各種環境に棲息する亜硝酸酸化菌の純粋分離および新規分類指標の開発

• 研究課題/領域番号: 19580096
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 応用微生物学
• 研究機関: 日本大学
• 研究代表者: 高橋 令二 日本大学, 生物資源科学部, 准教授 (70197193)
• 研究分担者: 徳山 龍明 日本大学, 生物資源科学部, 教授 (90059684) ; 中川 達功 日本大学, 生物資源科学部, 講師 (40434104)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 3,640千円 (直接経費: 2,800千円、間接経費: 840千円); 2009年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円); 2008年度: 910千円 (直接経費: 700千円、間接経費: 210千円); 2007年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 環境微生物学 / 亜硝酸酸化菌 / 分子系統分類 / 亜硝酸酸化還元酵素遺伝子 / nxrB / 新規分離 / 分布解析 / 微生物群集構造解析 / DGGE / Nitrobacter / norB

研究概要

亜硝酸酸化菌(NOB)は広汎な自然環境に棲息し、硝化の後段に関与する有用な菌種でありながら、単一菌として分離されている菌株はわずかである。本研究は有用遺伝子資源の探索とその応用はかるため、各種環境からNOBの新規分離菌株を多数獲得し、菌学的性質の検討のための対象菌株の充実を実現した。また、NOBの新規分類指標の探索、開発を行ない、新規指標による分子系統分類を確立し非培養系解析への応用を試みた。

