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蛋白質が主導する膜形態変化の分子シミュレーション研究

研究課題

研究課題/領域番号 19370069
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関京都大学

研究代表者

高田 彰二  京都大学, 大学院・理学研究科, 准教授 (60304086)

研究期間 (年度) 2007 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
18,200千円 (直接経費: 14,000千円、間接経費: 4,200千円)
2009年度: 7,150千円 (直接経費: 5,500千円、間接経費: 1,650千円)
2008年度: 7,020千円 (直接経費: 5,400千円、間接経費: 1,620千円)
2007年度: 4,030千円 (直接経費: 3,100千円、間接経費: 930千円)
キーワードベシクル融合 / ベシクル発芽 / ラフト / 粗視化モデル / シミュレーション / インフルエンザ / SNARE
研究概要

細胞融合、分裂などの生体膜形態変化は関連蛋白質によって引き起こされる。蛋白質-生体膜複合体の粗視化分子シミュレーションモデルを構築し、それによって膜形態変化過程を調べることが本研究の目的である。蛋白質には多谷モデル、脂質膜には野口モデルを用い、さらに蛋白質-脂質間相互作用には排除体積と疎水性相互作用を考慮に入れた。このモデルによって、ベシクル形成、ベシクル融合、2成分膜ベシクルの相分離、ベシクル出芽などをシミュレーションし、分子機構を調べた。

報告書

(4件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (76件)

すべて 2010 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 12件) 学会発表 (64件)

  • [雑誌論文] Paddling mechanism for the substrate translocation by AAA+ motor revealed by multiscale molecular simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Nobuyasu Koga、Tomoshi Kameda、Kei-ichi Okazaki、Shoji Takada
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences USA Vol.106

      ページ: 18237-18242

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Folding energy landscape and network dynamics of small globular proteins2009

    • 著者名/発表者名
      Naoto Hori、George Chikenji、R. Stephen Berry、Shoji Takada
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences USA Vol.106

      ページ: 73-78

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] アロステリーの分子機構 : MWCかあるいはKNFか?2009

    • 著者名/発表者名
      岡崎圭一, 高田彰二
    • 雑誌名

      生物物理 Vol. 49

      ページ: 132-134

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Self-learning multiscale simulation for achieving high accuracy and high efficiency simultaneously2009

    • 著者名/発表者名
      Wenfei Li, Shoji Takada
    • 雑誌名

      J.Chemical Physics Vol. 130

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Paddling mechanism for the substrate translocation by AAA+ motor revealed by multiscale molecular simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Nobuyasu Koga, Tomoshi Kameda, Kei-ichi Okazaki, Shoji Takada
    • 雑誌名

      Proc.Nat.Acad.Sci.USA Vol. 106

      ページ: 18237-18242

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Folding energy landscape and network dynamics of small globular proteins2009

    • 著者名/発表者名
      Naoto Hori, George Chikenji, R. Stephen Berry, Shoji Takada
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences USA 106

      ページ: 73-78

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic energy landscape view of coupled binding and protein conformational change: Induced-fit versus population-shift mechanisms2008

    • 著者名/発表者名
      Kei-ichi Okazaki、Shoji Takada
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences USA Vol.105

      ページ: 11182-11187

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Asymmetry in membrane protein sequence and structure: Glycine outside rule2008

    • 著者名/発表者名
      Wenzhen Jin、Shoji Takada
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology Vol.377

      ページ: 74-82

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] In silico chaperonin-like cycle helps folding of proteins for structure prediction2008

    • 著者名/発表者名
      Tadaomi Furuta, Yoshimi Fujitsuka, George Chikenji, Shoji Takada
    • 雑誌名

      Biophysical Journal 94

      ページ: 2558-2565

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamic energy landscape view of coupled binding and protein conformational change : Induced-fit versus2008

    • 著者名/発表者名
      Kei-ichi Okazaki, Shoji Takada
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences USA 105

      ページ: 11182-11187

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] In silico chaperonin-like cycle helps folding of proteins for structure prediction2008

    • 著者名/発表者名
      Tadaomi Furuta, Yoshimi Fujitsuka, George Chikenji, and Shoji Takada
    • 雑誌名

      Biophysical Jouxnal 94

      ページ: 2558-2565

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Asymmetry in membrane protein sequence and structure: Glycine outside rule2008

    • 著者名/発表者名
      Wenzhen Jin and Shoji Takada
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology 377

      ページ: 74-82

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] FUNCTIONALLY ROTATING MECHANISM OF A MULTIDRUG TRANSPORTER STUDIED BY COARSE-GRAINED SIMULATION2010

