核酸とのコンジュゲーションによる色素会合体調製法の確立

• 研究課題/領域番号: 19850006
• 研究種目: 若手研究(スタートアップ)
• 配分区分: 補助金
• 研究分野: 生体関連化学
• 研究機関: 名古屋大学
• 研究代表者: 樫田 啓 名古屋大学, 大学院・工学研究科, 助教 (30452189)
• 研究期間 (年度): 2007 – 2008
• 研究課題ステータス: 完了 (2008年度)
• 配分額: 3,105千円 (直接経費: 2,700千円、間接経費: 405千円); 2008年度: 1,755千円 (直接経費: 1,350千円、間接経費: 405千円); 2007年度: 1,350千円 (直接経費: 1,350千円)
• キーワード: DNA / 色素 / H会合体 / くし型会合

研究概要

本研究ではDNA二重鎖を"場"として利用し、色素を予め決められた数・配向・配列で整列させた色素超分子を調製することを目指した。D-スレオニノールを介して色素(メチルレッド)を二重鎖の対応する位置に導入したところ、極めて強い励起子相互作用を示した。また、NMRによる構造解析の結果、色素がらせん軸に対して垂直にスタッキングしていることがわかった。また、二重鎖の融解温度は色素数の増加と共に大幅に上昇したことから、導入した色素が"塩基対"として機能することが分かった。

