実験用霊長類(マカク属)における種内および種間の遺伝子的多様性に関する研究

• 研究課題/領域番号: 19770073
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生物多様性・分類
• 研究機関: 独立行政法人医薬基盤研究所
• 研究代表者: 長田 直樹 独立行政法人医薬基盤研究所, 生物資源研究部, 研究員 (70416270)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 2,350千円 (直接経費: 2,200千円、間接経費: 150千円); 2008年度: 650千円 (直接経費: 500千円、間接経費: 150千円); 2007年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
• キーワード: 進化 / 種分化 / 霊長類 / 遺伝子交流 / グノム / 遺伝学 / 生態学

研究概要

感染症などの医学研究、創薬などの薬学研究において、哺乳類実験動物、特に霊長類はヒトと遺伝的に非常に近く、重要な位置を占める.ところが、医薬学の実験にサル類の遺伝的多様性がどのような影響を及ぼすかは全くの未知数である.また、これらの実験用霊長類のなかにどれだけの種間・種内の遺伝的多様性があるのかもはっきりとはわかっていないのが現状である.これらを明らかにするため、マカク属の中でも実験用霊長類としてメジャーなアカゲザルとカニクイザルの個体より得られたDNAの多型解析を行った.その結果、1)カニクイザルの遺伝的多様性は現生人類よりも4-5倍高い値を示す、2)カニクイザルとアカゲザルでは、種がわかれた後に遺伝子交流があったかもしれない、3)薬剤代謝にかかわる遺伝子のいくつかは種間の遺伝子での分化度が非常に高い、ということが示された.