    • 著者名/発表者名
      Xin-Qiu Yao, Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      Biophysical Society 54th Annual Meeting
    • 発表場所
      San Francisco(USA)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] BIOMOLECULAR COARSE-GRAINED SIMULATION PROGRAM CAFEMOL2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroo Kenzaki、Nobuyasu Koga、Shinji Fujiwara、Shoji Takada
    • 学会等名
      Biophysical Society 54th Annual Meeting
    • 発表場所
      San Francisco(USA)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] MECHANISM OF UNIDIRECTIONAL MOVE OF KIF1A MOTOR STUDIED BY COARSE-GRAINED SIMULATIONS2010

    • 著者名/発表者名
      Ryo Kanada, Takeshi Kuwata, Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      Biophysical Society 54th Annual Meeting
    • 発表場所
      San Francisco (USA)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] BIOMOLECULAR COARSE-GRAINED SIMULATION PROGRAM CAFEMOL2010

    • 著者名/発表者名
      Hiroo Kenzaki, Nobuyasu Koga, Shinji Fujiwara
    • 学会等名
      Biophysical Society 54th Annual Meeting
    • 発表場所
      San Francisco (USA)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] FUNCTIONALLY ROTATING MECHANISM OF A MULTIDRUG TRANSPORTER STUDIED BY COARSE-GRAINED SIMULATION2010

    • 著者名/発表者名
      Xin-Qiu Yao, Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      Biophysical Society 54th Annual Meeting
    • 発表場所
      San Francisco (USA)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Protein folding network, and energy landscape, studied by parallel Wang-Landau sampling2009

    • 著者名/発表者名
      Shoji Takada
    • 学会等名
      Supercomputing in Solid State Physics 2009
    • 発表場所
      物性研究所
    • 年月日
      2009-02-16
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Membrane morphology dynamics induced by proteins: Coarse-grained molecular simulationsタンパク質によって誘起される膜形態ダイナミクス:粗視化分子シミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      藤原慎司、高田彰二
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま(徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Functionally rotating mechanism of a multidrug transporter studied by coarse-grained simulation2009

    • 著者名/発表者名
      Xin-Qiu Yao、Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま(徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 蛋白質の大振幅ゆらぎと機能の分子シミュレーション研究2009

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま(徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Working principle of biomolecular motors revealed by molecular dynamics simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Shoji Takada
    • 学会等名
      The 238th American Chemical Society National Meeting
    • 発表場所
      Washington D.C. (USA)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Functionally rotating mechanism of a multidrug transporter studied by coarse-grained simulation2009

    • 著者名/発表者名
      Xin-Qiu Yao、Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      次世代生命体統合PJ分子スケールワークショップ「ペタフロップスコンピューティングに向けた生体高分子シミュレーションの最前線」
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所(東京都)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] CafeMol:生体分子粗視化シミュレーションプログラム2009

    • 著者名/発表者名
      検崎博生、古賀信康、藤原慎司、堀直人、金田亮、岡崎圭一、姚新秋、高田彰二
    • 学会等名
      次世代生命体統合PJ分子スケールワークショップ「ペタフロップスコンピューティングに向けた生体高分子シミュレーションの最前線」
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所(東京都)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Biomolecular Coarse-Grained Simulation Program2009

    • 著者名/発表者名
      Hiroo Kenzaki, Nobuyasu Koga, Shinji Fujiwara, Naoto Hori, Ryo Kanada, Kei-ichi Okazaki, Xin-Qiu Yao, Shoji Takada、CafeMol
    • 学会等名
      RIKEN Joint Computational Science Workshop 2009
    • 発表場所
      理化学研究所(横浜市)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Functionally rotating mechanism of a multidrug transporter studied by coarse-grained simulation2009

    • 著者名/発表者名
      Xin-Qiu Yao、Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • 発表場所
      京都ガーデンプレス(京都市)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Working Principle of Biomolecular Motors Revealed by Molecular Dynamics Simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Shoji Takada
    • 学会等名
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • 発表場所
      京都ガーデンプレス(京都市)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 計算機実験による生体分子モーターの作動原理探求2009

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      自然科学研究機構スーパーコンピューターワークショップ2009
    • 発表場所
      自然科学研究機構岡崎コンファレンスセンター
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Working Principle of Biomolecular Motors Revealed by Molecular Dynamics Simulations2009

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • 発表場所
      京都ガーデンプレス (京都市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Self-Learning Multi-scale Simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Wenfei Li, Shoji Takada
    • 学会等名
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • 発表場所
      京都ガーデンプレス (京都市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Functionally rotating mechanism of a multidrug transporter studied by coarse-grained simulation2009

    • 著者名/発表者名
      Xin-Qiu Yao, Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • 発表場所
      京都ガーデンプレス (京都市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Mechanism of unidirectional move of KIF1A motor studied by coarse-grained simulations2009

    • 著者名/発表者名
      金田亮
    • 学会等名
      RIKEN Joint Computational Science Workshop 2009
    • 発表場所
      理化学研究所 (横浜市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] CafeMol : Biomolecular Coarse-Grained Simulation Program2009

