プロテオミクスによるEGF受容体下流シグナルの探索

• 研究課題/領域番号: 19370041
• 研究種目: 基盤研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 徳島大学
• 研究代表者: 谷口 寿章 徳島大学, 疾患酵素学研究センター, 教授 (10257636)
• 研究分担者: 小西 博昭 徳島大学, 疾患酵素学研究センター, 准教授 (40252811) ; 藤原 和子 徳島大学, 疾患酵素学研究センター, 准教授 (20108880) ; 池田 和子 徳島大学, 疾患酵素学研究センター, 助教 (10108863) ; 小迫 英尊 徳島大学, 疾患酵素学研究センター, 准教授 (10291171)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 18,200千円 (直接経費: 14,000千円、間接経費: 4,200千円); 2009年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2008年度: 5,200千円 (直接経費: 4,000千円、間接経費: 1,200千円); 2007年度: 7,800千円 (直接経費: 6,000千円、間接経費: 1,800千円)
• キーワード: タンパク質 / プロテオーム / バイオテクノロジー / シグナル伝達 / 分析科学 / 蛋白質

研究概要

EGF受容体下流シグナル経路のプロテオーム解析により見出された多数の新規タンパク質の生理機能と、それらのリン酸化など、翻訳後修飾による調節機構を詳細に解析することで、EGF受容体下流のシグナル伝達系を網羅的に解明することを目的とし、これまで4種類のタンパク質、Ymerタンパク質、CFBPタンパク質、CLPABPタンパク質、GAREMについてそれらのEGF受容体シグナルにおける役割とリン酸化、ユビキチン化による機能調節機構を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Phosphoproteomics reveals new ERK MAP kinase targets and links ERK to nucleoporin-mediated nuclear transport. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kosako, H., Yamaguchi, N., Aranami, C., Ushiyama, M., Kose, S., Imamoto, N., Taniguchi, H., Nishida, E., Hattori, S.
  • 雑誌名: Nature Struct. Mol. Biol. 16 ページ: 1026-1035
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitotic regulation of the stability of microtubule plus-end tracking protein EB3 by ubiquitin ligase SIAH-1 and Aurora mitotic kinases (2009)
  • 著者名/発表者名: Ban, R., Matsuzaki, H., Akashi, T., Sakashita, G., Taniguchi, H., Park, S, Y. Tanaka, H., Furukawa, K., Urano, T.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 284 ページ: 28367-28381
  • 査読あり
• [雑誌論文] a novel adaptor protein for growth factor receptor-bound protein 2, contributes to cellular transformation through the activation of extracellular signal-regulated kinase signaling. (2009)
  • 著者名/発表者名: Tashiro K, Tsunematsu T, Okubo H, Ohta T, Sano E, Yamauchi E, Taniguchi H, Konishi H. GAREM
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 284 ページ: 20206-20214
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive egg-coat proteome of an ascidian Ciona intestinalis reveals gamete recognition molecules involved in self-sterility. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamada, L., Saito, T., Taniguchi, H., Sawada, H., Harada, Y.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 284 ページ: 9402-9410
  • 査読あり
• [雑誌論文] Comprehensive egg-coat proteome of an ascidian Ciona intestinalis reveals gamete recognition molecules involved in self-sterility. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamada, L.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem., 284 ページ: 9402-9410
  • 査読あり
• [雑誌論文] GAREM, a novel adaptor protein for growth factor receptor-bound protein 2, contributes to cellular transformation through the activation of extracellular signal-regulated kinase signaling. (2009)
  • 著者名/発表者名: Tashiro K.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 284 ページ: 20206-20214
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitotic regulation of the stability of microtubule plus-end tracking protein EB3 by ubiquitin ligase SIAH-1 and Aurora mitotic kinases (2009)
  • 著者名/発表者名: Ban, R.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem 284 ページ: 28367-28381
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphoproteomics reveals new ERK MAP kinase targets and links ERK to nucleoporin-mediated nuclear transport. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kosako, H
  • 雑誌名: Nature Struct.Mol.Biol. 16 ページ: 1026-1035
  • 査読あり
• [雑誌論文] An a posteriori calibration method for improving protein identification accuracy in proteomics using electrospray ionization time-of-flight tandem mass spectrometry. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishino Y., Taniguchi, H
  • 雑誌名: Rapid Commun. Mass Spectrom. 22 ページ: 1335-1338
  • 査読あり
• [雑誌論文] Contribution of peroxisome-specific isoform of Lon protease in sorting PTS1 proteins to peroxisomes. (2008)
  • 著者名/発表者名: Omi, S., Nakata, R., Okamura-Ikeda, K., Konishi, H., Taniguchi, H.
