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生命進化における原始RNPネットワーク・モデルの人工再構成

研究課題

研究課題/領域番号 19657071
研究種目

挑戦的萌芽研究

配分区分補助金
研究分野 進化生物学
研究機関九州大学

研究代表者

井川 善也  九州大学, 大学院・工学研究院, 准教授 (70281087)

研究期間 (年度) 2007 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2009年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2008年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2007年度: 1,300千円 (直接経費: 1,300千円)
キーワードRNA / RNP / ポリペプチド / 複合体 / 分子進化
研究概要

本研究では、申請者が従来行ったRNA酵素の分子デザインとRNP複合体の人工創製の研究成果を展開し、未踏領域であるRNAワールドと現存の生命システムを結ぶ「RNPワールド」の再構成に挑戦する。特に「RNAとポリペプチド間のcross-catalysisとそのネットワーク化」に焦点をあて、最もシンプルなモデル系をデザインし実験的に再構成することに挑戦する。
H21年度は、ポリペプチドの連結反応を促進する鋳型分子として最適なRNA構造の探索と最適化を行った。
H20年度にテトラヒメナ・イントロンRNAを基盤とした鋳型RNAがポリペプチドの連結反応を効果的に促進する事を見いだしたが、RNAとペプチド間の静電相互作用によるバックグランド反応も併発する事が明らかとなった。この副反応を最小化するため、テトラヒメナ・イントロンRNAより小型の天然由来のRNA構造と人工デザインしたRNA構造を計4種用いて鋳型RNAをデザインし、その効果を比較した。
その結果、いずれのRNAも非特異的バックグランド反応は顕著に減少した。3種類の1分子からなる構造RNAは小型化に伴う構造の不安定化のため、目的とする特異的反応の収率も低下した。しかし、人工設計された自己2量化能力を有するRNA(tectoRNA)を基盤とした鋳型RNAは特異的反応の収率低下を伴わず、むしろ反応効率の向上が見られ、バックグランド反応も抑制された。これはリボソームが複数のRNAサブユニットから形成される事実と照らし、機能性RNAの進化に対して興味深い結果である。

報告書

(3件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] Designed RNAs with two peptide-binding units as artificial templates for native chemical ligation of RNA-binding peptides2009

    • 著者名/発表者名
      N.Kashiwagi, et al.
    • 雑誌名

      ChemBioChem 10

      ページ: 2745-2752

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Toward a Reciprocal Evolution System between RNA and Peptides as an Artificial Model for the Early RNP World2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Ikawa, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp.Ser 53

      ページ: 33-34

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [雑誌論文] Primitive templated catalysis of a peptide ligation byself-folding RNAs.2009

    • 著者名/発表者名
      N. Kashiwagi, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research. 37(In press)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Design and analysis of a structural RNA that acts as a template for peptide liation2007

    • 著者名/発表者名
      N. Kashiwagi, et. al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp Ser(Oxf) 51

      ページ: 387-388

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Toward a Reciprocal Evolution System between RNA and Peptides as an Artificial Model for the Early RNP World2009

    • 著者名/発表者名
      井川善也
    • 学会等名
      The 6^<th> international symposium on nucleic acids chemistry
    • 発表場所
      高山
    • 年月日
      2009-09-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 二量化RNAをプラットフォームとするプログラム型ペプチド連結システムの構築2008

    • 著者名/発表者名
      K. Yamashita, et al.
    • 学会等名
      BMB 2008
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-10
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] RNP形成によりペプチド連結反応塗促進するデザイン型RNA構造体の作成と解析2007

    • 著者名/発表者名
      N. Kashiwagi, et. al.
    • 学会等名
      第9回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • 年月日
      2007-07-30
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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