    • 著者名/発表者名
      Hiroo Kenzaki, Nobuyasu Koga, Shinji Fujiwara, Naoto Hori, Ryo Kanada, Kei-ichi Okazaki, Xin-Qiu Yao, Shoji Takada
    • 学会等名
      RIKEN Joint Computational Science Workshop 2009
    • 発表場所
      理化学研究所 (横浜市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Working principles of biomolecular motors studied by multiscale simulations2009

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function
    • 発表場所
      東京大学 (東京都)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Self-learning multiscale simulations for biomolecular systems2009

    • 著者名/発表者名
      Wenfei Li, Shoji Takada
    • 学会等名
      International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function
    • 発表場所
      東京大学 (東京都)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] CafeMol : 生体分子粗視化シミュレーションプログラム2009

    • 著者名/発表者名
      検崎博生, 古賀信康, 藤原慎司, 堀直人, 金田亮, 岡崎圭一, 姚新秋, 高田彰二
    • 学会等名
      次世代生命体統合PJ分子スケールワークショップ「ペタフロップスコンピューティングに向けた生体高分子シミュレーションの最前線」
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所 (東京都)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Functionally rotating mechanism of a multidrug transporter studied by coarse-grained simulation2009

    • 著者名/発表者名
      Xin-Qiu Yao, Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      次世代生命体統合PJ分子スケールワークショップ「ペタフロップスコンピューティングに向けた生体高分子シミュレーションの最前線」
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所 (東京都)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] KIF1A分子モーターの一方向性の運動発現機構の解明2009

    • 著者名/発表者名
      金田亮, 桑田豪, 検崎博生, 高田彰二
    • 学会等名
      次世代生命体統合PJ分子スケールワークショップ「ペタフロップスコンピューティングに向けた生体高分子シミュレーションの最前線」
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所 (東京都)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Working principle of biomolecular motors revealed by molecular dynamics simulations2009

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      The 238th American Chemical Society National Meeting
    • 発表場所
      Washington D. C. (USA)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 蛋白質の大振幅ゆらぎと機能の分子シミュレーション研究2009

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま (徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] KIF1A分子モーターの一方向性の運動発現機構のシミュレーション研究2009

    • 著者名/発表者名
      金田亮, 桑田豪, 岡崎圭一, 検崎博生, 高田彰二
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま (徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Coarse-grained simulation of protein-DNA complex : dynamics of nucleosome2009

    • 著者名/発表者名
      検崎博生, 高田彰二
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま (徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Folding simulations of chignolin by self-learning multiscale method2009

    • 著者名/発表者名
      Wenfei Li, Shoji Takada
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま (徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Functionally rotating mechanism of a multidrug transporter studied by coarse-grained simulation2009

    • 著者名/発表者名
      Xin-Qiu Yao, Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま (徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] レプリカ交換法による巨大タンパク質-核酸複合系の粗視化シミュレーション研究2009

    • 著者名/発表者名
      Naoto Hori, Hiroo Kenzaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま (徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Membrane morphology dynamics induced by proteins : Coarse-grained molecular simulations タンパク質によって誘起される膜形態ダイナミクス : 粗視化分子シミュレーション2009

    • 著者名/発表者名
      藤原慎司, 高田彰二
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アスティとくしま (徳島市)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 計算機実験による生体分子モーターの作動原理探求2009

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      自然科学研究機構スーパーコンピューターワークショップ2009
    • 発表場所
      自然科学研究機構 岡崎コンフアレンスセン
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Molecular Simulation Study of Kinesin : Coupling between ATPase Domain Conformational Change and Mechanical2009

    • 著者名/発表者名
      Ryo Kanada, Kei-ichi Okazaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      The Biophysical Society's 53rd Annual Meeting
    • 発表場所
      Boston
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Self-learning multi-scale simulation2009

    • 著者名/発表者名
      Wenfei Li, Shoji Takada
    • 学会等名
      The Biophysical Society's 53rd Annual Meeting
    • 発表場所
      Boston
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 計算機実験による生体分子モーターの作動原理探求2008

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      産業総合研究所生命情報工学研究センター研究報告シンポジウム
    • 発表場所
      産業総合研究所生命情報工学研究センター
    • 年月日
      2008-11-07
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 計算機実験による生体分子モーターの作動原理探求2008

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      産業総合研究所生命時報工学研究センター研究報告シンポジウム
    • 発表場所
      産業総合研究所生命情報報工学研究センター
    • 年月日
      2008-11-07
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 構造変化シミュレーションからの生体分子機械の作動原理探求2008

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー「蛋白質の構造変化の仕組みを探る」
    • 発表場所
      大阪大学蛋白質研究所(吹田)
    • 年月日
      2008-03-03
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] 巨大生体分子複合系のマルチスケールシミュレーションに向けて2008

