RND型トランスポーターの結晶構造に基づく機能解析

• 研究課題/領域番号: 19207009
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 東京工業大学 (2008-2009); 大阪大学 (2007)
• 研究代表者: 村上 聡 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (30300966)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 42,380千円 (直接経費: 32,600千円、間接経費: 9,780千円); 2009年度: 15,080千円 (直接経費: 11,600千円、間接経費: 3,480千円); 2008年度: 17,940千円 (直接経費: 13,800千円、間接経費: 4,140千円); 2007年度: 9,360千円 (直接経費: 7,200千円、間接経費: 2,160千円)
• キーワード: 多剤排出トランスポーター / 結晶化 / X線結晶構造解析 / 多剤耐性 / 膜輸送 / 構造解析 / 薬剤耐性 / 構造生物学 / 線結晶構造解析 / 膜輸送体 / トランスポーター

研究概要

院内感染などに見られる多剤耐性化の主要な原因の一つであるRND型多剤排出トランスポーターの作動メカニズムの本質的理解を目指し、立体構造情報の高解像度化を進めるとともに、得られた結晶構造に基づく機能解析を進めた。得られた結晶構造に基づく蛋白質工学的解析を行い、基質透過経路のなかほどに基質選択性に関わるフィルター様の働きを持つ部位を見いだした。また、これまで極めて困難であったRND型トランスポーターの直接的な生化学的解析を行う手法としてグラム陽性細菌由来のRNDトランスポーターホモログを用いる方法を考案した。グラム陽性細菌由来RND型トランスポーターにおける薬剤排出研究はこれまでほとんど行われてこなかったが、グラム陽性菌のRND型トランスポーターも実際に薬剤を排除することが実験的に示された。また、これらのターゲットとした膜蛋白質の大量発現に成功し、結晶化が可能な高純度のサンプルを得ることにも成功している。それらの結晶化に際し、フェムト秒レーザー照射や微量溶液撹拌のほか、新たに開発中の高濃度アガロースゲル中での結晶化など新たな結晶化技術の開発し特許申請を行うと共に、それらを適用して現在もトランスポーターの結晶化を行った。大腸菌AcrBについてはは分解能が2.5Å分解能にまで向上した。

研究成果

• [雑誌論文] Enhancement of femtosecond laser-induced nucleation of protein in a gel solution(043702) (2010)
  • 著者名/発表者名: Ryota Murai, Hiroshi Y. Yoshikawa, Yoshinori Takahashi, Mihoko Maruyama, Shigeru Sugiyama, Gen Sazaki, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Hiroyoshi Matsumura, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori.
  • 雑誌名: Appl. Phys. Lett. 96 ページ: 1-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Enhancement of femtodecond laser-induced nucleation of protein in a gel solution (043702) (2010)
  • 著者名/発表者名: Ryota Murai, Hiroshi Y.Yoshikawa, Yoshinori Takahashi, Mihoko Maruyama, Shigeru Sugiyama, Gen Sazaki, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Hiroyoshi Matsumura, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori.
  • 雑誌名: Appl.Phys.Lett. 96 ページ: 1-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Femtosecond laser processing of protein crystals grown in agarose gel (2009)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Hasenaka, Shigeru Sugiyama, Mika Hirose, Noriko Shimizu, Tomoya Kitatani, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Hiroyoshi Matsumura.
  • 雑誌名: J. Cryst. Growth 312 ページ: 73-78
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Manipulating Tool for Protein Microcrystals in Solution Using Adhesive Materials(118001) (2009)
  • 著者名/発表者名: Tomoya Kitatani, Hiroaki Adachi, Shigeru Sugiyama, Hiroyoshi Matsumura, Ryota Murai, Yoshinori Takahashi, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Kazufumi Takano.
  • 雑誌名: Jpn. J. Appl. Phys. 48 ページ: 1-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Promotion of Crystal Nucleation of Protein by Semi-Solid Agarose Gel(125501) (2009)
  • 著者名/発表者名: Kana Tanabe, Mika Hirose, Ryota Murai, Shigeru Sugiyama, Noriko Shimizu, Mihoko Maruyama, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Yusuke Mori, Eiichi Mizohata, Tsuyoshi Inoue, Hiroyoshi Matsumura.
  • 雑誌名: Appl. Phys. Express 2 ページ: 1-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] Growth of Large Protein Crystals by Top-Seeded Solution Growth Together with the Floating and Solution-Stirring Technique (2009)
  • 著者名/発表者名: Noriko Shimizu, Shigeru Sugiyama, Mihoko Maruyama, Hiroshi Y. Yoshikawa, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue Hiroyoshi Matsumura, Yusuke Mori.
