クロストリディウム・ディフィシル北米流行強毒株の迅速直接検出法の開発と実用化

• 研究課題/領域番号: 19590578
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 病態検査学
• 研究機関: 国立感染症研究所
• 研究代表者: 加藤 はる 国立感染症研究所, 細菌第二部, 室長 (00273136)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2009
• 研究課題ステータス: 完了 (2009年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2009年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円); 2008年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2007年度: 1,950千円 (直接経費: 1,500千円、間接経費: 450千円)
• キーワード: 臨床検査医学 / 院内感染 / 細菌 / 診断検査 / 遺伝子

研究概要

細胞表面タンパクをコードする遺伝子(slpA)の配列を比較することによるクロストリジウム・ディフィシルのタイピング法(slpA sequence typing)を評価し、日本の医療施設において分離された菌株を解析した。slpA sequence typingは、タイプ能と解析力が良好で、特に再現性と解析結果の比較の容易性に非常に優れていた。また、slpA sequence typingは、糞便検体からのダイレクト・タイピングに応用が可能であった。検討した160糞便検体のうち、北米流行高病原性株PCR ribotype 027が分離されたのは1株のみであった。次に、得られたslpAの遺伝子配列データを基にして、loop-mediated isothermal amplification(LAMP)法によりPCR ribotype 027株に特異的なslpA(slpAgc8)を検出する方法を確立した。本法はPCR ribotype 027株の迅速な同定に有用と考えられた。

