アレイCGHとトランスクリプトームによる腎癌の網羅的遺伝子解析

• 研究課題/領域番号: 19590355
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 人体病理学
• 研究機関: 大分大学
• 研究代表者: 松浦 恵子 大分大学, 医学部, 准教授 (00291542)
• 研究分担者: 守山 正胤 大分大学, 医学部, 教授 (90239707)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 4,680千円 (直接経費: 3,600千円、間接経費: 1,080千円); 2008年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2007年度: 3,380千円 (直接経費: 2,600千円、間接経費: 780千円)
• キーワード: アレイCGH / 腎癌 / トランスクリプトーム / 遺伝子解析 / 病型分類

研究概要

アレイCGHを用いて腎細胞癌(CCC)の発症にかかわるゲノム異常を検索したところ、特に14番染色体長腕(14q)の欠失が、高悪性度のCCCで高頻度にみられた。さらに網羅的遺伝子発現解析(トランスクリプトーム解析)を行い、ゲノムのコピー数異常が遺伝子発現異常に影響を与えていることを見出した。14qで遺伝子発現低下を示した遺伝子のいくつかは、実際に腎癌で遺伝子の発現が減弱しており、CCCの悪性化に関わる癌関連遺伝子と考えられた。

研究成果

• [雑誌論文] Genome-wide microRNA expression profiling in renal cell carcinoma : significant downregulation of miR-141 and miR-200c (2008)
  • 著者名/発表者名: Nakada C., Matsuura K., Tsukamoto Y., Tanigawa M., Yoshimoto T., Narimatsu T., Nguyen LT., Hijiya N., Uchida T., Sato F., Mimata H., Seto M., Moriyama M.
  • 雑誌名: The Journal of Pathology 216 ページ: 418-427
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of DNA copy number alterations and gene expression in gastric cancer (2008)
  • 著者名/発表者名: Tsukamoto Y., Uchida T., Karnan S., Noguchi T., Nguyen LT., Tanigawa M., Takeuchi I., Matsuura K., Hijiya N., Nakada C., Kishida T., Kawahara K., Ito H., Murakami K., Fujioka T., Seto M., Moriyama M.
  • 雑誌名: The Journal of Pathology 216 ページ: 471-482
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphorylation status of epidermal growth factor receptor is closely associated with responsiveness to gefitinib in pulmonary adenocarcinoma (2008)
  • 著者名/発表者名: Hijiya N., Miyawaki M., Kawahara K., Akamine S., Tsuji K., Kadota J., Akizuki S., Uchida T., Matsuura K., Tsukamoto Y., Moriyama M.
  • 雑誌名: Human Pathology 39 ページ: 316-323
  • 査読あり
• [雑誌論文] Arpp/Ankrd2, a member of the muscle ankyrin repeat proteins (MARPs), translocates from the I-band to the nucleus after muscle injury (2008)
  • 著者名/発表者名: Tsukamoto Y., Hijiya N., Yano S., Yokoyama S., Nakada C., Uchida T., Matsuura K., Moriyama M.
  • 雑誌名: Histochemistry and Cell Biology 129 ページ: 55-64
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genotyping of the cagA gene of Helicobacter pylori on immunohistochemistry with East Asian CagA-specific antibody (2008)
  • 著者名/発表者名: Kanada R., Uchida T., Tsukamoto Y., Nguyen LT., Hijiya N., Matsuura K., Kodama M., Okimoto T., Murakami K., Fujioka T., Yanagisawa S., Moriyama M.
  • 雑誌名: Pathology International 58 ページ: 218-225
  • NAID: 10027376254
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide microRNA expression profiling in renal cell carcinoma : significant downregulation of miR-141 and miR-200c. (2008)
  • 著者名/発表者名: Nakada C, Matsuura K., Tsukamoto Y., Tanigawa M., Yoshimoto T., Narimatsu T., Nguyen LT., Hijiya N., Uchida T., Sato F., Mimata H., Seto M., Morivama M.
  • 雑誌名: The Journal of Pathology 216 ページ: 418-427
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genome-wide analysis of DNA copy number alterations and gene expression ingastric cancer. (2008)
  • 著者名/発表者名: Tsukamoto Y., Uchida T., Karnan s., Noguchi T., Nguyen LT., Tanigawa M., Takeuchi I., Matsuura K., Hijiya N., Nakada C., Kishlda T., Kawahara K., Ito H., Murakami K., Fujioka T., Seto M., Moriyama M.
  • 雑誌名: The Journal of Pathology 216 ページ: 471-482
  • 査読あり
• [雑誌論文] Phosphorylation status of epidermal growth factor receptor is closely associatedwith responsiveness to gefitinib in pulmonary adenocarcinoma. (2008)
  • 著者名/発表者名: Hijiya N., Miyawaki M., Kawahara K., Akamine S., Tsuji K., Kadota J., Akizuki S., Uchida T., Matsuura K., Tsukamoto Y., Moriyama M
