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RNAネットワークを内包した人工細胞の創成

研究課題

研究課題/領域番号 19651091
研究種目

萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 生物分子科学
研究機関京都大学

研究代表者

齊藤 博英  京都大学, 生命科学研究科, 助教 (20423014)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2008年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
2007年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワード人工細胞モデル / RNA / 翻訳 / リボスイッチ / シンセティックバイオロジー / リポソーム / RNP / 情報変換素子 / 無細胞蛋白質合成 / 翻訳制御
研究概要

生命の起源において、核酸や蛋白質などの化学物質から、進化する生命システムがいかにして誕生したのかという問題の解決は、生命科学が目指す大きな目標の一つである。したがって現在、生体分子複合体や、それらの相互作用が形成する人工遺伝子発現制御系を構築する必要性が高まっている。
本研究では、以下三つの研究目標を定めた。(1)機能性RNA-蛋白質(RNP)複合体を試験管内で再構成できる基盤技術の開発、(2)RNPを利用した人工翻訳制御システムの試験管内構築、(3)人工脂質二重膜(リポソーム)内部に上記翻訳システムを内包した、人工細胞モデル進化系の構築。本年度は、特に課題(2)、(3)に焦点を絞り、人工脂質膜内部での翻訳制御システムの構築を達成した。具体的には、(a)PURE SYSTEMとよばれる精製蛋白質因子から構成される無細胞翻訳系をリポソームに内包し、個々のリポソーム内部での遺伝子発現を追跡、定量するシステムを開発した。また、(b)UV照射に依存してDNAやRNAに結合する低分子を利用した、光による人工翻訳制御システムを開発した。この低分子は、配列非特異的に核酸に結合するが、UV照射により、その相互作用が制御できる。この低分子とmRNAを含む無細胞翻訳系にUVを照射することで、翻訳が目的のタイミングで活性化できる。したがって、目的の基質や光照射に依存して、目的遺伝子発現のON/OFFを自在に制御できる人工細胞モデルの基盤技術を構築することに成功した。

報告書

(2件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (34件)

すべて 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 8件) 学会発表 (8件) 図書 (3件) 備考 (2件) 産業財産権 (13件) (うち外国 4件)

  • [雑誌論文] Synthetic biology with RNA motifs2009

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Tan Inoue
    • 雑誌名

      The International Journal of Biochemistry & Cell Biology 41

      ページ: 398-404

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A designed RNA selection : establishment of a stable complex between a target and selectant RNA via two2009

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Shiohara, Hirohide Saito, Tan Inoue
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 37

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A designed RNA selection: establishment of a stable complex between a target and selectant RNA via two2009

    • 著者名/発表者名
      Tomoaki Shiohara, Hirohide Saito, Tan Inoue
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 37

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Motif-programmed artificial protein induces apoptosis in several cancer cells by disrupting mitochondria2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Tamiko Minaraisawa, Takao Yamori, Kiyotaka Shiba
    • 雑誌名

      Cancer Science 99

      ページ: 398-406

    • NAID

      10024002827

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Motif-programmed artificial protein induces apoptosis in several cancer cells by disrupting mitochondria2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Tamiko Minamisawa, Takao Yamori, Kiyotaka Shiba
    • 雑誌名

      Cancer Science 99

      ページ: 398-406

    • NAID

      10024002827

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] RNA and RNP as new molecular parts in synthetic biology2007

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Tan Inoue
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology 132

      ページ: 1-7

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Motif programming: a microgene-based method for creating synthetic proteins containing multiple functional motifs2007

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Tamiko Minamisawa, Kiyotaka Shiba
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 35

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] The role of peptide motifs in the evolution of a protein network2007

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito, Shunichi Kashida, Tan Inoue, Kiyotaka
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research 35

