網羅的遺伝子解析による急性骨髄性白血病の新規原因遺伝子の探索

• 研究課題/領域番号: 19591132
• 研究種目: 基盤研究(C)
• 配分区分: 補助金
• 応募区分: 一般
• 研究分野: 血液内科学
• 研究機関: 自治医科大学
• 研究代表者: 山下 義博 自治医科大学, 医学部, 講師 (10326861)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 4,550千円 (直接経費: 3,500千円、間接経費: 1,050千円); 2008年度: 2,210千円 (直接経費: 1,700千円、間接経費: 510千円); 2007年度: 2,340千円 (直接経費: 1,800千円、間接経費: 540千円)
• キーワード: 急性骨髄性白血病 / DNA マイクロアレイ / Blast Bank / 染色体構造異常 / アレイCGH / DNAメチル化 / がん遺伝子

研究概要

我々は効率の良いゲノミクス解析を行うことを目的として、急性骨髄性白血病(AML)症例を含む様々な白血病類縁疾患の患者骨髄より造血幹細胞のみを純化保存する大規模検体収集事業「Blast Bank」を設立した。本研究において我々はBlast Bank のAML 検体の中から、核型や治療反応性などの臨床情報が整備された99 例からなる「標準検体セット」を選び出し、これらに対して網羅的なゲノミクス解析を行い、新たながん遺伝子の同定を目指すと共に、真に治療反応性にリンクする遺伝子の同定を行った。

