研究課題
若手研究(A)
本研究課題では、遺伝子重複によって新しい遺伝子が創りだされる進化メカニズムをゲノムスケールで解明することにより、ゲノム進化とそれに伴う表現型進化を理解することを究極のゴールとする。ゲノムが遺伝子重複により新規機能遺伝子を獲得するときの、進化メカニズムの一般的法則を理解することにある。そして、その結果をもとに、新規機能遺伝子をゲノム中から探し出し、それらに対して集団遺伝及び分子進化解析を行うことにより、ゲノム進化のメカニズムの解明を目指す。平成19年度、20年度では、重複した遺伝子が集団中に固定していく過程などに関する集団遺伝の理論を確立した。つづいて、平成21年度、22年度では、その応用に重点を置いた。応用範囲は、ハエ、イネ、魚に及ぶ。さらに、新規機能獲得遺伝子を同定するアルゴリズムの試運転をハエと酵母を用いて行った。とくに魚類と酵母で新規の結果が得られた。これらについて、新規機能獲得の進化的解析を行った。それによると、新規機能獲得遺伝子は、多くの近縁種にも共通にみられ、獲得イベントがそれらの種分化よりも古く、その後それぞれの種の進化のプロセスで新規機能遺伝子が自然選択の力で守られてきたことを示唆する。このように、生物が進化する上で、遺伝子重複によって新規機能獲得遺伝子を獲得することが重要な役目をはたすことが確認出来た。そして、その痕跡はゲノム中にはっきり残っており、それは本研究で確立した理論によって効果的に検出できることが分った。
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Genes(belongs to the special issue "Gene Conversion in Duplicated Genes" edited by Innan H.) 2
ページ: 191-209
ページ: 313-331
Mol. Biol. Evol. in press
Nat.Rev.Genet.
巻: 11 ページ: 97-108
Mol.Biol.Evol.
巻: 28(In press)
Mol. Biol. Evol. 27
ページ: 896-904
Nat. Rev. Genet. 11
ページ: 97-108
ページ: 453-464
Genetics 184
ページ: 517-527
ページ: 848-861
Genetics
巻: 184 ページ: 517-527
巻: 27 ページ: 896-904
Mol. Bio. Evol. 27
Nat.Rev.Genet. 11
Mol.Biol.Evol 27
Mol.Biol.Evol. 27
ページ: 848-904
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106
ページ: 4555-4560
Trends Genet. 25
ページ: 198-202
BMC Bioinformatics 10
ページ: 166-166
Genetica 137
ページ: 19-37
In "Meta-analysis and Combining Information in Genetics", edited by R.Guerra and D.Allison. Chapman & Hall
ページ: 275-303
Mol. Biol. Evol. 26
ページ: 2655-2659
Trends Genet 25
Chapman & Hall
PNAS 106
"Meta-analysis and Combining Information in Genetics", edited by R.Guerra and D.Allison. Chapman & Hall.
Mol.Biol.Evol. 26
Trends in Genetics (in press)
Genetica (in press)
Trends in Genet. 24
ページ: 57-59
Encyclopedia of Life Sciences.
Genetics 178
ページ: 1385-1398
Genetics 179
ページ: 965-976
Bioinformatics 24
ページ: 1705-1712
ページ: 1713-1720
Genetics 180
ページ: 493-505
ページ: 517-531
PLoS Genet. 4
Trends in Genet 24
Encyclopedia of Life Sciences
indica and subsp. japonica, demonstrated by multilocus microsatellites. Genetics 179
Bioinfomatics 24
PLoS Genet 4
ページ: 1000305-1000305
Encyclopedia of Life Sciences (online book)
PLoS Genetics 4
Trends in Genetics 24
Genetics (In press)
http://www.sendou.soken.ac.jp/esb/innan/InnanLab/