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メタゲノムライブラリーを利用した未知遺伝子スクリーニング法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 19880040
研究種目

若手研究(スタートアップ)

配分区分補助金
研究分野 応用微生物学
研究機関独立行政法人産業技術総合研究所

研究代表者

内山 拓  独立行政法人産業技術総合研究所, 生物機能工学研究部門, 研究員 (70450658)

研究期間 (年度) 2007 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
3,059千円 (直接経費: 2,660千円、間接経費: 399千円)
2008年度: 1,729千円 (直接経費: 1,330千円、間接経費: 399千円)
2007年度: 1,330千円 (直接経費: 1,330千円)
キーワードメタゲノム / メタゲノムライブラリ / スクリーニング法 / SIGEX / メタゲノムライブラリー / PIGEX / FACS
研究概要

本研究は、メタゲノムライブラリーのハイスループットなスクリーニング系であるSIGEX (Substrate Induced Gene Expression) 法に用いる為の宿主を、大腸菌以外に拡張する事を目的として行い、大腸菌及び古草菌で使用可能なシャトルベクターの構築に成功した。またSIGEX 法で得られる陽性クローンをレポーターシステムとして利用する新規の酵素活性スクリーニング法、PIGEX (Product Induced Gene Expression) 法の開発も併せて行い、当該法を用いて新規な安息香酸アミダーゼをメタゲノムライブラリーからスクリーニングする事に成功した。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書   研究成果報告書 ( PDF )
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて 2009 2008 その他

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (14件) 備考 (3件) 産業財産権 (2件)

  • [雑誌論文] メタゲノムを利用した新規酵素のスクリーニング2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 宮崎健太郎
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとバイオインダストリー 66巻

      ページ: 234-239

    • NAID

      10024745363

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [雑誌論文] Substrate-induced gene expression (SIGEX) screening of metagenome libraries2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 渡邉一哉
    • 雑誌名

      Nat. Protoc Vol. 3

      ページ: 1202-1212

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] メタゲノムを利用した新規酵素のスクリーニング2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 宮崎健太郎
    • 雑誌名

      バイオーサイエンスとバイオインダストリー 66

      ページ: 234-239

    • NAID

      10024745363

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [雑誌論文] Substrate-induced gene expression (SIGEX) screening of metagenome libraries2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 渡邉一哉
    • 雑誌名

      Nat. Protoc. 3

      ページ: 1202-1212

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 微生物センサーを利用した酵素開発スクリーニング法の開発2009

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 他
    • 学会等名
      日本農芸化学会2009年度大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-28
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 微生物センサーを利用した酵素活性スクリーニング法の開発2009

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 六谷明子, 宮崎健太郎
    • 学会等名
      日本農芸化学会2009年度大会
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      2009-03-28
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 微生物センサーを利用した酵素活性スクリーニング法の開発2009

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 他
    • 学会等名
      平成20年度ライフサイエンス分野合同会議
    • 発表場所
      つくば市
    • 年月日
      2009-01-29
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] 微生物センサーを利用した酵素活性スクリーニング法の開発2009

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 六谷明子, 宮崎健太郎
    • 学会等名
      平成20年度ライフサイエンス分野合同会議
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2009-01-29
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] メタゲノムからの有用遺伝子の探索2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 他
    • 学会等名
      農業環境技術研究所公開セミナー「農業分野におけるメタゲノム解析技術の応用の可能性」
    • 発表場所
      つくば市
    • 年月日
      2008-12-17
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] メタゲノムからの有用遺伝子の探索2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓
    • 学会等名
      農業環境技術研究所公開セミナー「農業分野におけるメタゲノム解析技術の応用の可能性」
    • 発表場所
      つくげ
    • 年月日
      2008-12-17
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] The SIGEX scheme: High throughput screening of metagenomes for isolation of novel catabolic genes2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 他
    • 学会等名
      ISSM サテライトシンポジウ
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2008-11-15
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] The SIGEX scheme : High throughput screening of metagenomes for isolation of novel catabolic genes2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓
    • 学会等名
      ISSMサテライトシンポジウム
    • 発表場所
      Tokyo
    • 年月日
      2008-11-15
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] PIGEX: A fluorescence-based novel activity-independent screening technology for enzymes2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 他
    • 学会等名
      The 12th International Symposium on Microbial Ecolog
    • 発表場所
      Australia
    • 年月日
      2008-08-19
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] PIGEX : A fluorescence-based novel activity-independent screening technology for enzymes2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 六谷明子, 宮崎健太郎
    • 学会等名
      The 12^<th> International Symposium on Microbial Ecology
    • 発表場所
      Australia
    • 年月日
      2008-08-19
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] メタゲノムスクリーニングを指向した宿主・ベクター系の開発2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 他
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度大会
    • 発表場所
      名古屋
    • 年月日
      2008-03-28
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] メタゲノムスクリーニングを指向した宿主・ベクター系の開発2008

    • 著者名/発表者名
      内山 拓、六谷 明子、宮崎 健太郎
    • 学会等名
      日本農芸化学会2008年度(平成20年度)大会
    • 発表場所
      名城大学天白キャンパス
    • 年月日
      2008-03-28
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] メタゲノムからの未知有用遺伝子スクリーニング法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      内山拓, 他
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • 年月日
      2008-03-06
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [学会発表] メタゲノムからの未知有用遺伝子スクリーニング法の開発2008

    • 著者名/発表者名
      内山 拓、渡辺 一哉、宮崎 健太郎
    • 学会等名
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • 発表場所
      大阪大学コンベンションセンター
    • 年月日
      2008-03-06
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://staff.aist.go.jp/miyazaki-kentaro/group/index.html

    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [備考]

    • URL

      http://staff.aist.go.jp/miyazaki-kentaro/group/index.html

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://staff.aist.go.jp/miyazaki-kentaro/group/index.html

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] 酵素遺伝子スクリーニング法2008

    • 発明者名
      内山拓, 宮崎健太郎
    • 権利者名
      内山拓、宮崎健太郎
    • 出願年月日
      2008-08-01
    • 関連する報告書
      2008 研究成果報告書
  • [産業財産権] 酵素遺伝子スクリーニング法2008

    • 発明者名
      内山拓, 宮崎健太郎
    • 権利者名
      独立行政法人産業技術総合研究所
    • 出願年月日
      2008-08-01
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2007-04-01   更新日: 2016-04-21  

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