  • 雑誌名: J. Biochem 143 ページ: 649-660
  • NAID: 10024909907
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mechanism of Self-Sterility in a Hermaphroditic Chordate. (2008)
  • 著者名/発表者名: Harada, Y., Takagaki, Y., Sunagawa, M., Saito, T., Yamada, L., Taniguchi, H., Shoguchi, E., Sawada, H.
  • 雑誌名: Science 320 ページ: 548-550
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel tyrosine phosphorylated and cardiolipin-binding protein CLPABP functions as mitochondrial RNA granule. (2008)
  • 著者名/発表者名: Sano, E., Shono, S., Tashiro, K., Konishi, H., Yamauchi, E., Taniguchi, H.
  • 雑誌名: Biochim Biophys Acta Mol. Cell. Res. 1783 ページ: 1036-1047
  • 査読あり
• [雑誌論文] An a posteriori calibration method for improving protein identification accuracy in proteomics using electrospray ionization time-of-flight tandem mass spectrometry. (2008)
  • 著者名/発表者名: Ishino Y.
  • 雑誌名: Rapid Commun Mass Spectrom. 22 ページ: 1335-1338
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mechanism of self-sterility in a hermaphroditic chordate. (2008)
  • 著者名/発表者名: Harada Y.
  • 雑誌名: Science. 320 ページ: 548-550
  • 査読あり
• [雑誌論文] Contribution of Peroxisome-specific Isoform of Lon Protease in Sorting PTS1 Proteins to Peroxisomes. (2008)
  • 著者名/発表者名: Omi s.
  • 雑誌名: J Biochem. 143 ページ: 649-660
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel tyrosine phosphorylated and cardiolipin-binding protein CLPABP functions as mitochondrial RNA granule. (2008)
  • 著者名/発表者名: Sano E.
  • 雑誌名: Biochim Biophys Acta. Mol. Cell. Res. 1783 ページ: 1036-1047
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mass spectrometry-based prokaryote gene annotation. (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishino, Y., Okada, H., Ikeuchi, M., Taniguchi, H.
  • 雑誌名: Proteomics 22 ページ: 4053-4065
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal Structure of Bovine Lipoyltransferase in Complex with Lipoyl-AMP. (2007)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, K., Hosaka, H., Matsuda, M., Okamura-Ikeda, K., Motokawa, Y., Suzuki, M., Nakagawa, A., Taniguchi, H.
  • 雑誌名: J Mol Biol 371 ページ: 222-234
  • 査読あり
• [雑誌論文] PGC7/Stella protects against DNA demethylation in early embryogenesis. (2007)
  • 著者名/発表者名: Nakamura, T., Arai, Y., Umehara, H., Masuhara, M., Kimura, T., Taniguchi, H., Sekimoto, T., Ikawa, M., Yoneda, Y., Okabe, M., Tanaka, S., Shiota, K., Nakano, T.
  • 雑誌名: ature Cell Biology 9 ページ: 64-71
  • 査読あり
• [雑誌論文] タンパク質間相互作用におけるアシル化の役割 (2007)
  • 著者名/発表者名: 谷口寿
  • 雑誌名: 生体の科学 58(5) ページ: 360-363
• [雑誌論文] Crystal structure of bovine lipoyltransferase in complex with lipoyl-AMP (2007)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara K.
  • 雑誌名: J Mol Biol 371 ページ: 222-234
  • 査読あり
• [雑誌論文] PGC7/Stella protects against DNA demethylation in early embryogenesis (2007)
  • 著者名/発表者名: Nakamura T.
