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単一細胞マイクロアレイ法による生命現象解明の基盤創出

研究課題

研究課題/領域番号 19370098
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 発生生物学
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

斎藤 通紀  理研, 研究員 (80373306)

研究分担者 栗本 一基  独立行政法人理化学研究所, 哺乳類生殖細胞研究チーム, 基礎科学特別研究員 (20415152)
薮田 幸宏  独立行政法人理化学研究所, 哺乳類生殖細胞研究チーム, 研究員 (30415327)
研究期間 (年度) 2007 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
15,210千円 (直接経費: 11,700千円、間接経費: 3,510千円)
2009年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2008年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2007年度: 6,370千円 (直接経費: 4,900千円、間接経費: 1,470千円)
キーワード単一細胞 / 遺伝子発現 / マイクロアレイ / 初期発生 / 胚盤胞 / 生殖細胞 / ジーンタゲティング / 細胞分化
研究概要

代表研究者らは、単一細胞から定量的かつ再現性良く発現遺伝子を増幅し、High density oligonucleotide microarrayにて解析可能とする系を確立(Kurimoto K et al.,Nuc.Acids Res.,34,e42,2006;Nature Protocols,2,739-752,2007)した。この単一細胞マイクロアレイ法を用いた解析を発展させ、生殖細胞形成過程におけるBlimp1及びPrdm14を核とした転写制御因子ネットワークの解析を行い、生殖細胞形成過程が、1)体細胞化の抑制、2)潜在的多能性の再獲得、3)エピゲノムリプログラミング、を包括する過程であり、Blimp1はそれらすべての過程に必須の中心的因子であること、Prdm14は後2者に必須であることを明らかにした(Kurimoto et al.,Genes&Development,22,1617-1635,2008:Yamaji M et al.,Nature Genetics,40,1016-1022,2008)。また、ドイツマックスプランク研究所の柊卓志博士を共同研究者として、マウス初期胚における細胞系譜分化機構の解析、本方法論を用いて、神経幹細胞からの神経系形成過程(Kawaguchi et al.,Development,135,3113-3124,2008)、glioblastoma stem cellの同定、X-reactivationを起こす分子機構の解析を共同研究として推進している。

報告書

(2件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (10件) (うち査読あり 9件) 学会発表 (10件) 図書 (1件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Specification of the germ cell lineage in mice2009

    • 著者名/発表者名
      Saitou, M.
    • 雑誌名

      Frontiers in Bioscience 14

      ページ: 1068-1087

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Specification of the germ cell lineage in mice : A process orchestrated by the PR-domain proteins, Blimp1 and Prdm142008

    • 著者名/発表者名
      Kurimoto, K., et al.
    • 雑誌名

      Cell Cycle 7

      ページ: 3514-3518

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Single-cell gene profiling defines differential progenitor subclasses in mammalian neurogenesis2008

    • 著者名/発表者名
      Kawaguchi, A., et al.
    • 雑誌名

      Development 135

      ページ: 3113-3124

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A comprehensive, non-invasive visualization of primordial germ cell development in mice by the Blimp1-mVenus and stella-ECFP double transgenic reporter2008

    • 著者名/発表者名
      Ohinata, Y., et al.
    • 雑誌名

      Reproduction 136

      ページ: 503-514

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Critical function of Prdm14 for the establishment of the germ cell lineage in mice2008

    • 著者名/発表者名
      Yamaji, M., et al.
    • 雑誌名

      Nature Genetics 40

      ページ: 1016-1022

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complex genome-wide transcription dynamics orchestrated by Blimp1 for the specification of the germ cell lineage in mice2008

    • 著者名/発表者名
      Kurimoto, K., et al.
    • 雑誌名

      Genes&Development 22

      ページ: 1617-1635

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Single-cell cDNA high-density oligonucleotide microarray analysis: Detection of individual cell types and properties in complex biological processes.2008

    • 著者名/発表者名
      Saitou M, et. al.
    • 雑誌名

      Reproductive Biomedicine Online 16

      ページ: 26-40

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Maternal nucleolus is essential for early embryonic development in mammals.2008