研究成果

• [雑誌論文] Genome-wide histone methylation profile for heart failure. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kaneda, R., et al. (全10 名、第3 著者)
  • 雑誌名: Genes Cells 14 ページ: 69-77
  • 査読あり
• [雑誌論文] KIF5B-ALK, a Novel Fusion Oncokinase Identified by an Immunohistochemistry-based Diagnostic System for ALK-positive Lung Cancer. (2009)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi, K., et al. (全14名、第9 著者)
  • 雑誌名: Clin Cancer Res, 15 ページ: 3143-3149
  • 査読あり
• [雑誌論文] MicroRNA expression profiles of human leukemias. (2008)
  • 著者名/発表者名: Takada, S., Yamashita, Y., et al. (全11 名、第2 著者)
  • 雑誌名: Leukemia 22 ページ: 1274-1278
  • 査読あり
• [雑誌論文] A mouse model of EML4-ALK-positive lung cancer. (2008)
  • 著者名/発表者名: Soda M., et al. (全12名、第9 著者)
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 105 ページ: 19893-19897
  • 査読あり
• [雑誌論文] Multiplex reverse transcription-PCR screening for EML4-ALK fusion transcripts. (2008)
  • 著者名/発表者名: Takeuchi, K., et al. (全14 名、第9 著者)
  • 雑誌名: Clin Cancer Res 14 ページ: 6618-6624
  • 査読あり
• [雑誌論文] Chromosome copy number analysis in screening for prognosis-related genomic regions. (2008)
  • 著者名/発表者名: Kurashina, K., Yamashita, Y., et al. (全16 名、第2 著者)
  • 雑誌名: Cancer Sci 99 ページ: 1835-1840
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of novel isoforms of the EML4-ALK transforming gene in non-small cell lung cancer. (2008)
  • 著者名/発表者名: Choi, Y. L., et al. (全18 名、第15 著者)
  • 雑誌名: Cancer Res 68 ページ: 4971-4976
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-resolution analysis of chromosome copy number alterations in angioimmunoblastic T-cell lymphoma and peripheral T-cell lymphoma, unspecified, with single nucleotide polymorphism-typing microarrays. (2008)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, S. I., Yamashita, Y., et al. (全14 名、第2 著者)
  • 雑誌名: Leukemia 22 ページ: 1891-1898
  • 査読あり
• [雑誌論文] MicroRNA expression profiles of human leukemias. (2008)
  • 著者名/発表者名: Takada, S., et al.
  • 雑誌名: Leukemia 22 ページ: 1274-1278
  • 査読あり
• [雑誌論文] High-resolution analysis of chromosome copy number alterations in angioimmunoblastic T-cell lymphoma and peripheral T-cell lymphoma, unspe cified, with single nucleotide polymorphism-typing microarrays. (2008)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, S. I., et al.
  • 雑誌名: Leukemia 22 ページ: 1891-1898
  • 査読あり
• [雑誌論文] A mouse model for EML4-ALK-positive lung cancer. (2008)
  • 著者名/発表者名: Soda, M., et al.
  • 雑誌名: Proc Natl Acad Sci U S A 105 ページ: 19893-19897
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of chromosome copy number in leukemic cells by different microarray platforms. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., et al. (全12 名、筆頭著者)
  • 雑誌名: Leukemia 21 ページ: 1333-1337
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transforming activity of purinergic receptor P2Y, G protein coupled, 8revealed by retroviral expression screening. (2007)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara, S., Yamashita, Y., et al. (全11 名、第2 著者)
  • 雑誌名: Leuk Lymphoma 48 ページ: 978-986
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of the transforming EML4-ALK fusion gene in non-mall-cell lung cancer. (2007)
  • 著者名/発表者名: Soda, M., et al. (全18名、第5 著者)
  • 雑誌名: Nature 448 ページ: 561-566
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of a constitutively active mutant of JAK3 by retroviral expression screening. (2007)
  • 著者名/発表者名: Choi, Y. L., et al. (全12 名、第11 著者)
  • 雑誌名: Leuk Res 31 ページ: 203-209
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transforming activity of purinergic receptor P2Y, G-protein coupled, 2revealed by retroviral expression screening. (2007)
  • 著者名/発表者名: Hatanaka, H., et al. (全11 名、第9 著者)
  • 雑誌名: Biochem Biophys Res Commun 356 ページ: 723-726
  • 査読あり
• [雑誌論文] A genomic analysis of adult T-cell leukemia. (2007)
  • 著者名/発表者名: Choi, Y. L., et al. (全16 名、第8 著者)
  • 雑誌名: Oncogene 26 ページ: 1245-1255
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of chromosome copy number in leukemic cells by different microarray platforms. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamashita Y., et. al.
  • 雑誌名: Leukemia 21 ページ: 1333-1337
  • 査読あり
• [雑誌論文] Transforming activity of purinergic receptor P2Y,G protein coupled,8 revealed by retroviral expression screening. (2007)
  • 著者名/発表者名: Fujiwara S., et. al.
  • 雑誌名: Leuk..Lymphoma 48 ページ: 978-986
  • 査読あり
• [雑誌論文] Identification of the transforming EML4-ALK fusion gene in non-small-cell lung cancer (2007)
  • 著者名/発表者名: Soda M., et. al.
  • 雑誌名: Nature 448 ページ: 561-566
  • 査読あり
• [学会発表] A large-scale resequencing project of ~5600 human genes in the genome of acute myeloid leukemia. (2009)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., Soda, M., Mano, H.
  • 学会等名: AACR 100th Annual Meeting 2009
  • 発表場所: Denver, U.S.A.
• [学会発表] 大型リ・シークエンスアレイによる白血病の遺伝子変異スクリーニング (2008)
  • 著者名/発表者名: 山下 義博
  • 学会等名: 第70回日本血液学会総会
  • 発表場所: 京都
  • 年月日: 2008-10-11
• [学会発表] A large-scale resequencing Project of 〜5400 human genes in the genome of acute myeloid leukemia. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamashita Y., et. al.
  • 学会等名: Keystone Symposia
  • 発表場所: 米国コロラド州
  • 年月日: 2008-03-27
• [学会発表] 大型リ・シークエンスアレイによる白血病の遺伝子変異スクリーニング (2008)
  • 著者名/発表者名: 山下義博, 崔永林, 高田修治, 間野博行
  • 学会等名: 第70 回日本血液学会総会
  • 発表場所: 京都
• [学会発表] A large-scale resequencing project of ~5400 human genes in the genome of acute myeloid leukemia. (2008)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., Kurashina, K., Soda, M., Watanabe, H., Mano, H.
  • 学会等名: Signaling Pathways in Cancer and Development
  • 発表場所: Steamboat Springs, U.S.A.
• [学会発表] Analysis of chromosome copy number in leukemic cells by different microarray platforms. (2007)
  • 著者名/発表者名: Yamashita, Y., Kurashina, K., Watanabe, H., Soda, M., Hatanaka, H., Mano, H.
  • 学会等名: Molecular Targets for Cancer
  • 発表場所: Whistler, Canada