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リボ核タンパク質複合体酵素の作用機構に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 19380060
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用生物化学
研究機関九州大学

研究代表者

木村 誠  九州大学, 大学院・農学研究院, 教授 (10204992)

研究分担者 角田 佳充  九州大学, 大学院・農学研究院, 准教授 (00314360)
研究期間 (年度) 2007 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
20,020千円 (直接経費: 15,400千円、間接経費: 4,620千円)
2009年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2008年度: 4,810千円 (直接経費: 3,700千円、間接経費: 1,110千円)
2007年度: 10,400千円 (直接経費: 8,000千円、間接経費: 2,400千円)
キーワードリボヌクレアーゼP / tRNA / RNAプロセシング / リボザイム / 結晶構造 / リボ核タンパク質 / 前駆体tRNA / タンパク質結晶構造 / 超好熱古細菌 / 酵素利用学 / RNAシャペロン / リボ核ダンパク質
研究概要

超好熱古細菌(Pyrococcus horikoshii)RNase Pは、触媒活性を持つRNA(PhopRNA)と5種のタンパク質(PhoPop5, PhoRpp21, PhoRpp29, PhoRpp30, PhoRpp38)から構成されている。本研究では、タンパク質複合体(PhoRpp21-PhoRpp29)の結晶構造を決定した。さらに、タンパク質とPhopRNAの相互作用部位を生化学的手法により検討するとともに、タンパク質によるPhopRNAの構造変化を円二色性(CD)および紫外(UV)吸収スペクトルにより検討した。

報告書

(4件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて 2010 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (24件) (うち査読あり 24件) 学会発表 (11件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Archaeal homologs of human RNase P protein pairs Pop5 with Rpp30 and Rpp21 with Rpp29 word on distinct functional domains of the RNA subunit.2010

    • 著者名/発表者名
      T. Honda, T. Hara, J. Nan, X. Zhang, M. Kimura
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 74

      ページ: 266-273

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural changes in ribonuclease P in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3 induced on interaction with proteins.2010

    • 著者名/発表者名
      S. Kosaka, K. Hada, T. Nakashima, M. Kimura
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 74

      ページ: 394-396

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Archaeal homologs of human RNase P protein pairs Pop5 with Rpp30 and Rpp21 with Rpp29 word on distinct functional domains of the RNA subunit.2010

    • 著者名/発表者名
      T.Honda, T.Hara, J.Nan, X.Zhang, M.Kimura
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 74

      ページ: 266-273

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural changes in ribonuclease P in the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3 induced on interaction with proteins.2010

    • 著者名/発表者名
      S.Kosaka, K.Hada, T.Nakashima, M.Kimura
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 74

      ページ: 394-396

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Steady-state and time-resolved fluorescence spectroscopic studies on interaction of the N-terminal region with the hairpin loop of the phytocystatin Scb.2009

    • 著者名/発表者名
      K. Doi-Kawano, E. Nishimoto, Y. Kouzuma, D. Takahashi, S. Yamashita, M. Kimura
    • 雑誌名

      J. Fluoresc. 19

      ページ: 631-639

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of chondroitin polymerase from Escherichia coli K4.2009

    • 著者名/発表者名
      T. Osawa, N. Sugiura, H. Shimada, R. Hirooka, A. Tsuji, T. Shirakawa, K. Fukuyama, M. Kimura, K. Kimata, Y. Kakuta
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 378

      ページ: 10-14

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural basis for the broad range substrate specificity of a novel mouse cytosolic sulfotransferase-mSULT1D1.2009

    • 著者名/発表者名
      T. Teramoto, Y. Sakakibara, M-C. Liu, M. Suiko, M. Kimura, Y. Kakuta
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 379

      ページ: 76-80

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular and biochemical characterization of a zeta-class glutathione S-transferase of the silkmoth.2009

    • 著者名/発表者名
      K. Yamamoto, Y. Shigeoka, Y. Aso, Y. Banno, M. Kimura, T. Nakashima
    • 雑誌名

