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バイオ分子の自己組織化によるマイクロ・ナノ構造形成ダイナミクス

研究課題

研究課題/領域番号 19560091
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 機械材料・材料力学
研究機関京都大学

研究代表者

安達 泰治  京都大学, 大学院・工学研究科, 准教授 (40243323)

研究分担者 北條 正樹  京都大学, 大学院・工学研究科, 教授 (70252492)
田中 基嗣  金沢工業大学, 工学部, 講師 (30346085)
研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円)
2008年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
2007年度: 2,600千円 (直接経費: 2,000千円、間接経費: 600千円)
キーワードマイクロ・ナノバイオメカニクス / 生体分子 / DNA / 自己組織化 / ナノ・バイオ工学 / 一本鎖DNA / バイオメカニクス / マイクロ・ナノ構造 / 分子ダイナミクス / タンパク質・DNA / ナノ・バイオエンジニアリング / タンパク・DNA / ナノバイオ
研究概要

本研究では, DNAを用いたボトムアップ型微小構造物の作製において重要となる環状一本鎖DNAの作製過程において, Precursor DNAとTemplate DNAの塩基長が, 最終的な構造に及ぼす影響を明らかにした. 同一のPrec.DNAに対しては, 長いTemp.DNAを用いることで, 直列の多量体環が産生されることが示され, 適切な一本鎖DNAの長さと組み合わせの選択により, 単量体環と多量体環の産生比率を制御できる可能性を示した.

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (25件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (15件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] Coarse-grained Modeling and Simulation of Actin Filament Behavior Based on Brownian Dynamics Method2009

    • 著者名/発表者名
      Yoshitaka Shimada, Taiji Adachi, Yasuhiro Inoue, and Masaki Hojo
    • 雑誌名

      Molecular and Cellular Biomechanics in press

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Strain Field in Actin Filament Network in Lamellipodia of Migrating Cells : Implication for Network Reorganization2009

    • 著者名/発表者名
      Taiji Adachi, Kennedy O. Okeyo, Yoshimichi Shitagawa, and Masaki Hojo
    • 雑誌名

      Journal of Biomechanics 42-3

      ページ: 297-302

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Strain Field in Actin Filament Network in Lamellipodia of Migrating Cells : Implication for Network Reorganization2009

    • 著者名/発表者名
      Taiji Adachi, Okeyo Kennedy Omondi, Yoshimichi Shitagawa, Masaki Hojo
    • 雑誌名

      Journal of Biomechanics 42-3

      ページ: 2678-2689

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Coarse-grained Modeling and Simulation of Actin Filament Behavior Based on Brownian Dynamics Method2009

    • 著者名/発表者名
      Yoshitaka Shimada, Taiji Adachi, Yasuhiro Inoue, Masaki Hojo
    • 雑誌名

      Molecular and Cellular Biomechanics (印刷中)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simultaneous observation of calcium signaling response and membrane deformation due to localized mechanical stimulus in single osteoblast-like cells2008

    • 著者名/発表者名
      Taiji Adachi, Katsuya Sato, Norio Higashi, Yoshihiro Tomita, and Masaki Hojo
    • 雑誌名

      Journal of Mechanical Behavior of Biomedical Materials 1-1

      ページ: 43-50

    • NAID

      120001741839

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Simultaneous Observation of Calcium Signaling Response and Membrane Deformation due to Localized Mechanical Stimulus in Single Osteoblast-like2008

    • 著者名/発表者名
      Taiji Adachi, Katsuya Sato, Norio Higashi, Yoshihiro Tomita, and Masaki
    • 雑誌名

      Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials 1-1

      ページ: 43-50

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Measurement of Local Strain on Cell Membrane at Initiation Point of Calcium Signaling Response to Applied Mechanical Stimulus in Osteoblastic Cell2007

    • 著者名/発表者名
      Katsuya Sato, Taiji Adachi, Daisuke Ueda, Masaki Hojo, and Yoshihiro
    • 雑誌名

      Journal of Biomechanics 40-6

      ページ: 1246-1255

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] ヒト大腿骨近位部海綿骨の骨梁リモデリングシミュレーション2007

    • 著者名/発表者名
      安達泰治, 鈴木優介, 坪田健一, 北條正樹
    • 雑誌名

      日本骨形態計測学会誌 17

      ページ: 15-20

    • NAID

      10024126884

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] A Thermodynamic Model Describing the Mechanosensitivity of Actin-cofilin Binding2009

    • 著者名/発表者名
      Yasuhiro Inoue, Taiji Adachi, Masaki Hojo
    • 学会等名
      Biophysical Society 53rd Annual Meeting
    • 発表場所
      ボストン, 米国
    • 年月日
      2009-03-01
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] アクチンフィラメントの構造ゆらぎと力学特性 : 分子動力学法による検討2009

