渦鞭毛虫のレンズ眼用器官の研究による光受容器としての眼の起源を分子、形態から探る

• 研究課題/領域番号: 19570007
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 遺伝・ゲノム動態
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 池尾 一穂 国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ 研究センター, 准教授 (20249949)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2008年度: 1,820千円 (直接経費: 1,400千円、間接経費: 420千円); 2007年度: 2,730千円 (直接経費: 2,100千円、間接経費: 630千円)
• キーワード: 進化遺伝 / ゲノム / 分子進化 / 眼 / 遺伝子発現 / 比較ゲノム / バイオインフォマティックス / 渦鞭毛虫 / 渦べん毛虫 / 遺伝子ネットワーク / 感覚器の起源 / EST

研究概要

渦鞭毛虫のうちレンズ型の眼を持つもの3種を採集し、cDNA ライブラリの作成を終了した。その結果、幾つかの眼に関係する遺伝子候補を発見した。詳細に関しては、現在、論文を準備中である。また、免疫染色により渦鞭毛虫におけるタンパク質の局在を調べたところ、これらのうちのいくつかは、眼に局在もしくは偏在していることが示唆されており、渦鞭毛虫のレンズを持つ器官は、少なくとも機能性分子のレベルでは、他の生物種のレンズ眼に対応する可能性が示唆された。

