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植物におけるスモールRNAを介したストレス応答遺伝子の制御機構の探索

研究課題

研究課題/領域番号 19870032
研究種目

若手研究(スタートアップ)

配分区分補助金
研究分野 植物生理・分子
研究機関独立行政法人理化学研究所

研究代表者

栗原 志夫  独立行政法人理化学研究所, 植物ゲノム発現研究チーム, 特別研究員 (60455342)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
3,125千円 (直接経費: 2,720千円、間接経費: 405千円)
2008年度: 1,755千円 (直接経費: 1,350千円、間接経費: 405千円)
2007年度: 1,370千円 (直接経費: 1,370千円)
キーワードシロイヌマズナ / トランスクリプトーム / タイリングアレイ / スモールRNA / DNAメチル化 / 遺伝子発現制御 / small RNA / 乾燥ストレス / Arabidopsis / ストレス
研究概要

植物において、casiRNAはゲノムDNAのメチル化を誘導し、遺伝子の発現を抑制する。この機構をRdDM と呼ぶ。未処理および乾燥ストレス下においてRdDMによる制御を受ける遺伝子を同定するために、野生型植物、casiRNA生合成の必須因子の変異体およびDNAメチル化酵素の変異体において、タイリングアレイ解析を行った。その結果、いくつかの遺伝子がRdDMによって直接制御されている候補として同定できた。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて 2008 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Identification of the candidate genes by RNA-directed DNA methylation in Arabidopsis2008

    • 著者名/発表者名
      Yukio Kurihara et al. (11人中1番目)
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications 376

      ページ: 553-557

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Identification of the candidate genes regulated by RNA-directed DNA methylation in Arabidopsis2008

    • 著者名/発表者名
      Kurihara, et al.
    • 雑誌名

      Biochemical and Biophysical Research Communications 376

      ページ: 553-557

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] シロイヌナズナにおける全ゲノムタイリングアレイを用いたRdDM標的遺伝子の同定2008

    • 著者名/発表者名
      栗原志夫
    • 学会等名
      日本RNA学会
    • 発表場所
      札幌
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書 2008 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://omicspace.riken.jp/gps/group/psca4

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

URL: 

公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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