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新規バイオファクター、D-アミノ酸の生合成機構と分子機能:哺乳動物への展開

研究課題

研究課題/領域番号 19380059
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用生物化学
研究機関名古屋大学

研究代表者

吉村 徹  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 教授 (70182821)

研究分担者 邊見 久  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 准教授 (60302189)
研究期間 (年度) 2007 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
19,760千円 (直接経費: 15,200千円、間接経費: 4,560千円)
2009年度: 5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2008年度: 4,420千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 1,020千円)
2007年度: 10,010千円 (直接経費: 7,700千円、間接経費: 2,310千円)
キーワードD-アミノ酸 / D-セリンデヒドラターゼ / D-セリン定量 / ピリドキサルリン酸 / スクレイピー / 細胞性粘菌 / Saccharomyces cerevisiae / Escherichia coli / D-セリン / セリンラセマーゼ / カイコ / 出芽酵母
研究概要

本研究では、Saccharomyces cerevisiaeに新奇D-セリンデヒドラターゼを見出し、その酵素学的性質を解明した。また同酵素の高い基質特異性を利用したD-セリンの新規酵素定量法を構築した。一方、BSEのモデル動物であるスクレイピー感染ハムスターで、病状の進行と各種臓器におけるD-アミノ酸濃度の変化を検討した。さらにD-アミノ酸と発生の関係を明らかにするため、単細胞から多細胞へと生活環を変化させる細胞性粘菌、Dictyostellium discoidiumをとりあげ、同菌が3種のD-セリン代謝酵素、すなわち動物型セリンラセマーゼ、D-セリンデヒドラターゼ、D-アミノ酸オキシダーゼを有することを明らかにした。さらに、細菌のアラニンラセマーゼや酵母のD-セリンデヒドラターゼと一次構造上の相同性を持ち、細菌から哺乳動物まで広く分布する機能未知タンパク質(UPF0001)のE.coliホモログであるYggSの機能解析を行った。

報告書

(4件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (34件)

すべて 2010 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (13件) (うち査読あり 12件) 学会発表 (16件) 備考 (1件) 産業財産権 (4件) (うち外国 1件)

  • [雑誌論文] The implication of YggT of Escherichia coli in osmotic regulation.2009

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Uozumi N, Nakamura T, Takayama S, Matsuda N, Aiba H, Hemmi H, Yoshimura T.
    • 雑誌名

      Biosci Biotechnol Biochem. 73

      ページ: 2698-2704

    • NAID

      10027549163

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Serine racemase with catalytically active lysinoalanyl residue.2009

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi T, Goto M, Wu HY, Uo T, Yoshimura T, Mihara H, Kurihara T, Miyahara I, Hirotsu K, Esaki N.
    • 雑誌名

      J Biochem. 145

      ページ: 421-424

    • NAID

      10026301897

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Implication of YggT of Escherichia coli in osmotic regulation2009

    • 著者名/発表者名
      Ito T.
    • 雑誌名

      Biosci.Biochem.Biotech. 73

      ページ: 2698-2704

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of a homolog of mammalian serine racemase from Schizosaccharomyces pombe2009

    • 著者名/発表者名
      Goto M.
    • 雑誌名

      J.Biol.Chem. 284

      ページ: 25944-25952

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Serine racemase with catalytically active lysinoalanyl residue2009

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi T.
    • 雑誌名

      J.Biochem. 145

      ページ: 421-424

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] D-Amino acids in the brain: structure and function of pyridoxal phosphate-dependent amino acid racemases.2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura T, Goto M.
    • 雑誌名

      FEBS J. 275

      ページ: 3527-3537

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A novel zinc-dependent D-serine dehydratase from Saccharomyces cerevisiae.2008

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Hemmi H, Kataoka K, Mukai Y, Yoshimura T.
    • 雑誌名

      Biochem J. 409

      ページ: 399-406

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] D-Amino acids in the brain : structure and function of pyridoxal phosphate-dependent amino acid racemases2008

    • 著者名/発表者名
      Yoshimura T., Goto, M.
    • 雑誌名

      FEBS J. 275

      ページ: 3527-3537

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] アミノ酸ラセマーゼの構造と機能2008

    • 著者名/発表者名
      吉村徹
    • 雑誌名

      生化学 80

      ページ: 324-330

    • NAID

      10021191626

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] A novel zinc-dependent D-serine dehydratase from Saccharomyces cerevisiae2008

    • 著者名/発表者名
      Ito, T.
    • 雑誌名

      Biochem. J. 409

      ページ: 399-406

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enzymatic assay of D-serine using D-serine dehydratase from Saccharomyces cerevisiae.2007

    • 著者名/発表者名
      Ito T, Takahashi K, Naka T, Hemmi H, Yoshimura T.
    • 雑誌名

      Anal Biochem. 371

      ページ: 167-172

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Enzymatic assay of D-serine using D-serine dehydratase from Saccharom yces cerevisiae.2007

    • 著者名/発表者名
      Ito, T.
    • 雑誌名

      Anal. Biochem. 371

      ページ: 167-172

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mode of action of a germination-specific cortex-lytic enzyme, SleC, of Clostridium perfringens S40.2007

