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固体核磁気共鳴シミュレーション解析法によるタンパク質結晶の水和構造の研究

研究課題

研究課題/領域番号 19510103
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 ナノ構造科学
研究機関金沢大学

研究代表者

水野 元博  金沢大学, 物質化学系, 教授 (70251915)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2008年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円)
2007年度: 3,250千円 (直接経費: 2,500千円、間接経費: 750千円)
キーワード複合材料・物性 / 蛋白質 / 物性実験 / タンパク質
研究概要

固体重水素の核磁気共鳴(NMR)スペクトルのシミュレーション解析法を開発し、これらを用いて卵白リゾチーム結晶, アルブミン結晶, フェリチン結晶の水和水のダイナミクスの解析を行った。その結果, これらの結晶中には運動性の低い水分子と低温(200K付近)まで速い運動をしている水分子が存在することが確認された。200K以下では速い運動をしていた水分子の速度が急激に遅くなり, 水分子の構造(H-O-H角)に分布が生じることが明らかになった。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (11件) (うち査読あり 11件) 学会発表 (13件) 図書 (2件) 備考 (3件)

  • [雑誌論文] Deuterium NMR Study of Molecular Dynamics and Phase Transition in Acetonitrile Crystal2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Suzuki, M. Sato, K. Takanohashi, T. Ida, M. Mizuno*
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A 112

      ページ: 13481-13486

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamics of [Zn(D_2O)_6]^<2+> in [Zn(D_2O)_6] [SiF_6] Crystal as Studied by 1D, 2D Spectra and Spin-Lattice Relaxation Time of ^2H NMR2008

    • 著者名/発表者名
      T. Araya, A. Niwa, M. Mizuno*, K. Endo
    • 雑誌名

      Chem. Phys 344

      ページ: 291-298

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformation and Molecular Dynamics of Single Polystyrene Chain Confined in Coordination Nanospace2008

    • 著者名/発表者名
      T. Uemura, S. Horike, K. Kitagawa, M. Mizuno, K. Endo, S. Bracco, A. Comotti, M. Nagaoka, S. Kitagawa
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc 130

      ページ: 6781-6788

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photochromism of an Organorhodium Dithionite Complex in the Crystalline-State : Molecular Motion of Pentamethylcyclopentadienyl Ligands Coupled to Atom Rearrangement in a Dithionite Ligand2008

    • 著者名/発表者名
      H. Nakai, T. Nonaka, Y. Miyano, M. Mizuno, Y. Ozawa, K. Toriumi, N. Koga, T. Nishioka, M. Irie, K. Isobe
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc 130

      ページ: 17836-17845

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Substitution Effects of Cp Ring Benzyl Groups on Photoisomerization of a Rhodium Dithionite Complex in the Crystalline State2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Miyano, H. Nakai, M. Mizuno, K. Isobe
    • 雑誌名

      Chem. Lett 37

      ページ: 826-827

    • NAID

      10024281275

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Deuterium NMR Study of Molecular Dynamics and Phase Transition in Acetonitrile Crystal2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Suzuki, M. Sato, K. Takanohashi, T. Ida, M. Mizuno
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A 112

      ページ: 13481-13486

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformation and Molecular Dynamics of Single Polystyrene Chain Confined in Coordination Nanospace2008

    • 著者名/発表者名
      T. Uemura, S. Horike, K. Kitagawa, M. Mizuno, K. Endo, S. Bracco, A. Comotti, M. Nagaoka, S. Kitagawa
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc. 130

      ページ: 6781-6788

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Photochromism of an Organorhodium Dithionite Complex in the Crystalline-State : Molecular Motion of Pentamethylcyclopentadienyl Ligands Coupled to Atom Rearrangement in a Dithionite Ligand2008

    • 著者名/発表者名
      H. Nakai, T. Nonaka, Y. Miyano, M. Mizuno, Y. Ozawa, K. Toriumi, N. Koga, T. Nishioka, M. Irie, Kisobe
    • 雑誌名

      J. Am. Chem. Soc. 130

      ページ: 17836-17845

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Dynamics of [Zn(D20)6]^<2+> in [Zn(D_2O_6][SiF_6] Crystal as Studied by 1D, 2D Spectra and Spin-Lattice Relaxation Time of ^2H NMR2008

    • 著者名/発表者名
      T.Araya, A.Niwa, M.Mizuno, K.Endo
    • 雑誌名

      Chem.Phys. 344

      ページ: 291-298

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics in Paramagnetic Materials as Studied by Magic-Angle Spinning ^2H NMR Spectra2007

    • 著者名/発表者名
      M. Mizuno*, Y. Suzuki, K. Endo, M. Murakami, M. Tansho, T. Shimizu
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. A 111