    • 著者名/発表者名
      Ogushi S, et. al.
    • 雑誌名

      Science 319

      ページ: 613-616

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Global single-cell cDNA amplification to provide a template for representative high-density oligonucleotide microarray analysis.2007

    • 著者名/発表者名
      Kurimoto K, et. al.
    • 雑誌名

      Nature Protocols 2

      ページ: 739-752

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Cellular dynamics associated with the genome-wide epigenetic reprogramming in migrating primordial germ cells in mice.2007

    • 著者名/発表者名
      Seki Y, et. al.
    • 雑誌名

      Develoment 134

      ページ: 2627-2638

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] A signaling principle for the specification of the germ cell lineage in mice2009

    • 著者名/発表者名
      Mitinori Saitou
    • 学会等名
      International Conference on Germ Cell Development-Function&19^<th> Annual Meeting of ISSRF
    • 発表場所
      Bangalore
    • 年月日
      2009-01-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] A signaling principle for the specification of germ cell fate in mice2008

    • 著者名/発表者名
      Mitinori Saitou
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会第81回日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] A signaling principle for the specification of germ cell fate in mice2008

    • 著者名/発表者名
      Mitinori Saitou
    • 学会等名
      International Symposium on Stem Cells, Epigenetics, and Development
    • 発表場所
      Taipei
    • 年月日
      2008-09-27
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Single-cell cDNA microarray analysis of cell fate specification in mammalian development2008

    • 著者名/発表者名
      Mitinori Saitou
    • 学会等名
      3^<rd> International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • 発表場所
      Zurich
    • 年月日
      2008-09-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] A signaling principle for the specification of germ cell fate in mice2008

    • 著者名/発表者名
      Mitinori Saitou
    • 学会等名
      2008 Santa Cruz Developmental Biology Meeting
    • 発表場所
      UC Santa Cruz
    • 年月日
      2008-06-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] A signaling principle for the specification of germ cell fate in mice2008

    • 著者名/発表者名
      Mitinori Saitou
    • 学会等名
      6^<th> ISSCR (International Society for Stem Cell Research) Annual Meeting
    • 発表場所
      Philadelphia
    • 年月日
      2008-06-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Specification of the germ cell lineage in mice2008

    • 著者名/発表者名
      Saitou M
    • 学会等名
      特定領域研究科学研究費補助金生殖系列の世代サイクルとエピゲノムネットワーク〜発足記念キックオフシンポジウム〜
    • 発表場所
      丸ビルホール
    • 年月日
      2008-03-05
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] マウス生殖細胞形成に必須な遺伝子Prdm14の同定と機能解析2007

    • 著者名/発表者名
      山路 剛史, ら
    • 学会等名
      第5回幹細胞シンポジウム
    • 発表場所
      兵庫県立淡路夢舞台国際会議場
    • 年月日
      2007-05-19
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] A Potential Hierarchy of Transcriptional Regulators for the Generation of the Germ Cell Lineage in Mice2007

    • 著者名/発表者名
      Saitou M, et. al.
    • 学会等名
      CDB Symposium 2007
    • 発表場所
      (独)理化学研究所発生・再生科学総合研究センター
    • 年月日
      2007-03-26
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 単一細胞マイクロアレイ法の応用と発展2007

    • 著者名/発表者名
      斎藤 通紀
    • 学会等名
      特定領域研究科学研究費補助金幹細胞の可塑性と未分化性維持機構〜成果発表シンポジウム〜
    • 発表場所
      学士会館
    • 年月日
      2007-02-27
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [図書] Genetic and Epigenetic Control of Mammalian Germ Cell Development and Function;Epigenetic reprogramming in primordial germ cell development

    • 著者名/発表者名
      Seki Y and Saitou M
    • 出版者
      Research Signpost(In press)
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.cdb.riken.jp/en/02_research/0202_creative19.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.cdb.riken.jp/en/04_news/articles/080715_Prdm1.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.cdb.riken.jp/en/04_news/articles/080620_GeneDev.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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