研究成果

• [雑誌論文] Succession and community composition of ammonia-oxidizing archaea and bacteria in bulk soil of a Japanese paddy field. (2010)
  • 著者名/発表者名: Fujii, C., T. Nakagawa, Y. Onodera, N. Matsutani, K. Sasada, R. Takahashi, T. Tokuyama
  • 雑誌名: Soil Sci. Plant Nutr (In Press)
  • NAID: 110008144314
  • 査読あり
• [雑誌論文] Seasonal change in vertical distribution of ammonia-oxidizing archaea and bacteria and their nitrification in temperate forest soil. (2010)
  • 著者名/発表者名: Onodera, Y., T. Nakagawa, R. Takahashi, T. Tokuyama
  • 雑誌名: Microbes Environ 25 ページ: 28-35
  • NAID: 10025921560
  • 査読あり
• [雑誌論文] Seasonal change in vertical distribution of ammonia-oxidizing archaea and bacteria and their nitrification in temperate forest soil (2010)
  • 著者名/発表者名: Yuki Onodera, Tatsunori Nakagawa, Reiji Takahashi, Tatsuaki Tokuyama
  • 雑誌名: Microbes and Environments 25 ページ: 28-35
  • NAID: 10025921560
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of ammonia monooxygenase and archaeal 16S rRNA gene fragments in nitrifying acid-sulfate soil microcosms. (2009)
  • 著者名/発表者名: Nakaya, A., Y. Onodera, T. Nakagawa, K. Satoh, R. Takahashi, S. Sasaki, T. Tokuyama
  • 雑誌名: Microbes Environ 24 ページ: 168-174
  • NAID: 10025920328
  • 査読あり
• [雑誌論文] Seasonal changes in abundance of ammonia-oxidizing archaea and ammonia-oxidizing bacteria and their nitrification in sand of an eelgrass zone. (2009)
  • 著者名/発表者名: Ando, Y., T. Nakagawa, R. Takahashi, K. Yoshihara, T. Tokuyama
  • 雑誌名: Microbes Environ 1 ページ: 21-27
  • NAID: 110007131155
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of ammonia monooxygenase and archaeal 16S rRNA gene fragments in nitrifying acid-sulfate soil microcosms (2009)
  • 著者名/発表者名: Asami Nakaya, Yuki Onodera, Tatsunori Nakagawa, Kazuo Satoh, Reiji Takahashi, Satohiko Sasaki, Tatsuaki Tokuyama
  • 雑誌名: Microbes and Environments 24 ページ: 168-174
  • NAID: 10025920328
  • 査読あり
• [雑誌論文] Seasonal changes in abundance of ammonia-oxidizing archaea and ammonia-oxidizing bacteria and their nitrification in sand of an eelgrass zone. (2009)
  • 著者名/発表者名: Tatsunori Nakaga-wa, Reiji Takahashi, Kiyoshi Yoshi-hara, Tatsuaki Tokuyama
  • 雑誌名: Microbes and Environments 24 ページ: 21-27
  • NAID: 110007131155
  • 査読あり
• [雑誌論文] Characteristics of newly isolated ammonia-oxidizing bacteria from acid sulfate soil and the rhizoplane of leucaena grown in that soil. (2007)
  • 著者名/発表者名: Satoh, K., Itoh, C., Kang, D.-J., Sumida, H., Takahashi, R., Isobe, K., Sasaki, S., Tokuyama T
  • 雑誌名: Soil Sci. Plant Nutr 53 ページ: 23-31
  • NAID: 110006532361
  • 査読あり
• [雑誌論文] 根面に棲息する硝化細菌 (2007)
  • 著者名/発表者名: 佐藤一朗、高橋令二、徳山龍明
  • 雑誌名: 土と微生物 61 ページ: 49-53
  • 査読あり
• [雑誌論文] Distribution of cold-adapted ammonia-oxidizing microorganisms in the deep-ocean of the northeastern Japan Sea (2007)
  • 著者名/発表者名: Tatsunori Nakagawa, Koji Mori, Chiaki Kato, Reiji Takahashi, and Tatsuaki Tokuyama
  • 雑誌名: Microbes and Environments 22 ページ: 365-372
  • NAID: 110006473363
  • 査読あり
• [学会発表] PCR-DGGE分析による水族館ろ過槽ろ材における亜硝酸酸化菌Nitrospira属のモニタリング (2009)
  • 著者名/発表者名: 羽飼亮太, 中川達功, 植田育男, 高橋令二, 徳山龍明
  • 学会等名: 第25回日本微生物生態学会大会
  • 発表場所: 広島大学
  • 年月日: 2009-11-22
• [学会発表] 酸性硫酸塩土壌から分離されたアンモニア酸化菌のウレアーゼの発現解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 日比野倫士, 高橋令二, 中川達功, 佐藤一朗, 徳山龍明
  • 学会等名: 第61回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 名古屋大学
  • 年月日: 2009-09-24
• [学会発表] 亜硝酸酸化菌Nitrospira属の16S rRNA遺伝子に特異的なPCRプライマーの開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 羽飼亮太, 山根さつき, 藤井千尋, 安藤善史, 中川達功, 植田育男, 笹田勝寛, 高橋令二, 吉原喜好, 徳山龍明
  • 学会等名: 第61回日本生物工学会大会
  • 発表場所: 名古屋大学
  • 年月日: 2009-09-24
• [学会発表] 各種環境から分離されたNitrobacter属菌の特性とnxrB遺伝子による分類の検討 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石森英樹, 高橋令二, 中村渉, 山田静恵, 中川達功, 徳山龍明
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • 発表場所: 京都大学
  • 年月日: 2009-09-15
• [学会発表] 各種環境から分離された Nitrobacter 属菌の特性とnxrB遺伝子による分類の検討 (2009)
  • 著者名/発表者名: 石森英樹, 高橋令二, 中村渉, 山田静恵, 中川達功, 徳山龍明
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会2009年度京都大会
  • 発表場所: 京都・京都大学
  • 年月日: 2009-09-15
• [学会発表] 各種環境から分離されたNitrobacter属菌の特性とその分類 (2008)
  • 著者名/発表者名: 石森英樹, 高橋令二, 佐藤有佑, 石山祥子, 中川達功, 徳山龍明
  • 学会等名: 2008年度日本土壌肥料学会関東支部大会
  • 発表場所: 新潟大学
  • 年月日: 2008-11-29
• [学会発表] タイ王国酸性硫酸塩土壌から分離されたアンモニア酸化菌のウレアーゼの発現解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 日比野倫士, 高橋令二, 中川達功, 佐藤一朗, 徳山龍明
  • 学会等名: 2008年度日本土壌肥料学会関東支部大会
  • 発表場所: 新潟大学
  • 年月日: 2008-11-29
• [学会発表] 各種環境から分離されたNitrobacter属菌の特性とその分類 (2008)
  • 著者名/発表者名: 石森英樹, 高橋令二, 佐藤有佑, 石山祥子, 中川達功, 徳山龍明
  • 学会等名: 2008年度日本土壌肥料学会関東支部大会
  • 発表場所: 新潟・新潟大学
  • 年月日: 2008-11-29
• [学会発表] 各種環境より分離した亜硝酸酸化菌の特性と新規分類指標の検討 (2007)
  • 著者名/発表者名: 高橋令二, 中川達功, 徳山龍明
  • 学会等名: 日本土壌肥料学会2007年度東京大会
  • 発表場所: 東京農業大学
  • 年月日: 2007-08-24
• [図書] Overview of microorganisms isolated from acid sulfate soils (2008)
  • 著者名/発表者名: Tokuyama, T
  • 出版者: Shoukadoh
• [図書] Analysis of microbial diversity, isolation of ammonia-oxidizing and sulfur-oxidizing bacteria in acid sulfate soil (2008)
  • 著者名/発表者名: Takahashi, R., K. Satoh, T. Tokuyama
  • 出版者: Shoukadoh
• [図書] "Analysis of microbial diversity, isolation of ammonia-oxidizing and sulfur-oxidizing bacteria in acid sulfate soil" in Sasaki S(ed.), "Development of New Bioremediation Systems of Acid Sulfate Soil for Agriculture and Forestry" (2008)
  • 著者名/発表者名: Reiji Takahashi, Kazuo Satoh, and Tatsuaki Tokuyama
  • 出版者: Shoukadoh(Kyoto, Japan)
• [備考]
  • URL: http://hp.brs.nihon-u.ac.jp/~biken/index/index.htm
• [備考]
  • URL: http://hp.brs.nihon-u.ac.jp/~biken/index/index.htm
• [備考]
  • URL: http://hp.brs.nihon-u.ac.jp/~biken/index/index.htm