研究成果

• [雑誌論文] Quantifying dominance and deleterious effect on human disease genes (2009)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Shuhei Mano, Jun Gojobori
  • 雑誌名: Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106 ページ: 841-847
• [雑誌論文] Multiple duplication of the bucentaur gene family, which recruits the APE-like domain of retrotransposon: identification of a novel homolog and distinct cellular expression (2009)
  • 著者名/発表者名: Shintaro Iwashita, Kentaro Nakashima, Motoki Sasaki, Naoki Osada, Si-Young Song
  • 雑誌名: Gene 435 ページ: 88-95
• [雑誌論文] Multiple duplication of the bucentaur gene family, which recruits the APE-like domain of retrotransposon: identification of a novel homolog and distinct cellu1ar expression (2009)
  • 著者名/発表者名: Shintaro Iwashita, Kentaro Nakashima, Motoki Sasaki, Naoki Osada, Si-Young Song
  • 雑誌名: Gene 435 ページ: 88-95
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of expressed sequence tags from liver in cynomolgus monkey (Macaca fascicularis) : A systematic identification of drug-metabolizing genes (2008)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Uno, Yutaka Suzuki, Hiroyuki Wakaguri, Yoshiko Sakamoto, Hitomi Sano, Naoki Osada, Katsuyuki Hashimoto, Sumio Sugano, Itsuro Inoue
  • 雑誌名: Febs lett 582 ページ: 351-358
• [雑誌論文] Large-scale analysis of Macaca fascicularis transcripts and inference of genetic divergence between M. fascicularis and M. mulatta (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Katsuyuki Hashimoto, Yosuke Kameoka, Makoto Hirata, Reiko Tanuma, Yasuhiro Uno, Itsuro Inoue, Munetomo Hida, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Keiji Terao, Jun Kusuda, Ichiro Takahashi
  • 雑誌名: BMC Genomics 9 ページ: 90-90
• [雑誌論文] Extensive Expansion and Diversification of the Chemokine Gene Family in Zebrafish : Identification of a Novel Chemokine Subfamily CX (2008)
  • 著者名/発表者名: Hisayuki Nomiyama, Kunio Hieshima, Naoki Osada, Yoko Kato-Unoki, Kaori Otsuka-Ono, Sumio Takegawa, Toshiaki Izawa, Yutaka Kikuchi, Sumio Tanase, Retsu Miura, Jun Kusuda, Miki Nakao, Osamu Yoshie, Akio Yoshizawa
  • 雑誌名: BMC Genomics 9 ページ: 222-222
• [雑誌論文] Evolution of Gene Expression in Human and Chimpanzee Brains (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Sumio Sugano, Yutaka Suzuki
  • 雑誌名: Encyclopedia of Life Sciences (ELS)(John Wiley & Sons, Ltd)(Chichester)
• [雑誌論文] Duplication and Gene Conversion in the Drosophila melanogaster Genome (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Hideki Innan
  • 雑誌名: PLoS Genet 4
  • NAID: 120006576004
• [雑誌論文] Duplication and Gene Conversion in the Drosophila melanogaster Genome (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Hideki Innan
  • 雑誌名: PLoS Genet. 4
  • NAID: 120006576004
  • 査読あり
• [雑誌論文] Analysis of expressed sequence tags from liver incynomolgus monkeyMacaca fascicularis):A systematic identification of drug-metabolizing genes (2008)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Uno, Yutaka Suzuki, Hiroyuki Wakaguri, Yoshiko Sakamoto, Hitomi Sano, Naoki Osada, Katsuyki Hashimoto, SumioSugano, Itsuro Inoue
  • 雑誌名: Febs Letters 582 ページ: 351-358
  • 査読あり
• [雑誌論文] Large-scale analysis of Macaca fascicularis transcripts and inference ofgenetic divergence between M.fascicularis and M. mulatta. (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Katsuyuki Hashimoto, Yosuke Kameoka, Makoto Hirata, R.eiko Tanuma, YasuhixoUno, Itsuro Inoue, Munetomo Hida, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Keiji Tbrao, Jun Kusuda, Ichiro Takahashi
  • 雑誌名: BMC Genoxnics 9 ページ: 90-90
  • 査読あり
• [雑誌論文] Inference of expression -dependent negative selection based on polymorphism and divergence in the human genome. (2007)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada
  • 雑誌名: Molecular Biology and Evolution 24 ページ: 1622-1626
  • 査読あり
• [学会発表] カニクイザル骨髄,脾臓,膵臓由来cDNAライブラリーの解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹,平田誠,田沼玲子,亀岡洋祐,高橋一郎
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会
  • 発表場所: 神戸国際展示場
• [学会発表] ヒトゲノム中の塩基置換多型と疾患関連遺伝子について (2008)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第62回日本人類学会
  • 発表場所: 愛知学院大学
• [学会発表] 実験用霊長類(マカク属)間における遺伝子交雑と種分化について (2008)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第80回日本遺伝学会
  • 発表場所: 名古屋大学工学部
• [学会発表] 実験用マカク間における遺伝的分化と交雑についてのゲノム解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹, 亀岡洋祐, 高橋一朗, 寺尾恵治
  • 学会等名: 第24回日本霊長類学会
  • 発表場所: 明治学院大学
• [学会発表] カニクイザルcDNAライブラリーコレクションの拡充とその解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹, 橋本雄之, 楠田潤, 亀岡洋祐, 田沼玲子, 平田誠, 高橋一朗
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [学会発表] ヒトゲノム中での遺伝子発現パターンと淘汰圧との関係 (2007)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第79回日本遺伝学会
  • 発表場所: 岡山大学
• [学会発表] ゲノムワイドな淘汰圧の検出と遺伝子発現パターンについて (2007)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹
  • 学会等名: 第9回日本進化学会
  • 発表場所: 京都大学
• [学会発表] カニクイザル由来cDNAデータベースの構築、アカゲザルとの比較解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 長田直樹、橋本雄之、平田誠、田沼玲子、亀岡洋祐、楠田潤
  • 学会等名: 第23回日本霊長類学会
  • 発表場所: 滋賀県立大学
• [学会発表] ゲノムワイドな淘汰圧の検出と遺伝子発現パターンについて (2007)
  • 著者名/発表者名: 長田 直樹
  • 学会等名: 第9回日本進化学会大会
  • 発表場所: 京都大学
• [学会発表] カニクイザル由来cDNAデータベースの構築、アカゲザルとの比較解栃 (2007)
  • 著者名/発表者名: 長田 直樹、橋本 雄之、平田 誠、田沼 玲子、亀岡 洋祐、楠田 潤
  • 学会等名: 第23回日本霊長類学会大会
  • 発表場所: 滋賀県立大学
• [学会発表] ヒトゲノム中での遺伝子発現パターンと淘汰圧との関係 (2007)
  • 著者名/発表者名: 長田 直樹
  • 学会等名: 第79回日本遺伝学会大会
  • 発表場所: 犬山国際センター
• [学会発表] カニクイザルcDNAライブラリーコレクションの拡充とその解祈 (2007)
  • 著者名/発表者名: 長田 直樹, 橋本 雄之, 楠田 潤, 亀岡 洋祐, 田沼 玲子, 平田 誠, 高橋 一朗
  • 学会等名: 第30回日本分子生物学会大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
• [図書] Handbook of Human Molecular Evolution(David N. Cooper (Editor), Hildegard Kehrer-Sawatzki (Editor)) (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Sumio Sugano, Yutaka Suzuki
  • 出版者: John Wiley & Sons, Ltd(Chichester)
• [図書] Handbook of Human Molecular Evolution(David N. Cooper(Editor). Hildegard Kehrer-Sawatzki(Editor)) (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Sumio Sugano, Yutaka Suzuki
  • 出版者: John Wiley & Sons, Ltd
• [図書] Evolution of GeneExpression in Human and Chimpanzee Brains.In:Encyclopedia of Life Sciences(ELS) (2008)
  • 著者名/発表者名: Naoki Osada, Sumio Sugano, Yutaka Suzuki
  • 出版者: John Wiley & Sons,Ltd
• [備考]
  • URL: http://genebank.nibio.go.jp/qfbase/