ヒト基本転写因子TFIIEの全体構造解明に向けたNMRによるドメイン構造解析

• 研究課題/領域番号: 19770090
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 構造生物化学
• 研究機関: 横浜市立大学
• 研究代表者: 奥田 昌彦 横浜市立大学, 国際総合科学研究科, 特任助教 (60448686)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 3,700千円 (直接経費: 3,400千円、間接経費: 300千円); 2008年度: 1,300千円 (直接経費: 1,000千円、間接経費: 300千円); 2007年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
• キーワード: 構造生物学 / 転写 / 基本転写因子 / タンパク質 / 立体構造 / 核磁気共鳴法 / 蛋白質 / 遣伝子発現 / NMR / 遺伝子発現

研究概要

真核生物において、タンパク質をコードする遺伝子の転写はRNAポリメラーゼIIが行うが、開始時には基本転写因子と呼ばれる少なくとも5種類のタンパク質の助けが必要となる。本研究では、ヒト由来の基本転写因子TFIIEとTFIIHに対して、これまで不明であった両者の相互作用ドメインを同定した。さらに、遊離状態と会合状態の両方の立体構造を核磁気共鳴(NMR)装置で決定し、認識機構を明らかにした。

研究成果

• [雑誌論文] Structural insight into the TFIIE/TFIIH interaction : TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH. (2008)
  • 著者名/発表者名: Okuda, M., Tanaka, A., Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: EMBO J. 27 ページ: 1161-1171
• [雑誌論文] 基本転写因子TFIIEの構造とTFIIHとの相互作用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 奥田昌彦、西村善文
  • 雑誌名: 生化学特集号 80 ページ: 501-510
  • NAID: 10021192114
• [雑誌論文] Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esa1 presumed chromodomain. (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimojo, H., Sano, N., Moriwaki, Y., Okuda, M., Horikoshi, M., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: J. Mol. Biol. 378 ページ: 987-1001
• [雑誌論文] Structural characterization of human general transcription factor TFIIF in solution. (2008)
  • 著者名/発表者名: Akashi, S., Nagakura, S., Yamamoto, S., Okuda, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.,
  • 雑誌名: Protein Sci. 17 ページ: 389-400
• [雑誌論文] Structural insight into the TFUE/THIE1 interaction : TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH (2008)
  • 著者名/発表者名: Okuda, M., Tanaka, A, Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: The EMBO Journal 27 ページ: 1161-1171
  • 査読あり
• [雑誌論文] Novel structural and functional mode of a knot essential for RNA binding activity of the Esal presumed chromodomain (2008)
  • 著者名/発表者名: Shimojo, H., Sano, N., Moriwaki, Y., Okuda, M., Horikoshi, M., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: Journal of Molecular Biology 378 ページ: 987-1001
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural characterization of human general transcription factor TFIIF in solution (2008)
  • 著者名/発表者名: Akashi, S., Nagakura, S., Yamamoto, S., Okuda, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: Protein Science 17 ページ: 389-400
  • 査読あり
• [雑誌論文] 基本転写因子TmEの構造とTFIIHとの相互作用 (2008)
  • 著者名/発表者名: 奥田昌彦、西村善文
  • 雑誌名: 生化学 80 ページ: 501-510
• [雑誌論文] Structural insight into the TFIIE-TFIIH interaction: TFIIE and p53 share the binding region on TFIIH. (2008)
  • 著者名/発表者名: Okuda M., Tanaka A., Satoh M., Mizuta S., Takazawa M., Ohkuma Y., Nishimura Y.
  • 雑誌名: The EMBO Journal 27 ページ: 1161-1171
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural polymorphism of chromodomains in Chd1. (2007)
  • 著者名/発表者名: Okuda, M., Horikoshi, M., Nishimura, Y.
  • 雑誌名: J Mol Biol. 365 ページ: 1047-1062
• [学会発表] ヒト基本転写因子TFIIEαの酸性ドメインとヒト基本転写因子TFIIH p62のPHドメインとの複合体の溶液構造 (2008)
  • 著者名/発表者名: 奥田昌彦、田中亜紀、佐藤真奈美、水田翔子、高澤学、大熊芳明、西村善文
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市、神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] ヒト基本転写因子TFIIEαの酸性ドメインとヒト基本転写因子TFIIHp62のPHドメインとの複合体の溶液構造 (2008)
  • 著者名/発表者名: 奥田昌彦、田中亜紀、佐藤真奈美、水田翔子、高澤学、大熊芳明、西村善文
  • 学会等名: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • 発表場所: 兵庫県神戸市、神戸ポートアイランド
  • 年月日: 2008-12-10
• [学会発表] NMR Studies on the Interaction between the General Transcription Factors (2008)
  • 著者名/発表者名: Okuda, M., Tanaka, A., Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
  • 学会等名: TFIIE and TFIIH XXIIIrd ICMRBS Conference
  • 発表場所: 米国、カリフォルニア州、サンディエゴ、シェラトンホテル
  • 年月日: 2008-08-26
• [学会発表] NMR Studies on the Interaction between the General Transcription Factors, TFIIE and TFIIH (2008)
  • 著者名/発表者名: Okuda, M., Tanaka, k, Satoh, M., Mizuta, S., Takazawa, M., Ohkuma, Y., Nishimura, Y.
  • 学会等名: XXIIIrd ICMRBS Conference
  • 発表場所: 米国、カリフォルニア州、サンディエゴ、シェラトンホテル
  • 年月日: 2008-08-26
• [備考]
  • URL: http://www.yokohama-cu.acjp/res/researcher/info/0804150kuda-ookuma.html
• [備考]
  • URL: http://www.yokohama-cu.ac.jp/res/researcher/info/080415okuda-ookuma.html