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病原性細菌由来オートトランスポーターの分泌機構と高次構造相関

研究課題

研究課題/領域番号 19370045
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 構造生物化学
研究機関横浜市立大学

研究代表者

JEREMY R.H.Tame (JEREMY R. H. Tame)  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 教授 (00336588)

研究分担者 朴 三用  横浜市立大学, 国際総合科学研究, 准教授 (20291932)
雲財 悟  横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 助教 (60336592)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
18,460千円 (直接経費: 14,200千円、間接経費: 4,260千円)
2008年度: 8,710千円 (直接経費: 6,700千円、間接経費: 2,010千円)
2007年度: 9,750千円 (直接経費: 7,500千円、間接経費: 2,250千円)
キーワード構造生物学 / X線結晶構造解析 / タンパク質 / オートトランスポーター
研究概要

オートトランスポータータンパク質Heme Binding Protein (HBP)のパッセンジャードメイン立体構造解析に成功した。HBPの外膜貫通領域βバレルドメインとオートシャペロン部分の発現系構築に成功し、タンパク質の結晶化および立体構造解析に成功した。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (22件) (うち査読あり 22件) 学会発表 (8件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] The nature of the TRAP-Anti-TRAP complex2009

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, M., Heddle, J. G., Kikuchi, K., Unzai, S., Akashi, S., Park, S. Y. & Tame, J. R.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A 106

      ページ: 2176-81

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insight into the essential PB1-PB2 subunit contact of the influenza virus RNA polymerase2009

    • 著者名/発表者名
      Sugiyama, K., Obayashi, E., Kawaguchi, A., Suzuki, Y., Tame, J. R., Nagata, K. & Park, S. Y.
    • 雑誌名

      Embo J., accepted

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mutational Analysis of the Substrate Specificity of Escherichia coli Penicillin Binding Protein 4 (PBP4)2009

    • 著者名/発表者名
      Clarke, T., Kawai, F., Park, S. Y., Tame, J., Dowson, C. & Roper, D.
    • 雑誌名

      Biochemistry 48

      ページ: 2675-2683

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA and Protein Complexes of trp RNA-Binding Attenuation Protein Characterized by Mass Spectrometry2009

    • 著者名/発表者名
      Akashi, S., Watanabe, M., Heddle, J. G., Unzai, S., Park, S. Y. & Tame, J. R.
    • 雑誌名

      Anal Chem 81

      ページ: 2218-2226

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The nature of the TRAP-Anti-TRAP complex.2009

    • 著者名/発表者名
      Watanabe M, Heddle JG, Kikuchi K, Unzai S, Akashi S, Park SY, Tame JR.
    • 雑誌名

      Proc Natl Acad Sci U S A. 106(7)

      ページ: 2176-81

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intersubunit linker length as a modifier of protein stability: crystal structures and thermostability of mutant TRAP2008

    • 著者名/発表者名
      Watanabe, M., Mishima, Y., Yamashita, I., Park, S. Y., Tame, J. R. & Heddle, J. G.
    • 雑誌名

      Protein Sci 17

      ページ: 518-26

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The structural basis for an essential subunit interaction in influenza virus RNA polymerase2008

    • 著者名/発表者名
      Obayashi, E., Yoshida, H., Kawai, F., Shibayama, N., Kawaguchi, A., Nagata, K., Tame, J. R. & Park, S. Y.
    • 雑誌名

      Nature 454

      ページ: 1127-31

    • NAID

      10023987774

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The structural basis for an essential subunit interaction in influenza virus RNA polymerase.2008

    • 著者名/発表者名
      Obayashi E, Yoshida H, Kawai F, Shibayama N, Kawaguchi A, Nagata K, Tame JR, Park SY.
    • 雑誌名

      Nature 454(7208)

      ページ: 1127-31

    • NAID

      10023987774

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intersubunit linker length as a modifier of protein stability : crystal structures and thermostability of mutant TRAP.2008

    • 著者名/発表者名
      Watanabe M, Mishima Y, Yamashita I, Park SY, Tame JR, Heddle JG.
    • 雑誌名

      Protein Sci. 17(3)

      ページ: 518-26

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Intersubunit linker length as a modifier of protein stability: crystal structures and thermostability of mutant TRAP.2008

    • 著者名/発表者名
      Watanabe M, Mishima Y, Yamashita I, Park SY, Tame JR, Heddle JG.
    • 雑誌名

      Protein Sci. 17(3)

      ページ: 518-26

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of N-terminal residues on the structural stability of recombinant horse L-chain apoferritin in an acidic environment2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshizawa, K., Mishima, Y., Park, S. Y., Heddle, J. G., Tame, J. R., Iwahori, K., Kobayashi, M. & Yamashita, I.
    • 雑誌名

      J Biochem 142

      ページ: 707-13

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Limited tolerance towards folded elements during secretion of the autotransporter Hbp2007

    • 著者名/発表者名
      Jong, W. S., ten Hagen-Jongman, C. M., den Blaauwen, T., Slotboom, D. J., Tame, J. R., Wickstrom, D., de Gier, J. W., Otto, B. R. & Luirink, J.
    • 雑誌名

      Mol Microbiol 63

      ページ: 1524-36

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and mechanism of HpcG, a hydratase in the homoprotocatechuate degradation pathway of Escherichia coli2007

    • 著者名/発表者名
      Izumi, A., Rea, D., Adachi, T., Unzai, S., Park, S. Y., Roper, D. I. & Tame, J. R.
    • 雑誌名

      J Mol Biol 370

      ページ: 899-91

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic studies of the metalloglycoprotein esterase A4 using a baculovirus expression system2007

    • 著者名/発表者名
      Hiraki, T., Shibayama, N., Yoon, Y. H., Yun, K. M., Hamamoto, T., Tame, J. R. & Park, S. Y.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 63