  • 雑誌名: Cryst. Growth Des. 9 ページ: 5227-5232
  • 査読あり
• [雑誌論文] Femtosecond Laser Processing of Agarose Gel Surrounding Protein Crystals for Development of an Automated Crystal Capturing System(105502) (2009)
  • 著者名/発表者名: Shigeru Sugiyama, Hitoshi Hasenaka, Mika Hirose, Noriko Shimizu, Tomoya Kitatani, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Hiroyoshi Matsumura.
  • 雑誌名: Jpn. J. Appl. Phys. 48 ページ: 1-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] 多剤耐性 (2009)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 雑誌名: Multi-drug resistance Medical Science Digest 35 ページ: 346-347
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein Crystallization in Agarose Gel 4 with High Strength: Developing an Automated System for Protein Crystallographic Processes(075502) (2009)
  • 著者名/発表者名: Shigeru Sugiyama, Kana Tanabe, Mika Hirose, Tomoya Kitatani, Hitoshi Hasenaka, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Yusuke Mori, Tsuyoshi Inoue, Hiroyoshi Matsumura.
  • 雑誌名: Jpn. J. Appl. Phys. 48 ページ: 1-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamic nature of disulfide bond formation catalysts revealed by crystal structures of DsbB (2009)
  • 著者名/発表者名: Keiji Inaba, Satoshi Murakami, Atsushi Nakagawa, Hiroka Iida, Mai Kinjo, Koreaki Ito, Mamoru Suzuki.
  • 雑誌名: EMBO J. 28 ページ: 779-791
  • 査読あり
• [雑誌論文] Femtosecond laser-induced nucleation of protein in agarose gel (2009)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Y. Yoshikawa, Ryota Murai, Shigeru Sugiyama, Gen Sazaki, Tomoya Kitatani, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Hiroyoshi Matsumura, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Kazufumi Takano, Yusuke Mori.
  • 雑誌名: J. Cryst. Growth 311 ページ: 956-959
  • 査読あり
• [雑誌論文] Femtosecond laser-induced nucleation of protein in agarose gel (2009)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Y.Yoshikawa, Ryota Murai, Shigeru Sugiyama, Gen Sazaki, Tomoya Kitatani, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Hiroyoshi Matsumura, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Kazufumi Takano, Yusuke Mori.
  • 雑誌名: J.Cryst.Growth 311 ページ: 956-959
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamic nature of disulfide bond formation catalysts revealed by crystal structures of DsbB. (2009)
  • 著者名/発表者名: Keiji Inaba, Satoshi Murakami, Atsushi Nakagwa, Hiroka Iida, Mai Kinjo, Koreaki Ito, Mamoru Suzuki.
  • 雑誌名: EMBO J. 28 ページ: 779-791
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein Crystallization in Agarose Gel with High Strength : Developing an Automated System for Protein Crystallographic Processes (075502) (2009)
  • 著者名/発表者名: Shigeru Sugiyama, Kana Tanabe, Mika Hirose, Tomoya Kitatani, Hitoshi Hasenaka, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Yusuke Mori, Tsuyoshi Inoue, Hiroyoshi Matsumura.
  • 雑誌名: Jpn.J.Appl.Phys. 48 ページ: 1-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] 多剤耐性 Multi-drug resistance (2009)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 雑誌名: Medical Science Digest 35 ページ: 346-347
  • 査読あり
• [雑誌論文] Femtosecond laser Processing of Agarose Gel Surrounding Protein Crystals for Development of an Automated Crystal Capturing System(105502) (2009)
  • 著者名/発表者名: Shigeru Sugiyama, Hitoshi Hasenaka, Mika Hirose, Noriko Shimizu, Tomoya Kitatani, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Hiroyoshi Matsumura
  • 雑誌名: Jpn. J. Appl. Phys. 48 ページ: 1-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] Growth of Large Protein Crystals by Top-Seeded Solution Growth Together with the Floating and Soulution-Stirring Technique (2009)
  • 著者名/発表者名: Noriko Shimizu, Shigeru Sugiyama, Mihoko Maruyama, Hiroshi Y.Yoshikawa, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue Hiroyoshi Matsumura, Yusuke Mori.
  • 雑誌名: Cryst.Growth Des. 9 ページ: 5227-5232
  • 査読あり
• [雑誌論文] Promotion of Crystal Nucleation of Protein by Semi-Solid Agarose Gel (125501) (2009)
  • 著者名/発表者名: Kana Tanabe, Mika Hirose, Ryota Murai, Shigeru Sugiyama, Noriko Shimizu, Mihoko Maruyama, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Yusuke Mori, Eiichi Mizohata, Tsuyoshi Inoue, Hiroyoshi Matsumura.