  • 雑誌名: Nat Cell Biol 9 ページ: 64-71
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mass spectrometry based prokaryote gene annotation (2007)
  • 著者名/発表者名: Ishino Y.
  • 雑誌名: Proteomics 22 ページ: 4053-4065
  • 査読あり
• [学会発表] Western blot-like presentation of gel-enhanced LC/MS data and software-based detection of protein modifications (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉沢明康
  • 学会等名: RECOMBサテライトミーティング
  • 発表場所: アトキンソンホール、UCSD、サンディエゴ、USA
  • 年月日: 2010-03-28
• [学会発表] Annotation of prokaryote genomes using large-scale proteomic data (2010)
  • 著者名/発表者名: 谷口寿章
  • 学会等名: RECOMBサテライトミーティング
  • 発表場所: アトキンソンホール、UCSD、サンディエゴ、USA
  • 年月日: 2010-03-27
• [学会発表] ProteoFiT : a bundle of VBA macros for parsing, filtering and analyzing Mascot database search results for large-scale proteomics. (2010)
  • 著者名/発表者名: 谷口貴子
  • 学会等名: RECOMBサテライトミーティング
  • 発表場所: アトキンソンホール、UCSD、サンディエゴ、USA
  • 年月日: 2010-03-27
• [学会発表] a bundle of VBA macros for parsing, filtering and analyzing Mascot database search results for large-scale proteomics. (2010)
  • 著者名/発表者名: 谷口貴子、谷口寿章ProteoFiT
  • 学会等名: RECOM Satellite Meeting on Computational Proteomics.
  • 発表場所: UCSD, San Diego, USA
• [学会発表] Annotation of prokaryote genomes using large-scale proteomic data. (2010)
  • 著者名/発表者名: 谷口寿章
  • 学会等名: RECOM Satellite Meeting on Computational Proteomics
  • 発表場所: UCSD, San Diego, USA
• [学会発表] Western blot-like presentation of gel-enhanced LC/MS data and software-based detection of protein modifications. (2010)
  • 著者名/発表者名: 吉沢明康、山田力志、谷口寿章
  • 学会等名: RECOM Satellite Meeting on Computational Proteomics.
  • 発表場所: UCSD, San Diego, USA
• [学会発表] Phosphorylation of nuclear pore complex proteins by ERK MAP kinase regulates interaction with transport receptors. (2010)
  • 著者名/発表者名: 小迫英尊
  • 学会等名: ASCB 49th Annual Meeting
  • 発表場所: San Diego, USA
• [学会発表] Phosphorylation of nuclear pore complex proteins by ERK MAP kinase regulates interaction with transport receotors. (2009)
  • 著者名/発表者名: 小迫英尊
  • 学会等名: 2009 ASCB Annual Meeting
  • 発表場所: コンベンションセンター(サンディェゴ)
  • 年月日: 2009-12-06
• [学会発表] Ascidian Adult Body Map: A proteomic view of adult ascidian tissues. (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉沢明康、山田力志、谷口寿章
  • 学会等名: The 5th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Naha, Okinawa
  • 年月日: 2009-06-22
• [学会発表] Global protein profiling of ascidian C. intestinalis: toward the comprehensive understanding at the protein level (2009)
  • 著者名/発表者名: 山田力志、谷口寿章
  • 学会等名: The 5th International Tunicate Meeting
  • 発表場所: Naha, Okinawa
  • 年月日: 2009-06-22
• [学会発表] Global protein profiling of ascidian C.intestinalis : toward the comprehensive understanding at the protein level (2009)
  • 著者名/発表者名: 山田力志
  • 学会等名: The 5^<th> International Tunicate Meeting
  • 発表場所: 沖縄産業支援センター
  • 年月日: 2009-06-22
• [学会発表] Ascidian Adult Body Map : A proteomic view of adult ascidian tissues (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉沢明康
  • 学会等名: The 5^<th> International Tunicate Meeting
  • 発表場所: 沖縄産業支援センター