    • 著者名/発表者名
      松下慎二, 安達泰治, 井上康博, 北條正樹, 曽我部正博
    • 学会等名
      日本機械学会第21回バイオエンジニアリング講演会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2009-01-23
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 張力作用下におけるアクチンフィラメントの分子ダイナミクス解析2008

    • 著者名/発表者名
      松下慎二, 安達泰治, 井上康博, 北條正樹, 曽我部正博
    • 学会等名
      日本機械学会第21回計算力学部門講演会
    • 発表場所
      那覇
    • 年月日
      2008-11-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 一重鎖DNAの環状化過程における塩基長の影響2008

    • 著者名/発表者名
      紀平佑毅, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
    • 学会等名
      日本機械学会2008年度年次大会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2008-08-06
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Coarse-grained Modeling and Simulation of Actin Filament Dynamics : Polymerization, Depolymerization and Severing2008

    • 著者名/発表者名
      Taiji Adachi, Yoshitaka Shimada, Yasuhiro Inoue, Masaki Hojo
    • 学会等名
      8th World Congress on Computational Mechanics (WCCM8)
    • 発表場所
      ヴェニス, イタリア
    • 年月日
      2008-06-30
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] アクチンフィラメントのターンオーバー速度に及ぼす脱重合と切断の影響:ブラウン動力学シミュレーション2008

    • 著者名/発表者名
      島田義孝, 安達泰治, 井上康博, 北條正樹
    • 学会等名
      日本機械学会第20回バイオエンジニアリング講演会
    • 発表場所
      東京芝浦工大(東京)
    • 年月日
      2008-01-25
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] 一重鎖DNAの環状化過程における塩基長の影響2008

    • 著者名/発表者名
      紀平佑毅, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
    • 学会等名
      日本機械学会2008年度年次大会
    • 発表場所
      横浜市(No. 08-1 (2008) 267-268)
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Coarse-grained modeling and simulation of actin filament dynamics : Polymerization, depolymerization and severing2008

    • 著者名/発表者名
      Taiji Adachi, Yoshitaka Shimada, Yasuhiro Inoue, and Masaki Hojo
    • 学会等名
      8th World Congress on Computational Mechanics
    • 発表場所
      Venice
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] ハイブリッド形成による環状一本鎖DNA作製手法の検討2008

    • 著者名/発表者名
      紀平佑毅, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
    • 学会等名
      帝人21世紀フォーラム
    • 発表場所
      裾野市(40)
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] アクチンフィラメントとリポソームのin vitro再構成条件の検討2007

    • 著者名/発表者名
      丸岡有記子, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
    • 学会等名
      日本機械学会バイオフロンティア講演会
    • 発表場所
      九州産業大学(福岡)
    • 年月日
      2007-10-06
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] ハイブリッド形成による環状一本鎖DNA作製手法の検討2007

    • 著者名/発表者名
      紀平佑毅, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
    • 学会等名
      日本機械学会バイオフロンティア講演会
    • 発表場所
      九州産業大学(福岡)
    • 年月日
      2007-10-06
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] アクチンフィラメントとリポソームのin vitro再構成条件の検討2007

    • 著者名/発表者名
      丸岡有記子, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
    • 学会等名
      日本機械学会バイオフロンティア講演会
    • 発表場所
      福岡市(講演論文集, 07-35 (2007) 87-88)
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] ハイブリッド形成による環状一本鎖DNA作製手法の検討2007

    • 著者名/発表者名
      紀平佑毅, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
    • 学会等名
      日本機械学会バイオフロンティア講演会
    • 発表場所
      福岡市(講演論文集, 07-35 (2007) 79-80)
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Biomechanics of Actin Cytoskeleton : In vitro and in silico studies2007

    • 著者名/発表者名
      Taiji Adachi
    • 学会等名
      The 2^<nd> International Conference on Mechanics of Biomaterials & Tissues
    • 発表場所
      Keynote Speaker, Hawaii
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] ジャイアントリポソーム内でのアクチンタンパク質の機能発現2007

    • 著者名/発表者名
      植田充彦, 丸岡有記子, 安達泰治, 須長純子, 北條正樹
    • 学会等名
      日本機械学会関西支部第82期定時総会講演会講演論文集
    • 発表場所
      大東市(74-1, 7-16)
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [産業財産権] 単量体環状一本鎖DNAおよび量体環状一本鎖DNAの形成比率を制御する方法2008

    • 発明者名
      安達泰治, 須長純子, 紀平佑毅, 安室怜, 北條正樹
    • 権利者名
      理化学研究所
    • 出願年月日
      2008-03-31
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] 単量体環状一本鎖DNAおよび多量体環状一本鎖DNAの形成比率を制御する方法

    • 発明者名
      安達泰治, 須長純子, 紀平佑毅, 安室怜, 北條正樹
    • 権利者名
      独立行政法人理化学研究所
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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