  • 雑誌名: Appl.Phys.Express 2 ページ: 1-3
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Manipulating Tool for Protein Microcrystals in Solution Using Adhesive Materials (118001) (2009)
  • 著者名/発表者名: Tomoya Kitatani, Hiroaki Adachi, Shigeru Sugiyama, Hiroyoshi Matsumura, Ryota Murai, Yoshinori Takahashi, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Kazufumi Takano.
  • 雑誌名: Jpn.J.Appl.Phys. 48 ページ: 1-2
  • 査読あり
• [雑誌論文] Femtosecond laser processing of protein crystals grown in agarose gel (2009)
  • 著者名/発表者名: Hitoshi Hasenaka, Shigeru Sugiyama, Mika Hirose, Noriko Shimizu, Tomoya Kitatani, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Hiroyoshi Matsumura.
  • 雑誌名: J.Cryst.Growth 312 ページ: 73-78
  • 査読あり
• [雑誌論文] Femtosecond laser-induced nucleation of protein in agalose gel (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Y. Yoshikawa, et al.
  • 雑誌名: J. Cryst. Growth 311 ページ: 956-959
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dynamic nature of disulphide bond formation catalysts revealed by crystal structures of DsbB. (2009)
  • 著者名/発表者名: K. Inaba, et al.
  • 雑誌名: EMBO J. 28 ページ: 779-791
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evaluation and Improvement of a Technique to Manipulate Protein Crystals in Solution (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomoya Kitatani, Hiroaki Adachi, Shigeru Sugiyama, Hiroyoshi Matsumura, Ryota Murai, Yoshinori Takahashi, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Kazufumi Takano.
  • 雑誌名: Jpn. J. Appl. Phys. 47 ページ: 8995-8997
  • NAID: 40016389649
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of Ca2+-free primary Ca2+-sensor of Na+/Ca2+ exchanger (2008)
  • 著者名/発表者名: Masashi Mima, Chika Kawai, Kumsun Paku, Koji Tomoo, Toshimasa Ishida, Shigeru Sugiyama, Hiroshi Matsumura, Tomoya Kitatani, Hiroshi Y. Yoshikawa, Syou Maki, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Satomi Kita, TakahMasashi Mima
  • 雑誌名: Acta Crystallogr F64 ページ: 1125-1127
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary neutron diffraction studies of HIV-1 protease cocrystallized with inhibitor KNI-272 (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Matsumura, Motoyasu Adachi, Shigeru Sugiyama, Shino Okada, Megumi Yamakami, Taro Tamada, Koushi Hidaka, Yoshio Hayashi, Tooru Kimura, Yoshiaki Kiso, Tomoya Kitatani, Syou. Maki, Hiroshi Y. Yoshikawa, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi MurakaHiroshi Matsumura, Motoyasu Adachi, Shigeru Su
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. F64 ページ: 1003-1006
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of an RNA aptamer in complex with the human IgG Fc fragment (2008)
  • 著者名/発表者名: Shigeru Sugiyama, Yusuke Nomura, Taiichi Sakamoto, Tomoya Kitatani, Asako Kobayashi, Shin Miyakawa, Yoshinori Takahashi, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Yoshikazu Nakamura, Hiroyoshi Matsumura.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. F64 ページ: 942-944
  • 査読あり
• [雑誌論文] Functional role of transmembrane Helix 6 in drug binding and transport by the ABC transporter MsbA (2008)
  • 著者名/発表者名: Barbara Woebking, Saroj Velamakanni, Luca Federici, Markus A. Seeger, Satoshi Murakami, Hendrik van Veen.
  • 雑誌名: Biochemistry. 47 ページ: 10904-10914
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multidrug efflux transporter, AcrB-the pumping mechanism (2008)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 雑誌名: Curr. Opin. Struct. Biol 18 ページ: 459-465
  • 査読あり
• [雑誌論文] Laser energy dependence on femtosecond laser-induced nucleation of protein (2008)
  • 著者名/発表者名: Hiroshi Y. Yoshikawa, Ryota Murai, Syou Maki, Tomoya Kitatani, Shigeru Sugiyama, Gen Sazaki, Hiroaki Adachi, Tsuyoshi Inoue, Hiroyoshi Matsumura, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Takatomo Sasaki, Yusuke Mori.
  • 雑誌名: Appl. Phys. A 93 ページ: 911-915
  • 査読あり
• [雑誌論文] Effect of solution flow by rotary shaker on protein crystallization (2008)
  • 著者名/発表者名: Ryota Murai, Hiroshi Y. Yoshikawa, Hisato Kawahara, Syou Maki, Shigeru Sugiyama, Tomoya Kitatani, Hiroaki Adachi, Kazufumi Takano, Hiroyoshi Matsumura, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Takatomo Sasaki, Yusuke Mori.