      Pest. Biochem. Physiol. 94

      ページ: 30-35

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Snapshot of a Michaelis complex in a sulfuryl transfer reaction: crystal structure of a mouse sulfotransferase, mSULT1D1, complexed with donor substrate and acceptor substrate.2009

    • 著者名/発表者名
      T. Teramoto, Y. Sakakibara, M-C. Liu, M. Suiko, M. Kimura, Y. Kakuta
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 383

      ページ: 83-87

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The action of rice branching enzyme I (BEI) on starch. Biosci.2009

    • 著者名/発表者名
      T. Akasaka, N.T. Vu, K. Chaen, A. Nishi, H. Satoh, H. Ida, T. Omori, M. Kimura
    • 雑誌名

      Biotechnol. Biochem. 73

      ページ: 2516-2518

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The C-terminal portion of an archaeal toxin aRelE plays a crucial role in protein synthesis inhibition.2009

    • 著者名/発表者名
      C. Kikutake, M. Shinohara, H. Takagi, T. Nakashima, M. Kimura
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 73

      ページ: 2766-2768

    • NAID

      10027549487

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of an archaeal Ski2p-like protein from Pyrococcus horikoshii OT3.2008

    • 著者名/発表者名
      X. Zhang, T. Nakashima, Y. Kakuta, M. Yao, I. Tanaka, M. Kimura
    • 雑誌名

      Protein Sci. 17

      ページ: 136-45

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure and functional analysis of an archaeal chromatin Alba from hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3.2008

    • 著者名/発表者名
      K. Hada, T. Nakashima, T. Osawa, H. Shimada, Y. Kakuta, M. Kimura
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 72

      ページ: 749-758

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the covalent intermediate of human cytosolic β-glucosidase.2008

    • 著者名/発表者名
      J. Noguchi, Y. Hayashi, Y. Baba, N. Okino, M. Kimura, M. Ito, Y. Kakuta
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 374

      ページ: 549-552

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Biochemical and crystallographic characterization of the starch branching enzyme I (BEI) from Oryza sativa L.2008

    • 著者名/発表者名
      N.T. Vu, H. Shimada, Y. Kakuta, T. Nakashima, H. Ida, T. Omori, A. Nishi, H. Satoh, M. Kimura
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 72

      ページ: 2858-2866

    • NAID

      10027533795

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of an archaeal homolog of the human protein complex Rpp21-Rpp29 that is a key core component for the assembly of active ribonuclease P.2008

    • 著者名/発表者名
      T. Honda, Y. Kakuta, K. Kimura, J. Saho, M. Kimura
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 384

      ページ: 652-662

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of an archaeal Ski2p-like protein from Pyrococcus horikoshiiOT32008

    • 著者名/発表者名
      X. Zhang, T. Nakashima, Y. Kakuta, M. Yao, I. Tanaka, M. Kimura
    • 雑誌名

      Protein Sci. 17

      ページ: 136-145

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure and functional analysis of an archaeal chromatin Alba from hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii 0T32008

    • 著者名/発表者名
      K. Hada, T. Nakashima. T. Osawa, H. Shimada, Y. Kakuta, M. Kimura
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 72

      ページ: 749-758

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structure of an archaeal homolog of the human protein complex Rpp21-Rpp29 that is a key core component for the assembly of active ribonuclease p.2008

    • 著者名/発表者名
      T. Honda, Y. Kakuta, K. Kimura, J. Saho, M. Kimura
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol. 384

      ページ: 652-662

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of an archaeal Ski2p-like protein from Pyrococcus horikoshii OT3.2008

    • 著者名/発表者名
      Zhang, et. al.
    • 雑誌名

      Protein Sci. 17

      ページ: 136-145

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure and functional analysis of an archaeal chromatin Alb a from hvnerthermonhilic archaeon Pvrococcus horikoshii OT3.2008

    • 著者名/発表者名
      Hada, et. al.
    • 雑誌名

      Biosci.Biotechnol.Biochem. 72

      ページ: 749-758

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of nucleotide residues essential for RNase P activity from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT3.2007

