| 研究課題/領域番号 |
19700139
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
知能情報学
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| 研究機関 | 豊橋技術科学大学 |
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研究代表者 |
加藤 博明 豊橋技術科学大学, 工学部, 講師 (30303704)
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| 研究期間 (年度) |
2007 – 2009
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| 研究課題ステータス |
完了 (2009年度)
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| 配分額 *注記 |
3,800千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 600千円)
2009年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2008年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円)
2007年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
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| キーワード | 分子構造情報処理 / 三次元構造類似性 / 構造活性相関 / 生体生命情報学 / タンパク質モチーフ / 化学グラフ / 構造データマイニング / タンパク質構造分類 / タンパク質 / GFS |
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| 研究概要 |
本研究では、分子の三次元構造特徴を定量的に記述する新たな方法としてジオメトリカルフラグメントスペクトル(GFS)を提案した。この表現をもとに、匂い分子に対する構造類似性検索を試みた結果、トポロジカルな構造特徴は異なるものの、同じ匂い活性を持つ構造を見出すことができた。また、グリシン残基の空間配置に注目したタンパク質三次元構造の縮約表現を基礎として、タンパク質立体構造の類似性評価への応用を試み、その有用性を示した。
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