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リガンドの共有結合に伴う核内受容体活性化キネティクスの解析

研究課題

研究課題/領域番号 19710187
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生物分子科学
研究機関東北大学 (2008)
大阪大学 (2007)

研究代表者

白木 琢磨  東北大学, 大学院医学系研究科, 助教 (10311747)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
3,790千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 390千円)
2008年度: 1,690千円 (直接経費: 1,300千円、間接経費: 390千円)
2007年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
キーワード活性発現の分子機構 / 核内受容体 / キネティクス / 共有結合 / ストップトフロー
研究概要

本研究では、核内受容体PPARγが内在性のリガンドと共有結合することにより活性化する過程について、リガンド側のスペクトルの変化と受容体側の構造変化のキネティクスを解明することを目標とした。申請書においては同時測定を目指すことも構想していたが、本研究ではリガンドと受容体の変化を別々に測定した。キネティクス測定に加えて、活性化過程の各状態の立体構造を解析することに成功した。
リガンド側のスペクトル変化のキネティクス解析から、リガンドは一旦受容体と非共有結合中間体を形成した後に共有結合状態に至ることが明らかとなった。非共有結合中間体はダイナミックな状態であるため、通常のリガンドを用いた場合安定にとらえることはできない。そこで、非共有結合中間体でとどまる新規リガンドを検索し、蛍光標識脂肪酸がこの状態でとどまることを明らかにした。蛍光タンパク質と融合した核内受容体とこの蛍光標識脂肪酸との間の結合依存的起る蛍光共鳴エネルギー移動を利用し、非共有結合中間体に至る結合キネティクスを測定することに成功した。
受容体がリガンドのない状態から非共有結合中間体、共有結合複合体へと至る過程でどのような構造変化をするかを知るために、この3状態の結晶構造を解析した。その結果、非共有結合中間体では受容体のヘリックス2と3の間にあるオメガループが構造変化し、その後共有結合に伴ってヘリックス3にあるフェニルアラニンの側鎖がフリップすることがわかった。オメガループにトリプトファンを導入しリガンド結合に伴う構造変化をスペクトル解析により確認した。またフェニルアラニンが内在性リガンドによる活性化に必須であることを確認した。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書

研究成果

(18件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 学会発表 図書 産業財産権

  • [雑誌論文] Atomic structure of mutant PPARγ LBD complexed with 15d-PGJ2 : novel modulation mechanism of PPARγ/RXRα function by covalently bound ligands2009

    • 著者名/発表者名
      Waku, T., Shiraki, T., Oyama, T., Morikawa, K
    • 雑誌名

      FEBS Lett 853

      ページ: 320-324

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Structural insight into PPARγ activation through covalent modification with endogenous fatty acids2009

    • 著者名/発表者名
      Waku, T., Shiraki, T., Oyama, T., Fujimoto, Y., Maebara, K., Kamiya, N., Jingami, H., Morikawa, K
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol 388

      ページ: 188-199

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Atomic structure of mutant PPARγ LBD complexed with 15d-PGJ_2 : novel modulation mechanism of PPARγ/RXRα function by covalently bound ligands2009

    • 著者名/発表者名
      Waku, T., Shiraki, T., Oyama, T., and Morikawa, K.
    • 雑誌名

      FEBS Lett 853

      ページ: 320-324

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural insight into PPARγ activation through covalent modification with endogenous fatty acids2009

    • 著者名/発表者名
      Waku, T.^*, Shiraki, T.^*, Oyama, T., Fujimoto, Y., Maebara, K., Kamiya, N., Jingami, H., and Morikawa, K
    • 雑誌名

      J. Mol. Biol 388

      ページ: 188-199

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Activation mechanism of PPARg bu its endogenous ligands.2007

    • 著者名/発表者名
      Shiraki. T.
    • 雑誌名

      生化学 79

      ページ: 960-964

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Molecular mechanism of environmental response to food and oxygen III2009

    • 著者名/発表者名
      Takuma Shiraki, Kosuke Morikawa
    • 学会等名
      Activation mechanism of PPARg by oxidized fatty acids JST International Symposium
    • 発表場所
      Sendai
    • 年月日
      2009-02-10
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] Activation mechanism of PPARg by oxidized fatty acids2009

    • 著者名/発表者名
      Takuma Shiraki, Kosuke Morikawa
    • 学会等名
      JST International Symposium" Molecular mechanism of environmental response to food and oxygen III"
    • 発表場所
      Gonryo Kaikan, Sendai
    • 年月日
      2009-02-10
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 内在性リガンドによる核内受容体PPARgの活性化機構の解明と創薬への応用2009

    • 著者名/発表者名
      白木琢磨、和久剛、森川耿右
    • 学会等名
      転写情報DEのワークショップ 2009
    • 発表場所
      越後湯沢
    • 年月日
      2009-01-19
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 内在性リガンドによる核内受容体PPARgの活性化機構の解明と創薬への応用2009

    • 著者名/発表者名
      白木琢磨、和久剛、森川耿右
    • 学会等名
      転写情報DECODE・冬のワークショップ2009
    • 発表場所
      越後湯沢
    • 年月日
      2009-01-19
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 脂肪酸リガンドによる核内受容体PPARγの活性化キネティクス2008

    • 著者名/発表者名
      白木 琢磨、和久 剛、森川 耿右
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会年大会合同大会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 核内受容体PPARγに対する新規内在性脂肪酸リガンドの同定と受容体活性化機構2008

    • 著者名/発表者名
      和久 剛、白木 琢磨、森川 耿右
    • 学会等名
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会年大会合同大会(BMB2008)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2008-12-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2008 研究成果報告書
  • [学会発表] PPARγ activating process through covalent modification by endogenous fatty acids2008

    • 著者名/発表者名
      白木 琢磨
    • 学会等名
      Lipid Peroxidation 2008
    • 発表場所
      軽井沢
    • 年月日
      2008-10-16
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] PPARγ activating process through covalent modification by endogenous fatty acids2008

    • 著者名/発表者名
      白木琢磨
    • 学会等名
      Lipid Peroxidation 2008
    • 発表場所
      軽井沢プリンスホテル
    • 年月日
      2008-10-16
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] リガンドの共通部分構造を認識する脂質シグナル系タンパク質部位の探索2008

    • 著者名/発表者名
      塩生 くらら、和久 剛、大山 拓次、白木 琢磨、白井 剛、森川 耿右
    • 学会等名
      第46回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2008 研究成果報告書
  • [学会発表] リガンドの共通部分構造を認識する脂質シグナル系タンパク質部位の探索2008

    • 著者名/発表者名
      塩生 くらら、和久 剛、大山 拓次、白木 琢磨、白井 剛、森川 耿右
    • 学会等名
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      タワーホール船堀
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2008 研究成果報告書
  • [図書] 活性酸素シグナル酸化ストレス最前線, (実験医学増刊号)2009

    • 著者名/発表者名
      白木琢磨
    • 出版者
      親電子性リガンドセンサーとしてのPPARγ
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [図書] 生化学, (79)2007

    • 著者名/発表者名
      白木琢磨
    • 出版者
      核内受容体PPARγの機能と内在性リガンドによる活性調節
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [産業財産権] 核内受容体に結合するリガンド2007

    • 発明者名
      白木琢磨
    • 権利者名
      国立大学法人大阪大学
    • 出願年月日
      2007-03-29
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 外国

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公開日: 2007-03-31   更新日: 2016-04-21  

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