  • 雑誌名: J. Cryst. Growth 310 ページ: 2168-2172
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein crystallization in a 100 nl solution with new stirring equipment (2008)
  • 著者名/発表者名: Syou Maki, Ryota Murai, Hiroshi Y. Yoshikawa, Tomoya Kitatani, Shinya Nakata, Hisato Kawahara, Hitoshi Hasenaka, Asako Kobayashi, Shino Okada, Shigeru Sugiyama, Hiroaki Adachi, Hiroshi Matsumura, Kazufumi Takano, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, TakatomoSyou Maki, Ryota Mura
  • 雑誌名: J. Synchrotron Rad. 15 ページ: 269-272
  • 査読あり
• [雑誌論文] New Technique of Manipulating a Protein Crystal Using Adhesive Material (2008)
  • 著者名/発表者名: Tomoya Kitatani, Shigeru Sugiyama, Hiroyoshi Matsumura, Hiroaki Adachi, Hiroshi Y. Yoshikawa, Syou Maki, Satoshi Murakami, Tsuyoshi Inoue, Yusuke Mori, Kazufumi Takano.
  • 雑誌名: Appl. Phys. Express 1 ページ: 1-3
  • NAID: 10025079731
  • 査読あり
• [雑誌論文] ultidrug recognition and pumping by bacterial multidrug transporter ~ A structural view (2008)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 雑誌名: Protein Science 17 ページ: 168-168
  • 査読あり
• [雑誌論文] 多剤耐性の仕組み (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 雑誌名: 日本臨床 66 ページ: 193-203
• [雑誌論文] Effect of solution flow by rotary shaker on protein crystallization (2008)
  • 著者名/発表者名: R. Murai, et al.
  • 雑誌名: J. Cryst. Growth 310 ページ: 2168-2172
  • 査読あり
• [雑誌論文] Protein crystallization in a 100 nl solution with new stirring equipment (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Maki, et al.
  • 雑誌名: J. Synchrotron Rad. 15 ページ: 269-272
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multidrug efflux transporter, AcrB-the pumping mechanism (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Murakami
  • 雑誌名: Curr. Opin. Struct. Biol 18 ページ: 459-465
  • 査読あり
• [雑誌論文] Laser energy dependence on femtosecond laser-induced nucleation of protein (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Y. Yoshikawa, et al.
  • 雑誌名: Appl. Phys. A 93 ページ: 911-915
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of an RNA aptamer in complex with the human IgG Fc fragment (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Sugiyama, et al.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. F64 ページ: 942-944
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary neutron diffraction studies of HIV-1 protease cocrystallized with inhibitor KNI-272 (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Matsumura, et al.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. F64 ページ: 1003-1006
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of Ca2+-free primary Ca2+-sensor of Na+/Ca2+exchanger (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Mima, et al.
  • 雑誌名: Acta Crystallogr. F64 ページ: 1125-1127
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evaluation and Improvement of a Technique to Manipulate Protein Crystals in Solution (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Kitatani, et al.
  • 雑誌名: Jpn. J. Appl. Phys. 47 ページ: 8995-8997
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structures of a bacterial multidrug transporter reveal a functionally rotating mechanism. (2007)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami, Akihito Yamaguchi
  • 雑誌名: FEBS Journa 274Sup.1 ページ: 119-119
  • 査読あり
• [雑誌論文] 多剤排出トランスポーターの構造と機能結晶構造から明らかになった機能的回転メカニズム (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 雑誌名: 蛋白質核酸酵素 52 ページ: 406-414
  • NAID: 40015447929
  • 査読あり
• [雑誌論文] 多剤排出トランスポーターの結晶構造解析により明らかになった機能的回転メカニズム (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡
  • 雑誌名: 生物物理 47 ページ: 309-316
  • NAID: 110006418741
• [雑誌論文] 多剤排出トランスポーターの構造と機能 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡
  • 雑誌名: 表面科学 28 ページ: 184-191
  • NAID: 10019506734
• [雑誌論文] Crystal structures of a bacterial multidrug transporter reveal a functionally rotating mechanism (2007)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 雑誌名: the FEBS Journal 274 ページ: 119-119
  • 査読あり
• [雑誌論文] 大腸菌の異物排出トランスポーターAcrBの構造と異物認識機構 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡、山口 明人
  • 雑誌名: 生化学 79 ページ: 542-549
• [雑誌論文] 多剤排出トランスポーターの構造と機能 結晶構造から明らかになった機能的回転メカニズム (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡
  • 雑誌名: 蛋白質核酸酵素 52 ページ: 406-414
  • NAID: 40015447929