  • 年月日: 2009-06-22
• [学会発表] プロテオミクスによる細胞生物学へのアプローチ日本細胞生物学会大会 (2009)
  • 著者名/発表者名: 谷口寿章
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2009-06-04
• [学会発表] プロテオミクスによる細胞生物学へのアプローチ (2009)
  • 著者名/発表者名: 谷口寿章
  • 学会等名: 日本細胞生物学会大会
  • 発表場所: 名古屋国際会議場
  • 年月日: 2009-06-04
• [学会発表] Ascidian Adult Body Map:質量分析によるホヤ・プロテオーム・データベースの構築、日本分子生物学会 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉沢明康、山田力志、谷口寿章
  • 学会等名: 第9回春季シンポジウム
  • 発表場所: 宮崎
  • 年月日: 2009-05-11
• [学会発表] Ascidian Adult Body Map : 質量分析によるホヤ・プロテオーム・データベースの構築 (2009)
  • 著者名/発表者名: 吉沢明康
  • 学会等名: 日本分子生物学会 第9回春季シンポジウム
  • 発表場所: シーガイヤワールドコンベンションセンター・サミット
  • 年月日: 2009-05-11
• [学会発表] プロテオミクスによるリンパ腫特異的血清マーカーの探索BMB2008 (2008)
  • 著者名/発表者名: 庄野繁一、谷口貴子、木戸慎介、阿倍正博、松本俊夫、谷口寿章
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-12
• [学会発表] プロテオミクスによるリンパ腫特異的血清マーカーの探索 (2008)
  • 著者名/発表者名: 庄野 繁一
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会・合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-12
• [学会発表] グリシン開裂酵素系T-Hタンパク質複合体の結晶構造解析と反応機構BMB2008 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池田和子, 保坂晴美, 真板宣夫, 藤原和子, 中川敦史, 本川雄太郎, 谷口寿章
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] 大腸菌lipoate-protein ligase Aによる2段階反応の構造的基盤BMB2008 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤原和子, 保坂晴美, 池田和子, 真板宣夫, 本川雄太郎, 中川敦史, 谷口寿章
  • 発表場所: 神戸
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] 大腸菌lipoate-protein ligase Aによる2段階反応の構造的基盤 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤原 和子
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会・合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] グリシン開裂酵素系T-Hタンパク質複合体の結晶構造解析と反応機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 池田 和子
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会・合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] 質量分析を基盤とするプロテオミクスの医学・生物学研究への応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 谷口寿章
  • 学会等名: 第56回質量分析総合討論会
  • 発表場所: つくば
  • 年月日: 2008-05-15
• [学会発表] 質量分析を基盤とするプロテオミクスの医学・生物学研究への応用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 谷口 寿章
  • 学会等名: 第56回質量分析総合討論会
  • 発表場所: つくば国際会議場エポカル
  • 年月日: 2008-05-15
• [学会発表] グリシン開裂酵素系T-Hタンパク質複合体の結晶構造解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 池田 和子
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-14
• [学会発表] X線結晶構造解析によるリポ酸転移酵素の触媒機構の解明 (2007)
  • 著者名/発表者名: 藤原 和子
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会・第80回日本生化学会合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] 脂肪細胞分泌タンパク質のプロテオーム解析による新規アディポサイトカインの探索 (2007)
  • 著者名/発表者名: 奥田 祐子
  • 学会等名: 第28回日本肥満学会
  • 発表場所: 都市センターホテル
  • 年月日: 2007-10-20
• [学会発表] Secretome Analysis of Human Adipocytes Obtained from Visceral and Subcutaneous Adipose Tissues (2007)
  • 著者名/発表者名: Yuko Okuda
  • 学会等名: Hupo 6th ANNUAL WORLD CONGRESS, SEOUL 2007
  • 発表場所: COEX
  • 年月日: 2007-10-09
• [図書] 「プロテオミクスと病態解析」図説分子病態学第4版 (2008)
  • 著者名/発表者名: 谷口寿章, 一瀬白帝、鈴木宏治(共編)
  • 出版者: 中外医学社刊
• [備考]
  • URL: http://www.ier.tokushima-u.ac.jp/
• [産業財産権] 生理活性物質と相互作用する物質の効率的スクリーニング方法 (2007)
  • 発明者名: 谷口 寿章, 他
  • 権利者名: 徳島大学, 他
  • 出願年月日: 2007-08-28