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第三紀後期のユーラシア産小型哺乳類の断続的放散と環境適応に関する分子系統学的解析

研究課題

研究課題/領域番号 19405010
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分海外学術
研究分野 生物多様性・分類
研究機関北海道大学

研究代表者

鈴木 仁  北海道大学, 大学院・地球環境科学研究院, 准教授 (40179239)

研究分担者 佐藤 淳  福山大学, 生命工学部, 講師 (80399162)
篠原 明男  宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター・実験支援部門, 助教 (50336294)
甲能 直樹  独立行政法人国立科学博物館, 地学研究部, 主任研究官 (20250136)
連携研究者 篠原 明男  宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 助教 (50336294)
甲能 直樹  独立行政法人国立科学博物, 地学研究部, 主任研究官 (20250136)
研究期間 (年度) 2007 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
5,330千円 (直接経費: 4,100千円、間接経費: 1,230千円)
2009年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2008年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
2007年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円)
キーワード第三紀 / 哺乳類 / 遺伝子 / 進化 / 分子系統 / 環境適応 / 系統地理 / 適応放散 / 日本列島 / ユーラシア
研究概要

分子系統学的解析の結果、ネズミ類、ウサギ類、モグラ類、イタチ類は500-600万年前、200-300万年前の2回の系統放散により、東南アジア、インド、ミャンマーなどの空間を拠点として種の多様化が起きたことが明らかとなった。このグローバルな傾向に呼応し日本列島の哺乳類種の多様化が生じたことも示唆された。広域分散後の系統において毛色関連遺伝子Mclrのアミノ酸置換速度が加速化された例が見出された。

報告書

(4件)
  • 2009 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (60件)

すべて 2010 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (24件) (うち査読あり 20件) 学会発表 (34件) 図書 (2件)

  • [雑誌論文] Detection of recombinant haplotypes in wild mice (Mus musculus) provides new insights into the origin of Japanese mice2010

    • 著者名/発表者名
      Nunome, M, Ishimori, C, Aplin, K, Tsuchiya, K, Yonekawa, H, Moriwaki, K, Suzuki, H.
    • 雑誌名

      Molecular Ecology (in press)

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The influence of Pleistocene refugia on the evolutionary history of the Japanese hare, Lepus brachyurus2010

    • 著者名/発表者名
      Nunome, M, Torii, H, Matsuki, R, Kinoshita, G, Suzuki, H.
    • 雑誌名

      Zoological Science

    • NAID

      40017358638

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Mitochondrial phylogeo- graphy and population his tory of the large Japanese wood mouse (Apodemus speciosus) on Sado Island, Japan2010

    • 著者名/発表者名
      Tomozawa, M, Tomida, H, Suzuki, H, Tsuchiya, K.
    • 雑誌名

      Mammal Study 35

      ページ: 93-97

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Muslepidoides (Muridae, Rodentia) of Central Burma is a Distinct Species of Potentially Great Evolutionary and Biogeographic Significance2010

    • 著者名/発表者名
      Shimada, T, Aplin, KP, Suzuki, H.
    • 雑誌名

      Zoological Science 27(5)

      ページ: 449-459

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Detection of recombinant haplotypes in wild mice(Mus musculus)provides new insights into the origin of Japanese mice.2010

    • 著者名/発表者名
      Nunome Mitsuo
    • 雑誌名

      Molecular Ecology (in press)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deciphering and dating the red panda's ancestry and early adaptive radiation of Musteloidea2009

    • 著者名/発表者名
      Sato, JJ, Wolsan, M, Minami, S, Hosoda, T, Sinaga, MH, Hiyama, K, Yamaguchi, Y, Suzuki, H.
    • 雑誌名

      Molecular Phylogenetics and Evolution 53

      ページ: 907-922

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Comparative analysis of evolutionary modes in Mc1r coat color gene in wild mice and mustelids2009

    • 著者名/発表者名
      Shimada T, Sato JJ, Aplin KP, Suzuki H
    • 雑誌名

      Genes & Genet Systems 84

      ページ: 225-231

    • NAID

      10026091041

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] オキナワトゲネズミ再発見と, トゲネズミ研究の最近2009

