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新しいエンド型・エキソ型グリコセラミダーゼの構造と機能及び応用に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 19380061
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用生物化学
研究機関九州大学

研究代表者

伊東 信  九州大学, 大学院・農学研究院, 教授 (40253512)

研究分担者 野村 一也  九州大学, 大学院・理学研究院, 准教授 (30150395)
角田 佳充  九州大学, 大学院・農学研究院, 准教授 (00314360)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
20,150千円 (直接経費: 15,500千円、間接経費: 4,650千円)
2008年度: 8,190千円 (直接経費: 6,300千円、間接経費: 1,890千円)
2007年度: 11,960千円 (直接経費: 9,200千円、間接経費: 2,760千円)
キーワード糖脂質 / 酵素 / 代謝 / X 線構造解析 / セラミド / スフィンゴ脂質 / 代謝酵素 / 結晶構造 / エンドグリコセラミダーゼ / EGALC / セラミダーゼ / グルコシルセラミド / スフィンゴ糖脂質 / KLrP / 機能解析 / 立体構造 / 6-ガラ糖脂質 / 細胞質 / 糖脂質代謝
研究概要

スフィンゴ脂質は、形質膜ミクロドメインに主として存在し、細胞内のシグナリングや細胞間の相互作用に重要な役割を演じている。本研究では、申請者らが発見した非リソソーム性スフィンゴ脂質代謝酵素の構造と機能について研究を行い、以下のような成果を上げた。先ず、哺乳動物の細胞質に存在するグルコシルセラミド(GlcCer)分解酵素(エキソ型グリコセラミダーゼ)をクローニングした。本酵素は、老化関連タンパク質クロトーのホモログ(KLrP)であった。本酵素の活性をRNAi で抑制すると、細胞内のGlcCer 量およびGlcCer骨格を持つ糖脂質量が減少することを見出し、KLrPが細胞の糖脂質代謝に関わっていることを示した。本酵素を大腸菌で大量に発現させ、グルコース及びガラクトースとの共結晶を作製し、X線結晶構造解析を行った。その結果、KLrPはαヘリックスとβストランドを8回繰り返す、典型的なTIMバレル構造を示すこと、β-ストランド4および7のC 末に存在するE165とE373がそれぞれ酸/塩基触媒残基、求核残基であることを証明した。また、本研究においてリソソーム性の中性セラミダーゼの結晶構造解析に初めて成功した。その構造は今までに報告のない新しいものであり、その触媒機構は亜鉛を触媒中心とすることを明らかにした。構造を解くことで、スフィンゴ脂質シグナリングや食餌由来のセラミドの代謝・消化への関与等、本酵素の多彩な機能が合理的に説明できた。一方、放線菌から単離したエンド型グリコセラミダーゼ(EGALC)の基質特異性を詳細に調べ、本酵素は6ガラ系列糖脂質に特異的に作用することを明らかにした。また、EGALC は加水分解のみならず糖鎖の転移反応も効率よく触媒することも明らかになった。この特異性を利用した、6-ガラ系列糖脂質の蛍光標識法及び微量定量法を開発し、その方法を用いて、病原性の原虫、糸状菌、及び食用海藻等に6-ガラ系列糖脂質が存在することを見出した。海藻から単離した6-ガラ系列糖脂質の構造解析を行い、その構造を1-phytyl-3-O-[α-D-galactopyranosyl-(1-6)-β-D-galactopyranosyl]- glycerol と同定した。このような構造の糖脂質は初めての報告である。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (15件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (10件) 図書 (3件)

  • [雑誌論文] Mechanistic insights into the hydrolysis and synthesis of ceramide by neutral ceramidase2009

    • 著者名/発表者名
      T. Inoue, N. Okino, Y. Kakuta, M. Ito. (他8人)
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 284

      ページ: 9566-9577

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Transglycosylation-based fluorescent labeling of 6-gala series glycolipids by EGALC2009

    • 著者名/発表者名
      Y. Ishibashi, M. Ito (他7名)
    • 雑誌名

      Glycobiology (in press)

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Simultaneous quantification of glucosylceramide and galactosylceramide by normal phase HPLC using O-phtalaldehyde derivatives prepared with sphingolipid ceramide N-deacylase2009

    • 著者名/発表者名
      K. Zama, M. Ito (他6名)
    • 雑誌名

      Glycobiology (in press)

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Mechanical insights into the hydrolysis and synthesis of ceramide by neutral ceramidase2009

    • 著者名/発表者名
      G. Inoue, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemsitry 284

      ページ: 9566-9577

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Crystal structure of the covalent intermediate of human cytosolic β-glucosidase2008

    • 著者名/発表者名
      J. Noguchi, M. Ito, Y. Kakuta. (他4人)
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 374

      ページ: 549-552

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] A sensitive and reproducible fluorescent-based HPLC assay to measure the activity of acid as well as neutral β-glucocerebrosidase2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Hayashi, M. Ito. (他5名)
    • 雑誌名

      Analy. Biochem. 383

      ページ: 122-129

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Crystal structure of the covalent intermediate of human cytosolic β-glucosidase2008