    • 著者名/発表者名
      A. Terada, T. Honda, M. Kimura
    • 雑誌名

      Biosci. Biotechnol. Biochem. 71

      ページ: 1940-1945

    • NAID

      10027517644

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Characterization of superoxide dismutase from the fall webworm, Hyphantria cunea: comparison of its properties to superoxide dismutase from the silkworm Bombyx mori.2007

    • 著者名/発表者名
      K. Yamamoto, M. Kimura, Y. Aso, Y. Banno, K. Koga.
    • 雑誌名

      Appl. Entomol. Zool. 42

      ページ: 465-472

    • NAID

      110006379849

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of nucIeotide residues essential for RNase'P activity from the hvnerthermoohilic archaeon Pvrococcus horikoshii OT3.2007

    • 著者名/発表者名
      Terada, et. al.
    • 雑誌名

      Biosci.Biotechnol.Biochem. 71

      ページ: 1940-1945

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] タンパク質合成抑制因子・RelEのC末端塩基性アミノ酸の役割2010

    • 著者名/発表者名
      篠原雅明、郭巾旭、森美佐子、中島崇、西本悦子、山下昭二、木村誠
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2010-03-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] RNase Pタンパク質はRNAシャペロンとして機能する2010

    • 著者名/発表者名
      小坂俊介、波田一誠、中島崇、木村誠
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2010-03-29
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] RNase Pタンパク質複合体Pop5-Rpp30とRpp21-Rpp29はそれぞれRNase P RNAの触媒(C)ドメインと特異性(S)ドメインを活性化する2009

    • 著者名/発表者名
      原唯史、本田貴史、中尾祐士、木村誠
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本、中四国、関西支部合同大会
    • 発表場所
      琉球大学
    • 年月日
      2009-10-31
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] タンパク質合成抑制因子・RelEのC末端領域の重要性2009

    • 著者名/発表者名
      篠原雅明、菊竹智恵、今村悠佑、森美佐子、中島崇、木村誠
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本、中四国、関西支部合同大会
    • 発表場所
      琉球大学
    • 年月日
      2009-10-31
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] RNase Pタンパク質はRNase P RNAを解くことにより活性化する2009

    • 著者名/発表者名
      小坂俊介、波田一誠、木村誠
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本、中四国、関西支部合同大会
    • 発表場所
      琉球大学
    • 年月日
      2009-10-31
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌トキシン-アンチトキシン・DinJ-YafQの生化学的性質と結晶化2009

    • 著者名/発表者名
      松尾尚紀、角田佳充、木村誠
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本、中四国、関西支部合同大会
    • 発表場所
      琉球大学
    • 年月日
      2009-10-31
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] イネ澱粉枝作り酵素I(BEI)の澱粉に対する作用2009

    • 著者名/発表者名
      赤坂泰輝、茶円喜美子、西愛子、佐藤光、井田寛子、大森俊郎、木村誠
    • 学会等名
      日本農芸化学会西日本、中四国、関西支部合同大会
    • 発表場所
      琉球大学
    • 年月日
      2009-10-31
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 大腸菌トキシン・アンチトキシン(RelE-RelB)複合体の調製とその性質2009

    • 著者名/発表者名
      今村悠佑、郭巾旭、木村誠
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2009-03-27
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 超高熱古細菌Pyrococcus horikoshii Ski2p様タンパク質の酵素活性について2009

    • 著者名/発表者名
      閻思遠、原田実季、張小冬、木村誠
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2009-03-27
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] リボヌクレアーゼpタンパク質Rpp21とRpp29の複合体形成が触媒活性に重要である2008

    • 著者名/発表者名
      本田貴史、角田佳充、木村誠
    • 学会等名
      日本生物物理学会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-12-04
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 前駆体tRNAプロセシング酵素・リボヌクレアーゼPの構造生物学的研究2007

    • 著者名/発表者名
      木村 誠
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.agr.kyushu-u.ac.jp/biosci-biotech/seibutu/

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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