in silico創薬スクリーニングのためのドッキング評価関数の開発

• 研究課題/領域番号: 19710173
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 応用ゲノム科学
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 小野寺 賢司 東京大学, 生産技術研究所, 助教 (30391907)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 3,360千円 (直接経費: 3,000千円、間接経費: 360千円); 2008年度: 1,560千円 (直接経費: 1,200千円、間接経費: 360千円); 2007年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
• キーワード: 創薬 / ドッキング / データベース

研究概要

本研究では、in silicoスクリーニングの精度向上のため、ドッキング評価関数の開発を行った。開発されたドッキング評価関数は従来の2倍の正答率が得られた。

研究成果

• [雑誌論文] Universal Optimizations of Scoring Functions for Virtual Screening (2010)
  • 著者名/発表者名: Onodera K, Kamijo S
  • 雑誌名: CBI Journal
  • NAID: 130004138115
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analyses of conditions for KMSSS loop in tyrosyl-tRNA synthetase by building a mutant library. (2009)
  • 著者名/発表者名: Kamijo S, Fujii A, Onodera K, Wakabayashi K
  • 雑誌名: J Biochem. 146 ページ: 241-50
  • NAID: 130000102320
  • 査読あり
• [雑誌論文] タンパク質への非天然アミノ酸の導入に用いられるアンバーサプレッサーtRNAの改良 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤井、小野寺、上條
  • 雑誌名: 生産研究 61 ページ: 111-115
  • NAID: 130000102286
• [雑誌論文] Analyses of conditions for KMSSS loop in tyrosyl-tRNA synthe tase by building a mutant library. (2009)
  • 著者名/発表者名: Shunsuke Kamijo
  • 雑誌名: Journal of Biochemistry 146 ページ: 241-250
  • 査読あり
• [雑誌論文] タンパク質への非天然アミノ酸の導入に用いられるアンバーサプレッサーtRNAの改良 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤井秋彦
  • 雑誌名: 生産研究 61 ページ: 111-115