• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

GatCABにおけるグルタミナーゼとキナーゼ反応のカップリング機構の解明

研究課題

研究課題/領域番号 19370037
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関北海道大学

研究代表者

姚 閔  北海道大学, 大学院・先端生命科学研究院, 准教授 (40311518)

研究分担者 田中 勲  北海道大学, 大学院・先端生命科学研究院, 教授 (70093052)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
18,720千円 (直接経費: 14,400千円、間接経費: 4,320千円)
2008年度: 7,410千円 (直接経費: 5,700千円、間接経費: 1,710千円)
2007年度: 11,310千円 (直接経費: 8,700千円、間接経費: 2,610千円)
キーワードGatCAB / グルタミナーゼ / キナーゼ / アンモニアチャネル / X線構造解析
研究概要

GatCABのアンモニアチャネルの開閉に重要と推定した残基の変異体調製に成功し、in vivoアッセイによって、E125が直接アンモニアの輸送に関与していることが検証された。SAXSを用いて得られた溶液中の構造情報は、tRNA^(Gln)のU1-A72がcradleドメインで、D-loopがC-tailドメインで認識することを示唆した。また、GatCABの1.9A分解能での構造解析に成功し、tRNA認識に重要であるGatBのC-tailドメインの構造を明らかにし、GatBに特徴的な配列を見い出した。更にGatCABとtRNA^(Gln)変異体のアッセイを行い、GatBのcradleドメインの3_(10)-helixとC-tailドメインに保存されたGlyがtRNA^(Gln)認識に重要であることが明らかになった。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (8件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Structural, Functional Characterization of the LldR from Corynebacterium glutamicum : a Transcriptional Repressor Involved in l-Lactate and Sugar Utilization2008

    • 著者名/発表者名
      Yong-Gui Gao, Hiroaki Suzuki, Hiroshi Itou, Yong Zhou, Yoshikazu Tanaka, Masaaki Wachi, Nobuhisa Watanabe, Isao Tanaka, Min Yao
    • 雑誌名

      Nucl. Acid Res 36

      ページ: 7110-7123

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Makoto Kimura, Crystal structure of an archaeal Ski2p-like protein from Pyrococcus horikoshii OT32008

    • 著者名/発表者名
      Xiaodong Zhang, Takashi Nakashima, Yoshimitsu Kakuta, Min Yao, Isao Tanaka
    • 雑誌名

      Protein Sci 17

      ページ: 136-145

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural and Functional Characterization of the LldR from Corynebacterium glutamicum : a Transcriptional Repressor Involved in 1-Lactate and Sugar Utilization2008

    • 著者名/発表者名
      Yong-Gui Gao
    • 雑誌名

      Nucl. Acid Res. 36

      ページ: 7110-7123

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of an archaeal Ski2p-like protein from Pyrococcus horikoshii OT32008

    • 著者名/発表者名
      Xiaodong Zhang
    • 雑誌名

      Protein Sci. 17

      ページ: 136-145

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 真正細菌型GatCABと古細菌型GatCABの比較2009

    • 著者名/発表者名
      中村彰良、山根潤二、Zhou Qian、姚閔、田中勲
    • 学会等名
      日本生物物理学会北海道支部例会
    • 発表場所
      札幌市
    • 年月日
      2009-03-09
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 真正細菌型GatCABのtRNA認識機構と分子進化、BMB20082008

    • 著者名/発表者名
      中村彰良、山根潤二、姚閔、田中勲
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸市
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] tRNAGln recognition loop in bacterial GatCAB, AARS2008 (International Conference on Aminoacyl-tRNA Synthetases2008

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi Nakamura, Junji Yamane, Min Yao, Isao Tanaka
    • 学会等名
      from Basic Mechanisms to Systems Biology
    • 発表場所
      France
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] High resolution structure of bacterial GatCAB reveals the C-tail domain structure in GatB2008

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi Nakamura, Jyunji Yamane, Min Yao, Isao Tanaka
    • 学会等名
      International Union of Crystallography (IUCr2008)
    • 発表場所
      Osaka
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 真正細菌型GatCABが獲得したtRNA Gln認識ループ2008

    • 著者名/発表者名
      中村彰良、山根潤二、姚閔、田中勲
    • 学会等名
      日本分子生物学会第8回春季シンポジウム
    • 発表場所
      札幌市
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2008 研究成果報告書
  • [学会発表] High resolution structure of bacterial GatCAB reveals the C-tail domain structure in GatB2008

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi Nakamura
    • 学会等名
      XXI Congress of the International Union of Crystallography (IUCr2008)
    • 発表場所
      Osaka, Japan
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] tRNAGln recognition loop in bacterial GatCAB2008

    • 著者名/発表者名
      Akiyoshi Nakamura
    • 学会等名
      AARS2008 (International Conference on Aminoacyl-tRNA Synthetases : from Basic Mechanisms to Systems Biology)
    • 発表場所
      Veyrier du Lac, France
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 黄色ブドウ球菌由来GatCABの高分解能X線結晶構造解析2007

    • 著者名/発表者名
      山根潤二、中村彰良、周勇、十亀弘子、辻下英樹、武本浩、姚閔、田中勲
    • 学会等名
      日本結晶学会2007年度年会
    • 発表場所
      東京都
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://altair.Sci.hokudai.Ac.Jp/g6/index.Html

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/index.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://altair.sci.hokudai.ac.jp/g6/

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

URL: 

公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi