寄生性線虫ミトコンドリアのタンパク質合成系研究の新展開

• 研究課題/領域番号: 19590425
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 寄生虫学(含衛生動物学)
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 吉成 茂夫 東京大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (70253317)
• 研究分担者: 渡邊 洋一 東京大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (90323568) ; 大槻 高史 岡山大学, 大学院・自然科学研究科, 準教授 (80321735) ; 横堀 伸一 東京薬科大学, 生命科学部, 講師 (40291702)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2008年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円); 2007年度: 2,860千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 660千円)
• キーワード: 寄生虫 / ミトコンドリア / タンパク質合成系 / tRNA / EF-Tu / 線形動物 / 節足動物 / 寄生性線虫 / リボソーム / EF-G

研究概要

動物ミトコンドリア(mt)のタンパク質合成系は、より短い機能性RNAを用いる。我々は、短縮化したmt tRNA を持つ種と持たない種が混在する節足動物で、短縮化したtRNAを持たない昆虫の2つのEF-Tu のうちの1つが、短縮化したtRNA と結合できることを示した。また、植物寄生性線虫ミトコンドリアで遺伝子が未同定だったtRNA のうち1種の発現を同定した。このtRNA は発現が確認された中で最も短い。

研究成果

• [雑誌論文] Functionalimportance of Crenarchaea-specificextra-loop revealed by an X-raystructure of a hetero-tetramericcrenarchaeal splicing endonuclease. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yoshinari, S., Shiba, T., Inaoka, D.,Itoh, T., Kurisu, G., Harada, S., Kita,K., Watanabe, Y.
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res., accepted
  • 査読あり
• [雑誌論文] Potential speciation of morphotypes inthe photosymbiotic ascidian Didemnummolle in the Ryukyu Archipelago (2009)
  • 著者名/発表者名: Hirose, M., Yokobori, S., Hirose, E.
  • 雑誌名: Japan.Coral Reefs 28 ページ: 119-126
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complete nucleotidesequences of mitochondrial genomes oftwo solitary entoprocts, Loxocoroneallax and Loxosomella aloxiata : Implications for lophotrochozoanphylogeny (2008)
  • 著者名/発表者名: Yokobori S., T.Iseto, S. Asakawa, T.Sasaki, N.Shimizu, A.Yamagishi, T.Oshima & E.Hirose
  • 雑誌名: Mol. Phylogen. Evol. 47 ページ: 612-628
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modified uridines withC5-methylene substituents at the firstposition of the tRNA anticodonstabilize U.G wobble pairing duringdecoding (2008)
  • 著者名/発表者名: Kurata, S., Weixlbaumer, A., Ohtsuki,T., Wada, T., Kirino, Y., Takai, K.,Watanabe, K. Ramakrishnan, V. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: J.Biol.Chem. 283 ページ: 18801-18811
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation of small RNAs usingbiotinylated PNAs (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuki, T., Fujimoto, T., Kamimukai,M., Kumano, C., Kitamatsu, M., Sisido,M.
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry 114 ページ: 415-418
  • 査読あり
• [雑誌論文] Amino acid sensing using aminoacyl-tRNAsynthetase (2008)
  • 著者名/発表者名: Kugimiya, A., Morii, M. and Ohtsuki, T.
  • 雑誌名: Analytical Biochemistry 378 ページ: 90-92
  • 査読あり
• [雑誌論文] Complete nucleotide sequences of mitochondrial genomes of two solitary entoprocts, Loxocorone allax and Loxosomella aloxiata: Implications for lophotrochozoan phylogeny (2008)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S., T. Iseto, S. Asakawa, T. Sasaki, N. Shimizu, A. Yamagishi, T. Oshima, & E. Hirose
  • 雑誌名: Mol. Phylogen. Evol. 47 ページ: 612-628
  • 査読あり
• [雑誌論文] tential speciation of morphotypes in the photosymbiotic ascidian demhum molle in the Ryukyu Archipelago, Japan (2008)
  • 著者名/発表者名: Hirose, M., S. Yokobori, & E. Hirose
  • 雑誌名: Coral Reefs 28 ページ: 119-126
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modified uridines with C5-methylene substituentS ,at the first position of the tRNA anticodon stabilize U,QwObleg during decoding (2008)
  • 著者名/発表者名: Kurata, S. , Weixlbaumer, A. , Ohtsuki, T., Wada, T., Ki rino, Y. , Takai, K. , Watana be, K. Ramakrishnan, V. and Suzuki, T.
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 283 ページ: 18801-18811
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation of small RNAs using biotinylated PNAs. (2008)
  • 著者名/発表者名: htsuki, T., Fujimoto, T., Kamimukai, M., Kumano, C., Kitamatsu, M. , Sisido, M.
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry 114 ページ: 415-418
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isolation of small RNAs using biotinylated PNAs. Amino acidsensing using aminoacyl-tRNA synthetase (2008)
  • 著者名/発表者名: Kugimiya, A., Morii, M. and Ohtsuki, T.
  • 雑誌名: Analytical Biochemistry 378 ページ: 90-92
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondrial genomestructure and evolution in the livingfossil vampire squid, Vampyroteuthisinfernalis, and extant cephalopods (2007)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S. Lindsay DJ, Yoshida M,Tsuchiya K, Yamagishi A, Maruyama T,Oshima T.
  • 雑誌名: Mol.Phylogen. Evol 44 ページ: 898-910
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondria and apicoplastof Plasmodium falciparum : behaviour onsubcellular fractionation and theimplication (2007)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi T, Sato S, Takamiya S,Komaki-Yasuda K, Yano K, Hirata A,Onitsuka I, Hata M, Mi-ichi F, Tanaka T,Hase T, Miyajima A, Kawazu S, WatanabeY, Kita K.
  • 雑誌名: Mitochondrion 7 ページ: 125-132
  • 査読あり
• [雑誌論文] T-armless tRNAand elongated elongation factor Tu (2007)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuki T, Watanabe Y.
  • 雑誌名: IUBMB Life 59 ページ: 68-75
  • 査読あり
• [雑誌論文] EF-Tu mutants expand aminoacid tolerance of protein biosynthesissystem (2007)
  • 著者名/発表者名: Doi Y, Ohtsuki T, Shimizu Y, Ueda T, Sisido M.
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc. 129 ページ: 14458-14462
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondrial genome structure and evolution in the living fossil vampire squid, Vampyroteuthis infernalis, and extant cephalopods (2007)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S.
  • 雑誌名: Mol. Phylogen. Evol. 44 ページ: 898-910
  • 査読あり
• [雑誌論文] Mitochondria and apicoplast of Plasmodium falciparum:behaviour on subcellular fractionation and the implication (2007)
  • 著者名/発表者名: Kobayashi, T.
  • 雑誌名: Mitochondrion 7 ページ: 125-132
  • 査読あり
• [雑誌論文] T-armless tRNA and elongated elongation factor Tu (2007)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuki, T.
  • 雑誌名: IUBMB Life 59 ページ: 68-75
  • 査読あり
• [雑誌論文] EF-Tu mutants expand amino acid tolerance of protein biosynthesis system (2007)
  • 著者名/発表者名: Doi, Y.
  • 雑誌名: J.Am. Chem. Soc. 129 ページ: 14458-14462
  • 査読あり
• [学会発表] ピロプラズマ類(Babesia 及びTheileria)原虫におけるミトコンドリアゲノムの多様性 (2009)
  • 著者名/発表者名: 彦坂健児、渡邊洋一、辻尚利、北潔、五十嵐郁男、田邉和裄
  • 学会等名: 第78回寄生虫学会
  • 発表場所: 東京・法政大学市ヶ谷キャンパス
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] ピロプラズマ類(Babesia及びTheileria)原虫におけるミトコンドリアゲノムの多様性 (2009)
  • 著者名/発表者名: 彦坂健児、渡邊洋一、辻尚利、北潔、五十嵐郁男、田邉和裄
  • 学会等名: 第78回寄生虫学会
  • 発表場所: 東京・法政大学市ヶ谷キヤンパス
  • 年月日: 2009-03-28
• [学会発表] tRNA構造との対応関係を越えたショウジョウバエミトコンドリアEF-Tu のtRNA 認識能 (2008)
  • 著者名/発表者名: 佐藤文、末松卓真、大槻高史、渡邊洋一
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-11
• [学会発表] EF-Tu変異体によるアミノアシルtRNAの精製・定量法 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山本浩道, 土井芳朗, 大槻高史, 宍戸昌彦
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-11
• [学会発表] EF-Tu変異体によるアミノアシルtRNAの精製・定量法 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山本浩道,土井芳朗,大槻高史,宍戸昌彦
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回目本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートピアアイランド
  • 年月日: 2008-12-11
• [学会発表] tRNA構造との対応関係を越えたショウジョウバエミトコンドリアEF-TuのtRNA認識能 (2008)
  • 著者名/発表者名: 佐藤文、末松卓真、大槻高史、渡邊洋一
  • 学会等名: 第31回巳本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートピアアイランド
  • 年月日: 2008-12-11
• [学会発表] 尾索動物ミトコンドリアゲノムの多様性とミトコンドリア遺伝子に基づく尾索動物の分子系統解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一、大曽根祐、倉林敦、西川淳、広瀬裕一、山岸明彦
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] 超好熱性古細菌における3つのイントロンを介在するtRNA の段階的スプライシング機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 喜久田薫、菅原潤一、藤島皓介、平野麗子、渡邊洋一、吉成茂夫、冨田勝、金井昭夫
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] X線構造に基づいたCrenarchaea スプライシングエンドヌクレアーゼの改変 (2008)
  • 著者名/発表者名: 吉成茂夫、北潔、渡邊洋一
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] 超好熱性古細菌における3っのイントロンを介在するtRNAの段階的スプライシング機構 (2008)
  • 著者名/発表者名: 喜久田薫、菅原潤一、藤島皓介、平野麗子、渡邊洋一、吉成茂夫、冨田勝、金井昭夫
  • 学会等名: 第31回1日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートピアアイランド
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] X線構造に基づいたCrenarchaeaスプライシングエンドヌクレアーゼの改変 (2008)
  • 著者名/発表者名: 吉成茂夫、北潔、渡邊洋一
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 神戸・神戸ポートピアアイランド
  • 年月日: 2008-12-09
• [学会発表] EF-Tu変異体を用いた非天然アミノアシルtRNA の精製と定量 (2008)
  • 著者名/発表者名: 山本浩道, 土井芳朗, 大槻高史, 宍戸昌彦
  • 学会等名: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  • 発表場所: 横浜・東京工業大学すずかけ台キャンパス
  • 年月日: 2008-09-19
• [学会発表] EF-Tu変異体を用いた.非天然アミノアシルtRNAの精製と定量. (2008)
  • 著者名/発表者名: 山本浩道,.土井芳朗,大槻高.史,宍戸畠彦
  • 学会等名: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  • 発表場所: 横浜・東京工業大学すずかけ台キャンパス
  • 年月日: 2008-09-19
• [学会発表] ミトコンドリアタンパク質合成系の進化 : 線形動物を中心に (2008)
  • 著者名/発表者名: 渡邊洋一
  • 学会等名: 第10回日本進化学会
  • 発表場所: 東京・東京大学駒場キャンパス
  • 年月日: 2008-08-22
• [学会発表] ミトコンドリアタンパク質合成系の進化:線形動物を中心に (2008)
  • 著者名/発表者名: 渡邊洋一
  • 学会等名: 第10回日本進化学会
  • 発表場所: 東京・東京大学駒場キャンパス
  • 年月日: 2008-08-22
• [学会発表] RNA structures andduplication of the protein-coding genes.Mitochondria (2008)
  • 著者名/発表者名: Yoh-ichi Watanabe
  • 学会等名: Ribosomes & Cells : Asymposium in honour of Mike Gray
  • 発表場所: Halifax, Canada
  • 年月日: 2008-07-04
• [学会発表] RNA structures and duplication of the protein-coding genes (2008)
  • 著者名/発表者名: Yoh-ichiWatanabe
  • 学会等名: Mitochondria, Ribosomes & Cells: A Symposium in honour of Mike Gray
  • 発表場所: Halifax, Canada
  • 年月日: 2008-07-04
• [学会発表] ピロプラズマ類原虫及びマラリア原虫ミトコンドリアのゲノム構造 (2008)
  • 著者名/発表者名: 彦坂健児、渡邊洋一、辻尚利、北潔、五十嵐郁男、田邉和裄
  • 発表場所: 長崎・ブリックホール
  • 年月日: 2008-04-04
• [学会発表] ピロプラズマ類原虫及びマラリア原虫ミトコンドリアのゲノム構造 (2008)
  • 著者名/発表者名: 彦坂健児、渡邊洋一、辻尚利、北潔、五十嵐郁男、田邉和裄
  • 学会等名: 第77回日本寄生虫学会
  • 発表場所: 長崎・長崎ブリックホーノレ
  • 年月日: 2008-04-04
• [学会発表] 尾索動物Ciona intestinalis ミトコンドリア特異的メチオニルtRNA 合成酵素の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 東正希、山岸明彦、横堀伸一
  • 学会等名: 第33回生命の起源および進化学会学術講演会
  • 発表場所: 東京・東京薬科大学
  • 年月日: 2008-03-18
• [学会発表] 尾壱動物ミトコンドリア特異的アミノアシルtRNA合成酵素の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 東 正希