    • 著者名/発表者名
      山田文雄, 黒岩麻里, 鈴木仁, 村田智慧
    • 雑誌名

      哺乳類科学 49

    • NAID

      10030471878

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] A molecular phylogenetic view of mammals in the "three-story museum" of Hokkaido, Honshu, and Ryukyu Islands2009

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, H.
    • 雑誌名

      The Wild Mammals of Japan.(Eds., Ohdachi SD, Ishibashi Y, Iwasa MA, Saitoh T, Shoukadoh)

      ページ: 261-263

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Mozaic genome structure of multiple subspecies in the Japanese wild mouse Mus musculus2009

    • 著者名/発表者名
      Nunome., M., Suzuki H., Moriwaki K.
    • 雑誌名

      The Wild Mammals of Japan.(Eds., Ohdachi SD, Ishibashi Y, Iwasa MA, Saitoh T, Shoukadoh)

      ページ: 180-181

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Comparative analysis of evolutionary modes in Mc1r coat color gene in wild mice and mustelids.2009

    • 著者名/発表者名
      Tomofumi Shimada
    • 雑誌名

      Genes & Genetic Systems 84

      ページ: 225-231

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deciphering and dating the red panda's ancestry.2009

    • 著者名/発表者名
      Jun J.Sato
    • 雑誌名

      Mol Phylogenet Evol 53

      ページ: 907-922

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A biogeographic view of Apodemus in Asia and Europe inferred from nuclear and mitochondrial gene sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, H., Filippucci, MG., Chelomina, GN., Sato, JJ., Serizawa, K, Nevo, E.
    • 雑誌名

      Biochemical Genetics 46

      ページ: 329-346

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A trend of central versus peripheral structuring in mitochondrial and nuclear gene sequences of the Japanese wood mouse, Apodemus speciosus2008

    • 著者名/発表者名
      Tomozawa, M, Suzuki, H.
    • 雑誌名

      Zoological Science 25

      ページ: 273-285

    • NAID

      40016029301

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationships of the short-faced mole, Scaptochirus moschatus (Mammalia : Eulipotyphla), among Eurasian fossorial moles, as inferred from mitochondrial and nuclear gene sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Shinohara, A, Kawada, S, Harada, M, Koyasu, K, Oda, S, Suzuki, H.
    • 雑誌名

      Mammal Study 33

      ページ: 77-82

    • NAID

      10027006818

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Isolation and development of microsatellite markers for the Japanese dormouse, Glirulus japonicus2008

    • 著者名/発表者名
      Yasuda, SP, Nakayama, A, Iwabuchi, M, Minato, S, Tsuchiya, K, Suzuki, H.
    • 雑誌名

      Molecular Ecology Resources 9

      ページ: 569-571

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 日本の野生哺乳類にみる毛色の進化2008

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 雑誌名

      生物の科学遺伝 62(6)

      ページ: 60-61

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [雑誌論文] A biogeographic view of Apodemus in Asia and Europe inferred from nuclear and mitochondrial gene sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Hitoshi Suzuki
    • 雑誌名

      Biochemical Genetics 46

      ページ: 329-334

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A Trend of Central versus Peripheral Structuring Appeared in Mitochondrial and Nuclear Gene Sequences of the Japanese Wood Mouse Apodemus speciosus2008

    • 著者名/発表者名
      Morihiko Tomozawa
    • 雑誌名

      Zoologicl Science 25

      ページ: 273-285

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationships of the short-faced mole, Scaptochirus moschatus (Mammalia : Eulipotyphla), among Eurasian fossorial moles, as inferred from mitochondrial and nuclear gene sequences2008

    • 著者名/発表者名
      Akio Shinohara
    • 雑誌名

      Mammal Study 33

      ページ: 77-82

    • NAID

      10027006818

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationships and divergence times among dormice (Rodentia, Gliridae) based on three nuclear genes2007

    • 著者名/発表者名
      Nunome, M., Yasuda, SP., Sato, JJ., Vogel, P., Suzuki, H.
    • 雑誌名