研究成果

• [雑誌論文] Optimized ancestral state reconstruction using Sankoff parsimony (2009)
  • 著者名/発表者名: Clemente, JC., Ikeo, K., Valiente, G., Gojobori, T.
  • 雑誌名: BMC Bioinformatics Feb 7;10:51 ページ: 10-51
• [雑誌論文] Evolutionary origin of the vertebrate blood complement and coagulation systems inferred from liver EST analysis of lamprey (2008)
  • 著者名/発表者名: Kimura, A., Ikeo, K., Nonaka, M.
  • 雑誌名: Dev Comp Immunol 33 ページ: 77-87
• [雑誌論文] The evolutionary relationship between gene duplication and alternative splicing (2008)
  • 著者名/発表者名: Jin, L., Ikeo, K., et. Al.
  • 雑誌名: Gene Dec 31;427(1-2) ページ: 19-31
• [雑誌論文] Cilium evolution: identification of a novel protein, nematocilin, in the mechanosensory cilium of Hydra nematocytes (2008)
  • 著者名/発表者名: Hwang, JS., Takaku, Y., Chapman, J., Ikeo, K., David, CN. And Gojobori, T.
  • 雑誌名: Mol. Biol. Evol. 25(9) ページ: 2009-2017
• [雑誌論文] Evola: Ortholog Database of all human genes in H-InvDB with manual curation of phylogenetic trees (2008)
  • 著者名/発表者名: Matsuya, A., Ikeo, K., et. Al.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. Jan;36 (Database issue) ページ: 787-792
  • NAID: 120004667178
• [雑誌論文] Insertional mutagenesis by the Tol2 transposon-mediated enhancer trap approach generated mutations in two developmental genes: tcf7 and synembryn-like (2008)
  • 著者名/発表者名: Nagayoshi, S., Ikeo, K., et. Al.
  • 雑誌名: Development Jan;135(1) ページ: 159-169
• [雑誌論文] Cilium evolution : identification of a novel protein, nematocilin, in the mechanosensory cilium of Hydra nematocytes. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hwang JS, et. al.
  • 雑誌名: Mol. Biol. Evol. 25(9) ページ: 2009-2017
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evolutionary origin of the vertebrate blood complement and coagulation systems inferred from liver EST analysis of lamprey. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kimura A, et. al.
  • 雑誌名: Dev Comp Immunol. 33(1) ページ: 77-87
  • 査読あり
• [雑誌論文] Evola: Ortholog database of all human genes in H-InvDB with manual curation of phylogenetic trees. (2008)
  • 著者名/発表者名: Matsuya A
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. 36(Database issus)
  • 査読あり
• [雑誌論文] A Web-Based Interactive Developmental Table for the Ascidian Ciona intestinalis, Including 3D Real-Image Embryo Reconstructions: I. From Fertilized Egg to Hatching Larva (2007)
  • 著者名/発表者名: Hotta, K., Mitsuhara, Kenta., Takahashi, H., Inaba, K., Oka, K., Gojobori, T., Ikeo, K.
  • 雑誌名: Developmental Dynamics 236 ページ: 1790-1805
• [雑誌論文] The evolutionary emergence of cell type-specific genes inferred from the gene expression analysis of Hydra (2007)
  • 著者名/発表者名: Hwang, JS., Ikeo, K., et. Al.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA 11;107(37) ページ: 14735-14740
• [雑誌論文] Transcriptional interferences in cis natural antisense transcripts of humans and mice (2007)
  • 著者名/発表者名: Osato, N. Suzuki, Y. Ikeo, K. And Gojobori, T.
  • 雑誌名: Genetics 176(2) ページ: 1299-1306
• [雑誌論文] A web-based interactive developmental table for the ascidian Ciona intestinalis, including 3D real-image embryo reconstructions: I. From fertilized egg to hatching larva. (2007)
  • 著者名/発表者名: Hotta K
  • 雑誌名: Dev Dyn. 236(7) ページ: 1790-805
  • 査読あり
• [雑誌論文] The evolutionary emergence of cell type-specific genes inferred from the gene expression analysis of Hydra. (2007)
  • 著者名/発表者名: Hwang JS
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci USA. 104(37) ページ: 14735-40
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transcriptional interferences in cis natural antisense transcripts of humans and mice. (2007)
  • 著者名/発表者名: Osato N
  • 雑誌名: Genetics. 176(2) ページ: 1299-306
  • 査読あり
• [学会発表] Is there a common origin between cnidarian and dinoflagellate nematocysts (2008)
  • 著者名/発表者名: Hwang, JS., Ikeo, K., et.al.
  • 学会等名: 12th Evolutionary Biology Meeting 2008
  • 発表場所: France
  • 年月日: 2008-09-24
• [学会発表] Evolution of nervous system from the viewpoint of comparative genomic and gene expressionics (2008)
  • 著者名/発表者名: Gojobori, T., Hwang, JS., Hayakawa, S., Noda, AO., Imanishi, T., Takaku, Y., Mineta, K., Ikeo, K.
  • 学会等名: International Congress of Genetics
  • 発表場所: Germany
  • 年月日: 2008-07-12
• [学会発表] molecular anatomy の試み - 遺伝子データと形態データ (2008)
  • 著者名/発表者名: 池尾 一穂
  • 学会等名: 第113 回日本解剖学会総会・全国学術集会
  • 発表場所: 大分大学医学部(大分県由布)
  • 年月日: 2008-03-28
• [学会発表] Evolution of Eyetowards the origin of sensory organ (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikeo, K.
  • 学会等名: 遺伝研国際シンポジウム:ゲノム進化の新視点から基礎生命活動を探る
  • 発表場所: 如水会館(東京都千代田区)
  • 年月日: 2008-03-27
• [学会発表] Search for the evolutionary origin of protozoan lens-eye (2008)
  • 著者名/発表者名: Hayakawa, S., Ikeo, K., et.al.
  • 学会等名: The 12th Conference of Peace through Mind Brain
  • 発表場所: 静岡県浜松市
  • 年月日: 2008-02-07
• [学会発表] molecular anatomyの試み-遺伝子データと形態データ (2008)
  • 著者名/発表者名: 池尾一穂
  • 学会等名: 第113回日本解剖学会総会・全国学術集会
  • 発表場所: 大分大学医学部
• [学会発表] Evolution of Eye towards the origin of sensory organ (2008)
  • 著者名/発表者名: K. Ikeo
  • 学会等名: 遺伝研国際シンポジウム:ゲノム進化の新視点から基礎生命活動を探る
  • 発表場所: 如水会館(東京都)
• [学会発表] 生物研究におけるデータベースの位置づけ (2007)
  • 著者名/発表者名: 池尾 一穂
  • 学会等名: 第三回マリンバイオ先端セミナー
  • 発表場所: 筑波大学下田臨海実験センター(静岡県下田市)
  • 年月日: 2007-12-20
• [学会発表] 遺伝子発現データを用いたネットワーク構築の実際 (2007)
  • 著者名/発表者名: 池尾 一穂
  • 学会等名: 沼津バイオインフォマティクス講座
  • 発表場所: 沼津産業振興プラザ(静岡県沼津)
  • 年月日: 2007-11-17
• [学会発表] Large Scale screening of human transcriptome: An Introduction of Human Genome Network Project (2007)
  • 著者名/発表者名: Ikeo, K.
  • 学会等名: Bose Institute Bioinformatics Centre
  • 発表場所: Kolkata, India
  • 年月日: 2007-08-24
• [学会発表] Large Scale screening of human transcriptome: An Introduction of Human Genome Network Project (2007)
  • 著者名/発表者名: Ikeo, K.
  • 学会等名: Symposium on Trends in Human Genetics
  • 発表場所: Toshali Sands (Orissa, India)
  • 年月日: 2007-08-21
• [学会発表] The proposal of gene expression data for molecular evolution as an example using the GNP platform (2007)
  • 著者名/発表者名: Ikeo, K.
  • 学会等名: SMBE 2007 Annual Meeting
  • 発表場所: Dalhousie University (Halifax, Canada)
  • 年月日: 2007-06-28
• [学会発表] The proposal of gene expression data for molecular evolution as an example using the GNP platform. (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Ikeo
  • 学会等名: SMBE 2007 Annual Meeting
  • 発表場所: Dalhousie University (Canada)
• [学会発表] Large Scale screening of human transcriptome: An Introduction of Human Genome Network Project (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Ikeo
  • 学会等名: Symposium on Trends in Human Genetics
  • 発表場所: Toshali Sands (lndia)
• [学会発表] Large Scale screening of human transcriptome: An Introduction of Human Genome Network Project (2007)
  • 著者名/発表者名: K. Ikeo
  • 学会等名: Bose Institute Bioinformatics Centre
  • 発表場所: Kolkata (India)
• [学会発表] 遺伝子発現データを用いたネットワーク構築の実際 (2007)
  • 著者名/発表者名: 池尾一穂
  • 学会等名: 沼津バイオインフォマティクス講座
  • 発表場所: 沼津産業振興プラザ(沼津市).
• [学会発表] 生物研究におけるデータベースの位置づけ (2007)
  • 著者名/発表者名: 池尾一穂
  • 学会等名: 第三回マリンバイオ先端セミナー
  • 発表場所: 筑波大学下田臨海実験センター
• [図書] Gene Expression in the brain and central nervous system in planarians. Planaria: A Model for Drug Action and Abuse, (Edited by Robert B. Raffa and Scott M. Rawls) (2008)
  • 著者名/発表者名: Mineta, K., Ikeo, K. and Gojobori, T.
  • 総ページ数: 150
  • 出版者: Landes Bioscience
• [図書] Gene Expression in the brain and central nervous system in planarians. Planaria : A Model for Drug Action and Abuse, Edited by Robert B. Raffa and Scott M. Rawls. (2008)
  • 著者名/発表者名: Mineta K, et. al.
  • 総ページ数: 150
  • 出版者: Landes Bioscience