      ページ: 12954-12960

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Molecular Dynamics in Paramag netic Materials as Studied by Magic-Angle Spinning ZHNMR Spectra2007

    • 著者名/発表者名
      M. Mizuno, Y. Suzuki, K. Endo, M. Murakami, M. Tansho, T. Shimizu
    • 雑誌名

      J.Phys.Chem.A 111

      ページ: 12954-12960

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 固体NMRによるリゾチーム結晶中の水和水のダイナミクスと構造の研究2009

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 宮東達也, 水野元博
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      船橋
    • 年月日
      2009-03-30
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 固体NMRによるリゾチーム結晶中の水和水のダイナミクスと構造の研究2009

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 宮東達也, 水野元博
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      日本大学理工学部船橋キャンパス
    • 年月日
      2009-03-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Hydration Water Dynamics in Biomaterials Studied by Simulation Analysis of Deuterium Solid-State NMR2009

    • 著者名/発表者名
      M. Mizuno, T. Araya, T. Miyato
    • 学会等名
      Joint International Open Symposium for Molecular Science, Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      Okazaki, Japan
    • 年月日
      2009-03-17
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Hydration Water Dynamics in Biomaterials Studied by Simulation Analysis of Deuterium Solid-state NMR2009

    • 著者名/発表者名
      水野元博, 新屋隆士, 宮東達也
    • 学会等名
      Joint International Open Symposium for Molecular Science and Fluctuations toward Biological Functions
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター
    • 年月日
      2009-03-17
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 固体^2H NMRによるウシ血清アルブミン結晶中の水和水のダイナミクスの研究2008

    • 著者名/発表者名
      宮東達也, 新屋隆士, 水野元博
    • 学会等名
      平成20年度日本化学会近畿支部北陸地区講演会と研究発表会
    • 発表場所
      福井
    • 年月日
      2008-11-15
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 固体NMRによるフェリチン結晶の水和水のダイナミクスの研究2008

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 宮東達也, 水野元博
    • 学会等名
      第47回NMR討論会
    • 発表場所
      筑波大学大学会館講堂
    • 年月日
      2008-11-14
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 固体NMRによるフェリチン結晶の水和水のダイナミクスの研究2008

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 宮東達也, 水野元博
    • 学会等名
      第47回NMR討論会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2008-11-12
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 固体NMRによるリゾチーム結晶の水和水のダイナミクスと物性の研究2008

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 水野元博
    • 学会等名
      分子科学討論会2008
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2008-09-25
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 固体NMRによるリゾチーム結晶の水和水のダイナミクスと物性の研究2008

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 水野元博
    • 学会等名
      第2回分子科学討論会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 年月日
      2008-09-25
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 固体NMRによるリゾチーム結晶の水和水のダイナミクスと局所構造の研究2008

    • 著者名/発表者名
      新屋隆士, 水野元博, 遠藤一央
    • 学会等名
      日本化学会第88春季年会
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2008-03-28
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 固体NMRによるリゾチーム結晶の水和水のダイナミクスと構造の研究2008

    • 著者名/発表者名
      新屋 隆士、水野 元博、遠藤 一央
    • 学会等名
      第88回目本化学会春季年会
    • 発表場所
      立教大学 池袋キャンパス
    • 年月日
      2008-03-28
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Development of Solid-State NMR Simulation for Analysis of Coordination Space2007

    • 著者名/発表者名
      M. Mizuno, Y. Suzuki, K. Endo, M. Murakami, M. Tansho, T. Shimizu
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • 年月日
      2007-12-09
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Separation of ^2H MAS NMR Spectra in Paramagnetic Compounds by Two-Dimensional Spectroscopy2007

    • 著者名/発表者名
      M. Mizuno, Y. Suzuki, K. Endo, M. Murakami, M. Tansho, T. Shimizu
    • 学会等名
      16^<th> Triennial Conference for the International Society of Magnetic Resonance
    • 発表場所
      Kenting, Taiwan
    • 年月日
      2007-10-13
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] 多核種の溶液および固体NMR錯体化学会選書42008

    • 著者名/発表者名
      北川進, 水野元博, 前川雅彦
    • 総ページ数
      349
    • 出版者
      三共出版
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] 多核種の溶液および固体NMR2008

    • 著者名/発表者名
      北川進, 水野元博, 前川雅彦
    • 総ページ数
      349
    • 出版者
      三共出版
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://chem.s.kanazawa-u.ac.jp/theo/index.html

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://chem.s.kanazawa-u.ac.jp/theo/index.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://chem.s.kanazawa-u.ac.jp/theo/index.html

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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