• [学会発表] 細菌の薬剤耐性化機構の結晶学的解析Mechanism of bacterial multi-drug resistance based on the crystal structure of efflux transporter (2010)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 学会等名: 第83回日本細菌学会総会
  • 発表場所: パシフィコ横浜(横浜)
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] RND transporter, AcrB-The pumping mechanism (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 3rd FEBS Special Meeting 『ATP-Binding Cassette Protein : Form Multidrug Resistance to Genetic Diseases』
  • 発表場所: Hotel Grauer Bar(オーストリア・インスブルック)
  • 年月日: 2010-03-02
• [学会発表] Structure and Function of Multi-drug Transporter AcrB (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 4th INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON RECENT TRENDS IN MACROMOLECULAR STRUCTURE AND FUNCTION
  • 発表場所: マドラス大学(インド・チェンナイ)
  • 年月日: 2010-01-22
• [学会発表] 細菌の薬剤耐性化機構の結晶学的解析Mechanism of bacterial multi-drug resistance based on the crystal structure of efflux transporter (2010)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 学会等名: 第83回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] RNDtransporter, AcrB-Thepumping mechanism (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 3rd FEBS Special Meeting『ATP-Binding Cassette Protein:From Multidrug Resistance to Genetic Diseases』
  • 発表場所: オーストリア
• [学会発表] Structure and Function of Multi-drug Transporter AcrB (2010)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 4th INTERNATIONAL SYMPOSIUM ON RECENT TRENDS IN MACROMOLECULAR STRUCTURE AND FUNCTION
  • 発表場所: インド
• [学会発表] Structure and Function of the Drug EffluxTransporter (2009)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 第一回台湾膜タンパク質・生物膜結晶と構造生物学シンポジウム
  • 発表場所: 国立台湾大学(台湾・台北)
  • 年月日: 2009-12-10
• [学会発表] Multidrug Efflux Transporter -The Pumping Mechanism (2009)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: Innovative Nanoscience of Supermolecular Motor Proteins Working in Biomembranes
  • 発表場所: 京都大学医学部 芝蘭会館(京都)
  • 年月日: 2009-09-08
• [学会発表] Multidrug Efflux Transporter -The Pumping Mechanism (2009)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 1st International Multidisciplinary Workshop 『Membrane Biology Frontiers -Dynamics, Energy, Structure and Technology-』
  • 発表場所: Royal Myconian Hotel, Elia Beach, Mykonos, Greece(ギリシャ・ミコノス)
  • 年月日: 2009-05-30
• [学会発表] Structure and Function of the Drug EffluxTransporter (2009)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 第一回台湾膜タンパク質・生物膜結晶構造生物学シンポジウム
  • 発表場所: 台湾
• [学会発表] Multidrug Efflux Transporter-The Pumping Mechanism (2009)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 1st International Multidisciplinary Workshop『Membrane Biology Frontiers-Dynamics, Energy, Structure and Technology-』
  • 発表場所: ギリシャ
• [学会発表] Transport by AcrB;a Structual approach (2009)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: Gordon Reseach Conferences
  • 発表場所: アメリカ
• [学会発表] 多剤排出輸送体の結晶構造に基づく多基質認識と輸送メカニズム (2009)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 学会等名: 第82回日本薬理学会年会
  • 発表場所: 横浜
• [学会発表] Transport by AcrB; a structural approach. (2009)
  • 著者名/発表者名: S. Murakami
  • 学会等名: The Gordon Research Conference (Multi-Drug Efflux Systems)
  • 発表場所: Galveston, TX, USA
• [学会発表] 多剤排出輸送体の結晶構造に基づく多基質認識と輸送メカニズム (2009)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡
  • 学会等名: 第82回日本薬理学会年会シンポジウム
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] 高粘性溶液中でのフェムト秒レーザー誘起タンパク質結晶核発生 (2009)
  • 著者名/発表者名: 村井良多ら
  • 学会等名: 第56回応用物理学関係連合講演会
  • 発表場所: 筑波大学筑波キャンパス(茨城県つくば市)
• [学会発表] フェムト秒レーザーを用いたタンパク質結晶加工 (2009)
  • 著者名/発表者名: 長谷中仁志ら
  • 学会等名: 第22回日本放射光学会年会
  • 発表場所: 東京大学本郷キャンパス
• [学会発表] 多剤排出トランスポーターによる多基質認識とその排出メカニズム (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 学会等名: 第7回微生物研究会微生物研究会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2008-06-14
• [学会発表] 細菌排出システムの構造機能解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2008-03-25
• [学会発表] Structure and mechanism of bacterial multi-drug efflux systems (2008)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: Gordon Research Conferences (NEW ANTIBACTERIAL DISCOVERY & DEVELOPMENT)
  • 発表場所: II Ciocco Hotel and Resort Lucca (Barga), Italy
  • 年月日: 2008-03-12
• [学会発表] 多剤排出トランスポーターによる薬剤排出機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: 千里ライフサイエンスセミナー 「生命機能を支える生体超分子の高次構造と機能」
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2008-02-28