  • 学会等名: 第33回生命の起源および進化学会学術講演会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2008-03-18
• [学会発表] 改変EF-Tuを用いた翻訳系の拡張 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大槻高史、土井芳朗、宍戸昌彦
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 仙台・東北大学片平キャンパス
  • 年月日: 2007-09-29
• [学会発表] リボソームを用いたβ-ペプチド合成に向けたアプローチ : 主鎖伸長型基質導入に関与するファクター (2007)
  • 著者名/発表者名: 水澤圭吾、阿部健二、山東信介、土井芳朗、大槻高史、宍戸昌彦、青山安宏
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 仙台・東北大学片平キャンパス
  • 年月日: 2007-09-29
• [学会発表] 改変EF-Tuを用いた翻訳系の拡張 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大槻 高史
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2007-09-29
• [学会発表] リボソームを用いたβ-ペプチド合成に向けたアプローチ:主鎖伸長型基質導入に関与するファクター (2007)
  • 著者名/発表者名: 小澤 圭吾
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 仙台
  • 年月日: 2007-09-29
• [学会発表] ミトコンドリアゲノムに基づく腸性目ホヤ(尾索動物亜門ホヤ綱)の分子系統解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 横堀伸一, 倉林敦, 山岸明彦, 広瀬裕一
  • 学会等名: 第78回日本動物学会年会
  • 発表場所: 弘前・弘前大学文京町キャンパス
  • 年月日: 2007-09-22
• [学会発表] ミトコンドリアゲノムに基づく腸性目ホヤ(尾索動物亜門ホヤ綱)の分子系統解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 横堀 伸一
  • 学会等名: 第78回日本動物学会年会
  • 発表場所: 弘前
  • 年月日: 2007-09-21
• [学会発表] 非天然アミノ酸含有タンパク質の無細胞及び細胞モデル系での発現 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大槻高史
  • 学会等名: 特定領域『バイオ操作』若手研究者第2回ワークショップ
  • 発表場所: 東京・東京農工大学小金井キャンパス
  • 年月日: 2007-07-21
• [学会発表] 非天然アミノ酸含有タンパク質の無細胞及び細胞モデル系での発現 (2007)
  • 著者名/発表者名: 大槻 高史
  • 学会等名: 特定領域『バイオ操作』若手研究者第2回ワークショップ
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2007-07-21
• [学会発表] Molecular Phylogeny ofUrochordata (Tunicata) inferred from18S rRNA genes and mitochondrialgenomes (2007)
  • 著者名/発表者名: Yokobori S
  • 学会等名: The 4th Interenational Tunicate Meeting
  • 発表場所: Villefranche-sur-Mer, France
  • 年月日: 2007-06-24
• [学会発表] Molecular Phylogeny of Urochordata(Tunicata)inferred from 18S rRNA genes and mitochondrial genomes. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S
  • 学会等名: The 4th Interenational Tunicate Meeting
  • 発表場所: Villefranche-sur-Mer, France
  • 年月日: 2007-06-24
• [学会発表] Molecular phylogeny of Trididemnum species(Didemnidae : Ascidiacea) hostingProchloron, non-Prochloron cyanophytes, and no photosymbionts (2007)
  • 著者名/発表者名: Yokobori S., Hirose E.
  • 学会等名: 第21回太平洋学術会議
  • 発表場所: 沖縄, 宜野湾
  • 年月日: 2007-06-14
• [学会発表] Molecular phylogeny of Trididemnum species(Didemnidae:Ascidiacea)hosting Prochloron, non-Prochloron cyanophytes, and no photosymbionts. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yokobori, S
  • 学会等名: 第21回太平洋学術会議
  • 発表場所: Ginowan, Okinawa, Japan
  • 年月日: 2007-06-14
• [図書] The centraldogma : from DNA to RNA, and to protein.In "Automation in Proteomics and Genomics(eds G.Alterovitz, R.Benson, M. Ramoni) (2009)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuki T. and Sisido M.
  • 出版者: Wiley
• [図書] 化学の指針シリーズ「生物有機化学-ケミカルバイオロジーへの展開-」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 宍戸昌彦、大槻高史
  • 総ページ数: 204
  • 出版者: 裳華房
• [図書] The central dogma: from DNA to RNA, and to protein. In "Automation in Proteomics and Genomics", eds by G. Alterovitz , R. Benson and M. Ramoni (2008)
  • 著者名/発表者名: Ohtsuki, T. and Sisido M.
  • 出版者: Wiley
• [図書] 化学の指針シリーズ「生物有機化学-ケミカルバイオロジーへの展開-」 (2008)
  • 著者名/発表者名: 宍戸 昌彦
  • 総ページ数: 204
  • 出版者: 裳華房