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ゲノミクス・プロテオミクス複合解析を利用した脳腫瘍(神経膠腫)のプロファイリング

研究課題

研究課題/領域番号 19791003
研究種目

若手研究(B)

配分区分補助金
研究分野 脳神経外科学
研究機関佐賀大学

研究代表者

岡本 浩昌  佐賀大学, 医学部, 客員研究員 (50336137)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
3,480千円 (直接経費: 3,300千円、間接経費: 180千円)
2008年度: 780千円 (直接経費: 600千円、間接経費: 180千円)
2007年度: 2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
キーワードゲノミクス / プロテオミクス / 脳腫瘍 / 神経膠腫 / 脳重瘍 / 神経膠種
研究概要

私は脳腫瘍を対象とした研究で、病理学的診断をもとにそれぞれのsubtype間の網羅的な蛋白発現検索を施行し、これらの解析を更に進めることで各脳腫瘍(特に神経膠腫)および各subtype間の特徴をプロテオミクスパターンとしてデータベース化できないかと考えてきた。この"脳腫瘍ファイル"が出来上がれば、例えば病理学的には診断困難な場合、プロテオミクス解析からの病理診断を判断すると言う逆からのアプローチも可能になると思われる。また特に神経膠芽腫などに関してはまだ細かなsubtypeへの分類が必要と以前より考えられているが、この病理学的診断手法、プロテオミクス解析手法を合わせることによりその細分化も可能になると考えられる。
平成20年度は、これまでの情報の蓄積を行うことで、脳腫瘍のプロテオミクスデータベースの構築を継続した。実際の症例に対してこの構築したプロテオミクスデータベースを利用することで、病理学的診断を試みている。これらの結果を踏まえ、当研究で得たプロテオミクスパターンと病理学的診断との関連を解析している。次にゲノムマイクロアレーによるゲノミクスデータに基づいた1p,10q,19qなどのLOHの陽性群陰性群の比較検討、EGFRのamplification有無での検討、またMSPによるMGMTのメチル化の有無での検討、更には予後(生存期間、薬剤感受性)などの因子に関しても比較検討している。これらの結果により、ゲノム異常に関連すると考えられる蛋白の同定を行い、マーカーとして有用かどうか検討するのみでなく、治療標的としても対象となりうるかどうか検討した(検討症例21例)。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2008

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件)

  • [雑誌論文] Proteomic characterization of primary diffuse large B-cell lymphomas in the central nervous system2008

    • 著者名/発表者名
      Li J, Okamoto H, Yin C, et al.
    • 雑誌名

      Journal of Neurosurgery 109

      ページ: 536-546

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of a novel proliferation-related protein WHSC1 4a, in human gliomas2008

    • 著者名/発表者名
      Li J, Yin C, Okamoto H, et al.
    • 雑誌名

      Neuro-oncology 10

      ページ: 45-51

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Proteomic characterization of primary diffuse large B- cell lymphomas in the central nervous system2008

    • 著者名/発表者名
      Li J, Okamoto H, Yin C, et.al.
    • 雑誌名

      Journal of Neurosurgery 109

      ページ: 536-546

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of a novel proliferation-related protein WHSC1 4a, in hu man gliomas2008

    • 著者名/発表者名
      Li J, Yin C, Okamoto H, et.al.
    • 雑誌名

      Neuro-oncology 10

      ページ: 45-51

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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