      Zoological Scripta 36

      ページ: 537-546

    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Complex phylogeographic structuring in a continental small mammal from East Asia, the rice field mouse, Mus caroli(Rodentia, Muridae).2007

    • 著者名/発表者名
      Tomofumi Shimada
    • 雑誌名

      Mammal Study 32

      ページ: 49-62

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rediscovery of Mus nitidulus Blyth, 1859(Rodentia, Muridae), an endemic murine rodent of the central basin of Myanmar.2007

    • 著者名/発表者名
      Tomofumi Shimada
    • 雑誌名

      Zootaxa 1498

      ページ: 45-68

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Phylogenetic relationships and divergence times among dormice(Rodentia,Gliridae)based on three nuclear genes.2007

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Nunome
    • 雑誌名

      Zoologica Scripta 36

      ページ: 537-546

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] ユーラシア産野生ハツカネズミの系統地理学的解析2009

    • 著者名/発表者名
      臼田大輝
    • 学会等名
      日本遺伝学会第81回大会
    • 発表場所
      松本
    • 年月日
      2009-09-17
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本産小型哺乳類の系統地理学的概観と進化遺伝学への活用2009

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      日本遺伝学会ワークショップ : 遺伝学の素材としての日本の野生生物 (オーガナイザー)
    • 発表場所
      松本
    • 年月日
      2009-09-16
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] A role of Pleistocene refugia in shaping genetic diversity of the Japanese hare, Lepus brachyurus.2009

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Nunome
    • 学会等名
      第10回国際哺乳類学会議
    • 発表場所
      アルゼンチン・メンドーサ
    • 年月日
      2009-08-09
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 野生ネズミ類の多様性の歴史とゲノム学への活用2009

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      第89回理研バイオリソースセンターセミナー
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2009-08-04
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Mus 属のユーラシア亜熱帯域での展開とモロシヌスの来た道2009

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      第23回モロシヌス研究会
    • 発表場所
      大津市
    • 年月日
      2009-07-11
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本産モグラ類の分子系統と系統地理2009

    • 著者名/発表者名
      桐原崇
    • 学会等名
      研究交流会「哺乳類の多様性研究」
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2009-06-23
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアDNAから見た台湾産イタチ類相の形成史2009

    • 著者名/発表者名
      細田徹治
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      台北大会
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 複数遺伝子座を用いたニホンノウサギ4亜種の遺伝的背景の解析2009

    • 著者名/発表者名
      布目三夫
    • 学会等名
      日本哺乳類学会2009年度大会
    • 発表場所
      (口頭発表)
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] A role of Pleistocene refugia in shaping genetic diversity of the Japanese hare, Lepus brachyurus2009

    • 著者名/発表者名
      Nunome, M.
    • 学会等名
      第10回国際哺乳類学会議
    • 発表場所
      アルゼンチン ポスター発表
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Multilocus phylogeny of Mustelidae and the ancestroy of the South American species2009

    • 著者名/発表者名
      Wolsan, M.
    • 学会等名
      第10回国際哺乳類学会議
    • 発表場所
      アルゼンチン
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] トゲネズミの進化的位置づけ2008

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      山口
    • 年月日
      2008-09-13
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ミトコンドリアDNAおよび核遺伝子配列からみたコウベモグラ Mogera2008

    • 著者名/発表者名
      桐原崇
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      山口
    • 年月日
      2008-09-13
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 複数の遺伝子配列の変異に基づく日本産野生ハツカネズミの起源2008

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      日本動物学会第79回大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-09-06
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本産野生ハツカネズミのが持つことなる亜種に由来する4つの遺伝的要素の特定2008

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      日本遺伝学会第80回大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-09-03
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 第三紀後期以降の哺乳類の断続的放散と日本産小型哺乳類の起源~韓国から日本への系統移入の多様な物語~2008

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      韓国国立バイオリソースセンター (National Institute of Biological Resources(NIBR))
    • 発表場所
      仁川
    • 年月日
      2008-05-21
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 第三紀後期以降の哺乳類の断続的放散と日本産小型哺乳類の起源-韓国から日本への系統移入の多様な物語2008

