| 研究課題/領域番号 |
19700275
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| 研究種目 |
若手研究(B)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
生体生命情報学
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| 研究機関 | 大阪大学 |
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研究代表者 |
瀬尾 茂人 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 助教 (30432462)
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| 研究期間 (年度) |
2007 – 2009
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| 研究課題ステータス |
完了 (2009年度)
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| 配分額 *注記 |
3,860千円 (直接経費: 3,200千円、間接経費: 660千円)
2009年度: 1,170千円 (直接経費: 900千円、間接経費: 270千円)
2008年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2007年度: 1,000千円 (直接経費: 1,000千円)
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| キーワード | 生物情報学 / 類似構造探索 / トランスクリプトーム解析 / 発現プロファイル / ゲノム / 類似構造検索 |
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| 研究概要 |
CAGE(Cap Analysis Gene Expression)法によって得られた発現プロファイルに基づくトランスクリプトーム解析手法に関する研究を行った.このデータを用いることで発現プロファイルとゲノム上の位置を関連付けて解析することができるのが利点である.本研究では,ゲノム上での位置と遺伝子の発現量の示すパターンの類似性を網羅的に探索する手法や,さらにこれを応用し,最尤推定アルゴリズムによって各遺伝子の組織特異的な選択的スプライシングを解析する手法を開発した.
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