      ページ: 6357-6366

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] RNP-based nanostructures and translational regulatory switches in vitro2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory meeting : Engineering Principles in Biological Systems
    • 発表場所
      コールドスプリングハーバーLab、アメリカ合衆国
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] RNP-based nanostructures and translational regulatory switches in vitro2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory meeting: Engineering Principles in Biological Systems
    • 発表場所
      コールドスプリングハーバーLab、アメリカ合衆国
    • 年月日
      2008-12-12
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] RNA-タンパク質相互作用モチーフを用いたナノスケール構造体の分子設計および構築2008

    • 著者名/発表者名
      大野博久
    • 学会等名
      BMB2008
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2007 実績報告書
  • [学会発表] Synthetic Translational Regulation with RNP Motifs2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      First International Frontiers in Synthetic Biology -2008- Meeting on Synthetic Biology :
    • 発表場所
      ハーバード大学、アメリカ合衆国、ボストン
    • 年月日
      2008-12-02
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Synthetic Translational Regulation with RNP Motifs2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      First International Frontiers in Synthetic Biology -2008- Meeting on Synthetic Biology: Engineering Genes, Genomes & Cells for Drug Discovery
    • 発表場所
      ハーバード大学、アメリカ合衆国、ボストン
    • 年月日
      2008-12-02
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Synthetic Biology with RNA Motifs2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      The First Annual Meeting of the Japanese Society for Researchers on Cell Synthesis (細胞を創る研究会1.0)
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2008-10-17
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Synthetic Biology with RNA Motifs2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      The First Annual Meeting of the Japanese Society for Researchers on Cell Synthesis(細胞を創る研究会1. 0)
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2008-10-17
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] RNP相互作用モチーフを活用したシンセティック・バイオロジー2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohide Saito
    • 学会等名
      第10回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2007 実績報告書
  • [図書] ゲノム中に潜むRNA機能構造モチーフ2009

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英
    • 総ページ数
      6
    • 出版者
      細胞工学、秀潤社
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2007 実績報告書
  • [図書] ナノブロックとしてのRNA分子、バイオナノプロセス2008

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英, 井上丹
    • 総ページ数
      10
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] ナノブロックとしてのRNA分子、バイオナノプロセス2008

    • 著者名/発表者名
      齊藤博英、井上丹
    • 総ページ数
      10
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/seika/

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://kuchem.kyoto-u.ac.jp/seika/

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] 機能性RNA-蛋白質複合体の分子デザイン2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 倉光祥平, 菊田雅之, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [産業財産権] RNPモチーフを利用した、蛋白質応答型shRNA/RNAi制御システムの構築2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 樫田俊一, 林香倫, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [産業財産権] RNPナノ構造体の作成法2008

    • 発明者名
      齊藤勝英, 大野博久, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-07-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [産業財産権] 低分子RNAによる細胞または人工細胞モデルでの翻訳制御システム2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 加藤祐章, 吉川研一, 山田彩子, 山中透, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 外国
  • [産業財産権] RNP翻訳制御システムの作成法2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 小林哲大, 原知明, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 外国
  • [産業財産権] RNP翻訳制御システムの作成法2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 小林哲大, 原知明, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-07-22
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [産業財産権] 機能性RNA-蛋白質複合体の分子デザイン2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 倉光祥平, 菊田雅之, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] RNPモチーフを利用した、蛋白質応答型shRNA/RNAi制御システム2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 樫田俊一, 林香倫, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] RNPナノ構造体の作成法2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 大野博久, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-07-22
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] 低分子RNAによる細胞または人工細胞モデルでの翻訳制御システム2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 加藤祐章, 吉川研一, 山田彩子, 山中透, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 外国
  • [産業財産権] RNP翻訳制御システムの作成法2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 小林哲大, 原知明, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-11-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 外国
  • [産業財産権] RNP翻訳制御システムの作成法2008

    • 発明者名
      齊藤博英, 小林哲大, 原知明, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2008-07-22
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] 低分子RNAによる細胞または人工細胞モデルでの翻訳制御システム2007

    • 発明者名
      齊藤博英, 加藤祐章, 吉川研一, 山田彩子, 山中透, 井上丹
    • 権利者名
      JST
    • 出願年月日
      2007-11-22
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

URL: 

公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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