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葉緑体翻訳系に於ける5'非翻訳領域とコード領域の適合性を決める要因の探索

研究課題

研究課題/領域番号 19370021
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 植物生理・分子
研究機関名古屋市立大学

研究代表者

杉浦 昌弘  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 名誉教授 (80027044)

研究分担者 黒田 洋詩  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 研究員 (80381903)
中邨 真之  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 研究員 (60322145)
湯川 眞希  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 研究員 (00448705)
連携研究者 黒田 洋詩  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 研究員 (80381903)
中邨 真之  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 研究員 (60322145)
湯川 眞希  名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 研究員 (00448705)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
15,730千円 (直接経費: 12,100千円、間接経費: 3,630千円)
2008年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
2007年度: 8,320千円 (直接経費: 6,400千円、間接経費: 1,920千円)
キーワード葉緑体 / 翻訳 / タバコ / mRNA / in vitro系 / コード領域 / 5'UTR / In vitro / 適合配列
研究概要

植物細胞の中で光合成を行う葉緑体は盛んにタンパク質も作っている。そこで、葉緑体で有用タンパク質を生産する試みがなされたが、必ずしも成功しなかった。このことは、葉緑体のタンパク質合成の機構が動・植物の細胞質や細菌の機構とは違っていることを意味する。本研究で、葉緑体でのタンパク質合成にはメッセンジャーRNAの上流部分のみならずタンパク質のアミノ酸配列を規定する部分の一部も必要なことを明らかにした。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (44件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 10件) 学会発表 (29件) 図書 (2件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Selection of synonymous codons for better expression of recombinant proteins in tobacco chloroplasts2009

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, M. and M. Sugiura
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology (in press)

    • NAID

      10025181202

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A new in vitro translation system for non-radioactive assay from tobacco chloroplasts : effect of pre-mRNA processing on translation in vitro2009

    • 著者名/発表者名
      Yukawa M., H. Kuroda and M. Sugiura
    • 雑誌名

      Plant J 49

      ページ: 367-376

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Termination codon-dependent translation of partially overlapping ndhC-ndhK transcripts in chloroplasts2008

    • 著者名/発表者名
      Yukawa, M. and M. Sugiura
    • 雑誌名

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105

      ページ: 19550-19554

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Termination codon-dependent translation of partially overlapping ndhC-ndhK transcripts in chloroplasts2008

    • 著者名/発表者名
      Yukawa, Y., M. Sugiura
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 105

      ページ: 19549-19553

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Selection of synonymous codons for better expression of recombinant proteins in tobacco chloroplasts2008

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, M., M. Sugiura
    • 雑誌名

      Plant Biotechnology (in press)

    • NAID

      10025181202

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Translation of psbC mRNAs starts from the downstream GUG, not the upstream AUG, and requires the extended Shine-Dalgarno sequence in tobacco chloroplasts2007

    • 著者名/発表者名
      Kuroda, H., H. Suzuki, T. Kusumegi, T. Hirose, Y. Yukawa and M. Sugiura
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiol 48

      ページ: 1374-1378

    • NAID

      10027004706

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Translation efficiencies of synonymous codons are not always correlated with codon usage in tobacco chloroplasts2007

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, M. and M. Sugiura
    • 雑誌名

      Plant J 49

      ページ: 128-134

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A survey of expressed tRNA genes in the chromosome I of Arabidopsis using an RNA polymerase III-dependent in vitro transcription system2007

    • 著者名/発表者名
      Yukawa, Y., T. Mizutani, K. Akama and M. Sugiura
    • 雑誌名

      Gene 392

      ページ: 7-13

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Translation of psbC mRNAs starts from the downstream GUG, not the upstream AUG, and requires the extended Shine-Dalgarno sequence in tobacco chloroplasts2007

    • 著者名/発表者名
      Kuroda, H., H. Suzuki, T. Kusumegi, T. Hirose, Y. Yukawa and M. Sugiura
    • 雑誌名

      Plant Cell Physiology 48

      ページ: 1374-1378

    • NAID

      10027004706

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The complete structure of the cucumber(Cucumis sativus L.)chloroplast genome: its composition and comparative analysis2007

    • 著者名/発表者名
      Plader, W., Y. Yukawa, M. Sugiura and S. Malepszy
    • 雑誌名

      Cell. Mol. Biol. Lett. 12

      ページ: 582-594

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 葉緑体mRNAの5'非翻訳領域の切断と翻訳効率2009

    • 著者名/発表者名
      黒田洋詩、足達由佳、湯川泰、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第50回に本植物生理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体翻訳開始に関与するトランス因子2009

    • 著者名/発表者名
      黒田洋詩、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第50回に本植物生理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 同義コドンの選択によるコード領域の翻訳効率の変化について2009

    • 著者名/発表者名
      中邨真之、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第50回に本植物生理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] タバコ葉緑体ndhC-K mRNAにおける終止コドンに依存した翻訳開始機構2009

    • 著者名/発表者名
      湯川眞希、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第50回に本植物生理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] タバコ葉緑体翻訳反応における5'非翻訳領域とコード領域の適合性検証2009

    • 著者名/発表者名
      大羽祐衣、湯川眞希、杉浦昌弘、湯川泰
    • 学会等名
      第50回に本植物生理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Unique mechanisms of translation in higher plant chloroplasts.2008

    • 著者名/発表者名
      Sugiura, M., M. Yukawa, H. Kuroda, M. Nakamura
    • 学会等名
      The XVI Congress of the Federation of European Societies of Plant Biology
    • 発表場所
      Tampere, Finland
    • 年月日
      2008-08-18
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体mRNAの翻訳開始に必要なシス配列とトランス因子(口頭発表)2008