    • 著者名/発表者名
      Kumazawa, T.
    • 雑誌名

      Biosci. Siotechnol. Siochem. 71

      ページ: 884-892

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 疾患マーカーとしてのD-アミノ酸と微生物酵素によるその検出法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      吉村徹
    • 学会等名
      日本薬学会第130年会シンポジウム
    • 発表場所
      就実大学、岡山
    • 年月日
      2010-03-29
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] D-Amino acids as disease marker and construction of their detection system2009

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      Italy-Japan Symposium New Trends in Enzyme Science and Technology
    • 発表場所
      Naples, Italy
    • 年月日
      2009-10-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書 2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Eukaryotic D-serine dehydratase from Saccharomyces cerevisiae2009

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      The first international conference of D-amino acid research
    • 発表場所
      淡路島
    • 年月日
      2009-07-04
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Eukaryotic D-serine dehydratase from Saccharomyces cerevisiae2009

    • 著者名/発表者名
      吉村徹
    • 学会等名
      The first international conference of D-amino acid research
    • 発表場所
      Awajishima, Hyogo, Japan
    • 年月日
      2009-07-04
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Eucaryotic D-serine dehydratase and its application to D-serine assay2009

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      Recent Trends in Bioconvergence Technology
    • 発表場所
      Daejeon, Korea
    • 年月日
      2009-06-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書 2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Saccharomyces cerevisiae D-セリンデヒドラターゼの反応機構2009

    • 著者名/発表者名
      吉村徹
    • 学会等名
      第61回日本ビタミン学会大会
    • 発表場所
      京都学園大学、京都
    • 年月日
      2009-05-01
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] E. coliの新奇ビタミンB6タンパク質、YggSの構造と機能2009

    • 著者名/発表者名
      伊藤智和, 吉村徹, 他
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      福岡市
    • 年月日
      2009-03-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 細胞性粘菌、Dyctiostelium discoideumのD-アミノ酸代謝関連酵素2008

    • 著者名/発表者名
      諸橋直也, 邊見久, 吉村徹, 他
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 真核生物型D-セリンデヒドラターゼの触媒機構 : 亜鉛の機能と触媒残基の同定2008

    • 著者名/発表者名
      伊藤智和, 邊見久, 吉村徹, 他
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] カイコ変態時のD-セリン動態に関する研究2008

    • 著者名/発表者名
      袴田真穂, 伊藤智和, 邊見久, 吉村徹, 他
    • 学会等名
      日本分子生物学会年会・日本生化学会大会合同大会
    • 発表場所
      神戸市
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] A novel zinc-dependent D-serine dehydratase from Saccharomyces cerevisiae2008

    • 著者名/発表者名
      Ito, T., Yoshimura, T., 他
    • 学会等名
      2nd International Interdisciplinary Conference on Vitamins, Coenzymes and Biofactors
    • 発表場所
      Athens, Georgea, USA
    • 年月日
      2008-10-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Enzymology and application of D-serine-related enzymes.2008

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      4th apan-Finland Biotechnology Symposium.
    • 発表場所
      扎幌
    • 年月日
      2008-10-02
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] A novel Zinc-dependent D-serine dehydratase of Saccharomyces cerevisiae and its application to enzymatic assay of D-serine.2008

    • 著者名/発表者名
      Tohru Yoshimura
    • 学会等名
      JSPS-NOW Joint Seminar on The 4th Japan-Netherland Joint Seminar on Enzymatic Science and Biotechnology.
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-09-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 病態解析を目的としたD-セリン酵素定量法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      中朋子, 伊藤智和, 邊見久, 吉村徹
    • 学会等名
      D-アミノ酸研究会学術講演会
    • 発表場所
      名古屋市
    • 年月日
      2008-09-20
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 細胞生粘菌セリンラセマーゼの触媒機構2008

    • 著者名/発表者名
      伊藤智和, 邊見久, 吉村徹, 他
    • 学会等名
      D-アミノ酸研究会学術講演会
    • 発表場所
      名古屋市
    • 年月日
      2008-09-19
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 真核生物型D-セリンデヒドラターゼの触媒機構2008

    • 著者名/発表者名
      伊藤智和
    • 学会等名
      2008年度日本農芸化学会大会
    • 発表場所
      名古屋市(名城大学)
    • 年月日
      2008-03-27
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.agr.nagoya-u.ac.jp/~bmm/yoshimura/index.html

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] D-アミノ酸測定法2009

    • 発明者名
      吉村徹, 加藤志郎
    • 権利者名
      国立大学法人名古屋大学
    • 産業財産権番号
      2009-241924
    • 出願年月日
      2009-10-21
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [産業財産権] D-セリンデヒドラターゼ及びその利用2009

    • 発明者名
      吉村徹, 伊藤智和
    • 権利者名
      名古屋大学
    • 出願年月日
      2009-03-21
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 外国
  • [産業財産権] D-セリンデヒドラターゼ及びその利用

    • 発明者名
      吉村徹、伊藤智和
    • 権利者名
      名古屋大学
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [産業財産権] D-アミノ酸測定法

    • 発明者名
      吉村徹、加藤志郎
    • 権利者名
      名古屋大学
    • 産業財産権番号
      2009-241924
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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