研究成果

• [雑誌論文] Typing of Clostridium difficile isolates endemic in Japan by sequencing slpA and application to direct typing (2010)
  • 著者名/発表者名: Haru Kato, Hideaki Kato, Yoichiro Ito, Takayuki Akahane, Sayuri Izumida, ToshiyukiYokoyama, Chiharu Kaji, Yoshichika Arakawa.
  • 雑誌名: (in press)
• [雑誌論文] Typing of Clostridium difficile isolates endemic in Japan by sequencing slpA and application to direct typing (2010)
  • 著者名/発表者名: Haru Kato, Hideaki Kato, Yoichiro Ito, Takayuki Akahane, Sayuri Izumida, Toshiyuki Yokoyama, Chiharu Kaji, Yoshichika Arakawa
  • 雑誌名: Journal of Medical Microbiology (In press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] Clostridium difficile感染症について. (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 雑誌名: 日本病院薬剤師会雑誌 45 ページ: 897-902
• [雑誌論文] Clostridium difficile 感染症について (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 雑誌名: 日本病院薬剤師会雑誌 45 ページ: 897-902
• [雑誌論文] 長期入院がん患児におけるClostridium difficile消化管保有と院内伝播に関する検討. (2008)
  • 著者名/発表者名: 村端真由美、加藤はる、矢野久子、小椋正道、柴山順子、脇本幸夫、荒川宜親、溝上雅史.
  • 雑誌名: 感染症学雑誌 82 ページ: 419-426
  • NAID: 10024802926
• [雑誌論文] 長期入院がん患児における Clostridium difficile 消化管保有と院内伝播に関する検討 (2008)
  • 著者名/発表者名: 村端真由美, 加藤はる, 矢野久子, 小椋正道, 柴山順子, 脇本幸夫, 荒川宜親, 溝上雅史
  • 雑誌名: 感染症学雑誌 82 ページ: 419-426
  • NAID: 10024802926
  • 査読あり
• [雑誌論文] Molecular analysis of Clostridium difficile at a university teaching hospital in Japan: a shift in the predominant type over a five-year period. (2007)
  • 著者名/発表者名: Sawabe, E, H. Kato, K. Osawa, T. Chiba, N. Tojo, Y. Arakawa, N. Okamura.
  • 雑誌名: Eur J Clin Microbiol Infect Dis 26 ページ: 695-703
• [雑誌論文] Molecular analysis of Clostridium difficile at a university teaching hospital in Japan:a shift in the predominant type over a five-year period. (2007)
  • 著者名/発表者名: Sawabe, E.H.Kato, et. al.
  • 雑誌名: Eur J Clin Microbiol Infect Dis 26 ページ: 695-703
  • 査読あり
• [学会発表] Clostridium difficile感染症と薬剤部の関わり.「感染制御領域」 (2010)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 学会等名: 第31回病院薬剤師会近畿学術大会専門薬剤師分科会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Q and AレクチャーClostridium difficile感染症-よくある質問から- (2010)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 学会等名: 第25回日本環境感染学会総会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 教育講演Clostridium difficile感染症-変化する疫学と日本における現状- (2010)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 学会等名: 第40回日本嫌気性菌感染症研究会
• [学会発表] Clostridium difficile 感染症と薬剤部の関わり (2010)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 学会等名: 第31回病院薬剤師会近畿学術大会 専門薬剤師分科会「感染制御領域」
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Q and Aレクチャー Clostridium difficile 感染症 -よくある質問から- (2010)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 学会等名: 第25回日本環境感染学会総会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] Clostridium difficile 感染症―変化する疫学と日本における現状― (2010)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 学会等名: 第40回日本嫌気性菌感染症研究会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] 日本の医療機関で臨床分離されたbinary toxin遺伝子陽性Clostridium difficile菌株について. (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる, 他
  • 学会等名: 第39回日本嫌気性菌感染症研究会
  • 発表場所: 岐阜
• [学会発表] Clostridium difficile感染対策～欧米から始まった新たな展開～ (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 学会等名: 第81回ICD講習会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] 日本の医療機関でのbinary toxin遺伝子陽性Clostridium difficile臨床分離株について. (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる, 他
  • 学会等名: 第83回日本感染症学会総会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] A rapid and simple identifi- cation of Clostridium difficile PCR ribotype 027 by loop-mediated isothermal amplification method. (2009)
  • 著者名/発表者名: Haru Kato, et al.
  • 学会等名: 19th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
  • 発表場所: Helsinki (Finland)
• [学会発表] 日本の医療機関での binary toxin 遺伝子陽性 Clostridium difficile 臨床分離株について (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる、荒川宜親、赤羽貴行、里村秀行、酒井力、中村敦、加藤秀章、岩島康仁、伊藤陽一郎、横山敏之
  • 学会等名: 第83回日本感染症学会総会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] A rapid and simple identification of Clostridium difficile PCR ribotype 027 by loop-mediated isothermal amplification method (2009)
  • 著者名/発表者名: Haru Kato, Hideaki Kato, Yoichiro Ito, Takayuki Akahane, Sayuri Izumida, Toshiyuki Yokoyama, Chiharu Kaji, Yoshichika Arakawa
  • 学会等名: 19th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases
  • 発表場所: ヘルシンキ(フィンランド)
• [学会発表] 日本の医療機関で臨床分離された binary toxin 遺伝子陽性 Clostridium difficile 菌株について (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる, 荒川宜親, 岩島康仁, 加藤秀章, 中村敦, 赤羽貴行, 里村秀行, 酒井力, 伊藤陽一郎, 斉木由美子
  • 学会等名: 第39回日本嫌気性菌感染症研究会
  • 発表場所: 岐阜
• [学会発表] Clostridium difficile 感染対策〜欧米から始まった新たな展開〜 (2009)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 学会等名: 第81回ICD講習会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] Clostridium difficil流行株BI/NAP1/027について. (2008)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる
  • 学会等名: 第4回日本環境感染学会教育委員会講習会(第23回環境感染学会総会)
  • 発表場所: 長崎
• [学会発表] PCRによるClostridium difficile BI/NAP1/027株の同定. (2008)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる, 他
  • 学会等名: 第82回日本感染症学会総会
  • 発表場所: 島根
• [学会発表] PCRによる Clostridium difficile BI/NAP1/027株の同定 (2008)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる, 荒川宜親
  • 学会等名: 第82回日本感染症学会総会
  • 発表場所: 島根
• [学会発表] Clostridium difficile流行株BI/NAP1/027について (2008)
  • 著者名/発表者名: 加藤 はる
  • 学会等名: 第4回日本環境感染学会教育委員会講習会(第23回環境感染学会総会)
  • 発表場所: 長崎
• [学会発表] slpA遺伝子配列解析によるClostridium difficileのタイピング法 (2007)
  • 著者名/発表者名: 加藤はる, 他
  • 学会等名: 第81回日本感染症学会総会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] Detection of the toxin B gene of Clostridium difficile in stool specimens by loop-mediated isothermal amplification (LAMP) and direct typing of the slpA gene by sequencing. (2007)
  • 著者名/発表者名: Haru Kato, et al.
  • 学会等名: 2nd International Clostridium difficile Symposium
  • 発表場所: Maribor (Slovenia)
• [学会発表] Typing system for Clostridium difficile by sequencing the slpA gene and its application to direct typing from stool specimens. (2007)
  • 著者名/発表者名: Haru Kato, et al.
  • 学会等名: 47 th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy
  • 発表場所: Chicago (US)
• [学会発表] Detection of the toxin B gene of Clostridium difficile in stool specimens by loop-mediated isothermal amplification(LAMP)and direct typing of the slpA gene by sequencing (2007)
  • 著者名/発表者名: Haru Kato, et. al.
  • 学会等名: 2nd International Clostridium difficile Symposium
  • 発表場所: Maribor,Slovenia
• [学会発表] Typing system for Clostridium difficile by sequencing the slpA gene and its application to direct typing from stool specimens (2007)
  • 著者名/発表者名: Haru Kato, et. al.
  • 学会等名: 47th Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy
  • 発表場所: Chicago,U.S.
• [備考] ホームページ等
  • URL: http://www.nih.go.jp/niid/bac2/C_difficile/
• [備考]
  • URL: http://www.nih.go.jp/niid/bac2/C_difficile/
• [備考]
  • URL: http://www.nih.go.jp/niid/bac2/C_difficile
• [備考]
  • URL: http://www.nih.go.jp/niid/bac2/C_difficile/