• [学会発表] Multidrug recognition and pumping by bacterial multidrug transporter-A structural view (2008)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: GPCRシンポジウム-膜タンパク質結晶構造解析のフロンティア-
  • 発表場所: 兵庫
  • 年月日: 2008-02-26
• [学会発表] Multidrug recognition and pumping by bacterial multidrug efflux transporter-A structural view (2008)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: Katzir Workshop on The Unbearable Complexity of Life
  • 発表場所: Tel Aviv University, Israel
  • 年月日: 2008-02-11
• [学会発表] Multidrug recognition and pumping by bacterial multidrug efflux transporter-A structural view (2008)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: International Symposium on Recent Trends in Macromolecular Structure and Function
  • 発表場所: Chennai, India
  • 年月日: 2008-01-07
• [学会発表] 大腸菌多剤排出トランスポーターによる薬剤認識および排出機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 学会等名: 日本生物物理学会第46回年会
  • 発表場所: 福岡
• [学会発表] Bacterial multi drug efflux transporter AcrB, -The pumping mechanism (2008)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: 大阪
• [学会発表] Multidrug Recognition and Pumping by Bacterial Multidrug Transporter-A structual View (2008)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 22nd Annual Symposium of The Protein Society
  • 発表場所: アメリカ
• [学会発表] 大腸菌多剤排出トランスポーターによる薬剤認識および排出機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 学会等名: 第8回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Protein Crystallization by Femtosecond Laser Irradiation and Solution Stirring (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Takano, et al.
  • 学会等名: The 4th Asian Conference on Crystal Growth and Crystal Technology (CGCT-4)
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] 大腸菌多剤排出トランスポーターによる薬剤認識および排出機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡
  • 学会等名: 第8回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: タワーホール船堀
• [学会発表] Multidrug Recognition and Pumping by Bacterial Multidrug Transporter -A Structural View (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Murakami
  • 学会等名: 22nd Annual Symposium of The Protein Society
  • 発表場所: San Diego, CA, USA
• [学会発表] Protein Crystallization by Femtosecond Laser Ablation in Supersaturated Solution (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Y. Yoshikawa, et al.
  • 学会等名: IUPAC Symposium on Photochemistry
  • 発表場所: Gothenburg, Sweden
• [学会発表] Bacterial Multidrug Efflux Transporter AcrB - The pumping mechanism. (Micro Symposium on New membrane protein structure. ) (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Murakami
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: グランキューブ大阪
• [学会発表] 大腸菌多剤排出トランスポーターによる薬剤認識および排出機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡
  • 学会等名: 日本生物物理学会第46回年会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡市博多区)
• [学会発表] Development of a Novel Mounting Method for Protein Crystals (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Kitatani, et al.
  • 学会等名: The 4th Asian Conference on Crystal Growth and Crystal Technology (CGCT-4)
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Growth of large protein crystals by hanging a seed crystal (CGCT-4) (2008)
  • 著者名/発表者名: N. Shimizu, et al.
  • 学会等名: The 4th Asian Conference on Crystal Growth and Crystal Technology
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] 膜タンパク質の結晶育成〜膜輸送体の結晶構造 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡
  • 学会等名: 第7回国際バイオフォーラム
  • 発表場所: 東京ビッグサイト
• [学会発表] フェムト秒レーザー照射によるタンパク質核発生メカニズムの解明と最適条件の検討 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村井良多ら
  • 学会等名: 第38回結晶成長国内会議
  • 発表場所: 仙台市戦災復興記念館(宮城県仙台市)
• [学会発表] New Technique of Manipulating a Protein Crystal (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Takano, et al.
  • 学会等名: The 2008 Annual Meeting of the American Crystallographic Association (ACA2008)
  • 発表場所: Knoxville Convention Center, Knoxville, Tennessee, USA
• [学会発表] フェムト秒レーザー照射によるタンパク質結晶化の原理解明研究 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村井良多ら
  • 学会等名: 第8回日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: タワーホール船堀
• [学会発表] Study on Nucleation Mechanism with Femtosecond Laser Irradiation (2008)
  • 著者名/発表者名: R. Murai, et al.
  • 学会等名: 1st Global COE Student Conference on Innovative Electronic Topics SCIENT2008
  • 発表場所: 大阪大学
• [学会発表] Crystal structure of RNA aptamer in complex with human immunoglobulin G (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Matsumura, et al.
