, H., Katada, T., Furutani-Seiki, M., Nishina, H.
    • 雑誌名

      Hepatol 51(3)

      ページ: 1037-1045

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Two distinct types of theca cells in the medaka gonad : germ cell-dependent maintenance of cyp19al-expressing theca cells2009

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, S., Kurokawa, H., Asakawa, S., Shimizu, N., Tanaka M.
    • 雑誌名

      Dev Dyn 238(10)

      ページ: 2652-2657

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ethylnitrosourea-induced thymus-defective mutants identify roles of KIAA1440, TRRAP, and SKIV2L2 in teleost organ development2009

    • 著者名/発表者名
      Iwanami, N., Okada, M., Hoa, V. Q., Seo, Y., Mitani, H., Sasaki, T., Shimizu. N., Kondoh, H., Furutani-Seiki, M., Takahama, Y.
    • 雑誌名

      Eur J Immunol 39(9)

      ページ: 2606-2616

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Polycystic Kidney Disease in the Medaka (Oryzias latipes) pc Mutant Caused by a Mutation in the Gli-Similar3 (glis3) Gene.2009

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto, H., Miyamoto, R., Watanabe, N., Shiba, D., Ozato, K., Inoue, C., Kubo, Y, Koga, A., Jindo, T., Narita, T., Naruse, K., Ohishi, K., Nogata, K., Shin-I, T., Asakawa, S., Shimizu. N., Miyamoto, T., Mochijiki, T., Yokoyama, T., Hori, H., Takeda, T., Kohara, Y., Wakamatsu, Y.
    • 雑誌名

      Plos ONE 4(7)

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cell Cycle Progression, and Teleost Organ Development2008

    • 著者名/発表者名
      Iwanami, N., Higuchi, T., Sasano, Y., Fujiwara, T., Hoa, V. Q., Okada, M., Talukder, S. R., Kunimatsu, S., Li, J., Saito, F., Bhattacharya, C., Matin, A., Sasaki, T., Shimizu. N., Mitani, H., Himmelbauer, H., Momoi, A., Kondoh, H., Furutani-Seiki, M., Takahama, Y.
    • 雑誌名

      PLoS Genet 4(8)

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Myocyte enhancer factor 2 regulates expression of medaka Oryzias latipes fast skeletal myosin heavy chain genes in a temperature-dependent manner2008

    • 著者名/発表者名
      Liang, C. S., Ikeda, D., Kinoshita, S., Shimizu, A., Sasaki, T., Asakawa, S., Shimizu. N., Watabe, S.
    • 雑誌名

      Gene 407

      ページ: 42-53

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] UTGB/medaka : Genomic Resource Database for Medaka Biology2008

    • 著者名/発表者名
      Ahsan, B., Kobayashi, D., Yamada, T., Kasahara, M., Sasaki, S., Saito, T. L., Nagayasu, Y., Doi, K., Nakatani, Y, Qu, W., Jindo, T., Shimada, A., Naruse, K., Toyoda, A., Kuroki, Y., Fujiyama, A., Sasaki, T., Shimizu, A., Asakawa, S., Shimizu. N., Hashimoto, S. I., Yang, J., Lee, Y. Matsushima, K., Sugano, S., Sakaizumi M, Narita T, Ohishi K, Haga S, Ohta F, Nomoto H, Nogata K, Morishita, T., Endo, T., Shin-I., T., Takeda, H., Kohara, Y., Morishita, S.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 36

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] UTGB/medaka : Genomic Resource Database for Medaka Biology2008

    • 著者名/発表者名
      Ahsan, B.
    • 雑誌名

      Nucleic Acis Res. 36

      ページ: 747-752

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] WDR55 is a Nucleolar Modulator of Ribosomal RNA Synthesis, cell Cycle Progression, and Teleost Organ Developraent2008

    • 著者名/発表者名
      Iwanami, N.
    • 雑誌名

      PLoS Genet. 4

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Radiation hybrid maps of Medaka chromosomes LG 12, 17, and 222007

    • 著者名/発表者名
      Su, F., Osada, Y., Ekker, M., Chevrette, M., Shimizu, A., Asakawa, S., Shiohama, A., Sasaki, T., Shimizu. N., Yamanaka, T., Sasado, T., Mitani, H., Geisler, R., Kondoh, H., Furutani-Seiki, M.
    • 雑誌名

      DNA Res 14(3)

      ページ: 135-40

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The hotei mutation of medaka in the anti-Mullerian hormone receptor causes the dysregulation of germ cell and sexual development2007

    • 著者名/発表者名
      Morinaga, C., Saito, D., Nakamura, S., Sasaki, T., Asakawa, S., Shimizu, N., Mitani, H., Furutani-Seiki, M., Tanaka, M., Kondoh, H.
    • 雑誌名

      PNAS. 104(23)

      ページ: 9691-9696

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The medaka draft genome and insights into vertebrate genome evolution.2007

    • 著者名/発表者名
      Kasahara, M.
    • 雑誌名

      Nature 447

      ページ: 714-719

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The DNA Sequence of Medaka Chromosome LG22.2007

    • 著者名/発表者名
      Sasaki, T.
    • 雑誌名

      Genomics 89

      ページ: 124-133

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] カオナシ遺伝子群の解析およびオンライン画像データベースの構築2008

    • 著者名/発表者名
      浅川修一, 清水厚志, 佐々木貴史, 清水信義
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      (神戸ポートアイランド) 神戸
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] カオナシ遺伝子群の解析およびオンライン画像データベースの構築2008

    • 著者名/発表者名
      浅川 修一
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学大会合同大会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] カオナシ遺伝子群のノックダウン解析およびオンラインデータベースの構築2007

    • 著者名/発表者名
      清水厚志, 浅川修一, 佐々木貴史, 清水信義
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      (パシフィコ横浜) 横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] カオナシ遺伝子群のノックダウン解析およびオンラインデータベースの構築2007

    • 著者名/発表者名
      清水 厚志
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会(BMB2007)
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] The American Society of Human Genetics 57th Annual Meeting2007

    • 著者名/発表者名
      Shimizu, A, Asakawa, S., Sasaki, T., Shimizu. N., An On-line Database System for Knock-down Analysis of KAO-NASHI Genes
    • 学会等名
      San Diego
    • 年月日
      2007-10-26
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] An On-line Database System for Knock-down Analysis of KAO-NASHI Genes2007

    • 著者名/発表者名
      清水 厚志
    • 学会等名
      第56回アメリカ人類遺伝学会
    • 発表場所
      米国サンディエゴ
    • 年月日
      2007-10-26
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] Encyclopedia of Life Sciences;Comparing the Human and Medaka Genomes2008

    • 著者名/発表者名
      Sasaki, T.
    • 出版者
      NPG(Nature Pubhshing Group)(in press)
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考] N-K高校講座生物第23回 第3部 遺伝 20071015

    • URL

      http://www.nhk.or.jp/kokokoza/tv/seibutsu/archive/resume023.htm

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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