  • 雑誌名: Human Pathology 39 ページ: 316-323
  • 査読あり
• [雑誌論文] Arpp/Ankrd2, a member of the muscle ankyrin repeat proteins(MARPs), translocates from the I-band to the nucleus after muscle injury. (2008)
  • 著者名/発表者名: Tsukamoto Y., Hijiya N., Yano S., Yokoyama S., Nakada C, Uchida T., Matsuura K., Morivama M.
  • 雑誌名: Histochemistry and Cell Biology 129 ページ: 55-64
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genotyping of the cagA gene of Helicobacter pylori on immunohistochemistry with East Asian CagA-specific antibody. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kanada R., Uchida T., Tsukamoto Y., Nguyen LT., Hijiya N., Matsuura K., Kodama M., Okimoto T., Murakami K., Fujioka T., Yanagisawa S., Morivama M.
  • 雑誌名: Pathology International 58 ページ: 218-225
  • NAID: 10027376254
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-resolution analysis of DNA copy number alterations and the gene expression in renal clear cell carcinoma (2007)
  • 著者名/発表者名: Yoshimoto T, Matsuura K, Karnan S, Tagawa H, Nakada C, Tanigawa M, Tsukamoto Y, Uchida T, Kashima K, Akizuki S, Takeuchi I, Sato F, Mimata H, Seto M, Moriyama M.
  • 雑誌名: Journal of Pathology 213 ページ: 392-401
  • 査読あり
• [雑誌論文] Upregulated expression of cardiac ankyrin-repeated protein in renal podocytes is associated with proteinuria severity in lupus nephritis (2007)
  • 著者名/発表者名: Matsuura K, Uesugi N, Hijiya N, Uchida T and Moriyama M
  • 雑誌名: Human Pathology 38 ページ: 410-419
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-resolution analysis of DNA copy number alterations and the gene expression in renal clear cell carcinoma. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yoshimoto T, Matsuura K, Karnan S, Tagawa H, Nakada C, Tanigawa M, Tsukamoto Y, Uchida T, Kashhna K, Akizuki S, Takeuchi I, Sato F, Mimata H, Seto M, Moriyama M.
  • 雑誌名: Journal of Pathology 213 ページ: 392-401
  • 査読あり
• [雑誌論文] Upregulated expression of cardiac ankyrin-repeated protein in renal podocytes is associated with proteinuria severity in lupus nephritis. (2007)
  • 著者名/発表者名: Matsuura K, Uesugi N, Hijiya N, Uchida T and Moriyama M
  • 雑誌名: Human Pathology 38 ページ: 410-419
  • 査読あり
• [学会発表] High-resolution analysis of DNA copy number alterations and the gene expression in renal clear cell carcinoma (2008)
  • 著者名/発表者名: Taichiro Yoshimoto
  • 学会等名: American Urological Association (AUA) 2008 Annual Meeting
  • 発表場所: Florida
  • 年月日: 2008-05-18
• [学会発表] アレイCGHによる腎癌転移巣における網羅的ゲノム解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 成松隆弘
  • 学会等名: 第96回日本泌尿器科学会総会
  • 発表場所: 横浜市
  • 年月日: 2008-04-26
• [学会発表] High-resolution analysis of DNA copy number alterations and the geneexpression in renal clear cell carcinoma (2008)
  • 著者名/発表者名: Taichiro Yoshimoto, Keiko Matsuura, Masao Seto, Takahiro Narimatsu, Fuminori Sato, Hiromitsu Mimata, Masatsugu Moriyama
  • 学会等名: American Urological Association (AUA) 2008Annual Meeting
  • 発表場所: Florida
• [学会発表] High-resolution analysis of DNA copy number alterations and the gene expression in renal clear cell carcinoma (2007)
  • 著者名/発表者名: Keiko Matsuura
  • 学会等名: 第66回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜市
  • 年月日: 2007-10-04
• [学会発表] High-resolution analysis of DNA copy number alterations and the gene expression in renal clear cell carcinoma (2007)
  • 著者名/発表者名: Keiko Matsuura, Taichiro Yoshimoto, Sivasundaram Karnan, Hiroyuki Tagawa, Chisato Nakada, Masato Tanigawa, Yoshiyuki Tsukamoto, Tomohisa Uchida, Ichiro Takeuchi, Fuminori Sato, Hiromitsu Mimata, Masao Seto, Masatsugu Moriyama
  • 学会等名: 第66回日本癌学会学術総会
  • 発表場所: 横浜市(パシフィコ横浜)
  • 年月日: 2007-10-04