枯草菌のGABA代謝に関与する酵素の構造と機能

• 研究課題/領域番号: 19579003
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 東邦大学
• 研究代表者: 後藤 勝 東邦大学, 理学部, 講師 (80379289)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 3,870千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 570千円); 2009年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2008年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2007年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
• キーワード: X線結晶解析 / 酵素反応 / 立体構造

研究概要

His-tagを付与したコハク酸セミアルデヒド脱水素酵素をNi-NTAをもちいたカラムクロマトグラフィーで精製した。GABAアミノ基転移酵素の立体構造を酸性と中性の条件で決定した。GabRタンパク質の結晶化に成功し、2.2Å分解能のネイティブデータを収集した。Hg誘導体を用いた重原子同形置換法により位相の決定に成功した。現在、3次元モデルの構築中である。

研究成果

• [雑誌論文] Reaction mechanism and molecular basis for selenium/sulfur discrimination of selenocysteine lyase (2010)
  • 著者名/発表者名: Omi R.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 285 ページ: 12133-9
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal structure of a homolog of mammalian serine racemase from Schizo saccharomyces pombe (2009)
  • 著者名/発表者名: Goto M.
  • 雑誌名: J Biol Chem. 284 ページ: 25944-52
  • 査読あり
• [雑誌論文] Serine racemase with catalytically active lysinoalanyl residue. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamauchi T.
  • 雑誌名: J Biochem. 145 ページ: 421-424
  • 査読あり
• [雑誌論文] D-amino acids in the brain : strueture and function of pyridoxal phosphate-dependent amino acid racemases. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yoshimura T.
  • 雑誌名: FEBS J. 275 ページ: 3527-3537
  • 査読あり
• [雑誌論文] Crystal Structure of Monofunctional Histidinol Phosphate Phosphatase from Thermus thermophilus HB8. (2007)
  • 著者名/発表者名: Omi R, Goto M, Miyahara I, Manzoku M, Ebihara A, Hirotsu K.
  • 雑誌名: Biochemistry 46 ページ: 12618-12627
  • 査読あり
• [学会発表] アカガイ由来アスパラギン酸ラセマーゼのX線結晶構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 後藤勝
  • 学会等名: 第82回日本生化学会大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2009-10-23
• [学会発表] 酢酸菌由来膜結合型アルコール脱水素酵素の結晶構造解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 宮原 郁子
  • 学会等名: 第26回PFシンポジウム
  • 発表場所: 筑波
• [学会発表] Role of pyridoxal 5'-phosphate and・-amino butyrate of GabR, a transcriptional regulator of Bacillus subtilis (2008)
  • 著者名/発表者名: Tohru Yoshimura, Keita Okuda, Hisashi Hemmi, Masaru Goto, Harumi Fukada
  • 学会等名: Second International Interdisciplinary Conference on Vitamins, Coenzymes and Biofactors
  • 発表場所: GEORGIA, USA
  • 年月日: 2008-10-02
• [学会発表] ピリドキサルリン酸に依存する細菌の転写制御因子, GabRの構造と機能 (2008)
  • 著者名/発表者名: 吉村徹, 奥田啓太, 邉見久, 深田はるみ, 後藤勝
  • 学会等名: 日本ビタミン学会第60回大会
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2008-06-14
• [学会発表] アカガイ由来アスパラギン酸ラセマーゼの立体構造解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 後藤 勝
  • 学会等名: 日本ビタミン学会第60回大会
  • 発表場所: 仙台
• [学会発表] Structural study of putative aminotransferase from Thermus thermophllus HB8 (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikuko Miyahara
  • 学会等名: XXI Congress of the International Union of Crystal lography
  • 発表場所: Osaka
• [学会発表] Structure of membrane-bound quinohemoprotein alcohol dehydrogenase (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaru Goto
  • 学会等名: XXI Congress of the International Union of Crystallography
  • 発表場所: Osaka
• [学会発表] Role of pyridoxal 5'-phosphate and γ-aminobutyrate of GabR, a transcriptional regulator of Bacillus subtilis (2008)
  • 著者名/発表者名: Tohru Yoshimura
  • 学会等名: Second International Interdisciplinary Conference onVitamins, Coenzymes and Biofactors
  • 発表場所: GEORGIA、USA
• [学会発表] X-ray Structure of membrane-bound quinohemoprotein alchol dehydrogenase (2008)
  • 著者名/発表者名: Ikuko Miyahara
  • 学会等名: Second International Interdisciplinary Conference onVitamins, Coenzymes and Biofactors
  • 発表場所: GEORGIA、USA
• [学会発表] Analysis of structure and function of membrane-bound alcohol dehydrogenase from acetic acid bacteria (2008)
  • 著者名/発表者名: Masaru Goto
  • 学会等名: The 2nd International Conference on Acetic Acid Bacteria
  • 発表場所: Nagoya
• [学会発表] ピリドキサルリン酸に依存する細菌の転写制御因子、GabRの構造と機能 (2007)
  • 著者名/発表者名: 奥田啓太, 深田はるみ, 後藤勝, 邉見久, 吉村徹
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 横浜
  • 年月日: 2007-12-11
• [学会発表] Crystal Structures of Nonoxidative Zn-Dependent 2,6-Dihydroxybenzoate Decarboxylase. (2007)
  • 著者名/発表者名: Goto, M., Hayashi, H., Yoshida, M., Oikawa, T., Miyahara, I., Hirotsu, K.
  • 学会等名: 2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology 2007,
  • 発表場所: タワーホール船堀、東京
• [学会発表] 酢酸菌由来表在性膜タンパク質アルコール脱水素酵素の構造解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 後藤 勝、宮原郁子、広津 建、松下一信
  • 学会等名: 2007年度 酵素・補酵素研究会
  • 発表場所: 倉敷アイビースクエア、岡山
• [学会発表] 酢酸菌アルコール脱水素酵素の立体購造 (2007)
  • 著者名/発表者名: 後藤勝、宮原郁子、広津建、小林由宜、中柄朋子、外山博英、足立収生、松下一信
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会 第33 回討論会
  • 発表場所: 山口大学大学会館、山口
• [学会発表] γ-レゾルシン酸脱炭酸酵素の結晶構造解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 後藤 勝、林 秀行、吉田雅博、老川典夫、宮原郁子、広津 建
  • 学会等名: 日本結晶学会 2007年度 年会
  • 発表場所: 東京工業大学 大岡山キャンパス、東京
• [学会発表] ピリドキサルリン酸に依存する細菌の転写制御因子、GabRの構造と機能 (2007)
  • 著者名/発表者名: 奥田啓太、深田はるみ、後藤 勝、邉見 久、吉村 徹
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜、神奈川