      ページ: 734-6

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic allostery in the ring protein TRAP2007

    • 著者名/発表者名
      Heddle, J. G., Okajima, T., Scott, D. J., Akashi, S., Park, S. Y. & Tame, J. R.
    • 雑誌名

      J Mol Biol 371

      ページ: 154-67

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Using the ring-shaped protein TRAP to capture and confine gold nanodots on a surface2007

    • 著者名/発表者名
      Heddle, J. G., Fujiwara, I., Yamadaki, H., Yoshii, S., Nishio, K., Addy, C., Yamashita, I. & Tame, J. R.
    • 雑誌名

      Small 3

      ページ: 1950-6

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Nickel binding to NikA : an additional binding site reconciles spectroscopy, calorimetry and crystallography2007

    • 著者名/発表者名
      Addy, C., Ohara, M., Kawai, F., Kidera, A., Ikeguchi, M., Fuchigami, S., Osawa, M., Shimada, I., Park, S. Y., Tame, J. R. & Heddle, J. G.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 63

      ページ: 221-9

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Effect of N-terminal residues on the structural stability of recombinant horse L-chain apoferritin in an acidic environment.2007

    • 著者名/発表者名
      Yoshizawa K, Mishima Y, Park SY, Heddle JG, Tame JR, Iwahori K, Kobayashi M, Yamashita I.
    • 雑誌名

      J Biochem 142(6)

      ページ: 707-13

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Using the ring-shaped protein TRAP to capture and confine gold nanodots on a surface.2007

    • 著者名/発表者名
      Heddle JG, Fujiwara I, Yamadaki H, Yoshii S, Nishio K, Addy C, Yamashita I, Tame JR.
    • 雑誌名

      Small. 3(11)

      ページ: 1950-6

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystallization and preliminary crystallographic studies of the metallogl ycoprotein esterase A4 using a baculovirus expression system.2007

    • 著者名/発表者名
      Hiraki T, Shibayama N, Yoon YH, Yun KM, Hamamoto T, Tame JR, Park SY.
    • 雑誌名

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 63(Pt 9)

      ページ: 734-6

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure and mechanism of HpcG, a hydratase in the homoprotocatechuate degradation pathway of Escherichia coli.2007

    • 著者名/発表者名
      Izumi A, Rea D, Adachi T, Unzai S, Park SY, Roper DI, Tame JR.
    • 雑誌名

      J Mol Biol. 370(5)

      ページ: 899-911

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic allostery in the ring protein TRAP.2007

    • 著者名/発表者名
      Heddle JG, Okajima T, Scott DJ, Akashi S, Park SY, Tame JR.
    • 雑誌名

      J Mol Biol. 371(1)

      ページ: 154-67

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Haemoglobin as a drug target2008

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Yokoyama, Satoru Unzai, Sam-Yong Park, Jeremy
    • 学会等名
      The 40th crystallographic meeting at Erice
    • 発表場所
      Italy
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Protonation states of buried histidine residues in human deoxyhemoglobin revealed by neutron crystallography2008

    • 著者名/発表者名
      Sam-Yong Park, Toshiyuki Chatake, Naoya Shibayama, Yukiko Morimoto
    • 学会等名
      XVth International Conference on Oxygen Binding and Sensing Proteins
    • 発表場所
      Aarhus, Denmark
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] インフルエンザウイルスのRNAポリメラーゼにおけるサブユニット間相互作用2008

    • 著者名/発表者名
      尾林栄治, 吉田尚史, 河合文啓,川口敦史, 永田恭介, Jeremy Tame,朴三用
    • 学会等名
      第81回日本生化学会大会
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] What a crystal structure doesn't tell you2008

    • 著者名/発表者名
      Jeremy R. H. Tame
    • 学会等名
      よこはまNMR構造生物学研究会 国際シンポジウム
    • 発表場所
      横浜
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Structural insights into serine protease autotoransporter HBP from pathogenic Escherichia coli.2008

    • 著者名/発表者名
      J. Tame
    • 学会等名
      Society for General Microbiology
    • 発表場所
      Edinburgh, UK
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] X-ray Crystallography of Autotransporters from Pathogenic Bacteria2007

    • 著者名/発表者名
      Kaoru Nishimura, Sam-Yong Park, Jeremy
    • 学会等名
      Molecular Microbiology Young Microbiologists Minisymposium Prokaryotic Membranes
    • 発表場所
      Paris, France
    • 年月日
      2007-10-12
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] X-ray Crystallography of Autotransporters from Pathogenic Bacteria.2007

    • 著者名/発表者名
      Kaoru Nishimura, Sam-Yong Park, and Jeremy Tame
    • 学会等名
      Molecular Microbiology Young Microbiologists Minisymposium Prokaryotic Membranes.
    • 発表場所
      Paris, France
    • 年月日
      2007-10-12
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Dynamic allostery in the tryptophan-binding protein TRAP2007

    • 著者名/発表者名
      Heddle JG, Akashi S, Park SY, Tame JR.
    • 学会等名
      Biophysics of ligand binding to drug tagets.
    • 発表場所
      Strasbourg, France
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] Dioxygen Binding and Sensing Proteins : A Tribute to Beatrice and Jonathan Wittenberg(編集 : Martino Bolognesi, Guido Di Prisco, Cinzia Verde, 出版社 : Springer)(ISBN 8847008069, 9788847008069)2008

    • 著者名/発表者名
      Satoru Unzai, Kiyohiro Imai, Sam-Yong Park, Kiyoshi Nagai, and Jeremy R.H.
    • 出版者
      Mutagenic studies on the Origins of the Root Effect
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2021-04-07  

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