大腸菌におけるO抗原の変換メカニズムの解析

• 研究課題/領域番号: 19790325
• 研究種目: 若手研究(B)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 細菌学(含真菌学)
• 研究機関: 宮崎大学
• 研究代表者: 井口 純 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 研究員 (00437948)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 3,630千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 330千円); 2008年度: 1,430千円 (直接経費: 1,100千円、間接経費: 330千円); 2007年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
• キーワード: 遺伝 / 大腸菌 / O抗原 / 水平伝播 / 比較ゲノム

研究概要

本研究では、O抗原コード領域とその周辺領域を株間で比較することにより、水平伝播領域の特定および入れ換わった領域の特徴を調べた。その結果、複数の大腸菌株でO抗原コード領域を含む大きな領域が水平伝播により入れ換わったことが明らかとなった。

研究成果

• [雑誌論文] The complete genome sequence and com parative genome analysis of enteropathoge nic E (2009)
  • 著者名/発表者名: Iguchi A, Thomson N R, Ogura Y, Saun ders D, Ooka T, Henderson I R, Harris D, Asadulghani M, Kurokawa K, Dean P Kenny B, Quail M A, Thurston S, Dou gan G, Hayashi T, Parkhill J, Frankel G
  • 雑誌名: coli O127:H6 strain E2348/69 vol.191 ページ: 347-354
  • 査読あり
• [雑誌論文] The Emergence and Constrained Radiations of Escherichia coli O157 : A Precise Reconstruction (2009)
  • 著者名/発表者名: Leopold R S, Magrini V, Holt J N, Shaikh N, Mardis R E, Cagno J, Ogura Y, Iguchi A, Hayashi T, Mellmann A, Karch H, Besser E T, Sawyer A S, Whittam S T, Tarr I P
  • 雑誌名: PNAS vol.106 ページ: 8713-8718
  • 査読あり
• [雑誌論文] The complete genome sequence and comparative genome analysis of enteropathogenic E. coli 0127 : H6 strain E2348/69 (2009)
  • 著者名/発表者名: Iguchi A., et.al.
  • 雑誌名: J. Bacteriol 191(1) ページ: 347-354
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic comparison of the O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia coli O55 strains belonging to three distinct lineages (2008)
  • 著者名/発表者名: Iguchi A, Ooka T, Ogura Y, Asadulghani, Nakayama K, Frankel G, Hayashi T
  • 雑誌名: Microbiology vol.154 ページ: 559-570
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic comparison of the O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia coli 055 strains belonging to three distinct lineages (2008)
  • 著者名/発表者名: Iguchi A., et.al.
  • 雑誌名: Microbiology 154(2) ページ: 559-570
  • 査読あり
• [雑誌論文] Systematic identification and sequence analysis of the genomic islands of the enteropathogenic Escherichia coli strain B171-8 by the combined use of Whole Genome PCR Scanning and fosmid mapping (2008)
  • 著者名/発表者名: Ogura Y, et.al.
  • 雑誌名: J. Bacteriol 190(21) ページ: 6948-6960
  • 査読あり
• [雑誌論文] Genomic comparison of the O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia coli 055 strains belonging to three distinct lineages (2008)
  • 著者名/発表者名: Atsushi Iguchi
  • 雑誌名: Microbiology 154 ページ: 559-570
  • 査読あり
• [雑誌論文] The defective prophage pool of Escherichia coli O157 : prophage-prophage interactions potentiate horizontal transfer of virulence determinants
  • 著者名/発表者名: Asadulghani M, Ogura Y, Ooka T, Itoh T, Sawaguchi A, Iguchi A, Nakayama K,Hayashi T
  • 雑誌名: PLoS Pathogen (in press)
  • 査読あり
• [雑誌論文] The defective prophage pool of Escherichia coli 0157 : prophage-p rophage interactions potentiate horizontal transfer of virulence deter minants
  • 著者名/発表者名: Asadulghani, et.al.
  • 雑誌名: PLoS Pathog. (in press)
  • 査読あり
• [学会発表] 腸管病原性大腸菌(EPEC)E2348/69株のゲノム解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 井口純,他
  • 学会等名: 第3回ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] The complete genome sequence and comparative genome analysis of EPEC O127 : H6 strain E2348/69 (2009)
  • 著者名/発表者名: 井口純,他(ワークショップ)
  • 学会等名: 第82回日本細菌学会総会
• [学会発表] 腸管病原性大腸菌(EPEC)E2348/69株のゲノム解析 (2009)
  • 著者名/発表者名: 井口純, 他
  • 学会等名: 第3回ゲノム微生物学会年会
  • 発表場所: 東京
• [学会発表] The complete genome sequence and comparative genome analysis of EPEC O127 : H6 strain E2348/69 (2009)
  • 著者名/発表者名: 井口純, 他(ワークショップ)
  • 学会等名: 第82回日本細菌学会総会
  • 発表場所: 名古屋
• [学会発表] 大腸菌におけるO抗原をコードする領域の組換え過程の解析 等 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井口 純
  • 学会等名: 日本ゲノム微生物学会 等
  • 発表場所: 大阪大学 等
  • 年月日: 2008-03-06
• [学会発表] 大腸菌におけるO抗原をコードする領域の組換え過程の解析 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井口純,他
  • 学会等名: 第2回ゲノム微生物学会年会
• [学会発表] 大腸菌におけるO抗原をコードする領域の組換え過程 (2008)
  • 著者名/発表者名: 井口純,他
  • 学会等名: 第81回日本細菌学会総会
• [学会発表] 大腸菌におけるO抗原合成遺伝子群を含む水平伝播領域の解析 (2007)
  • 著者名/発表者名: 井口純,他
  • 学会等名: 第11回腸管出血性大腸菌感染症シンポジウム