    • 著者名/発表者名
      黒田洋詩、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体psbD-psbC翻訳機構の解析2008

    • 著者名/発表者名
      足達由佳、黒田洋詩、杉浦昌弘、湯川泰
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] タバコ葉緑体ndhC-ndhK mRNAにみられる翻訳終結に依存した翻訳開始機構2008

    • 著者名/発表者名
      湯川眞希、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体mRNAのタンパク質コード領域に存在する翻訳調節領域の解析2008

    • 著者名/発表者名
      中邨真之、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体rps2 mRNA の翻訳に必要なシス配列2008

    • 著者名/発表者名
      杉浦昌弘、黒田洋詩
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] An active in vitro translation system from chloroplasts : a powerful tool to study mechanism of translation in chloroplasts2008

    • 著者名/発表者名
      Kuroda, H., M. Yukawa, H. Suzuki, Y. Yukawa and M. Sugiura
    • 学会等名
      International Symposium "The Ins and Outs of Chloroplasts"
    • 発表場所
      Osaka
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体の特異な翻訳機構 : コード領域内の必須配列2008

    • 著者名/発表者名
      杉浦昌弘、中邨真之
    • 学会等名
      日本植物学会第72回大会
    • 発表場所
      高知
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体ndhK遺伝子の翻訳開始点2008

    • 著者名/発表者名
      杉浦昌弘、湯川眞希
    • 学会等名
      日本遺伝学会第80回大会
    • 発表場所
      名古屋(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Unique mechanisms of translation in higher plant chloroplasts2008

    • 著者名/発表者名
      Sugiura, M., M. Yukawa, H. Kuroda and M. Nakamura
    • 学会等名
      The XVI Congress of the Federation of European Societies of Plant Biology, Tampere, Finland
    • 発表場所
      Selected speaker
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] タバコ葉緑体の同義コドン間の翻訳効率の測定2008

    • 著者名/発表者名
      杉浦昌弘、中邨真之
    • 学会等名
      第49回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体mRNAの翻訳調節におけるタンパク質コード領域の影響2008

    • 著者名/発表者名
      中邨真之、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第49回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体in vitro翻訳系を用いたatpE mRNA翻訳開始機構の解析2008

    • 著者名/発表者名
      黒田洋詩、鈴木晴香、湯川泰、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第49回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] タバコ葉緑体ndhC-K mRNAにおける翻訳開始機構に関する研究2008

    • 著者名/発表者名
      湯川眞希、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第49回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      札幌(口頭発表)
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Mechanisms of protein synthesis in higher plant chloroplasts2007

    • 著者名/発表者名
      Sugiura, M.
    • 学会等名
      10th International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis
    • 発表場所
      Gmunden, Austria
    • 年月日
      2007-09-11
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 葉緑体ゲノムにおけるコドン使用頻度と翻訳効率は必ずしも一致しない2007

    • 著者名/発表者名
      中邨真之、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第71回日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2007-05-19
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] タバコ葉緑体のSD様配列のないmRNAの翻訳開始に必要なシス領域とトランス因子の解析2007

    • 著者名/発表者名
      黒田洋詩、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第71回日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2007-05-19
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体のpsbCmRNAの翻訳は上流のAUGではなく下流のGUGから始まる2007

    • 著者名/発表者名
      黒田洋詩、鈴木晴香、久寿米木幸寛、廣瀬哲郎、湯川泰、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] SD様配列を持たない葉緑体mRNAの翻訳開始機構の解析2007

    • 著者名/発表者名
      黒田洋詩、杉浦昌弘
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体in vitro翻訳系を用いたatpE遺伝子の翻訳機構の解析2007

    • 著者名/発表者名
      鈴木晴香、黒田洋詩、杉浦昌弘、湯川泰
    • 学会等名
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 葉緑体同義コドン間の翻訳効率2007

    • 著者名/発表者名
      杉浦昌弘、中邨真之
    • 学会等名
      日本遺伝学会第79回大会
    • 発表場所
      岡山
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Mechanisms of protein synthesis in higher plant chloroplasts2007

    • 著者名/発表者名
      Sugiura, M
    • 学会等名
      10^<th> International Colloquium on Endocytobiology and Symbiosis, Gmunden, Austria
    • 発表場所
      invited lecture
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 光化学系IIサブユニットCP43をコードするタバコ葉緑体psbCの翻訳開始点はGUGである2007

    • 著者名/発表者名
      黒田洋詩、鈴木晴香、久寿米木幸寛、廣瀬哲郎、湯川泰、杉浦昌弘
    • 学会等名
      日本光合成研究会・公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡山
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Analysis of translation efficiencies between synonymous codons in tobacco chloroplasts with the aid of in vitro translation system

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, M. and M. Sugiura
    • 発表場所
      invited lecture
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] Springer2008

    • 著者名/発表者名
      Sugiura, M.
    • 出版者
      RNA editing in chloroplasts. In "RNA Editing"(H.U. Goringer, ed)Springer
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] RNA editing in chloroplasts. In"RNA Editing"(H.U.Goringer, ed)2008

    • 著者名/発表者名
      Sugiura, M.(分担執筆)
    • 総ページ数
      23
    • 出版者
      Springer-Verlag, Berlin Heidelberg
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/~sugiura/index.html

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/~sugiura/index.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.nsc.nagoya-cu.ac.jp/~sugiura/index.html

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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