研究成果

• [雑誌論文] Modulation of pKa of Brooker's Merocyanine by DNA Hybridization (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, K. Sano, Y. Hara, H. Asanuma
  • 雑誌名: Bioconjugate Chem 20 ページ: 258-265
  • 査読あり
• [雑誌論文] Modulation of pKa of Brooker's Merocyanine by DNA Hybridization (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, K. Sano, Y. Hara, H. Asanuma
  • 雑誌名: Bioconjugate Chem. 20 ページ: 258-265
  • 査読あり
• [雑誌論文] Threoninol as a scaffold of dyes (threoninol-nucleotide) and their stable interstrand clustering in duplexes (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, T. Fujii, H. Asanuma
  • 雑誌名: Org. Biomol. Chem 6 ページ: 2892-2899
  • 査読あり
• [雑誌論文] Postsynthetic modification of DNA via threoninol on a solid support by means of allylic protection (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Asanuma, Y. Hara, A. Noguchi, K. Sano, H. Kashida
  • 雑誌名: Tetrahedron Lett 49 ページ: 5144-5146
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preparation of coherent hetero clusters with threoninol scaffold (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Fujii, H. Kashida, H. Asanuma
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. Symp. Ser 52 ページ: 699-700
• [雑誌論文] Incorporation of cationic dyes into DNA for distinct stabilization of duplex (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, H. Itoh, T. Fujii, H. Asanuma
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. Symp. Ser 52 ページ: 700-701
• [雑誌論文] Threoninol as a scaffold of dyes (threoninol-nucleotide) and their stable interstrand clustering in duplexes (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, T. Fujii, H. Asanuma
  • 雑誌名: Ore. Biomol. Chem. 6 ページ: 2892-2899
  • 査読あり
• [雑誌論文] Postsynthetic modification of DNA via threoninol on a solid support by means of allylic protection (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Asanuma, Y. Hara, A. Noguchi, K. Sano, H. Kashida
  • 雑誌名: Tetrahedron Lett. 49 ページ: 5144-5146
  • 査読あり
• [雑誌論文] Preparation of coherent hetero clusters with threoninol scaffold (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Fujii, H. Kashida, H. Asanuma
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. Symp. Ser. 52 ページ: 699-700
• [雑誌論文] Incorporation of cationic dyes into DNA for distinct stabilizatio of duplex (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, H. Itoh, T. Fujii, H. Asanuma
  • 雑誌名: Nucleic Acids Res. Symp. Ser. 52 ページ: 700-701
• [雑誌論文] Detection of genetic polymorphisms with high sensitivity by DNA-perylene conjugate (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, T. Takatsu, H. Asanuma
  • 雑誌名: Tetrahedron Lett 48 ページ: 6759-6762
  • 査読あり
• [雑誌論文] Asanuma 2', 6'-Dimethylazobenzene as an efficient and thermo-stable photoregulator for the photoregulation of DNA hybridization (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Nishioka, X. G. Liang, H. Kashida H
  • 雑誌名: Chem. Commun ページ: 4354-4356
  • 査読あり
• [雑誌論文] Construction of novel dye aggregates based on "comb-type" sequence (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, T. Fujii, H. Asanuma
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser 51 ページ: 11-12
• [雑誌論文] Preparation of "comb-type" hetero aggregates by DNA-dye conjugation (2007)
  • 著者名/発表者名: T. Fujii, H. Kashida, H. Asanuma
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser 51 ページ: 277-278
• [雑誌論文] Development of high-sensitive DNA probe by using perylene (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, T. Takatsu, H. Asanuma
  • 雑誌名: Nucleic Acids Symp. Ser 51 ページ: 279-280
• [雑誌論文] Detection of genetic polymorphisms with high sensitivity by DNA-perylene conjugate (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, T. Takatsu, H. Asanuma
  • 雑誌名: Tetrahedron Letters 48 ページ: 6759-6762
  • 査読あり
• [雑誌論文] 2', 6'-Dimethylazobenzene as an efficient and thermo-stable photoregulator for the photoregulation of DNA hybridization (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Nishioka, X. G. Liang, H. Kashida, H. Asanuma
  • 雑誌名: Chemical Communications ページ: 4354-4356
  • 査読あり
• [学会発表] 二重鎖形成に伴うpKaの変化を利用した蛍光性DNAプローブの設計 (2009)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓・山口恭平, ほか
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 2009-03-30
• [学会発表] カチオン性色素による"塩基対"導入によるDNA二重鎖の安定化 (2009)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓ほか
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 2009-03-30
• [学会発表] 二重鎖形成に伴うpKaの変化を利用した蛍光性DNAグローブの設計 (2009)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓, 山口恭平, ほか
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 2009-03-30
• [学会発表] 新規ビーコンの設計を目指したThreoninol nucleotide"塩基対"の吸収スペクトルと安定性の評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤井大雅・樫田啓, ほか
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] ペリレン導入Threoninol nucleotideを活用した高感度モレキュラービーコンの設計 (2009)
  • 著者名/発表者名: 高津智彦・樫田啓, ほか
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] 蛍光色素のDNAへの多数導入による高感度ラベル化法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓・関口康司, ほか
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] 新規ビーコンの設計を目指したThreoninol nuoleotide"塩基対"の吸収スペクトルと安定性の評価 (2009)
  • 著者名/発表者名: 藤井大雅, 樫田啓, ほか
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] 蛍光色素のDNAへの多数導入による高感度ラペル化法の開発 (2009)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓, 関口康司, ほか
  • 学会等名: 日本化学会第89春季年会
  • 発表場所: 日本大学
  • 年月日: 2009-03-27