    • 著者名/発表者名
      J. Noguchi, et al.
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications 374

      ページ: 549-552

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A sensitive and reproducible fluorescent-based HPLC assay to measure the activity of acid as well as neutral β-glucocerebrosidases2008

    • 著者名/発表者名
      H. Hayashi, et al.
    • 雑誌名

      Analytical Biochemistry 383

      ページ: 122-129

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Klotho-related protein is a novel cytosolic neutral β-glycosylceramidase2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Hayashi, N. Okino, Y, Kakuta, M. Ito. (他3名)
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 282

      ページ: 30889-30900

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] A novel endoglycoceramidase hydrolyzes oligogalactosylceramides to produce galactooligosaccharides and ceramides2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Ishibashi, M. Ito (他12名)
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem. 282

      ページ: 11386-11396

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Synthesis of fluorescent glycosphingolipids and neoglycoconjugates which contain 6-gala oligosaccharides using the transglycosylation reaction of a novel endogalacosylceramidase(EGALC)2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Ishibashi, M. Ito. (他2名)
    • 雑誌名

      J. Biochem. 142

      ページ: 239-246

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Fucosyl GM1a, an endoglycoceramidase-resistant ganglioside of porcine brain2007

    • 著者名/発表者名
      X. Xu, M. Ito(他7名)
    • 雑誌名

      J. Biochem. 141

      ページ: 1-7

    • NAID

      10020101680

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Anovel endogalactosylceramidase hydrolyzes oligogalactosylceramides toproduce galactooligosachharides and ceramides2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Ishibashi, et. al.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 282

      ページ: 11386-11396

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Synthesis of fluorescent glycosphingolipids and neoglycoconjugates whichcontain 6-gala oligosaccharides using the transglycosylation reaction ofanovel endoglycoceramidase(EGALC)2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Ishibashi, et. al.
    • 雑誌名

      Journal of Biochemisty 142

      ページ: 239-246

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Kltoho-related protein is a novel cytosolic neutral b-glycosylceramidase2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Hayashi, et. al.
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry 282

      ページ: 30889-30900

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] スフィンゴ脂質代謝マシーナリーの解明と その応用2008

    • 著者名/発表者名
      伊東信
    • 学会等名
      産業酵素国際シンポジウム
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-03-07
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Novel catabolic pathway of glycosphingolipids2008

    • 著者名/発表者名
      M. Ito
    • 学会等名
      Gordon Research Congerence
    • 発表場所
      Lucca, Italy
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Novel metabolic pathway of glucosylceramide involving Klotho-related protein : Insights into Gaucher disease2008

    • 著者名/発表者名
      M. Ito
    • 学会等名
      Lysosomal Diseases and the Brain Conferernce 2008
    • 発表場所
      Sacramento, USA
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 非リソソーム性のスフィンゴ脂質代謝酵素の構造と機能2008

    • 著者名/発表者名
      伊東信
    • 学会等名
      酵素とタンパク質に関するシンポジウム
    • 発表場所
      熊本
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] セラミダーゼとグルコセレブロシダーゼの構造と機能2008

    • 著者名/発表者名
      伊東信
    • 学会等名
      セラミド研究会
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 新しいグルコセレブロシダーゼKLrP の発見2008

    • 著者名/発表者名
      伊東信
    • 学会等名
      第3回スフィンゴテラピィー研究会
    • 発表場所
      鳥取
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] ゼブラフィッシュ初期発生におけるセラミド代謝の機能解析2008

    • 著者名/発表者名
      吉村征浩、座間宏太、伊東信
    • 学会等名
      シンポジウム「モデル生物を用いた脂質生物学」BMB2008
    • 発表場所
      神戸
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Novel metabolic pathway of glucosylceramide involving Klotho-related protein : Insights into Gaucher disease2008

    • 著者名/発表者名
      M. Ito
    • 学会等名
      Lysosomal Diseases and the Brain Conference 2008
    • 発表場所
      Sacramento, USA
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Novel catabolic pathway of glycosphingolipids involving KLrP2007

    • 著者名/発表者名
      M. Ito
    • 学会等名
      Gordon Reserch Conferernce
    • 発表場所
      Lucca, Italy
    • 年月日
      2007-02-20
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] A novel catabolic pathway of GSLs mediated with a Klotho-related protein2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Hayashi, Y. Kakuta, M. Ito (他4名)
    • 学会等名
      International Conference on the Bioscience of Lipids
    • 発表場所
      Finland. Best poster award
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] ベーシックマスター生化学(大山隆編)2008

    • 著者名/発表者名
      伊東信(糖質)
    • 出版者
      オーム社
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] ベーシッスクマスター生化学(糖質の生化学)2008

    • 著者名/発表者名
      伊東 信 (共著)
    • 総ページ数
      414
    • 出版者
      オーム社
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] Comprehensive Glycoscience (Editor-in-Chief, J. P. Kamerling)

    • 著者名/発表者名
      M. Ito
    • 出版者
      Degradation of glycolipid Degradation of glycolipid Elsevier
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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