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      バイオスーパーコンピューティング・シンポジウム(BSCS)
    • 発表場所
      理化学研究所
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2008 実績報告書
  • [学会発表] 膜融合を引き起こすウイルスタンパク質の大規模構造変化のシミュレーション研究2008

    • 著者名/発表者名
      藤原慎司、高田彰二
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2008 実績報告書
  • [学会発表] 結合による構造変化と生体分子システムの作動原理2008

    • 著者名/発表者名
      岡崎圭一、高田彰二
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2008 実績報告書
  • [学会発表] 構造変化とリガンド結合の共役メカニズム:induced-fit vs population-shift2008

    • 著者名/発表者名
      岡崎圭一、高田彰二
    • 学会等名
      第22回分子シミュレーション討論会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Working principle of biomolecular motors revealed by multi-scale simulations2008

    • 著者名/発表者名
      Shoji Takada
    • 学会等名
      The 235th American Chemical Society National Meeting
    • 発表場所
      New Orleans
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2008 実績報告書
  • [学会発表] Protein folding network, and energy landscape, studied by parallel Wang-Landau sampling2008

    • 著者名/発表者名
      Shoji Takada
    • 学会等名
      The 235th American Chemical Society National Meeting
    • 発表場所
      New Orleans
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 計算機実験による生体分子モーターの作動原理探求2008

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      東北大理学部化学教室講演会
    • 発表場所
      東北大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 構造変化とリガンド結合の共役メカニズム : induced-fit vs population-shift2008

    • 著者名/発表者名
      岡崎圭一, 高田彰二
    • 学会等名
      第22回分子シミュレーション討論会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 粗視化モデルによる双頭キネシンのステップ機構の解明2008

    • 著者名/発表者名
      金田亮, 岡崎圭一, 高田彰二
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Coarse-grained simulation of complex of protein and DNA2008

    • 著者名/発表者名
      検崎博生, 高田彰二
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Adaptive multi-scale simulations of biomolecules for achieving high accuracy and high efficiency2008

    • 著者名/発表者名
      Wenfei Li, Shoji Takada
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Coarse-grained simulation for understanding working mechanism of Fl-ATPase2008

    • 著者名/発表者名
      Kei-ichi Okazaki, Shoji Takada
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Mechanical principle of the motor protein KIFIA studied by molecular dynamics simulation (2)2008

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Kuwata, Kei-ichi Okazaki, Ryo Kanada, Hiroo Kenzaki
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Folding energy landscape of small globular proteins at atomistic resolution revealed by multiscale modeling2008

    • 著者名/発表者名
      Hiroaki Yoshii, Naoto Hori, Tomoshi Kameda, Shoii Takada
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 粗視化モデルによるタンパク質の構造変化とリガンド結合の共役メカニズムの解明:分子モーターへの応用2007

    • 著者名/発表者名
      岡崎圭一, 高田彰二
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      横浜パシフィコ
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] Asymmetry in membrane protein sequence and structure: Glycine outside rule2007

    • 著者名/発表者名
      Wenzhen Jin、Shoji Takada
    • 学会等名
      第45回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      横浜パシフィコ
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] 計算機実験による生体分子システムの作動原理探求2007

    • 著者名/発表者名
      高田彰二
    • 学会等名
      第1回論理薬研究会
    • 発表場所
      岐阜大学
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] Working principle of molecular motors revealed by molecular simulations2007

    • 著者名/発表者名
      Shoji Takada
    • 学会等名
      WORKSHOP ON COMPUTATIONAL BIOPHYSICS
    • 発表場所
      Nagoya University
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] The working principle of biomolecular machines revealed by molecular simulations2007

    • 著者名/発表者名
      Shoji Takada
    • 学会等名
      The 10th Asia Pacific Physical Conference
    • 発表場所
      Pohang, Korea
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質の構造変化とligand結合との共役の仕方: ligand結合の効果を取り入れたMultiple-basin energy landscape modelによるシミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      岡崎圭一、高田彰二
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 膜蛋白質のアミノ酸分布の非対称性について2007

    • 著者名/発表者名
      金文珍、高田彰二
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] ミオシンVの運動機構の解明に向けて-粗視化モデルによる分子シミュレーション-2007

    • 著者名/発表者名
      古賀理恵(京都大)、古賀信康、高田彰二
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] タンパク質の構造変化とligand結合との共役の仕方:ligand結合の効果を取り入れたMultip!e-basin energy landscape modelによるシミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      岡崎圭一(神戸大)、高田彰二
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      仙台国際センター
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 生体分子モーターの粗視化分子シミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      高田 彰二
    • 学会等名
      日本物理学会第62回年次大会
    • 発表場所
      北海道大学札幌キャンパス
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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