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: グランキューブ大阪
• [学会発表] Growth of high-quality and large crystals of HIV protease-in-hibitor complex for neutron crystallography (2008)
  • 著者名/発表者名: M. Yamakami, et al.
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: グランキューブ大阪
• [学会発表] Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of RNA aptamer in complex with human immunoglobulin G. (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Sugiyama, et al.
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: グランキューブ大阪
• [学会発表] Study on femtosecond laser-induced nucleation dynamics of proteins (2008)
  • 著者名/発表者名: R. Murai, et al.
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: グランキューブ大阪
• [学会発表] Wavelength dependence of the crystallization by the laser irradiation (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Hasenaka, et al.
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: グラシキューブ大阪
• [学会発表] The first direct observation of individual protein molecules on a protein crystal under forced solution-flow (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Kawahara, et al.
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: グランキューブ大阪
• [学会発表] Growth of large protein crystals for neutron crystallography by hanging a seed crystal (2008)
  • 著者名/発表者名: N. Shimizu, et al.
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: グランキューブ大阪
• [学会発表] Application of a novel mounting tool using adhesive for protein crystals (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Kitatani, et al.
  • 学会等名: XXI Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: グランキューブ大阪
• [学会発表] X-ray structure of RNA aptamer in complex with human immunoglobulin G (2008)
  • 著者名/発表者名: S. Sugiyama, et al.
  • 学会等名: 第46回日本生物物理学会
  • 発表場所: 福岡国際会議場(福岡市博多区)
• [学会発表] 多剤排出トランスポーターによる多基質認識と輸送機耕を考える (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: 第45回生物物理学会年会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2007-12-23
• [学会発表] Molecular mechanism of multidrug efflux transporter (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] 膜輸送体作動メカニズムの結晶学的解明 (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡、中島 良介、松本 崇、近藤 洋平、津田 岳夫、小川 治夫、豊島 近
  • 学会等名: 第11回 Spring8シンポジウム
  • 発表場所: 兵庫
  • 年月日: 2007-10-29
• [学会発表] 膜タンパク質を含むターゲット蛋白質の精製 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 学会等名: 千里ライフサイエンス技術講習会第47回「蛋白質X線構造解析技術～発現からデータ処理まで～」
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2007-10-23
• [学会発表] 膜タンパク質を含むターゲット蛋白質の精製 (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: 千里ライフサイエンス技術講習会 第47回 「蛋白質X線構造解析技術 〜発現からデータ処理まで〜」
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2007-10-23
• [学会発表] Structural aspects of drug recognition and transport by bacterial multidrug efflux transporter (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: 財団法人 応用微生物学研究奨励会設立50周年記念東京大学創立130周年記念 第12回分生研シンポジウム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-10-11
• [学会発表] 多剤排出トランスポーターの結晶構造と薬剤排出メカニズム (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: サントリー生有研フォーラム 小分子を運ぶトランスポーター機能制御と機構解明に向けて
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2007-08-31
• [学会発表] Structure and mechanism of bacterial multi-drug efflux transporter (2007)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: 24th European Crystallographic Meeting
  • 発表場所: Marrakech, Morocco
  • 年月日: 2007-08-22
• [学会発表] Structure and mechanism of AcrAB bacterial multi-drug efflux pump (2007)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: Seminar
  • 発表場所: Imperial College London, London, England
  • 年月日: 2007-08-21
• [学会発表] Structure and mechanism of AcrAB bacterial multi-drug efflux pump (2007)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: AstraZeneca Membran Protein Day(Seminar)
  • 発表場所: イングランド
  • 年月日: 2007-08-20
• [学会発表] Structure and mechanism of AcrAB bacterial multi-drug efflux pump (2007)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: AstraZeneca Membran Protein Day(Seminar)
  • 発表場所: Alderlay Park, Macclesfield, UK
  • 年月日: 2007-08-20