• [学会発表] Preparation of coherent hetero clusters with threoninol scaffold (2009)
  • 著者名/発表者名: T. Fujii, H. Kashida, et al.
  • 学会等名: 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] Incorporation of cationic dyes into DNA for distinct stabilization of duplex (2009)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, et al.
  • 学会等名: 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] DNAを足場とした新規へテロ会合体の開発 : 極大吸収波長と励起子相互作用の関係 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤井大雅・樫田啓, ほか
  • 学会等名: 第39回中部化学関連学協会支部連合秋季大会
  • 発表場所: 名古屋大学
  • 年月日: 2008-11-09
• [学会発表] DNAを足場とした新規ヘテロ会合体の開発 : 極大吸収波長と励起子相互作用の関係 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤井大雅, 樫田啓, ほか
  • 学会等名: 第39回中部化学関連学協会支部連合秋季大会
  • 発表場所: 名古屋大学
  • 年月日: 2008-11-09
• [学会発表] DNA-色素コンジュゲーションを利用したコヒーレントヘテロクラスターの調製 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤井大雅・樫田啓, ほか
  • 学会等名: 第57回高分子討論会
  • 発表場所: 大阪府立大学
  • 年月日: 2008-09-25
• [学会発表] DNA-色素コンジュグージョンを利用したコヒーレントヘテロクラスターの調製 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤井大雅, 樫田啓, ほか
  • 学会等名: 第57回高分子討論会
  • 発表場所: 大阪府立大学
  • 年月日: 2008-09-25
• [学会発表] カチオン性色素会合を利用したDNA二重鎖の安定化 (2008)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓, ほか
  • 学会等名: 第3回バイオ関連化学合同シンポジウム
  • 発表場所: 東京工業大学
  • 年月日: 2008-09-19
• [学会発表] 蛍光色素導入DNAを用いた塩基欠失多型の高感度検出 (2008)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓ほか
  • 学会等名: 第18回バイオ・高分子シンポジウム
  • 発表場所: 上智大学
  • 年月日: 2008-07-25
• [学会発表] DNA二重鎖形成による励起子相互作用を伴う新規へテロ会合体の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤井大雅・樫田啓ほか
  • 学会等名: 第57回高分子学会年次大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2008-05-30
• [学会発表] ペリレンを利用した高感度な遺伝子多型検出用DNAプローブの開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 高津智彦・樫田啓ほか
  • 学会等名: 第57回高分子学会年次大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2008-05-30
• [学会発表] 色素会合を利用したDNA二重鎖の安定化 (2008)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓ほか
  • 学会等名: 第57回高分子学会年次大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2008-05-30
• [学会発表] DNA二重鎖形成による励起子相互作用を伴う新規ヘテロ会合体の開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 藤井大雅, 樫田啓, ほか
  • 学会等名: 第57回高分子学会年次大会
  • 発表場所: パシフィコ横浜
  • 年月日: 2008-05-30
• [学会発表] ペリレンを利用した高感度な遺伝子多型検出用DNAプローブの開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 高津智彦, 樫田啓, ほか
  • 学会等名: 第57回高分子学会年次大会
  • 発表場所: パシフイコ横浜
  • 年月日: 2008-05-30
• [学会発表] DNA二重鎖形成を利用したカチオン性色素会合体の調製 (2008)
  • 著者名/発表者名: 伊藤栄紘、樫田啓, 他
  • 学会等名: 日本化学会第88回春季年会
  • 発表場所: 立教大学
  • 年月日: 2008-03-28
• [学会発表] メロシアニン系色素導入DNAを用いた新規蛍光プローブの開発 (2008)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓ほか
  • 学会等名: 日本化学会第88回春季年会
  • 発表場所: 立教大学
  • 年月日: 2008-03-26
• [学会発表] Preparation of coherent hetero clusters with threoninol scaffold (2008)
  • 著者名/発表者名: T. Fujii, H. Kashida et.al.
  • 学会等名: 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] Incorporation of cationic dyes into DNA for distinct stabilization of duplex (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida et.al.
  • 学会等名: 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: Kyoto
• [学会発表] Preparation of dye aggregates by means of (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida et.al.
  • 学会等名: DNA scaffolds XXII IUPAC Symposium on Photochemistry
  • 発表場所: Gothenburg, Sweden
• [学会発表] Preparat ion of dye aggregates by means of DNA scaffolds (2008)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, et al.
  • 学会等名: XXII IUPAC Symposium on Photochemistry
  • 発表場所: Gothenburg, Sweden
• [学会発表] Development of high-sensitive DNA probe by using perylene (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida, T. Takatsu et.al.
  • 学会等名: The Fifth International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2007-11-21
• [学会発表] Construction of novel dye aggregates based on "comb-type" sequence (2007)
  • 著者名/発表者名: H. Kashida et.al.
  • 学会等名: The Fifth International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2007-11-20
• [学会発表] Preparation of "comb-type" hetero aggregates by DNA-dye conjugation (2007)
  • 著者名/発表者名: T. Fujii, H. Kashida et.al.
  • 学会等名: The Fifth International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2007-11-20
• [学会発表] Preparation of ‘comb-type' hetero aggregates by DNA-dye conjugation (2007)
  • 著者名/発表者名: T. Fujii, H. Kashida, et. al.
  • 学会等名: The Fifth International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
  • 発表場所: 東京大学
  • 年月日: 2007-11-20
• [学会発表] DNA 二重鎖形成に伴う"くし型"会合を利用したホモ色素クラスターの調製 (2007)
  • 著者名/発表者名: 藤井大雅・樫田啓, ほか
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2007-09-28
• [学会発表] ペリレンのexcimer 発光を利用した遺伝子欠失多型検出用DNAプローブの開発 (2007)
  • 著者名/発表者名: 高津智彦・樫田啓, ほか
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2007-09-28
• [学会発表] "くし型"DNA配列を用いた異種色素の交互積層 (2007)
  • 著者名/発表者名: 藤井 大雅・樫田 啓ほか
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2007-09-28
• [学会発表] DNA二重鎖形成に伴う"くし型"会合を利用したホモ色素クラスターの調製 (2007)
  • 著者名/発表者名: 樫田 啓, ほか
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2007-09-28
• [学会発表] ペリレンのexcimer発光を利用した遺伝子欠失多型検出用DNAプローブの開発 (2007)
  • 著者名/発表者名: 高津 智彦・樫田啓ほか
  • 学会等名: 第22回生体機能関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 東北大学
  • 年月日: 2007-09-28
• [学会発表] DNA二重鎖形成を利用した色素超分子の調製 (2007)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓
  • 学会等名: 第121回東海高分子研究会講演会
  • 発表場所: ホテル犬山
  • 年月日: 2007-09-07
• [学会発表] DNAの二重鎖形成を利用したくし型色素クラスターの調製 (2007)
  • 著者名/発表者名: 樫田啓ほか
  • 学会等名: 第17回バイオ・高分子シンポジウム
  • 発表場所: 上智大学
  • 年月日: 2007-07-31