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      韓国国立バイオリソースセンター(National Institute of Biological Resources)特別講演会
    • 発表場所
      韓国国立バイオリソースセンター(韓国仁川)
    • 年月日
      2008-05-21
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] マイクロサテライトを用いたニホンヤマネの配偶システムと巣箱共有個体の血縁関係解析2008

    • 著者名/発表者名
      安田俊平
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      山口
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] マイクロサテライトマーカーを用いたアカネズミ島嶼集団の遺伝解析2008

    • 著者名/発表者名
      友澤森彦
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      山口
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 第四紀の複数のレフュージアがニホンノウサギの遺伝的多様性に与えた影響についての系統地理学的解析2008

    • 著者名/発表者名
      布目三夫
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      山口
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 野生ハツカネズミの系統地理学的研究へのSNPsの活用2008

    • 著者名/発表者名
      臼田大輝
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      山口
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] Mc1r遺伝子の変異に基づく日本産クマネズミ Rattus rattus の遺伝的背景の解析2008

    • 著者名/発表者名
      神戸嘉一
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      山口
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ESU策定のための汎用分子マーカー開発の試み -ニホンヤマネをモデルとして-2008

    • 著者名/発表者名
      安田俊平
    • 学会等名
      日本進化学会第10回大会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] The role of Pleistocene refugia in shaping genetic diversity of the Japanese hare (Lepus brachyurus)2008

    • 著者名/発表者名
      布目三夫
    • 学会等名
      Hokkaido University Sustainability Weeks G8 Summit Round
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本固有種ニホンテンの保全遺伝学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      佐藤淳
    • 学会等名
      第55回日本生態学会
    • 発表場所
      福岡
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本産野生ハツカネズミにおける亜種間組換体探索と二次的接触の時空間動態把握2007

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      東京都・東京農工大学・農学部
    • 年月日
      2007-09-17
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] A thirty-year project of the genetic survey on the wild mice Modern Achievements in Population2007

    • 著者名/発表者名
      Suzuki, H
    • 学会等名
      Evolutionary and Ecological Genetics
    • 発表場所
      ウラジオストック
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 下顎骨形態およびBmp4遺伝子からみたコウベモグラ (Mogera wogura) の種内変異2007

    • 著者名/発表者名
      桐原崇
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ニホンノウサギにみられる冬毛の白化が集団の遺伝的分化に与える影響の検証2007

    • 著者名/発表者名
      布目三夫
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 多重遺伝子族5S rDNAの変異を利用した集団の遺伝的分化の検出2007

    • 著者名/発表者名
      安田俊平
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 日本産野生ハツカネズミにおける亜種間組換体探索と二次的接触の時空間動態把握2007

    • 著者名/発表者名
      鈴本仁
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 複数の核遺伝子から見たアカネズミの遺伝的多様性~伊豆諸島集団の遺伝的独自性~2007

    • 著者名/発表者名
      友澤森彦
    • 学会等名
      日本哺乳類学会
    • 発表場所
      東京
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 複数の核遺伝子を用いたアカネズミ地域集団の歴史推定2007

    • 著者名/発表者名
      友澤森彦
    • 学会等名
      日本動物学会
    • 発表場所
      弘前
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] ニホンヤマネは何種いるのか : 遺伝子の解析から見えてきたこと2007

    • 著者名/発表者名
      安田俊平
    • 学会等名
      日本動物学会
    • 発表場所
      弘前
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [学会発表] 連鎖遺伝子群のイントロン配列解析と日本産野生ハツカネズミの起源2007

    • 著者名/発表者名
      鈴木仁
    • 学会等名
      日本遺伝学会第79回大会
    • 発表場所
      岡山
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書
  • [図書] The Wild Mammals of Japan. 分担執筆 261~2632009

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Hitoshi
    • 総ページ数
      544
    • 出版者
      Shoukadoh, Kyoto
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] 第3章レッドエコシステム ボルネオ (大崎満、岩熊編)2008

    • 著者名/発表者名
      甲山隆司, 鈴木仁
    • 出版者
      岩波出版
    • 関連する報告書
      2009 研究成果報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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