• [学会発表] Structural studies of multi-drug efflux transporter (2007)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: 9th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation
  • 発表場所: Manchester, England
  • 年月日: 2007-08-15
• [学会発表] 多剤排出トランスポーターによる薬剤認識および排出機構 (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: 日本ヒトプロテオーム機構第5回大会〜プロテオミクス生物学から医科学研究へ向かう新たな潮流〜
  • 発表場所: 日本科学未来館、東京
  • 年月日: 2007-07-31
• [学会発表] 膜タンパク質精製への新しいアプローチ (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: GE Healthcare, Challenging Protein Purification Seminar
  • 発表場所: 大阪
  • 年月日: 2007-07-19
• [学会発表] 膜タンパク質精製への新しいアプローチ (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: GE Healthcare, Challenging Protein Purification Seminar
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-07-19
• [学会発表] Crystal structures of a bacterial multidrug transporter reveal a function ally rotating mechanism (2007)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: 32nd FEBS Congress, Molecular Machines
  • 発表場所: Vienna, Austria
  • 年月日: 2007-07-08
• [学会発表] 多剤排出トランスポーターの結晶構造に基づく機能解明 (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: 第34回 生体分子科学討論会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2007-06-22
• [学会発表] 膜タンパク質の結晶育成〜膜輸送体の結晶構造 (2007)
  • 著者名/発表者名: ○村上 聡
  • 学会等名: 第6回国際バイオフォーラム
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-06-20
• [学会発表] Structure and mechanism of AcrAB bacterial multi-drug efflux pump (2007)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: Seminar
  • 発表場所: Scripps Inst., SanDiego
  • 年月日: 2007-05-25
• [学会発表] Structure and mechanism of AcrAB bacterial multi-drug efflux pump (2007)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: Seminar
  • 発表場所: TakedaSD, SanDiego
  • 年月日: 2007-05-24
• [学会発表] Structure and mechanism of AcrAB bacterial multi-drug efflux pump (2007)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: Seminar
  • 発表場所: Mpex Pharmaceuticals, Inc., SanDiego
  • 年月日: 2007-05-23
• [学会発表] Structure and mechanism of AcrAB bacterial multi-drug efflux pump (2007)
  • 著者名/発表者名: ○Satoshi Murakami
  • 学会等名: Seminar
  • 発表場所: UCSF, USA
  • 年月日: 2007-05-22
• [学会発表] 膜輸送体作動メカニズムの結晶学的解明 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上聡、中島良介、松本崇、近藤洋平1、津田岳夫1、小川治夫1、豊島近1
  • 学会等名: 第11回Spring8シンポジウム
  • 発表場所: 兵庫
• [学会発表] Structure and mechanism of bacterial multi-drug efflux transporter (2007)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 24th European Crystallographic Meeting
  • 発表場所: モロッコ
• [学会発表] Session1 Multi-Protein complex, Structural studies of multi-drug efflux transporter (2007)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 9th International Conference on Biology and Synchrotron Radiation
  • 発表場所: イングランド
• [学会発表] Crystal structures of a bacterial multidrug transporter reveal a functionally rotating mechanism (2007)
  • 著者名/発表者名: Satoshi Murakami
  • 学会等名: 32nd FEBS Congress, Molecular Machines
  • 発表場所: オーストリア
• [図書] やさしい原理から入るタンパク質科学実験:Iタンパク質をつくる-抽出・精製と合成 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 出版者: 化学同人
• [図書] シリーズ生物薬科学実験講座 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 出版者: 廣川書店
• [図書] 多剤耐性のしくみ (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡
  • 総ページ数: 11
  • 出版者: 日本臨床
• [図書] やさしい原理からはいるタンパク質科学実験法 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村上 聡
  • 総ページ数: 27
  • 出版者: 化学同人
• [図書] 生化学vol. 79 (2007)
  • 著者名/発表者名: 村上聡
  • 出版者: 日本生化学会
• [産業財産権] 有機高分子結晶製造装置 (2009)
  • 発明者名: 杉山成、安達宏昭、松村浩由、高野和文、村上聡、井上豪、森勇介、国宗範彰
  • 権利者名: 株式会社クニムネ
  • 産業財産権番号: 2009-275465
  • 出願年月日: 2009-12-03
• [産業財産権] 結晶製造方法、凍結結晶製造方法、結晶構造解析方法、結晶化スクリーニング方法、結晶化スクリーニング装置 (2008)
  • 発明者名: 杉山成、安達宏昭、松村浩由、高野和文、村上聡、井上豪、森勇介
  • 権利者名: 株式会社創晶(506243161)
  • 産業財産権番号: 2008-008561
  • 出願年月日: 2008-01-17
• [産業財産権] 粘着式ピンセット、粘着式ピンセット用部材、粒子の保持方法、粒子の解析方法および分析装置 (2007)
  • 発明者名: 安達宏昭、松村浩由、高野和文、村上聡、井上豪、森勇介、柴田和博、上野元信、山本浩司
  • 権利者名: 有限会社シバタシステムサービス
  • 産業財産権番号: 2007-296354
  • 出願年月日: 2007-11-15
• [産業財産権] 有機高分子結晶製造装置
  • 発明者名: 杉山成、安達宏昭、松村浩由、高野和文、村上聡、井上豪、森勇介、国宗範彰
  • 権利者名: 株式会社クニムネ
  • 産業財産権番号: 2009-275465